Heatmap: Cluster_87 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	FB cap+lamellae,YMG,strain #326	FB stipe,YMG,strain #326	Hyphal knots,control,strain #326	Mycelium	Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h	Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h	Mycelium,LiCl,strain #326	Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO	Mycelium,control,20C,matA/matB KO	Mycelium,control,28C,8h	Mycelium,control,strain #326	Stg 1 primordium,YMG,strain #326	Stg 2 primordium,YMG,strain #326	Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130	Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130	Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO	Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130	Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130	Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130	Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130	Vegetative mycelium,YMG,strain #326	Mycelium,control,YMG,37C,strain #130	YFB cap,YMG,strain #326	YFB lamellae,YMG,strain #326	secondary hyphal knots,YMG,strain #326	strain #130
EAU80586	0.13	0.58	0.88	0.33	0.56	0.56	0.67	0.23	0.51	0.43	0.59	0.69	0.46	0.49	0.48	0.47	0.48	0.38	0.35	0.58	0.48	0.57	0.35	0.55	0.41	1.0	0.43	0.34
EAU80788	0.26	0.75	0.24	0.24	0.29	0.15	0.48	0.24	0.46	0.33	0.51	0.33	0.09	0.48	0.6	0.61	0.39	1.0	0.39	0.51	0.64	0.54	0.32	0.54	0.13	0.33	0.33	0.25
EAU80868	0.34	0.8	1.0	0.43	0.41	0.53	0.88	0.61	0.5	0.5	0.51	0.27	0.67	0.46	0.45	0.62	0.43	0.43	0.63	0.67	0.64	0.53	0.35	0.62	0.52	0.79	0.72	0.31
EAU81652	0.18	0.6	0.73	0.11	0.34	0.36	0.56	0.36	0.42	0.31	0.39	0.42	0.53	0.67	0.78	0.27	0.31	0.51	0.51	0.3	0.32	0.37	0.17	0.41	1.0	0.78	0.73	0.11
EAU83617	0.37	0.86	1.0	0.37	0.57	0.58	0.89	0.83	0.71	0.74	0.79	0.34	0.52	0.71	0.69	0.66	0.54	0.26	0.36	0.89	0.77	0.79	0.61	0.8	0.78	0.41	0.96	0.26
EAU84099	0.26	0.65	0.71	0.27	0.62	0.46	0.65	0.55	0.5	0.6	0.45	0.41	1.0	0.66	0.49	0.25	0.17	0.32	0.18	0.32	0.3	0.3	0.49	0.28	0.49	0.51	0.84	0.07
EAU84353	0.09	0.6	0.27	0.06	0.08	0.07	0.16	0.07	0.08	0.04	0.13	0.08	0.07	0.18	0.19	0.12	0.16	0.09	0.1	0.14	0.19	0.16	0.11	0.18	0.26	1.0	0.08	0.06
EAU84398	0.44	0.94	1.0	0.51	0.56	0.68	0.99	0.56	0.37	0.4	0.44	0.35	0.87	0.53	0.49	0.56	0.41	0.36	0.41	0.63	0.57	0.5	0.32	0.56	0.75	0.78	0.56	0.42
EAU84772	0.7	0.9	0.45	0.35	0.3	0.3	0.48	0.28	0.29	0.28	0.34	0.29	0.37	0.56	0.53	0.48	0.33	0.23	0.34	0.49	0.53	0.42	0.21	0.45	0.91	1.0	0.5	0.33
EAU85125	0.11	0.54	0.53	0.29	0.61	0.62	0.46	0.56	0.52	0.65	0.55	0.56	0.43	0.42	0.39	0.29	0.37	0.56	0.39	0.38	0.31	0.37	0.32	0.31	1.0	0.39	0.43	0.37
EAU85344	0.59	1.0	0.23	0.4	0.23	0.2	0.24	0.17	0.15	0.14	0.17	0.12	0.31	0.42	0.43	0.39	0.28	0.15	0.24	0.4	0.42	0.31	0.29	0.3	0.6	0.55	0.52	0.32
EAU85838	0.11	1.0	0.24	0.31	0.35	0.72	0.22	0.43	0.31	0.37	0.34	0.35	0.09	0.38	0.34	0.19	0.15	0.16	0.2	0.21	0.16	0.17	0.2	0.19	0.36	0.97	0.31	0.24
EAU85859	0.12	0.71	0.24	0.17	0.59	0.66	0.35	0.25	0.21	0.13	0.18	0.57	0.42	0.41	0.28	0.22	0.32	0.27	0.12	0.18	0.24	0.25	0.16	0.2	0.39	1.0	0.24	0.21
EAU85921	0.3	0.66	1.0	0.57	0.67	0.77	0.94	0.59	0.59	0.58	0.6	0.71	0.75	0.65	0.59	0.41	0.41	0.47	0.32	0.49	0.48	0.54	0.52	0.54	0.74	0.79	0.76	0.49
EAU85957	0.37	1.0	0.49	0.28	0.29	0.34	0.46	0.4	0.65	0.38	0.77	0.35	0.29	0.31	0.32	0.49	0.39	0.21	0.22	0.51	0.49	0.46	0.27	0.47	0.2	0.47	0.33	0.3
EAU85997	0.39	0.65	0.6	0.41	0.67	0.56	0.8	0.53	0.57	0.62	0.59	0.6	0.73	0.53	0.47	0.5	0.45	0.39	0.32	0.7	0.49	0.6	0.45	0.57	0.45	1.0	0.59	0.27
EAU86695	0.35	1.0	0.36	0.44	0.54	0.5	0.32	0.18	0.15	0.17	0.14	0.25	0.39	0.17	0.22	0.31	0.35	0.21	0.13	0.31	0.26	0.26	0.26	0.21	0.27	0.34	0.44	0.51
EAU86749	0.29	0.53	0.63	0.51	0.31	0.27	0.57	0.42	0.39	0.52	0.49	0.2	0.61	0.33	0.31	0.35	0.32	0.19	0.25	0.43	0.49	0.36	0.36	0.35	1.0	0.41	0.41	0.49
EAU86993	0.66	0.92	0.05	0.01	0.02	0.0	0.0	0.02	0.02	0.0	0.02	0.03	0.03	0.07	0.05	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01	0.16	1.0	0.02	0.02
EAU87449	0.22	0.33	1.0	0.38	0.62	0.5	0.65	0.31	0.19	0.33	0.18	0.38	0.92	0.06	0.06	0.74	0.53	0.54	0.73	0.58	0.77	0.52	0.23	0.58	0.04	0.31	0.08	0.24
EAU87648	0.26	0.47	0.39	0.35	0.45	0.4	0.36	0.38	0.47	0.37	0.51	0.49	0.34	0.41	0.4	0.49	0.34	0.28	0.44	0.42	0.47	0.4	0.33	0.4	0.51	1.0	0.36	0.31
EAU87661	0.11	0.63	0.06	0.04	0.06	0.06	1.0	0.03	0.07	0.05	0.04	0.1	0.09	0.13	0.14	0.04	0.01	0.03	0.01	0.06	0.03	0.03	0.07	0.03	0.29	0.35	0.31	0.09
EAU87867	0.12	0.82	0.16	0.24	0.14	0.18	0.25	0.12	0.15	0.14	0.17	0.13	0.38	0.43	0.37	0.26	0.31	0.09	0.2	0.35	0.29	0.23	0.2	0.19	0.77	1.0	0.48	0.18
EAU87921	0.29	0.52	0.73	0.53	0.43	0.37	0.65	0.43	0.48	0.45	0.48	0.42	0.47	0.7	0.61	0.63	0.57	0.61	0.96	0.72	0.5	0.57	0.37	0.58	0.83	1.0	0.78	0.43
EAU87949	0.26	0.5	0.99	0.32	0.38	0.37	0.36	0.98	0.47	0.43	0.91	0.22	0.46	0.33	0.33	0.98	0.38	0.52	0.82	0.74	1.0	0.77	0.42	0.71	0.18	0.19	0.25	0.16
EAU88177	0.1	0.56	0.25	0.12	0.22	0.22	0.35	0.22	0.22	0.16	0.2	0.13	0.4	0.42	0.39	0.22	0.12	0.2	0.26	0.25	0.25	0.18	0.18	0.24	1.0	0.42	0.51	0.06
EAU88507	0.46	0.82	1.0	0.56	0.52	0.54	0.68	0.64	0.67	0.42	0.76	0.49	0.6	0.49	0.54	0.61	0.56	0.37	0.52	0.68	0.63	0.67	0.54	0.71	0.37	0.57	0.48	0.36
EAU89342	0.47	0.63	0.24	0.19	0.31	0.17	0.4	0.51	0.66	0.4	1.0	0.39	0.53	0.41	0.34	0.5	0.36	0.77	0.31	0.57	0.3	0.35	0.34	0.36	0.48	0.36	0.33	0.13
EAU89437	0.77	0.57	0.51	0.33	0.25	0.27	0.49	0.23	0.27	0.22	0.29	0.18	0.56	0.46	0.42	0.45	0.31	0.8	0.46	0.46	0.53	0.37	0.28	0.42	1.0	0.75	0.46	0.27
EAU89778	0.08	0.41	1.0	0.34	0.25	0.3	0.92	0.82	0.72	0.69	0.7	0.23	0.66	0.35	0.33	0.6	0.41	0.54	0.76	0.63	0.65	0.55	0.31	0.62	0.49	0.62	0.5	0.3
EAU89972	0.46	0.68	0.71	0.33	0.4	0.58	0.46	0.56	0.71	0.36	1.0	0.36	0.38	0.5	0.48	0.8	0.46	0.54	0.61	0.63	0.62	0.64	0.59	0.53	0.57	0.2	0.42	0.14
EAU90322	0.15	0.62	1.0	0.55	0.63	0.61	0.86	0.49	0.43	0.55	0.51	0.55	0.77	0.51	0.47	0.6	0.58	0.3	0.56	0.64	0.54	0.57	0.29	0.57	0.51	0.87	0.58	0.43
EAU90367	0.45	0.87	0.68	0.51	0.46	0.32	0.47	0.7	0.47	0.53	0.56	0.33	0.61	0.76	0.7	0.5	0.35	0.32	0.27	0.52	0.52	0.39	0.37	0.38	1.0	0.59	0.84	0.33
EAU90425	0.85	0.62	1.0	0.25	0.39	0.26	0.47	0.91	0.29	0.4	0.45	0.21	0.63	0.33	0.3	0.72	0.36	0.38	0.4	0.65	0.59	0.45	0.36	0.42	0.37	0.4	0.93	0.14
EAU90429	0.42	0.64	0.98	0.54	0.57	0.56	0.77	0.67	0.59	0.67	0.62	0.59	0.57	0.59	0.55	0.54	0.47	0.56	0.69	0.58	0.6	0.56	0.5	0.6	1.0	0.66	0.66	0.59
EAU91184	0.2	0.62	0.38	0.22	0.21	0.17	0.34	0.35	0.27	0.31	0.34	0.16	0.36	0.35	0.33	0.42	0.35	0.34	0.39	0.44	0.46	0.43	0.21	0.42	1.0	0.59	0.3	0.17
EAU91257	0.02	0.42	0.3	0.25	0.16	0.23	0.32	0.21	0.21	0.28	0.27	0.17	0.22	0.31	0.32	0.36	0.38	0.2	0.52	0.39	0.45	0.4	0.18	0.42	1.0	0.4	0.25	0.31
EAU91283	0.18	0.43	0.2	0.21	0.18	0.12	0.2	0.13	0.22	0.24	0.24	0.2	0.32	0.24	0.21	0.17	0.14	0.16	0.13	0.21	0.24	0.17	0.08	0.19	0.29	1.0	0.2	0.26
EAU91417	1.0	0.66	0.69	0.36	0.46	0.52	0.51	0.85	0.56	0.47	0.48	0.31	0.54	0.64	0.54	0.64	0.43	0.32	0.75	0.54	0.6	0.48	0.3	0.56	0.88	0.45	0.84	0.13
EAU91702	0.52	0.83	0.84	0.48	0.63	0.65	0.86	0.64	0.59	0.48	0.68	0.49	0.7	0.69	0.72	0.73	0.59	0.36	0.5	0.8	0.96	0.75	0.45	0.74	0.99	1.0	0.72	0.35
EAU91964	0.39	0.72	0.47	0.43	0.33	0.22	0.7	0.53	0.76	0.56	0.78	0.28	0.99	0.92	0.77	0.66	0.56	0.61	0.71	0.76	0.67	0.53	0.31	0.56	0.12	0.39	1.0	0.37
EAU92412	0.19	0.44	0.35	0.13	0.34	0.2	0.24	0.44	0.32	0.33	0.27	0.18	0.34	0.23	0.21	0.24	0.13	1.0	0.11	0.21	0.21	0.17	0.14	0.18	0.27	0.31	0.4	0.07
EAU92573	0.7	1.0	0.86	0.54	0.56	0.42	0.67	0.34	0.35	0.42	0.36	0.27	0.81	0.38	0.35	0.65	0.59	0.27	0.23	0.65	0.66	0.58	0.28	0.56	0.52	0.58	0.62	0.37
EAU92578	0.11	0.41	0.13	0.25	0.44	0.53	0.4	0.12	0.11	0.12	0.11	0.4	0.38	0.24	0.23	0.23	0.27	0.28	0.16	0.29	0.26	0.34	0.08	0.27	1.0	0.65	0.23	0.51
EAU92600	0.88	0.52	1.0	0.4	0.6	0.59	0.74	0.74	0.63	0.61	0.69	0.38	0.98	0.53	0.47	0.45	0.44	0.29	0.29	0.58	0.55	0.54	0.42	0.54	0.36	0.32	0.76	0.29
EAU92662	0.36	1.0	0.25	0.17	0.23	0.17	0.18	0.1	0.1	0.1	0.11	0.13	0.29	0.47	0.45	0.2	0.14	0.1	0.09	0.17	0.23	0.16	0.08	0.17	0.82	0.95	0.52	0.11
EAU92714	0.71	0.84	0.47	0.49	0.87	1.0	0.61	0.56	0.51	0.53	0.54	0.61	0.51	0.54	0.59	0.75	0.65	0.63	0.36	0.59	0.52	0.67	0.54	0.61	0.43	0.84	0.61	0.52
EAU92878	0.43	0.69	0.85	0.46	0.77	1.0	0.84	0.46	0.53	0.52	0.58	0.76	0.71	0.74	0.68	0.38	0.4	0.39	0.37	0.48	0.36	0.49	0.36	0.49	0.73	0.98	0.64	0.56
EAU92886	0.33	1.0	0.1	0.26	0.09	0.08	0.11	0.07	0.1	0.06	0.26	0.14	0.07	0.07	0.09	0.1	0.34	0.07	0.12	0.11	0.07	0.14	0.14	0.09	0.33	0.7	0.05	0.16
EAU93003	0.11	0.52	0.84	0.57	0.65	0.6	0.77	0.5	0.52	0.5	0.55	0.7	0.76	0.61	0.57	0.61	0.59	0.44	0.44	0.67	0.62	0.63	0.44	0.63	1.0	0.94	0.62	0.39
EAU93031	0.15	0.42	0.72	0.47	0.54	0.66	0.71	0.58	0.41	0.56	0.4	0.45	1.0	0.56	0.48	0.54	0.56	0.37	0.29	0.59	0.54	0.59	0.28	0.51	0.32	0.37	0.83	0.35
EAU93278	0.32	0.78	0.59	0.49	0.89	0.58	0.55	0.39	0.42	0.5	0.43	0.68	0.77	0.82	0.69	0.52	0.53	0.42	0.49	0.47	0.47	0.47	0.38	0.34	1.0	0.39	0.78	0.42
EAU93324	0.45	0.83	0.73	0.27	0.15	0.2	0.57	0.16	0.44	0.26	0.41	0.3	0.38	0.54	0.51	0.26	0.24	0.16	0.28	0.44	0.37	0.39	0.24	0.39	1.0	0.67	0.46	0.23
EAU93335	0.15	0.61	0.5	0.5	0.67	0.54	0.69	0.66	0.84	0.6	1.0	0.69	0.89	0.69	0.61	0.32	0.26	0.42	0.31	0.46	0.41	0.43	0.37	0.46	0.61	0.77	0.74	0.11
EAU93350	0.32	1.0	0.3	0.12	0.15	0.36	0.26	0.12	0.11	0.13	0.11	0.23	0.19	0.39	0.42	0.12	0.21	0.11	0.15	0.19	0.13	0.16	0.3	0.15	0.4	0.68	0.36	0.11
EAU93453	0.62	0.75	0.87	0.34	0.55	0.38	1.0	0.51	0.4	0.28	0.5	0.45	0.67	0.39	0.37	0.58	0.41	0.41	0.36	0.62	0.59	0.49	0.21	0.54	0.86	0.55	0.45	0.23
EFI26579	0.21	0.69	0.29	0.18	0.19	0.23	0.34	0.4	0.27	0.39	0.27	0.15	0.27	0.54	0.42	0.36	0.25	0.3	0.36	0.29	0.35	0.28	0.18	0.3	0.42	1.0	0.59	0.21
EFI26697	0.31	0.66	0.33	0.32	0.31	0.32	0.23	0.2	0.23	0.17	0.25	0.27	0.3	0.25	0.2	0.18	0.12	0.13	0.2	0.24	0.15	0.18	0.19	0.18	0.44	1.0	0.29	0.24
EFI27054	0.14	0.24	1.0	0.37	0.18	0.12	0.64	0.67	0.48	0.55	0.5	0.11	0.62	0.51	0.46	0.15	0.11	0.12	0.06	0.13	0.19	0.1	0.41	0.17	0.49	0.23	0.9	0.24
EFI27173	0.46	0.91	1.0	0.6	0.66	0.48	0.83	0.42	0.6	0.38	0.73	0.62	0.92	0.68	0.63	0.81	0.67	0.38	0.79	0.83	0.97	0.79	0.37	0.91	0.51	0.72	0.9	0.46
EFI27376	0.15	0.44	0.87	0.42	0.59	0.57	0.83	0.62	0.79	0.5	0.84	0.65	0.57	0.58	0.6	0.46	0.43	0.41	0.44	0.55	0.51	0.53	0.49	0.55	0.48	1.0	0.61	0.34
EFI27401	0.5	0.74	1.0	0.49	0.49	0.43	0.9	0.48	0.64	0.47	0.68	0.51	0.52	0.59	0.54	0.54	0.44	0.4	0.55	0.55	0.58	0.54	0.47	0.57	0.86	0.91	0.68	0.48
EFI27681	0.2	0.56	1.0	0.49	0.64	0.56	0.83	0.65	0.72	0.52	0.86	0.58	0.65	0.5	0.45	0.63	0.53	0.48	0.67	0.68	0.63	0.68	0.38	0.68	0.39	0.67	0.53	0.35
EFI27996	0.01	1.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.01	0.01	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.02	0.54	0.0	0.0
EFI28064	0.43	1.0	0.24	0.26	0.16	0.1	0.38	0.25	0.43	0.25	0.39	0.2	0.66	0.6	0.5	0.34	0.32	0.72	0.35	0.34	0.23	0.29	0.26	0.3	0.34	0.68	0.45	0.23
EFI28065	0.62	1.0	0.19	0.19	0.26	0.18	0.34	0.32	0.49	0.34	0.53	0.3	0.56	0.43	0.41	0.27	0.26	0.43	0.1	0.29	0.14	0.17	0.24	0.18	0.38	0.65	0.29	0.12
EFI28557	0.56	0.8	0.72	0.55	0.76	0.8	0.67	0.74	0.72	0.75	0.76	0.69	0.68	0.79	0.71	0.49	0.4	0.29	0.31	0.57	0.51	0.66	0.66	0.55	0.98	1.0	0.8	0.59
EFI28703	0.25	0.77	0.94	0.32	0.44	0.39	0.67	0.66	0.8	0.54	1.0	0.49	0.42	0.63	0.56	0.49	0.39	0.43	0.64	0.54	0.63	0.57	0.48	0.63	0.98	0.9	0.63	0.2
EFI28770	0.35	0.43	0.1	0.11	0.08	0.11	0.26	0.16	0.06	0.13	0.08	0.03	0.12	0.84	0.72	0.02	0.03	0.16	0.03	0.05	0.04	0.06	0.07	0.05	0.61	0.34	1.0	0.12

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)