Heatmap: Cluster_112 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.11 0.08 0.05 0.14 0.31 0.28 0.1 0.49 0.54 0.74 0.72 0.3 0.21 0.09 0.13 0.49 0.39 1.0 0.99 0.69 0.74 0.58 0.08 0.69 0.13 0.18 0.09 0.37
0.21 0.07 0.08 0.1 0.49 0.39 0.11 0.07 0.13 0.03 0.0 0.43 0.28 0.04 0.06 0.24 0.11 0.39 0.0 0.2 0.0 0.19 0.0 0.04 0.08 1.0 0.0 0.2
0.06 0.14 0.26 0.27 0.17 0.14 0.42 0.13 0.23 0.24 0.25 0.18 0.45 0.29 0.28 0.61 0.65 0.31 1.0 0.76 0.61 0.7 0.13 0.68 0.11 0.39 0.22 0.38
0.04 0.02 0.1 0.18 0.06 0.03 0.08 0.13 0.12 0.13 0.14 0.07 0.08 0.03 0.02 0.46 0.53 0.07 0.39 0.49 0.53 0.48 0.04 0.46 0.03 1.0 0.04 0.18
0.07 0.3 0.48 0.37 0.17 0.27 0.56 0.3 0.46 0.31 0.6 0.16 0.75 0.4 0.38 0.74 0.6 0.85 1.0 0.86 0.98 0.75 0.5 0.9 0.28 0.68 0.36 0.38
0.25 0.01 0.18 0.42 0.18 0.11 0.31 0.18 0.29 0.28 0.35 0.22 0.52 0.03 0.02 1.0 0.72 0.15 0.57 0.83 0.78 0.73 0.11 0.74 0.03 0.88 0.05 0.44
0.02 0.04 0.06 0.22 0.06 0.08 0.05 0.1 0.07 0.09 0.11 0.07 0.07 0.04 0.04 0.08 0.13 0.1 0.17 0.11 0.12 0.13 0.07 0.11 0.09 1.0 0.04 0.17
0.04 0.19 0.42 0.29 0.17 0.14 0.29 0.19 0.43 0.13 0.61 0.21 0.17 0.42 0.45 0.86 0.48 0.48 0.84 0.78 1.0 0.82 0.84 0.94 0.06 0.14 0.63 0.38
0.03 0.07 0.39 0.2 0.29 0.18 0.31 0.32 0.59 0.3 0.65 0.46 0.23 0.3 0.28 0.6 0.5 0.38 0.61 1.0 0.59 0.83 0.45 0.8 0.04 0.24 0.36 0.31
0.03 0.33 0.21 0.19 0.53 0.3 0.3 0.28 0.92 0.36 0.91 1.0 0.27 0.28 0.29 0.24 0.25 0.38 0.17 0.4 0.17 0.27 0.41 0.29 0.06 0.64 0.3 0.32
0.36 0.51 0.67 0.44 0.4 0.34 0.74 0.36 0.38 0.43 0.39 0.35 0.66 0.5 0.5 0.72 0.84 0.33 0.48 0.9 0.81 0.94 0.55 0.89 0.37 1.0 0.6 0.44
0.16 0.43 0.71 0.45 0.8 0.83 0.71 0.58 0.63 0.52 0.7 0.6 0.54 0.45 0.48 0.84 0.77 0.78 0.76 0.93 1.0 0.86 0.46 0.82 0.76 0.89 0.59 0.49
0.11 0.25 0.48 0.38 0.41 0.36 0.49 0.39 0.55 0.46 0.67 0.42 0.41 0.4 0.36 0.97 0.83 0.77 1.0 0.93 0.79 0.85 0.26 0.91 0.17 0.42 0.4 0.4
0.05 0.13 0.69 0.39 0.77 0.52 0.64 0.42 0.71 0.44 0.7 0.81 0.53 0.48 0.49 0.9 0.73 0.78 1.0 0.93 0.88 0.84 0.48 0.82 0.21 0.74 0.52 0.57
0.59 0.08 0.34 0.23 0.18 0.21 0.41 0.38 0.5 0.3 0.51 0.26 0.2 0.36 0.42 0.85 0.59 0.54 0.98 0.94 0.79 0.72 0.77 1.0 0.12 0.21 0.48 0.52
0.03 0.03 0.28 0.17 0.11 0.09 0.23 0.25 0.64 0.28 0.81 0.15 0.09 0.12 0.11 0.59 0.55 0.26 1.0 0.7 0.68 0.9 0.18 0.92 0.02 0.03 0.13 0.24
0.16 0.04 0.93 0.24 0.68 0.73 0.95 0.54 0.21 1.0 0.23 0.69 0.57 0.12 0.09 0.42 0.79 0.37 0.29 0.73 0.65 0.67 0.34 0.68 0.02 0.89 0.23 0.51
0.05 0.3 0.49 0.41 0.47 0.43 0.52 0.4 0.62 0.41 0.64 0.55 0.38 0.43 0.42 0.83 0.75 0.35 0.88 0.93 0.95 0.93 0.51 1.0 0.11 0.22 0.45 0.72
0.12 0.08 0.52 0.16 0.48 0.36 0.51 0.35 0.63 0.38 0.63 0.62 0.43 0.22 0.26 0.53 0.43 0.81 0.56 0.55 0.41 0.55 0.33 0.52 0.32 1.0 0.3 0.2
0.03 0.08 0.25 0.12 0.23 0.19 0.19 0.22 0.23 0.14 0.32 0.23 0.18 0.2 0.22 0.41 0.26 1.0 0.73 0.37 0.34 0.39 0.23 0.32 0.12 0.23 0.17 0.11
0.04 0.24 0.36 0.28 0.31 0.29 0.48 0.32 0.46 0.35 0.52 0.25 0.32 0.37 0.36 1.0 0.58 1.0 0.51 0.88 1.0 1.0 0.22 0.8 0.21 0.99 0.38 0.65
0.03 0.1 0.29 0.23 0.54 0.81 0.18 0.15 0.19 0.08 0.23 0.49 0.14 0.11 0.12 0.39 0.38 0.1 0.43 0.3 0.2 0.34 0.27 0.35 0.04 1.0 0.11 0.16
0.17 0.1 0.21 0.41 0.32 0.35 0.31 0.45 0.7 0.73 0.9 0.37 0.29 0.19 0.22 0.35 0.33 0.58 0.22 0.38 0.27 0.51 0.2 0.37 0.24 1.0 0.14 0.61
0.11 0.09 0.4 0.13 0.26 0.16 0.22 0.3 0.67 0.35 0.61 0.35 0.25 0.25 0.25 0.5 0.5 1.0 0.9 0.57 0.57 0.55 0.41 0.63 0.02 0.05 0.24 0.13
0.13 0.15 0.3 0.2 0.24 1.0 0.35 0.09 0.18 0.15 0.21 0.22 0.29 0.4 0.34 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.02 0.01 0.27 0.01 0.09 0.44 0.28 0.0
0.09 0.14 0.26 0.28 0.33 0.49 0.34 0.19 0.28 0.14 0.32 0.34 0.18 0.19 0.21 0.55 0.6 0.15 0.69 0.47 0.36 0.51 0.24 0.58 0.09 1.0 0.15 0.4
0.02 0.1 0.46 0.14 0.2 0.11 0.36 0.12 0.33 0.18 0.32 0.3 0.23 0.32 0.27 0.37 0.53 0.23 0.47 1.0 0.29 0.51 0.31 0.69 0.1 0.74 0.35 0.32
0.01 0.14 0.41 0.29 0.21 0.18 0.39 0.67 0.72 0.61 0.68 0.17 0.52 0.26 0.29 0.74 0.51 0.65 0.79 0.99 1.0 0.91 0.42 0.94 0.05 0.33 0.32 0.47
0.05 0.22 0.2 0.17 0.15 0.1 0.23 0.18 0.35 0.22 0.43 0.25 0.2 0.19 0.19 0.51 0.45 0.91 1.0 0.47 0.51 0.48 0.23 0.48 0.04 0.22 0.18 0.18
0.01 0.04 0.3 0.1 0.24 0.24 0.22 0.53 0.66 0.78 0.89 0.25 0.32 0.1 0.09 0.61 0.61 1.0 0.67 0.79 1.0 0.91 0.15 0.92 0.01 0.03 0.19 0.18
0.03 0.05 0.26 0.22 0.19 0.3 0.14 0.25 0.27 0.38 0.26 0.15 0.22 0.17 0.12 0.52 0.42 0.44 0.41 1.0 0.48 0.71 0.11 0.65 0.04 0.44 0.24 0.52
0.02 0.04 0.07 0.08 0.41 0.32 0.68 0.09 0.19 0.22 0.28 0.88 0.42 0.13 0.11 0.07 0.07 0.9 0.04 0.2 0.02 0.07 0.05 0.09 0.03 1.0 0.11 0.07
0.1 0.48 0.75 0.52 0.62 0.62 0.86 0.35 0.52 0.48 0.64 0.61 0.54 0.41 0.39 0.81 0.7 0.49 0.96 0.79 0.71 0.73 0.38 0.81 0.37 1.0 0.48 0.57
0.46 0.11 0.69 0.25 0.66 0.63 0.43 0.7 0.75 0.75 0.8 0.75 0.4 0.13 0.17 0.52 0.52 1.0 0.44 0.68 0.49 0.67 0.95 0.59 0.05 0.59 0.26 0.32
0.33 0.23 0.66 0.7 0.6 0.64 0.83 0.52 0.33 0.44 0.4 0.34 0.75 0.26 0.24 1.0 0.92 0.42 0.81 0.89 0.8 0.87 0.44 0.85 0.07 0.59 0.5 0.71
0.01 0.02 0.35 0.19 0.55 0.44 0.47 0.35 0.73 0.82 0.72 0.87 0.59 0.07 0.08 0.17 0.19 0.46 0.11 0.34 0.2 0.28 0.38 0.3 0.02 1.0 0.18 0.38
0.05 0.17 0.3 0.15 0.19 0.17 0.19 0.35 0.46 0.21 0.56 0.14 0.18 0.19 0.21 0.49 0.41 1.0 0.67 0.54 0.55 0.52 0.31 0.57 0.33 0.18 0.2 0.18
0.07 0.05 0.42 0.18 0.53 0.27 0.42 0.31 0.7 0.28 0.75 0.7 0.21 0.38 0.43 0.88 0.87 0.45 1.0 0.89 0.63 0.85 0.52 0.9 0.01 0.04 0.41 0.36
0.03 0.24 0.97 0.23 0.45 0.44 1.0 0.36 0.68 0.5 0.75 0.55 0.52 0.5 0.36 0.27 0.5 0.44 0.23 0.44 0.38 0.64 0.38 0.49 0.09 0.88 0.35 0.85
0.53 0.34 0.72 0.53 0.68 0.75 0.61 0.69 0.85 0.7 0.86 0.84 0.56 0.5 0.46 0.67 0.67 0.65 0.25 0.71 0.46 0.62 0.8 0.56 0.29 1.0 0.81 0.63
0.04 0.08 0.47 0.28 0.48 0.24 0.43 0.17 0.59 0.21 0.64 0.74 0.34 0.4 0.35 0.75 0.75 0.97 1.0 0.72 0.69 0.75 0.46 0.85 0.06 0.17 0.34 0.31
0.3 0.04 0.21 0.07 0.03 0.02 0.08 0.04 0.01 0.03 0.03 0.02 0.14 0.05 0.04 0.33 0.14 0.22 0.35 0.9 0.29 0.22 0.39 0.34 0.07 1.0 0.32 0.43
0.01 0.19 0.44 0.36 0.82 0.51 0.56 0.41 0.78 0.81 0.77 1.0 0.64 0.43 0.4 0.62 0.37 0.64 0.65 0.54 0.27 0.44 0.42 0.39 0.15 0.91 0.43 0.42
0.08 0.15 0.43 0.4 0.52 0.64 0.51 0.52 0.48 0.48 0.53 0.46 0.47 0.42 0.4 0.87 0.54 0.64 0.87 0.88 1.0 0.79 0.29 0.87 0.33 0.45 0.38 0.23
0.04 0.14 0.4 0.22 0.19 0.15 0.16 0.09 0.22 0.16 0.22 0.25 0.17 0.45 0.39 0.42 0.31 0.46 0.43 1.0 0.43 0.46 0.56 0.54 0.11 0.26 0.55 0.41
0.13 0.05 0.31 0.17 0.36 0.34 0.41 0.26 0.33 0.27 0.45 0.27 0.27 0.13 0.12 0.38 0.46 0.15 0.36 0.41 0.48 0.55 0.15 0.6 0.07 1.0 0.2 0.58
0.53 0.22 0.44 0.36 0.6 0.44 0.35 0.46 0.81 0.49 1.0 0.53 0.19 0.35 0.37 0.72 0.54 0.28 0.3 0.83 0.7 0.69 0.64 0.59 0.08 0.14 0.43 0.3
0.08 0.07 0.41 0.29 0.62 0.84 0.36 0.39 0.28 0.47 0.27 0.52 0.2 0.16 0.17 1.0 0.65 0.64 0.84 0.65 0.64 0.81 0.33 0.64 0.05 0.24 0.16 0.23
0.01 0.01 0.04 0.15 0.05 0.09 0.04 0.02 0.08 0.05 0.02 0.06 0.03 0.05 0.05 0.71 0.92 0.0 0.56 0.6 1.0 0.82 0.06 0.61 0.03 0.76 0.08 0.69
0.54 0.59 0.39 0.34 0.6 0.84 0.89 0.5 0.55 0.61 0.71 0.91 0.67 0.58 0.51 0.35 0.41 0.23 0.15 0.35 0.24 0.35 0.49 0.27 0.19 1.0 0.65 0.45
0.04 0.06 0.2 0.07 0.15 0.18 0.24 0.13 0.18 0.38 0.26 0.16 0.23 0.12 0.15 0.25 0.15 0.54 0.48 1.0 0.26 0.26 0.48 0.4 0.09 0.66 0.32 0.36

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)