1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
- - - - - 1.66 - - - - - 1.56 2.19 - - - - 0.51 2.71 2.12 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.14 1.12 1.31 - - - - -0.5 - - -
- - - - - 3.3 - - - - - - - - - - - - 2.71 2.73 - - -
- - - - - - - - - - - - 2.36 - 3.94 - - - - 1.32 - - -
- - - - - - - - - - - - - 4.06 - - - - - 2.67 - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.63 - - - - 2.89 1.68 - - -
-0.53 0.74 1.36 -0.93 -1.44 0.75 -1.04 -1.62 2.16 -1.84 -1.4 -0.45 1.92 0.12 -1.66 -1.25 -1.29 -1.48 -1.41 -1.36 -0.6 -1.04 -0.95
- - 3.4 - - - - - - - 1.13 - 2.91 - - - 0.18 - - 0.66 - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.66 - - - 2.06 - 2.63 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.76 - - - - - - 3.23 - - -
- - 3.95 - - - - - - 1.92 - - - - - - 0.77 - - 1.01 - - -
- - - - - 1.77 - - 1.87 - - - - 3.68 - - - 0.57 - 0.74 - - -
- - 3.84 - - - - - - - - - - 2.53 - - - - - 1.53 - - -
- 1.61 - 1.08 - - - - - 2.56 2.09 - 0.68 2.4 - - - - - -0.32 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.52 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.64 - 2.63 - - 2.11 - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.52 - 3.53 - - - - - - - -
- 2.26 - - - -15.42 - - - 1.17 - - 2.89 2.85 - - -0.02 - - -1.65 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - -
- 0.46 2.43 -1.91 -2.08 -1.87 - - -1.77 0.92 -1.96 -2.02 1.97 0.36 0.52 -1.06 -2.8 -1.43 -0.29 0.64 0.4 - 0.54
- - - - - - - - - - - - - - 3.34 - - - 3.37 1.32 - - -
- - - - - - - - - - - 1.72 - 1.69 3.0 0.52 0.37 - 0.87 - 1.98 - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - -
- 1.79 - - - - - - 1.61 2.53 - - 1.92 2.46 -0.14 - - - - -1.01 - - -
- - 2.6 - - 1.18 2.32 - - - - - 1.32 -0.44 1.28 - 0.98 0.68 - -1.22 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.34 - - - 3.37 1.32 - - -
- 1.1 - - - 0.64 - - - - 0.55 1.18 3.52 - 0.12 -0.13 - - 0.06 0.1 - - -
- - - - - 1.8 - - - - - - 2.69 - 2.32 1.75 0.0 - - 1.89 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.21 - - - - - - 2.19 - - -
- - - - -0.55 0.64 - - 1.36 1.25 0.57 -0.49 - 2.83 0.63 -1.12 -1.26 1.13 - 0.93 - - -
- - - - - - - - 2.78 2.53 - 1.11 0.12 1.89 1.65 - - - - -1.87 - - -
- - - - - - - - - - - - 2.37 - - - - - 3.35 2.94 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.67 - 3.36 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.63 2.49 2.31 - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.18 - - - - - - 3.8 - - -
- - - - - - - - - - - 2.92 2.91 - - - - - - 2.98 - - -
-1.45 -0.37 - -2.01 -0.04 -2.05 -1.03 -1.65 0.42 -2.46 0.63 1.61 1.36 -0.21 1.25 -0.8 -0.49 0.55 0.51 1.43 -0.34 - -
- - - - - - - - - - - - 3.76 - - - - - - 3.24 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 3.57 - - 3.04 - 1.54 - - -
- - - - - - - - - - 3.9 - 2.49 - - - - - - 1.31 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - -
- - - - - - 2.02 - 2.16 0.27 - - -0.56 0.23 2.71 - 0.1 -1.2 - 1.74 - - -
- 1.9 - - - - - 0.41 -0.83 - 0.67 1.07 2.55 0.7 1.86 - -1.9 - - 1.22 - - -
- - - - - - - - - 2.82 - - - 3.51 1.61 - - - - 0.61 - - -
- - - 1.33 - - - - 2.48 2.65 - 1.81 0.78 - 1.77 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - 2.26 3.4 - - - - 2.3 - 1.44 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.1 2.53 - - -
- 0.44 2.01 -1.92 - -1.93 1.14 -0.48 1.43 1.91 -0.05 -1.03 0.75 0.0 -1.5 -1.65 -1.21 -0.7 - 0.9 - - -
- - - - 2.44 2.52 - - 2.67 - - - - - - - - - - 2.44 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.01 - 2.43 - - - - 0.62 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - -
- - - - - 2.57 - - - - - - - 0.85 1.03 0.9 - 1.54 - 3.08 - - -
- - - - - - - - - - 4.05 - - 1.52 - - - - - 1.83 - - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - - - - - - -
- - - - - 1.18 - - - - - 1.57 1.73 1.02 2.92 -1.03 -1.2 - - 1.97 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.87 2.72 - - - - - 0.85 - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.15 - - 2.83 2.54 - 2.5 - - -
- - - - - - - - - - - 3.62 - - - 0.67 - - - 3.19 - - -
- - - - - - - - - - - - 2.65 - 4.06 - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - 3.71 - - - - - - 3.31 - - -
- - - 1.01 - 1.0 - - - - - - 0.49 1.38 0.43 0.3 2.15 0.84 0.46 2.26 - - -
0.73 0.55 0.27 -1.08 -2.24 -2.15 - - -0.93 0.49 0.27 -1.6 0.41 1.64 2.36 -1.21 - -3.24 - -0.12 0.98 - 0.38
- - - - - - - - - - - - 4.52 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - -
- - - - - - - - - - - - 1.28 2.7 - - 1.0 0.74 - 3.38 - - -
-0.59 -0.07 -0.36 0.09 0.05 0.03 0.13 0.76 0.8 -0.25 -0.54 -0.11 -0.6 0.49 -0.14 0.01 0.08 -0.29 -0.36 0.44 -0.22 -0.03 -0.57
- - - - - - - - - - - - - - - - - - - 4.52 - - -
- - 2.86 0.51 - 1.44 - - - 0.83 0.47 - 1.63 -0.04 -0.05 - - - - 0.05 1.25 - -
- - - -1.16 - -0.28 1.73 - 1.43 -0.69 - - -0.27 0.99 3.06 - - - - 1.98 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.52 - - - - - - - - - -
- - - 1.89 0.81 - - - - 1.53 - - 0.37 2.59 - 0.19 0.02 - - 2.38 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.74 - 2.62 - - - - 1.81 - - -
- 0.93 - - - - - - 2.19 1.88 - - 1.85 2.28 -0.15 - -0.47 0.91 - -0.19 - - -
- - 2.72 - - 0.42 - - - - - 0.96 2.69 -0.18 0.81 - - - - 0.9 1.11 - -
- 1.08 - - - - - - - - - - 0.35 0.12 2.91 - - - - - - 3.46 -
- - - - - - - - - - - - - 1.49 1.64 1.49 2.33 - - 3.21 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.89 - - - - - - 3.03 - - -
- - - - - - - - - 2.56 - 1.82 1.37 2.3 - - - - 1.55 1.66 - - -
- - 2.25 -1.09 - 0.44 2.55 - - -0.45 -0.7 -0.2 1.58 - 0.66 -0.8 - 0.41 - 0.88 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.59 2.8 1.99 - - - - - - - -
- - - - - - - - - 1.59 - - 2.77 2.13 - 0.58 - 0.18 - 2.63 - - -
0.29 1.2 -1.93 -1.77 -1.8 -1.05 0.45 -1.86 -0.51 1.48 -1.06 0.47 -0.38 -1.39 2.37 -1.36 -1.06 -2.51 -2.7 0.2 0.29 -0.41 -0.95
- -1.58 - -0.42 -2.2 -2.12 - 0.33 - 0.9 -2.16 1.08 -0.6 -0.09 3.15 -0.84 -1.38 -1.23 - 0.72 0.2 0.47 -
0.05 1.09 -0.5 -2.01 -1.92 -1.28 1.04 -2.1 0.24 -0.2 -0.93 0.14 -0.45 -0.59 2.7 -2.13 -1.78 -3.06 -3.13 0.2 -0.35 -0.38 -0.19
0.78 1.0 -0.64 -1.18 -0.8 -0.45 0.79 -0.59 -0.84 0.05 0.07 0.19 0.04 0.13 1.34 -0.69 -0.7 -1.44 -1.46 0.63 0.02 -0.38 -0.37
- - - - - - - - - - - - - - 3.67 - - - - 3.36 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.41 - - - - - - 0.84 - - -
- - - - - - - - - - - - - - - - - 4.01 - 2.79 - - -
- 1.53 - - - - - - 1.23 2.34 - 2.31 0.63 - - - - - - 2.63 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.52 - - - - - - - - - -
- - - - - - - - - - - - - 2.59 2.74 - - 2.2 - 2.5 - - -
- 0.78 2.91 0.73 - - - - - - 1.52 - - 0.94 2.82 - - - - -1.94 - - -
- -1.5 - -1.55 -1.87 0.26 - - - -0.23 1.37 2.21 0.15 0.38 2.77 - - -1.22 - 1.63 - - -
- - 3.68 - - - - - - - - - 2.4 - - - - - 0.79 1.69 - - -
- -2.19 1.96 0.75 0.12 -0.12 - -1.11 0.64 0.41 -0.14 -0.83 1.76 -0.69 -0.8 -0.57 -0.73 -0.16 0.44 1.08 -2.77 - -
- - - - - - - - - - - - - - 4.36 - - - - 1.33 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.76 - - - - - - 3.25 - - -
- - - - - - - - - - - - - 3.71 2.54 - - 0.35 - 1.5 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.17 - - - - - - 2.34 - - -
- - - - - - - - - - - - 4.01 - - - - 2.32 - 0.91 - - -
- - - - - - - - - - - - 3.41 2.27 - 2.26 - - - 1.47 - - -

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.