Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
-1.9 0.22 0.82 -0.6 0.17 0.16 0.41 -1.1 0.04 -0.22 0.25 0.48 -0.11 -0.03 -0.05 -0.1 -0.07 -0.4 -0.51 0.21 -0.06 0.19 -0.51 0.13 -0.28 1.0 -0.21 -0.57
-0.65 0.87 -0.76 -0.76 -0.51 -1.47 0.23 -0.77 0.18 -0.32 0.34 -0.31 -2.22 0.23 0.57 0.58 -0.07 1.3 -0.07 0.32 0.66 0.4 -0.36 0.4 -1.64 -0.3 -0.32 -0.7
-0.73 0.53 0.84 -0.39 -0.44 -0.07 0.66 0.14 -0.17 -0.16 -0.12 -1.04 0.26 -0.29 -0.32 0.15 -0.38 -0.38 0.18 0.25 0.2 -0.08 -0.67 0.16 -0.1 0.51 0.37 -0.83
-1.31 0.42 0.71 -1.96 -0.41 -0.33 0.33 -0.31 -0.1 -0.54 -0.2 -0.1 0.24 0.58 0.8 -0.73 -0.55 0.19 0.19 -0.57 -0.49 -0.28 -1.42 -0.14 1.16 0.8 0.72 -2.05
-0.81 0.41 0.63 -0.79 -0.17 -0.16 0.47 0.37 0.14 0.2 0.29 -0.91 -0.3 0.13 0.1 0.04 -0.25 -1.3 -0.85 0.46 0.26 0.3 -0.08 0.31 0.27 -0.65 0.58 -1.33
-0.81 0.52 0.63 -0.76 0.44 0.0 0.51 0.27 0.12 0.39 -0.01 -0.15 1.13 0.53 0.11 -0.89 -1.47 -0.53 -1.36 -0.53 -0.59 -0.63 0.1 -0.69 0.11 0.16 0.88 -2.73
-0.96 1.8 0.64 -1.58 -1.17 -1.35 -0.07 -1.33 -1.17 -2.06 -0.38 -1.08 -1.2 0.06 0.14 -0.57 -0.11 -0.98 -0.77 -0.3 0.18 -0.12 -0.61 0.06 0.58 2.55 -1.09 -1.62
-0.37 0.72 0.81 -0.15 -0.03 0.26 0.8 -0.03 -0.61 -0.51 -0.39 -0.72 0.61 -0.12 -0.21 -0.01 -0.48 -0.66 -0.47 0.14 0.01 -0.2 -0.84 -0.02 0.39 0.45 -0.01 -0.44
0.63 1.0 -0.0 -0.37 -0.61 -0.58 0.1 -0.71 -0.65 -0.68 -0.42 -0.62 -0.28 0.32 0.22 0.08 -0.43 -0.95 -0.4 0.12 0.23 -0.11 -1.1 -0.02 1.01 1.15 0.14 -0.45
-2.03 0.25 0.22 -0.64 0.41 0.45 0.0 0.3 0.19 0.53 0.28 0.3 -0.07 -0.11 -0.23 -0.63 -0.32 0.29 -0.21 -0.28 -0.54 -0.3 -0.49 -0.55 1.14 -0.22 -0.07 -0.3
0.78 1.55 -0.57 0.24 -0.6 -0.78 -0.54 -0.98 -1.15 -1.33 -0.97 -1.51 -0.16 0.3 0.33 0.19 -0.26 -1.22 -0.5 0.22 0.29 -0.15 -0.22 -0.17 0.81 0.69 0.59 -0.08
-1.53 1.63 -0.42 -0.05 0.13 1.15 -0.53 0.42 -0.07 0.19 0.06 0.13 -1.86 0.21 0.05 -0.74 -1.15 -0.98 -0.69 -0.61 -1.06 -0.94 -0.72 -0.8 0.16 1.58 -0.06 -0.46
-1.44 1.13 -0.46 -0.93 0.87 1.03 0.09 -0.39 -0.62 -1.35 -0.86 0.82 0.37 0.34 -0.22 -0.55 -0.02 -0.28 -1.44 -0.82 -0.46 -0.36 -1.03 -0.73 0.25 1.62 -0.41 -0.6
-1.03 0.14 0.73 -0.09 0.14 0.36 0.64 -0.04 -0.03 -0.07 -0.02 0.23 0.31 0.11 -0.04 -0.55 -0.57 -0.38 -0.94 -0.29 -0.34 -0.16 -0.22 -0.17 0.29 0.39 0.33 -0.29
-0.14 1.28 0.27 -0.57 -0.49 -0.29 0.16 -0.03 0.65 -0.11 0.91 -0.23 -0.49 -0.42 -0.37 0.27 -0.07 -0.97 -0.89 0.31 0.26 0.15 -0.58 0.18 -1.04 0.18 -0.33 -0.46
-0.5 0.24 0.11 -0.43 0.27 0.01 0.53 -0.07 0.03 0.17 0.1 0.12 0.41 -0.07 -0.25 -0.15 -0.29 -0.51 -0.78 0.34 -0.16 0.11 -0.31 0.04 -0.3 0.85 0.08 -1.03
0.11 1.63 0.15 0.46 0.73 0.63 -0.0 -0.8 -1.11 -0.9 -1.25 -0.39 0.29 -0.92 -0.55 -0.08 0.11 -0.61 -1.28 -0.08 -0.32 -0.3 -0.3 -0.59 -0.26 0.06 0.44 0.65
-0.53 0.33 0.59 0.28 -0.42 -0.63 0.44 0.01 -0.11 0.29 0.21 -1.06 0.53 -0.35 -0.44 -0.28 -0.42 -1.13 -0.73 0.03 0.21 -0.23 -0.23 -0.26 1.25 -0.05 -0.04 0.22
2.56 3.05 -1.23 -3.48 -2.71 -4.48 -4.82 -2.77 -2.52 -5.42 -2.36 -1.8 -1.94 -0.66 -1.26 - - -4.17 -4.38 - - -5.23 -4.94 -4.21 0.51 3.17 -2.42 -2.86
-0.95 -0.37 1.22 -0.18 0.54 0.22 0.59 -0.45 -1.2 -0.37 -1.24 -0.17 1.1 -2.87 -2.97 0.79 0.31 0.32 0.77 0.42 0.84 0.29 -0.89 0.44 -3.29 -0.48 -2.45 -0.87
-0.68 0.17 -0.1 -0.26 0.11 -0.07 -0.22 -0.16 0.16 -0.19 0.28 0.21 -0.33 -0.05 -0.07 0.21 -0.29 -0.57 0.06 0.01 0.15 -0.08 -0.34 -0.09 0.28 1.24 -0.25 -0.46
-0.33 2.16 -1.15 -1.76 -1.22 -1.16 2.83 -2.11 -1.02 -1.59 -1.89 -0.48 -0.69 -0.1 -0.02 -1.99 -4.37 -2.45 -3.47 -1.23 -2.42 -2.13 -1.09 -2.3 1.03 1.31 1.12 -0.7
-1.36 1.46 -0.86 -0.34 -1.06 -0.72 -0.25 -1.27 -0.96 -1.1 -0.83 -1.17 0.36 0.53 0.32 -0.21 0.04 -1.71 -0.55 0.23 -0.02 -0.38 -0.61 -0.63 1.36 1.74 0.67 -0.74
-1.0 -0.14 0.34 -0.12 -0.43 -0.64 0.17 -0.42 -0.26 -0.34 -0.25 -0.46 -0.3 0.28 0.08 0.13 -0.0 0.09 0.74 0.32 -0.19 -0.02 -0.63 0.02 0.53 0.8 0.44 -0.43
-0.99 -0.04 0.95 -0.71 -0.42 -0.48 -0.51 0.92 -0.13 -0.25 0.81 -1.23 -0.16 -0.63 -0.66 0.93 -0.43 0.02 0.67 0.51 0.96 0.58 -0.29 0.46 -1.5 -1.44 -1.03 -1.73
-1.54 1.0 -0.17 -1.28 -0.32 -0.37 0.31 -0.37 -0.36 -0.81 -0.48 -1.14 0.54 0.57 0.48 -0.35 -1.18 -0.5 -0.1 -0.16 -0.19 -0.67 -0.61 -0.25 1.84 0.6 0.88 -2.15
-0.34 0.5 0.78 -0.04 -0.15 -0.1 0.22 0.15 0.2 -0.45 0.39 -0.25 0.04 -0.24 -0.1 0.08 -0.06 -0.64 -0.17 0.23 0.11 0.21 -0.11 0.29 -0.64 -0.04 -0.28 -0.71
0.15 0.59 -0.81 -1.17 -0.44 -1.28 -0.08 0.28 0.65 -0.09 1.25 -0.1 0.32 -0.03 -0.32 0.25 -0.25 0.88 -0.45 0.43 -0.47 -0.28 -0.33 -0.23 0.19 -0.21 -0.37 -1.68
0.8 0.36 0.19 -0.4 -0.83 -0.73 0.14 -0.94 -0.69 -1.0 -0.61 -1.27 0.35 0.05 -0.09 0.04 -0.49 0.86 0.04 0.06 0.27 -0.27 -0.68 -0.08 1.18 0.77 0.07 -0.72
-2.76 -0.35 0.92 -0.63 -1.09 -0.83 0.81 0.63 0.45 0.39 0.4 -1.17 0.32 -0.57 -0.7 0.19 -0.38 0.03 0.53 0.25 0.29 0.06 -0.77 0.23 -0.11 0.24 -0.09 -0.83
-0.19 0.37 0.43 -0.65 -0.4 0.15 -0.19 0.09 0.43 -0.54 0.93 -0.56 -0.47 -0.07 -0.13 0.6 -0.2 0.03 0.21 0.25 0.25 0.3 0.17 0.01 0.11 -1.41 -0.31 -1.93
-1.96 0.13 0.83 -0.04 0.15 0.11 0.61 -0.19 -0.38 -0.03 -0.13 -0.03 0.46 -0.13 -0.25 0.08 0.05 -0.91 0.01 0.18 -0.05 0.02 -0.94 0.02 -0.14 0.63 0.04 -0.4
-0.22 0.72 0.37 -0.05 -0.2 -0.74 -0.18 0.41 -0.17 0.01 0.09 -0.67 0.2 0.52 0.41 -0.09 -0.59 -0.71 -0.98 -0.03 -0.02 -0.43 -0.53 -0.49 0.92 0.17 0.66 -0.69
0.82 0.37 1.05 -0.96 -0.31 -0.9 -0.03 0.92 -0.71 -0.28 -0.09 -1.19 0.38 -0.57 -0.67 0.57 -0.44 -0.33 -0.26 0.42 0.29 -0.11 -0.43 -0.19 -0.4 -0.27 0.94 -1.84
-0.58 0.05 0.66 -0.19 -0.11 -0.15 0.32 0.11 -0.06 0.11 -0.0 -0.07 -0.11 -0.07 -0.17 -0.2 -0.38 -0.14 0.16 -0.11 -0.05 -0.15 -0.3 -0.04 0.69 0.08 0.08 -0.08
-0.87 0.78 0.06 -0.71 -0.81 -1.1 -0.11 -0.06 -0.44 -0.2 -0.08 -1.18 -0.02 -0.05 -0.11 0.23 -0.03 -0.08 0.09 0.27 0.35 0.24 -0.78 0.21 1.47 0.72 -0.26 -1.11
-4.06 0.38 -0.1 -0.35 -1.03 -0.45 0.02 -0.58 -0.59 -0.18 -0.26 -0.94 -0.53 -0.07 -0.01 0.17 0.26 -0.69 0.71 0.31 0.48 0.34 -0.82 0.39 1.65 0.31 -0.35 -0.04
-0.39 0.88 -0.25 -0.18 -0.36 -0.93 -0.2 -0.9 -0.1 0.03 0.06 -0.24 0.43 0.06 -0.13 -0.45 -0.75 -0.58 -0.81 -0.18 0.01 -0.5 -1.5 -0.33 0.31 2.1 -0.22 0.16
0.85 0.26 0.31 -0.62 -0.27 -0.08 -0.13 0.62 0.02 -0.22 -0.2 -0.83 -0.04 0.21 -0.04 0.21 -0.35 -0.78 0.45 -0.03 0.1 -0.22 -0.9 0.0 0.66 -0.29 0.61 -2.15
-0.37 0.32 0.34 -0.49 -0.09 -0.05 0.36 -0.07 -0.19 -0.46 0.02 -0.46 0.06 0.04 0.12 0.12 -0.17 -0.9 -0.43 0.25 0.52 0.17 -0.57 0.15 0.56 0.58 0.11 -0.93
-0.56 0.33 -0.29 -0.42 -0.78 -1.4 0.27 -0.12 0.41 -0.04 0.44 -1.05 0.78 0.67 0.43 0.21 -0.04 0.08 0.31 0.4 0.22 -0.11 -0.9 -0.04 -2.32 -0.57 0.8 -0.63
-0.52 0.69 0.36 -1.09 0.32 -0.43 -0.18 0.68 0.25 0.29 -0.02 -0.6 0.3 -0.25 -0.37 -0.18 -1.1 1.88 -1.29 -0.37 -0.4 -0.71 -1.0 -0.6 -0.03 0.17 0.55 -1.99
0.44 0.94 0.73 0.05 0.11 -0.31 0.35 -0.61 -0.57 -0.33 -0.53 -0.94 0.64 -0.46 -0.57 0.31 0.17 -0.93 -1.2 0.32 0.34 0.15 -0.9 0.09 0.0 0.15 0.26 -0.5
-1.48 0.42 -1.23 -0.3 0.52 0.8 0.38 -1.41 -1.47 -1.35 -1.44 0.4 0.32 -0.37 -0.41 -0.39 -0.16 -0.14 -0.95 -0.05 -0.21 0.14 -1.93 -0.17 1.71 1.09 -0.39 0.74
0.65 -0.1 0.84 -0.47 0.12 0.08 0.41 0.4 0.18 0.12 0.32 -0.54 0.82 -0.06 -0.24 -0.32 -0.35 -0.93 -0.95 0.06 -0.03 -0.04 -0.41 -0.05 -0.62 -0.78 0.45 -0.94
0.35 1.84 -0.16 -0.71 -0.31 -0.7 -0.67 -1.42 -1.56 -1.43 -1.36 -1.16 0.05 0.76 0.68 -0.5 -0.97 -1.54 -1.7 -0.69 -0.27 -0.78 -1.83 -0.73 1.55 1.76 0.89 -1.33
0.22 0.46 -0.38 -0.31 0.5 0.71 -0.0 -0.13 -0.27 -0.21 -0.18 0.0 -0.27 -0.17 -0.05 0.29 0.09 0.05 -0.77 -0.04 -0.24 0.13 -0.17 0.01 -0.5 0.46 0.0 -0.23
-0.46 0.21 0.51 -0.37 0.37 0.75 0.5 -0.39 -0.17 -0.2 -0.04 0.36 0.26 0.32 0.19 -0.63 -0.57 -0.59 -0.68 -0.32 -0.72 -0.29 -0.73 -0.28 0.3 0.73 0.11 -0.09
0.82 2.42 -0.9 0.47 -1.03 -1.22 -0.8 -1.49 -0.92 -1.64 0.49 -0.38 -1.33 -1.41 -1.03 -0.98 0.86 -1.32 -0.69 -0.79 -1.45 -0.44 -0.46 -1.0 0.82 1.9 -1.87 -0.27
-2.38 -0.22 0.48 -0.06 0.12 -0.01 0.37 -0.26 -0.2 -0.26 -0.12 0.23 0.35 0.02 -0.08 0.02 -0.04 -0.44 -0.44 0.16 0.05 0.07 -0.45 0.07 0.74 0.65 0.04 -0.62
-1.81 -0.29 0.51 -0.1 0.09 0.37 0.48 0.18 -0.31 0.14 -0.34 -0.19 0.97 0.14 -0.09 0.08 0.14 -0.45 -0.8 0.22 0.09 0.21 -0.89 0.02 -0.66 -0.47 0.7 -0.53
-0.8 0.49 0.09 -0.18 0.67 0.07 -0.01 -0.5 -0.4 -0.16 -0.38 0.29 0.47 0.56 0.3 -0.11 -0.08 -0.4 -0.18 -0.24 -0.25 -0.26 -0.53 -0.7 0.84 -0.53 0.48 -0.41
0.16 1.03 0.85 -0.57 -1.44 -1.02 0.49 -1.37 0.13 -0.63 0.03 -0.46 -0.09 0.4 0.34 -0.66 -0.74 -1.31 -0.53 0.13 -0.13 -0.04 -0.78 -0.07 1.3 0.73 0.2 -0.82
-1.83 0.17 -0.11 -0.12 0.28 -0.02 0.35 0.26 0.62 0.14 0.87 0.33 0.7 0.33 0.15 -0.76 -1.1 -0.36 -0.82 -0.26 -0.4 -0.34 -0.56 -0.24 0.15 0.49 0.43 -2.28
0.28 1.94 0.19 -1.12 -0.77 0.47 -0.0 -1.14 -1.29 -0.97 -1.25 -0.18 -0.44 0.59 0.69 -1.06 -0.33 -1.2 -0.79 -0.47 -0.98 -0.74 0.21 -0.76 0.63 1.39 0.46 -1.21
0.27 0.55 0.76 -0.58 0.11 -0.45 0.96 -0.01 -0.36 -0.86 -0.05 -0.2 0.38 -0.38 -0.46 0.18 -0.35 -0.34 -0.5 0.26 0.21 -0.07 -1.3 0.08 0.74 0.1 -0.18 -1.18
-0.71 0.98 -0.26 -0.92 -0.9 -0.61 -0.02 0.2 -0.38 0.17 -0.35 -1.21 -0.36 0.64 0.28 0.06 -0.5 -0.2 0.04 -0.24 -0.0 -0.33 -0.95 -0.23 0.27 1.52 0.77 -0.72
0.13 1.23 0.24 0.16 0.14 0.19 -0.32 -0.5 -0.27 -0.71 -0.2 -0.05 0.07 -0.15 -0.51 -0.67 -1.22 -1.13 -0.53 -0.2 -0.92 -0.68 -0.58 -0.63 0.65 1.83 0.06 -0.21
-1.38 -0.53 1.5 0.07 -0.97 -1.61 0.87 0.92 0.44 0.64 0.51 -1.65 0.81 0.53 0.38 -1.21 -1.64 -1.58 -2.63 -1.4 -0.93 -1.83 0.22 -1.06 0.46 -0.65 1.35 -0.55
-0.55 0.41 0.56 -0.18 -0.04 -0.49 0.29 -0.68 -0.17 -0.85 0.11 -0.12 0.43 0.0 -0.11 0.26 -0.03 -0.83 0.21 0.28 0.51 0.21 -0.89 0.42 -0.42 0.08 0.4 -0.55
-1.91 -0.35 0.63 -0.42 0.06 0.0 0.56 0.13 0.48 -0.18 0.58 0.2 0.02 0.03 0.09 -0.3 -0.38 -0.46 -0.35 -0.03 -0.16 -0.1 -0.2 -0.05 -0.23 0.83 0.1 -0.75
-0.26 0.33 0.76 -0.26 -0.28 -0.46 0.61 -0.3 0.1 -0.35 0.2 -0.21 -0.18 -0.01 -0.12 -0.13 -0.44 -0.55 -0.09 -0.12 -0.02 -0.12 -0.33 -0.06 0.54 0.63 0.21 -0.3
-1.54 -0.08 0.76 -0.28 0.13 -0.08 0.49 0.13 0.29 -0.18 0.55 -0.02 0.14 -0.24 -0.39 0.1 -0.14 -0.31 0.19 0.21 0.08 0.2 -0.62 0.21 -0.61 0.19 -0.15 -0.76
-2.23 4.07 -3.5 -6.35 -4.51 -3.84 -3.35 -3.53 -3.79 -2.67 -3.61 -6.16 -3.32 -3.48 -2.97 -5.47 -5.27 -4.26 -4.63 -4.95 -4.11 -4.36 -4.73 -4.28 -1.35 3.19 -5.06 -6.46
0.16 1.39 -0.65 -0.55 -1.23 -1.97 -0.0 -0.62 0.15 -0.64 0.02 -0.94 0.79 0.65 0.39 -0.18 -0.24 0.91 -0.13 -0.16 -0.73 -0.38 -0.56 -0.33 -0.16 0.83 0.24 -0.76
0.84 1.53 -0.84 -0.88 -0.43 -0.97 -0.04 -0.12 0.51 -0.04 0.61 -0.21 0.71 0.32 0.26 -0.34 -0.4 0.31 -1.86 -0.24 -1.3 -1.02 -0.52 -0.97 0.15 0.9 -0.24 -1.48
-0.25 0.27 0.13 -0.27 0.2 0.28 0.01 0.16 0.12 0.18 0.2 0.06 0.03 0.26 0.1 -0.44 -0.71 -1.16 -1.09 -0.2 -0.37 -0.01 -0.01 -0.26 0.58 0.6 0.28 -0.16
-1.25 0.39 0.69 -0.87 -0.39 -0.6 0.19 0.17 0.45 -0.11 0.77 -0.27 -0.46 0.1 -0.06 -0.25 -0.59 -0.45 0.14 -0.11 0.11 -0.04 -0.3 0.11 0.74 0.63 0.1 -1.56
0.65 0.98 -1.16 -1.0 -1.46 -0.98 0.25 -0.46 -1.84 -0.75 -1.52 -2.68 -0.92 1.94 1.72 -3.5 -2.66 -0.47 -3.04 -2.14 -2.55 -1.96 -1.71 -2.26 1.46 0.64 2.19 -0.83

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.