Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.93 7.64 0.0 0.0 0.0 0.0 2.37 10.93 7.29 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 29.38 3.63 4.13 0.0 0.0 0.0 0.0 1.18 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.44 4.49 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.16 0.0 9.45 0.0 0.0 0.0 0.0 1.53 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.89 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.96 0.0 0.0 0.0 0.0 4.74 2.06 0.0 0.0 0.0
7.1 17.09 26.26 5.39 3.78 17.18 4.98 3.32 45.82 2.85 3.89 7.5 38.78 11.11 3.23 4.32 4.17 3.67 3.84 3.99 6.76 4.99 5.28
0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.54 0.0 0.0 0.0 2.15 0.0 3.19 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.4 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 1.27 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 2.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0
0.0 0.46 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 0.64 0.0 0.24 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13.55 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.15 0.0 4.53 0.0 0.0 3.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.95 0.0 1.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.0 0.0 3.16 3.07 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.86 0.0 0.0 0.0
0.0 3.99 15.57 0.77 0.69 0.79 0.0 0.0 0.85 5.47 0.74 0.71 11.33 3.7 4.14 1.39 0.42 1.08 2.37 4.49 3.81 0.0 4.2
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.54 0.0 0.0 0.0 1.57 0.38 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.12 0.3 0.05 0.05 0.0 0.07 0.0 0.15 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 3.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.87 5.44 0.0 0.0 3.55 5.18 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 13.81 0.0 0.0 5.16 11.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.69 1.67 5.51 0.0 4.48 3.65 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 5.18 0.0 0.0 0.0 3.77 0.0 0.0 0.0 0.0 3.53 5.47 27.53 0.0 2.62 2.2 0.0 0.0 2.51 2.59 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16.82 0.0 13.07 8.8 2.62 0.0 0.0 9.71 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.2 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.05 4.64 0.0 0.0 7.69 7.12 4.43 2.13 0.0 21.22 4.64 1.38 1.25 6.54 0.0 5.69 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.62 3.04 0.0 1.14 0.57 1.96 1.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.56 7.2 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.31 0.0 2.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.68 1.67 1.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.54 8.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.86 0.0 0.0 0.0
5.18 10.94 0.0 3.52 13.8 3.42 6.92 4.51 18.9 2.58 21.93 43.38 36.28 12.26 33.67 8.13 10.06 20.76 20.2 38.14 11.23 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.26 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.45 0.0 0.0 1.01 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.39 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.78 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 14.58 0.0 16.04 4.32 0.0 0.0 2.44 4.21 23.49 0.0 3.85 1.56 0.0 11.93 0.0 0.0 0.0
0.0 25.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.07 3.83 0.0 10.81 14.26 39.72 11.04 24.76 0.0 1.82 0.0 0.0 15.82 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 1.16 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.76 0.0 0.0 0.0 0.0 3.92 4.39 0.0 2.47 1.21 0.0 2.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.08 15.55 0.0 0.0 0.0 0.0 7.26 0.0 3.99 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 11.96 4.03 0.0 0.0 0.0
0.0 1.16 3.43 0.23 0.0 0.22 1.88 0.61 2.3 3.22 0.83 0.42 1.44 0.86 0.3 0.27 0.37 0.53 0.0 1.6 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 2.16 2.28 0.0 0.0 2.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.16 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.12 0.0 2.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.28 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.73 4.24 3.87 0.0 6.01 0.0 17.52 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.4 0.0 0.0 1.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 12.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 16.01 17.89 10.95 40.82 2.64 2.34 0.0 0.0 21.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.81 3.99 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.61 0.0 0.0 5.79 4.75 0.0 4.62 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 24.63 0.0 0.0 0.0 3.2 0.0 0.0 0.0 18.38 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.53 0.0 12.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.95 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 5.82 0.0 5.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.05 7.53 3.91 3.57 12.8 5.2 3.99 13.9 0.0 0.0 0.0
2.86 2.52 2.07 0.81 0.37 0.39 0.0 0.0 0.9 2.41 2.07 0.57 2.29 5.38 8.81 0.74 0.0 0.18 0.0 1.58 3.39 0.0 2.24
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.72 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.84 10.28 0.0 0.0 3.15 2.64 0.0 16.37 0.0 0.0 0.0
33.14 47.47 39.08 53.16 51.74 50.93 54.7 84.85 87.09 42.04 34.47 46.22 33.09 70.22 45.41 50.39 52.69 40.87 39.07 67.96 42.79 48.83 33.6
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.71 0.14 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.17 0.14 0.0 0.3 0.1 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.23 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 3.05 0.0 5.61 22.7 0.0 18.38 4.23 0.0 0.0 5.64 13.54 56.99 0.0 0.0 0.0 0.0 26.87 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 8.92 4.22 0.0 0.0 0.0 0.0 6.96 0.0 0.0 3.12 14.53 0.0 2.75 2.44 0.0 0.0 12.55 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.18 0.0 1.93 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 0.0 0.0 0.0
0.0 2.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.97 5.65 0.0 0.0 5.54 7.45 1.38 0.0 1.1 2.87 0.0 1.34 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.89 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.15 3.82 0.52 1.04 0.0 0.0 0.0 0.0 1.1 1.27 0.0 0.0
0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.14 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.39 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.55 2.83 2.54 4.56 0.0 0.0 8.42 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.97 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.19 0.0 3.7 2.71 5.15 0.0 0.0 0.0 0.0 3.07 3.32 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 43.77 4.31 0.0 12.47 53.95 0.0 0.0 6.7 5.64 8.01 27.36 0.0 14.54 5.29 0.0 12.2 0.0 16.95 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.8 5.09 2.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.15 0.0 0.0 13.93 8.94 0.0 3.05 0.0 2.33 0.0 12.72 0.0 0.0 0.0
44.65 84.28 9.6 10.71 10.51 17.72 50.11 10.08 25.72 102.34 17.52 50.6 28.17 13.99 188.88 14.28 17.54 6.42 5.62 41.94 44.87 27.63 18.9
0.0 1.27 0.0 2.84 0.83 0.87 0.0 4.77 0.0 7.07 0.85 8.01 2.5 3.58 33.63 2.12 1.45 1.62 0.0 6.27 4.37 5.27 0.0
21.07 43.25 14.41 5.07 5.38 8.36 41.69 4.74 23.97 17.73 10.69 22.36 14.93 13.5 132.52 4.65 5.92 2.43 2.32 23.42 15.94 15.64 17.83
16.38 19.08 6.12 4.23 5.48 6.99 16.5 6.33 5.34 9.89 10.0 10.86 9.8 10.44 24.24 5.92 5.88 3.52 3.47 14.73 9.7 7.36 7.37
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.77 0.0 0.0 0.0 0.0 6.24 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 28.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.42 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 4.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.01 8.64 0.0 8.48 2.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 10.61 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 13.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.05 2.27 0.0 0.0 1.56 0.0 1.93 0.0 0.0 0.0
0.0 0.78 3.43 0.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.3 0.0 0.0 0.87 3.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 3.85 0.0 3.74 2.98 13.08 0.0 0.0 0.0 9.31 28.31 50.54 12.12 14.25 74.44 0.0 0.0 4.68 0.0 33.83 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 20.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.73 5.1 0.0 0.0 0.0
0.0 6.62 117.6 50.94 32.9 27.72 0.0 13.99 47.03 40.02 27.49 16.97 102.3 18.75 17.38 20.33 18.26 27.0 41.03 63.99 4.44 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 6.46 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 30.43 13.53 0.0 0.0 2.97 0.0 6.6 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.27 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.96 0.0 0.0 0.0 0.0 1.85 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 7.45 3.37 0.0 3.36 0.0 0.0 0.0 1.94 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)