Heatmap: Cluster_133 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.04 0.04 0.25 0.06 0.02 0.0 0.04 0.34 0.28 0.32 0.23 0.02 0.05 0.47 0.31 0.29 0.16 0.23 0.31 1.0 0.28 0.4 0.15 0.54 0.14 0.68 0.78 0.07
0.09 0.13 0.75 0.35 0.47 0.35 0.51 0.4 0.42 0.37 0.47 0.45 0.5 0.68 0.52 0.42 0.36 0.59 0.29 0.72 0.42 0.56 0.52 0.57 0.12 0.4 1.0 0.62
0.33 0.13 0.81 0.19 0.47 0.44 0.65 0.59 0.72 0.35 0.64 0.49 0.61 0.92 0.59 0.39 0.45 0.96 0.27 0.51 0.47 0.5 0.37 0.59 0.09 0.47 1.0 0.57
0.03 0.84 0.12 0.05 0.01 0.01 0.15 0.11 0.07 0.22 0.03 0.01 0.02 0.38 0.33 0.12 0.06 0.22 1.0 0.46 0.13 0.29 0.27 0.39 0.67 0.0 0.38 0.06
0.36 0.29 0.32 0.15 0.25 0.33 0.37 0.24 0.23 0.43 0.35 0.29 0.29 0.15 0.2 0.34 0.25 1.0 0.52 0.61 0.32 0.35 0.59 0.37 0.44 0.34 0.24 0.22
0.04 0.51 0.84 0.36 0.58 0.48 0.83 0.85 0.89 0.75 1.0 0.62 0.66 0.72 0.74 0.66 0.76 0.72 0.56 0.82 0.76 0.86 0.54 0.96 0.17 0.4 0.73 0.41
0.29 0.07 1.0 0.17 0.45 0.43 0.57 0.49 0.45 0.37 0.49 0.42 0.42 0.13 0.13 0.66 0.54 0.19 0.53 0.76 0.67 0.75 0.26 0.7 0.1 0.23 0.22 0.15
0.12 0.07 0.67 0.35 0.45 0.75 0.51 0.5 0.93 0.52 1.0 0.66 0.48 0.39 0.33 0.6 0.81 0.36 0.39 0.98 0.55 0.84 0.58 0.82 0.03 0.37 0.46 0.44
0.55 0.18 1.0 0.29 0.21 0.08 0.6 0.2 0.24 0.24 0.23 0.09 0.37 0.35 0.35 0.6 0.41 0.39 0.85 0.65 0.59 0.61 0.72 0.66 0.24 0.72 0.51 0.41
0.21 0.22 0.78 0.35 0.57 0.52 0.73 0.62 0.5 1.0 0.65 0.4 0.59 0.6 0.62 0.59 0.49 0.57 0.85 0.61 0.58 0.6 0.29 0.6 0.67 0.65 0.53 0.43
0.19 0.46 0.72 0.28 0.42 0.28 0.59 0.63 0.7 0.57 1.0 0.69 0.5 0.38 0.35 0.7 0.72 0.32 0.33 0.7 0.59 0.94 0.49 0.75 0.37 0.6 0.48 0.24
0.34 0.45 0.34 0.26 0.48 0.46 0.35 0.34 0.69 0.3 0.8 0.64 0.26 0.38 0.42 0.34 0.4 0.33 0.27 0.41 0.29 0.47 0.54 0.43 1.0 0.72 0.33 0.44
0.14 0.36 0.38 0.34 0.41 0.48 0.47 0.39 0.93 0.35 0.9 0.83 0.57 0.42 0.53 0.85 0.97 0.44 0.57 0.71 0.69 0.86 1.0 0.84 0.23 0.91 0.36 0.47
0.4 0.59 0.31 0.33 0.46 0.45 0.3 0.42 0.48 0.39 0.54 0.59 0.2 0.49 0.55 0.38 0.38 0.32 0.69 0.42 0.39 0.42 0.56 0.44 0.78 1.0 0.4 0.44
0.54 0.46 0.9 0.51 0.69 0.79 0.79 0.71 0.93 0.64 1.0 0.89 0.57 0.76 0.71 0.61 0.62 0.46 0.76 0.77 0.56 0.82 0.69 0.73 0.46 0.65 0.7 0.58
0.23 0.22 0.42 0.32 0.36 0.41 0.44 0.43 0.52 0.38 0.47 0.42 0.32 0.5 0.44 0.36 0.39 1.0 0.7 0.44 0.42 0.41 0.53 0.4 0.29 0.48 0.45 0.32
0.08 0.2 0.46 0.28 0.38 0.56 0.75 0.42 0.63 0.29 0.63 0.46 0.44 0.38 0.44 0.41 0.58 1.0 0.67 0.49 0.47 0.53 0.8 0.5 0.09 0.21 0.33 0.32
0.1 0.43 0.13 0.26 0.3 0.21 0.18 0.3 0.43 0.37 0.46 0.48 0.19 0.41 0.5 0.25 0.24 0.26 0.34 0.25 0.14 0.22 0.33 0.24 0.39 1.0 0.3 0.26
0.11 0.15 0.5 0.35 0.71 0.66 0.55 0.4 0.81 0.45 0.83 1.0 0.43 0.37 0.45 0.74 0.54 0.73 0.54 0.7 0.58 0.62 0.73 0.65 0.44 0.58 0.36 0.61
0.06 0.26 0.23 0.2 0.21 0.29 0.24 0.18 0.28 0.17 0.26 0.33 0.33 0.39 0.35 0.19 0.19 1.0 0.5 0.24 0.16 0.27 0.16 0.19 0.26 0.48 0.38 0.13
0.48 0.49 0.37 0.24 0.3 0.55 0.34 0.57 0.36 0.37 0.57 0.3 0.32 0.5 0.49 0.35 0.48 0.34 0.56 0.44 0.41 0.61 0.45 0.5 1.0 0.74 0.4 0.32
0.2 0.23 0.46 0.26 0.47 1.0 0.39 0.47 0.33 0.38 0.38 0.35 0.23 0.34 0.33 0.47 0.5 0.38 0.85 0.54 0.44 0.51 0.29 0.5 0.28 0.38 0.38 0.36
0.44 0.13 0.66 0.32 0.34 0.21 0.52 0.51 0.75 0.63 0.78 0.58 0.33 1.0 1.0 0.6 0.54 0.63 0.74 0.79 0.78 0.73 0.44 0.87 0.14 0.36 0.87 0.52
0.07 0.17 0.43 0.38 0.37 0.37 0.57 0.31 0.72 0.21 1.0 0.48 0.32 0.5 0.48 0.73 0.83 0.48 0.99 0.58 0.59 0.6 0.64 0.68 0.55 0.44 0.56 0.47
0.34 0.06 0.41 0.35 0.46 0.42 0.48 0.46 0.55 0.4 0.57 0.64 0.42 0.49 0.54 0.27 0.34 0.44 0.2 0.26 0.18 0.36 0.61 0.3 1.0 0.48 0.54 0.36
0.08 0.13 0.83 0.28 0.62 0.61 0.61 0.45 1.0 0.55 0.94 0.65 0.43 0.46 0.46 0.67 0.69 0.51 0.36 0.86 0.73 0.9 0.69 0.9 0.08 0.68 0.54 0.49
0.41 0.26 1.0 0.1 0.31 0.32 0.37 0.33 0.74 0.17 0.99 0.48 0.19 0.4 0.32 0.13 0.23 0.21 0.22 0.3 0.18 0.35 0.56 0.31 0.05 0.11 0.34 0.11
0.25 0.19 0.33 0.31 0.44 0.27 0.44 0.24 0.66 0.25 0.62 0.59 0.28 0.49 0.54 0.6 0.64 1.0 0.89 0.75 0.67 0.71 0.83 0.64 0.3 0.73 0.36 0.67
0.22 0.63 0.52 0.58 0.76 0.85 0.65 0.52 0.65 0.77 0.7 0.87 0.63 0.72 0.65 0.41 0.56 0.64 1.0 0.52 0.4 0.58 0.6 0.51 0.61 0.68 0.54 0.93
0.15 0.41 0.2 0.17 0.28 0.24 0.29 0.2 0.26 0.24 0.25 0.31 0.22 0.3 0.35 0.22 0.22 1.0 0.54 0.25 0.16 0.25 0.41 0.25 0.22 0.38 0.45 0.25
0.52 0.58 0.72 0.37 0.69 0.64 0.61 0.62 1.0 0.54 0.98 0.9 0.64 0.62 0.6 0.56 0.44 0.93 0.95 0.67 0.49 0.65 0.71 0.69 0.71 0.69 0.66 0.41
0.33 0.83 0.8 0.39 0.55 0.49 0.8 0.68 0.74 0.78 0.96 0.52 0.86 0.69 0.61 0.61 0.64 0.77 0.54 0.72 1.0 0.73 0.56 0.69 0.27 0.8 0.71 0.48
0.26 0.37 0.5 0.45 0.6 0.73 0.54 0.44 0.66 0.37 0.68 0.71 0.39 0.61 0.65 0.54 0.53 1.0 0.82 0.57 0.46 0.62 0.81 0.55 0.33 0.38 0.54 0.53
0.07 0.34 0.4 0.24 0.43 0.35 0.23 0.56 0.73 0.6 0.76 0.44 0.14 0.59 0.52 0.77 0.55 0.91 0.6 1.0 0.88 0.9 0.45 0.96 0.45 0.35 0.64 0.61
0.01 0.04 0.24 0.17 0.17 0.1 0.18 0.21 0.33 0.21 0.36 0.15 0.14 0.33 0.27 0.29 0.22 1.0 0.37 0.64 0.31 0.39 0.19 0.39 0.04 0.08 0.36 0.53
0.0 0.06 0.18 0.18 0.14 0.05 0.13 0.24 0.16 0.34 0.4 0.18 0.04 0.23 0.13 0.26 0.11 1.0 0.24 0.43 0.29 0.49 0.16 0.24 0.16 0.22 0.37 0.38
0.0 0.08 0.36 0.19 0.24 0.15 0.15 0.27 0.33 0.25 0.31 0.25 0.17 0.2 0.17 0.26 0.18 1.0 0.2 0.57 0.28 0.39 0.15 0.34 0.05 0.12 0.22 0.39
0.15 0.18 0.99 0.32 0.37 0.26 1.0 0.43 0.72 0.39 0.81 0.43 0.38 0.58 0.54 0.39 0.39 0.32 0.32 0.6 0.5 0.62 0.61 0.61 0.12 0.21 0.48 0.47
0.34 0.37 0.83 0.35 0.54 0.46 0.67 0.44 0.62 0.55 0.7 0.69 0.37 0.41 0.44 0.6 0.82 0.4 0.68 0.93 0.56 1.0 0.44 0.8 0.45 0.53 0.44 0.36
0.24 0.55 0.74 0.5 0.6 0.88 0.72 0.6 0.78 0.64 0.82 0.68 0.44 0.48 0.45 0.77 0.88 0.38 1.0 0.69 0.56 0.75 0.52 0.69 0.62 0.58 0.4 0.58
0.33 0.37 0.46 0.61 0.79 0.81 0.48 0.53 0.79 0.57 0.86 1.0 0.47 0.82 0.86 0.69 0.66 0.48 0.97 0.76 0.68 0.7 0.87 0.72 0.37 0.71 0.67 0.72
0.23 0.4 0.83 0.45 0.68 1.0 0.7 0.85 0.78 0.8 0.76 0.64 0.53 0.68 0.62 0.7 0.73 0.6 0.66 0.84 0.71 0.77 0.66 0.79 0.2 0.52 0.81 0.57
0.52 0.36 1.0 0.75 0.88 0.82 0.81 0.68 0.78 0.74 0.9 0.76 0.76 0.69 0.64 0.63 0.78 0.77 0.68 0.88 0.73 0.92 0.61 0.88 0.92 0.85 0.77 0.72
0.12 0.18 0.85 0.38 0.32 0.11 0.74 0.49 1.0 0.4 0.96 0.49 0.35 0.43 0.46 0.56 0.44 0.35 0.71 0.76 0.67 0.78 0.59 0.78 0.16 0.29 0.47 0.42
0.1 0.2 0.5 0.31 0.56 0.49 0.57 0.49 0.41 0.42 0.48 0.42 0.4 0.62 0.5 0.57 0.47 0.51 0.27 0.61 0.51 0.57 0.39 0.54 0.22 0.37 1.0 0.48
0.21 0.18 0.65 0.49 0.64 0.73 0.6 0.44 0.6 0.43 0.57 0.57 0.19 0.8 0.66 0.7 0.41 0.28 0.31 0.75 0.57 0.66 0.48 0.53 1.0 0.83 0.8 0.66
0.18 0.59 0.46 0.46 0.75 0.81 0.5 0.71 0.55 0.71 0.6 0.61 0.55 0.6 0.59 0.57 0.56 0.52 1.0 0.6 0.58 0.53 0.57 0.53 0.4 0.77 0.61 0.57
0.12 0.47 0.55 0.35 0.49 0.44 0.59 0.42 0.57 0.51 0.6 0.61 0.4 0.56 0.57 0.59 0.55 0.91 0.76 0.68 0.51 0.67 0.49 0.61 0.62 1.0 0.66 0.55
0.18 0.14 0.74 0.13 0.66 0.61 0.72 0.53 0.68 0.65 0.74 0.66 0.83 0.36 0.34 0.27 0.26 1.0 0.94 0.59 0.33 0.59 0.37 0.58 0.08 0.21 0.32 0.07
0.46 0.57 0.11 0.28 0.3 0.34 0.11 0.34 0.31 0.35 0.33 0.33 0.14 0.44 0.46 0.22 0.26 0.73 0.91 0.21 0.17 0.24 0.36 0.24 1.0 0.51 0.29 0.29
0.01 0.08 0.94 0.3 0.57 0.51 0.34 0.73 0.73 0.86 0.86 0.73 0.41 0.81 0.79 0.56 0.31 0.85 0.43 0.85 0.56 0.53 0.39 0.53 0.26 0.97 0.9 1.0
0.06 0.05 0.49 0.22 0.33 0.41 0.24 0.38 0.52 0.43 0.62 0.39 0.23 0.64 0.55 0.48 0.34 1.0 0.52 0.9 0.53 0.62 0.54 0.6 0.09 0.39 0.72 0.38
0.13 0.45 0.44 0.4 0.69 0.68 0.42 0.41 0.62 0.47 0.64 0.87 0.41 0.63 0.64 0.5 0.4 0.69 1.0 0.54 0.56 0.55 0.6 0.53 0.34 0.73 0.53 0.44
0.23 0.38 0.6 0.34 0.4 0.43 0.6 0.56 0.65 0.44 0.74 0.41 0.85 0.5 0.64 0.57 0.59 0.9 0.97 0.89 0.9 1.0 0.56 0.88 0.21 0.42 0.74 0.22
0.06 0.35 0.35 0.05 0.01 0.03 0.42 0.31 0.2 0.35 0.32 0.04 0.22 0.51 0.46 0.2 0.31 1.0 0.34 0.3 0.27 0.33 0.32 0.28 0.13 0.24 0.33 0.02
0.24 0.43 0.89 0.56 1.0 0.78 0.85 0.61 0.67 0.54 0.79 0.99 0.71 0.58 0.55 0.92 0.8 0.59 0.88 0.87 0.82 0.86 0.63 0.83 0.37 0.59 0.64 0.7
0.21 0.4 0.12 0.09 0.12 0.28 0.22 0.17 0.2 0.19 0.15 0.11 0.11 0.1 0.1 0.18 0.18 1.0 0.72 0.17 0.09 0.16 0.19 0.15 0.17 0.17 0.12 0.11
0.43 0.68 0.25 0.49 0.4 0.55 0.46 0.49 0.41 0.46 0.42 0.38 0.42 0.77 0.79 0.4 0.54 1.0 0.87 0.39 0.35 0.52 0.97 0.39 0.91 0.59 0.66 0.61
0.09 0.27 0.53 0.37 0.93 0.62 0.55 0.44 0.73 0.43 0.77 1.0 0.49 0.64 0.63 0.53 0.7 0.62 0.87 0.69 0.53 0.82 0.47 0.84 0.22 0.43 0.64 0.52
0.24 0.13 0.49 0.24 0.52 0.37 0.57 0.29 0.45 0.3 0.43 0.62 0.48 0.53 0.56 0.51 0.5 1.0 0.72 0.53 0.44 0.53 0.64 0.53 0.16 0.56 0.41 0.36
0.07 0.23 0.19 0.26 0.26 0.2 0.22 0.2 0.39 0.15 0.43 0.41 0.17 0.51 0.56 0.35 0.37 1.0 0.54 0.48 0.39 0.56 0.4 0.46 0.16 0.35 0.32 0.44
0.27 0.31 0.1 0.06 0.15 0.2 0.17 0.14 0.15 0.26 0.15 0.19 0.14 0.22 0.19 0.16 0.13 1.0 0.48 0.11 0.09 0.13 0.21 0.1 0.35 0.31 0.22 0.04
0.2 0.18 0.54 0.16 0.32 0.26 0.65 0.4 0.43 0.53 0.41 0.25 0.72 0.47 0.49 0.43 0.36 1.0 0.27 0.49 0.48 0.5 0.44 0.44 0.36 0.58 0.45 0.31

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)