Heatmap: Cluster_3 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 1.0 0.67 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.67 0.67 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.26 0.0 0.0 0.0
0.15 0.37 0.57 0.12 0.08 0.38 0.11 0.07 1.0 0.06 0.08 0.16 0.85 0.24 0.07 0.09 0.09 0.08 0.08 0.09 0.15 0.11 0.12
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0
0.0 0.52 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.72 0.0 0.27 0.9 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.49 0.0 0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 1.0 0.97 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.26 1.0 0.05 0.04 0.05 0.0 0.0 0.05 0.35 0.05 0.05 0.73 0.24 0.27 0.09 0.03 0.07 0.15 0.29 0.24 0.0 0.27
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.4 1.0 0.18 0.16 0.0 0.23 0.0 0.49 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 1.0 0.0 0.0 0.65 0.95 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.37 0.82 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.12 0.4 0.0 0.32 0.26 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 0.0 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0
0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.2 1.0 0.0 0.1 0.08 0.0 0.0 0.09 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.78 0.52 0.16 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.22 0.0 0.0 0.36 0.34 0.21 0.1 0.0 1.0 0.22 0.06 0.06 0.31 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.84 0.0 0.31 0.16 0.54 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.75 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.96 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.25 0.0 0.08 0.32 0.08 0.16 0.1 0.44 0.06 0.51 1.0 0.84 0.28 0.78 0.19 0.23 0.48 0.47 0.88 0.26 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.68 0.18 0.0 0.0 0.1 0.18 1.0 0.0 0.16 0.07 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0
0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.1 0.0 0.27 0.36 1.0 0.28 0.62 0.0 0.05 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 0.0 1.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.89 1.0 0.0 0.56 0.28 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.34 0.0 0.0 0.0
0.0 0.34 1.0 0.07 0.0 0.07 0.55 0.18 0.67 0.94 0.24 0.12 0.42 0.25 0.09 0.08 0.11 0.15 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.9 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.24 0.22 0.0 0.34 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.44 0.27 1.0 0.06 0.06 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.0 0.0 1.0 0.82 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.76 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.54 0.28 0.26 0.92 0.37 0.29 1.0 0.0 0.0 0.0
0.32 0.29 0.24 0.09 0.04 0.04 0.0 0.0 0.1 0.27 0.24 0.06 0.26 0.61 1.0 0.08 0.0 0.02 0.0 0.18 0.38 0.0 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.63 0.0 0.0 0.19 0.16 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.38 0.55 0.45 0.61 0.59 0.58 0.63 0.97 1.0 0.48 0.4 0.53 0.38 0.81 0.52 0.58 0.6 0.47 0.45 0.78 0.49 0.56 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.2 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.24 0.19 0.0 0.42 0.13 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.33 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.4 0.0 0.32 0.07 0.0 0.0 0.1 0.24 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.61 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.21 1.0 0.0 0.19 0.17 0.0 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0
0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.76 0.0 0.0 0.74 1.0 0.19 0.0 0.15 0.39 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.29 0.98 0.13 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.33 0.0 0.0
0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.34 0.3 0.54 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.6 0.44 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.54 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.81 0.08 0.0 0.23 1.0 0.0 0.0 0.12 0.1 0.15 0.51 0.0 0.27 0.1 0.0 0.23 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.58 0.33 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 1.0 0.64 0.0 0.22 0.0 0.17 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0
0.24 0.45 0.05 0.06 0.06 0.09 0.27 0.05 0.14 0.54 0.09 0.27 0.15 0.07 1.0 0.08 0.09 0.03 0.03 0.22 0.24 0.15 0.1
0.0 0.04 0.0 0.08 0.02 0.03 0.0 0.14 0.0 0.21 0.03 0.24 0.07 0.11 1.0 0.06 0.04 0.05 0.0 0.19 0.13 0.16 0.0
0.16 0.33 0.11 0.04 0.04 0.06 0.31 0.04 0.18 0.13 0.08 0.17 0.11 0.1 1.0 0.04 0.04 0.02 0.02 0.18 0.12 0.12 0.13
0.68 0.79 0.25 0.17 0.23 0.29 0.68 0.26 0.22 0.41 0.41 0.45 0.4 0.43 1.0 0.24 0.24 0.15 0.14 0.61 0.4 0.3 0.3
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0
0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.81 0.0 0.8 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 1.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0
0.0 0.23 1.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.26 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 0.0 0.05 0.04 0.18 0.0 0.0 0.0 0.13 0.38 0.68 0.16 0.19 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.25 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 1.0 0.43 0.28 0.24 0.0 0.12 0.4 0.34 0.23 0.14 0.87 0.16 0.15 0.17 0.16 0.23 0.35 0.54 0.04 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.44 0.0 0.0 0.1 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.45 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)