Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log₂ transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene	FB cap+lamellae,YMG,strain #326	FB stipe,YMG,strain #326	Hyphal knots,control,strain #326	Mycelium	Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h	Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h	Mycelium,LiCl,strain #326	Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO	Mycelium,control,20C,matA/matB KO	Mycelium,control,28C,8h	Mycelium,control,strain #326	Stg 1 primordium,YMG,strain #326	Stg 2 primordium,YMG,strain #326	Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130	Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130	Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO	Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130	Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130	Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130	Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130	Vegetative mycelium,YMG,strain #326	Mycelium,control,YMG,37C,strain #130	YFB cap,YMG,strain #326	YFB lamellae,YMG,strain #326	secondary hyphal knots,YMG,strain #326	strain #130
EAU81475	-4.27	0.82	0.76	-0.34	-0.46	-0.77	-0.0	-0.76	-0.06	-0.08	0.02	-0.39	-0.27	0.57	0.34	-0.11	-0.62	-1.36	-0.71	0.24	0.07	0.07	-1.02	-0.06	1.25	0.63	0.6	-0.33
EAU81505	-2.39	0.53	0.66	0.18	-0.74	-0.79	0.29	-1.05	-0.67	-1.11	-0.1	-0.25	0.38	-0.51	-0.42	-0.05	0.03	-0.29	0.59	0.29	0.17	0.13	-0.82	0.41	0.19	1.56	-0.69	-0.3
EAU81510	-1.3	1.7	0.1	-1.7	-0.21	0.72	0.04	-0.34	-0.09	-0.39	0.12	-0.09	-0.58	0.41	0.13	0.04	0.31	-0.65	-0.16	0.02	-0.35	0.13	-0.43	0.1	-1.15	0.88	-0.67	-1.42
EAU82454	-1.87	1.41	-0.26	-0.14	-0.69	-0.94	-0.44	-1.87	0.07	-1.06	0.06	-0.28	-0.65	1.3	1.22	-1.21	-0.52	0.31	-1.27	-0.27	-1.16	-0.6	-0.75	-0.73	0.76	0.96	0.4	0.54
EAU83508	-0.29	0.72	0.63	-0.11	-0.13	-1.13	0.63	-1.23	0.94	-1.23	0.57	0.49	-0.03	0.1	0.06	0.12	-0.05	-0.83	-0.63	0.08	-0.34	0.24	-0.74	0.19	-0.23	-0.38	-0.1	-0.3
EAU84321	-1.5	0.37	0.2	-0.33	0.19	0.11	-0.03	0.08	0.18	-0.41	0.41	0.31	-0.2	0.3	0.21	-0.07	-0.14	-0.64	0.25	0.21	0.11	0.2	-0.44	0.31	-0.39	-0.14	0.08	-0.63
EAU84352	-1.22	1.18	0.67	-0.79	-0.11	-0.19	0.41	-0.54	-0.71	-0.37	-0.7	-0.35	0.44	-0.91	-1.13	-0.09	-0.23	-0.25	0.19	0.21	-0.13	0.01	-0.71	0.02	1.15	1.16	-0.86	-0.5
EAU84585	-2.52	1.14	0.72	-0.37	-0.06	-0.25	0.21	-1.06	-0.09	-0.6	0.15	0.07	-0.44	0.23	0.14	0.09	-0.21	-0.8	-0.19	0.32	-0.02	0.28	-0.76	0.12	-0.05	0.74	-0.16	-0.05
EAU84753	-1.66	-0.01	0.98	-0.55	0.04	-0.05	0.5	-0.65	0.28	-0.22	0.33	0.24	0.33	0.4	0.42	-0.34	-0.23	-0.57	-1.05	0.15	-0.15	0.18	-0.42	0.0	0.03	-0.41	0.46	-0.47
EAU84812	-1.11	-0.51	1.16	-0.79	0.12	-0.12	0.43	-0.13	-0.07	-0.26	0.08	0.01	-0.33	0.76	0.4	-0.26	-0.51	-0.17	-0.26	0.09	-0.22	0.03	-0.42	-0.26	-0.69	0.45	0.98	-1.48
EAU85250	-2.42	1.27	0.23	-0.79	0.09	-0.01	-0.1	-0.29	0.18	-0.09	0.31	0.36	-0.44	0.36	0.2	-0.43	-0.59	0.62	-0.15	-0.41	-0.45	-0.28	0.09	-0.57	0.21	0.26	0.04	-0.3
EAU85370	-1.7	-0.19	0.46	-0.05	0.59	0.96	0.72	-0.72	0.17	-0.83	0.3	0.53	-0.09	0.0	-0.17	0.07	0.05	0.09	-0.8	0.09	-0.38	-0.17	-1.26	0.03	-0.76	-0.09	0.28	-0.06
EAU85998	-2.89	0.48	1.22	-0.5	-0.03	-0.85	0.1	0.28	0.31	0.13	0.43	-0.57	-0.47	-0.15	-0.2	-0.51	-1.07	-0.88	-0.24	0.16	-0.08	0.1	-0.88	-0.31	1.24	1.12	-0.5	-1.14
EAU87532	-1.51	1.5	-0.72	-0.49	-0.18	-0.7	-0.38	-0.92	-0.03	-0.49	0.26	0.27	-0.44	1.01	1.15	-0.03	-0.15	-0.48	-0.32	-0.28	-0.26	-0.25	0.17	-0.17	-0.78	0.06	0.42	-0.37
EAU87611	-1.22	0.98	0.97	-0.22	-0.31	-0.75	0.5	-0.92	-0.17	-0.52	-0.1	-0.23	0.17	-0.15	-0.2	0.01	-0.35	-0.89	-0.33	0.1	0.13	-0.1	-0.77	-0.05	0.85	0.7	0.24	-0.34
EAU87793	-0.88	1.36	0.25	-0.11	0.02	-0.79	-0.65	-1.3	0.09	-0.18	0.33	0.18	-0.34	0.43	0.45	-0.46	-0.15	0.06	-0.53	-0.57	-0.2	-0.5	-1.52	-0.87	-1.06	1.63	-0.25	0.44
EAU88108	-2.78	0.37	0.65	-0.72	-0.08	-0.57	0.74	-0.36	0.48	0.08	0.56	0.09	0.41	0.29	0.17	-0.41	-0.36	-1.05	-1.12	-0.23	-0.46	-0.29	-0.49	-0.27	0.69	0.94	0.3	-1.11
EAU88129	-1.5	0.87	-0.02	0.02	-0.26	0.21	-0.36	-0.38	-0.53	-0.47	-0.48	-0.65	-0.37	0.1	0.2	0.43	0.16	-0.63	-0.08	0.62	0.59	0.36	-0.58	0.29	-0.08	0.45	-0.13	0.02
EAU88241	-1.33	1.42	1.16	-0.66	0.44	-0.41	-0.19	-0.46	0.26	0.74	0.33	0.13	0.67	0.11	-0.15	-0.67	-0.91	-1.26	-2.21	-0.07	-0.92	-0.82	-1.63	-0.76	-0.13	1.26	0.13	-1.29
EAU88339	-1.35	1.07	-0.33	-0.37	0.01	0.04	-0.38	-0.11	0.12	-0.12	0.27	0.29	-0.48	0.57	0.49	-0.48	-0.61	-0.45	-0.68	-0.03	-0.49	0.04	-0.17	-0.29	0.68	0.6	0.02	-0.16
EAU88377	-1.53	-0.26	0.91	-0.55	-0.04	-0.53	0.39	-0.46	0.27	-0.22	0.39	0.26	-0.21	0.26	0.1	-0.01	-0.18	-0.26	0.26	0.2	0.07	0.19	-0.49	0.23	-0.12	0.17	0.11	-0.77
EAU88578	-2.48	0.22	-0.14	0.01	0.26	0.16	0.0	-0.38	0.37	0.12	0.53	0.48	-0.17	0.24	0.09	-0.13	-0.13	-0.72	-0.19	0.12	-0.35	0.19	-0.51	0.11	-0.15	0.03	-0.04	0.4
EAU88711	-2.05	0.01	-0.02	-0.08	-0.36	-0.76	0.18	-0.41	0.39	-0.15	0.35	-0.06	-0.24	-0.13	-0.12	0.19	-0.11	-0.9	0.69	0.32	0.45	0.12	-0.24	0.27	0.01	0.5	-0.28	0.29
EAU88724	0.52	1.25	0.41	-0.5	-0.47	-0.76	0.05	-0.26	0.23	0.08	0.57	-0.31	-0.39	0.33	0.18	-0.42	-0.59	-1.11	-1.07	-0.33	-0.22	-0.28	-0.73	-0.21	0.7	0.85	0.0	-0.79
EAU89417	-1.09	0.43	0.22	-0.23	0.3	0.3	0.04	-0.48	0.28	-0.07	0.29	0.63	-0.42	-0.11	-0.11	-0.19	-0.25	-0.32	-0.47	0.14	-0.12	0.15	-0.05	0.03	-0.33	0.54	-0.19	-0.08
EAU89667	-2.46	-0.35	0.5	-0.52	-0.58	-0.67	0.34	-0.29	-0.16	-0.44	0.14	-0.73	-0.17	0.72	0.63	0.22	-0.07	1.29	-0.4	0.39	0.4	0.4	-0.9	0.52	-1.46	-0.1	0.0	-0.74
EAU89948	-2.48	1.09	0.57	-0.6	-1.94	-2.0	0.31	-1.56	-0.83	-1.26	-1.33	-1.96	-0.17	-0.7	-0.62	0.52	0.01	-1.01	1.25	0.4	0.72	0.33	-1.43	0.57	1.24	1.34	-0.32	-0.78
EAU90450	-4.27	-1.27	0.71	0.04	0.42	-0.02	0.41	-0.43	0.6	0.73	0.43	0.83	0.03	0.4	0.08	-0.44	-0.23	-1.0	-0.58	-0.11	-0.4	-0.09	-0.98	-0.39	-0.76	0.06	0.18	0.45
EAU90498	-1.64	0.49	-0.12	-0.3	0.18	0.15	-0.29	-0.46	0.23	-0.07	0.25	0.39	-0.61	0.06	-0.0	0.1	0.06	0.01	0.12	0.28	0.06	0.23	-0.23	0.24	-0.17	0.15	-0.17	-0.22
EAU90591	-0.98	-0.15	0.6	-0.5	-0.06	-0.17	0.31	0.04	-0.03	-0.09	0.31	-0.08	0.16	0.27	0.12	0.28	-0.01	-0.79	-0.96	0.44	0.32	0.36	-0.7	0.24	-0.22	-0.12	0.33	-0.5
EAU90605	-1.57	1.51	-0.21	-0.88	-0.2	-0.63	-0.19	-0.02	0.44	-0.15	0.43	0.17	-0.49	0.22	0.42	-0.19	-0.38	-0.38	-1.68	-0.15	-0.66	-0.23	-0.05	-0.44	0.69	0.86	0.17	-0.44
EAU90645	-1.55	0.03	0.46	0.03	0.37	-0.16	0.42	-0.64	-0.04	0.52	-0.07	0.54	0.32	0.53	0.19	-0.68	-0.57	-0.68	-0.28	-0.48	-0.65	-0.55	-1.23	-0.6	0.39	0.39	0.6	0.51
EAU90931	-2.01	-0.05	0.21	-0.18	-0.34	-0.37	0.27	-0.29	-0.29	0.2	0.11	-0.34	0.29	1.01	1.01	-0.53	-0.27	-0.31	-0.51	-0.48	-0.44	-0.33	-0.89	-0.42	0.4	0.86	0.6	-0.27
EAU91266	-1.57	0.7	-0.07	-0.47	-0.22	0.25	0.01	-0.5	0.34	-0.12	0.53	-0.13	-0.53	0.22	0.23	0.16	-0.15	-0.53	-0.02	0.2	-0.06	0.33	-0.2	0.11	-0.45	0.57	-0.27	-0.06
EAU91267	-1.59	1.07	0.65	-0.16	-0.17	-0.14	0.85	0.11	0.29	0.18	0.37	-0.3	0.2	0.54	0.4	-0.69	-0.76	-0.31	-0.84	-0.52	-0.82	-0.69	-0.07	-0.48	-0.53	0.11	0.33	-0.16
EAU91364	-2.09	-0.11	0.38	-0.36	-0.2	0.16	0.33	0.3	0.27	0.35	0.52	-0.38	-0.76	0.03	-0.05	0.1	-0.22	0.24	0.24	0.19	-0.13	0.17	-0.06	0.07	-0.48	0.11	-0.04	-0.36
EAU91435	-2.71	0.03	0.88	0.1	0.27	0.24	0.49	0.01	-0.08	-0.17	-0.06	-0.09	0.19	-0.34	-0.38	0.2	0.09	-0.18	-0.37	0.26	0.08	0.14	-0.64	0.18	-0.3	-0.28	0.19	-0.13
EAU91650	-0.91	0.42	0.74	-0.73	-0.25	-0.43	0.52	-0.36	-0.32	-0.07	-0.12	-0.33	0.5	0.44	0.32	-0.08	-0.24	-0.82	-0.68	0.14	0.14	0.05	-0.9	0.05	-0.17	1.04	0.39	-0.93
EAU91755	-0.99	0.16	0.01	-0.13	0.08	-0.08	-0.29	-0.1	0.74	0.26	0.61	0.14	-0.28	0.34	0.17	-0.43	-0.35	-0.21	-0.58	-0.13	-0.38	-0.25	-0.35	-0.48	0.39	0.47	0.34	-0.07
EAU92289	-2.9	0.53	0.58	-0.31	0.89	-0.01	-0.03	-0.35	-0.02	-0.1	0.16	0.65	0.33	0.77	0.5	-0.37	-0.3	0.16	-0.74	-0.25	-0.69	-0.37	-0.8	-0.5	-0.65	-0.19	0.81	-1.23
EAU92346	-2.58	-0.19	0.78	-0.45	-0.03	-0.23	0.25	-0.26	-0.01	-0.15	0.25	0.21	-0.2	0.87	0.73	-0.34	-0.57	-0.61	-0.93	-0.09	-0.13	-0.09	-0.26	-0.02	0.32	0.14	0.83	-0.58
EAU92550	-2.56	0.39	0.21	-0.05	-0.16	-0.04	0.45	-0.15	0.21	0.06	0.47	0.11	-0.36	0.17	0.05	-0.28	-0.47	0.02	0.06	-0.07	-0.14	0.02	-0.5	-0.1	0.49	0.29	-0.14	-0.01
EAU92665	-1.12	0.84	0.07	-0.0	-0.04	-0.01	0.16	-1.12	-0.46	-0.5	-0.41	0.15	0.39	0.69	0.45	-0.39	-0.13	-0.62	-1.46	-0.17	-0.56	-0.06	-0.41	-0.41	-0.03	1.0	0.64	0.4
EAU92682	-1.32	0.17	0.09	-0.37	0.29	-0.24	-0.11	-0.08	0.08	0.04	0.29	0.4	-0.14	0.48	0.31	-0.07	-0.34	-0.51	-0.29	0.07	-0.14	-0.13	-0.48	-0.15	0.64	0.44	0.32	-0.75
EAU92696	-2.61	-0.09	0.75	-0.76	-0.35	-0.37	0.17	-0.26	0.28	-0.57	0.42	-0.14	-0.18	-0.06	-0.13	-0.4	-0.2	-0.51	0.91	0.2	-0.17	0.36	-0.31	0.26	0.85	0.61	-0.22	-1.03
EAU92862	-0.95	0.17	0.62	-0.65	-0.06	-0.08	0.44	-0.48	0.19	-0.02	0.07	0.15	-0.05	0.21	0.04	0.26	0.32	-0.7	-0.77	0.4	0.09	0.41	-0.46	0.24	-0.9	-0.17	0.4	-0.42
EAU93028	-2.01	0.66	-0.25	-0.11	1.13	1.34	-0.12	-1.79	-0.46	-0.28	-0.41	1.23	-0.12	0.13	-0.21	-0.2	0.29	-1.19	-0.32	-0.21	-1.23	-0.24	-1.59	-0.58	0.19	0.37	-0.29	0.32
EAU93204	-1.71	1.03	-0.54	-0.27	0.27	0.52	-0.12	-0.76	0.14	-0.38	0.11	0.61	0.02	0.28	0.2	-0.19	0.29	-0.58	-0.3	0.12	-0.42	-0.09	-0.9	0.15	-0.36	0.08	0.33	0.06
EFI27362	-1.51	0.68	0.12	0.12	0.36	0.87	0.73	-1.02	0.21	-0.64	0.43	0.49	-0.24	-0.08	-0.3	0.06	-0.02	-0.53	-0.52	0.16	-0.32	-0.27	-1.37	-0.02	-0.39	-0.27	0.07	0.35
EFI27794	-0.58	-0.19	0.82	-0.74	-0.02	-0.02	-0.1	0.24	0.51	-0.07	0.75	0.07	-0.77	0.21	-0.0	-0.17	-0.21	0.63	-0.85	-0.1	-0.34	-0.09	-0.55	0.04	0.67	-0.35	0.2	-1.34
EFI28122	-3.71	1.17	0.16	-0.22	0.03	-0.42	0.06	-0.82	-0.79	-0.76	-0.56	-0.26	0.18	1.01	0.96	-0.59	-0.48	-0.18	0.34	-0.18	-0.5	-0.14	-0.12	-0.22	-0.63	0.86	0.85	-1.04
EFI28214	-1.59	0.73	0.9	-0.75	0.13	-0.48	0.14	-0.29	0.52	0.43	0.62	0.27	0.47	0.46	0.27	-0.43	-0.66	-0.38	-1.04	-0.14	-0.25	-0.31	-0.98	-0.33	-1.09	0.66	0.29	-0.8
EFI28247	-3.02	-1.19	1.6	-1.75	-1.42	-1.45	0.64	0.5	0.29	0.09	0.46	-0.95	-0.06	0.36	0.43	-1.41	-0.66	-1.54	-1.1	-0.87	0.26	-0.75	-0.18	-0.12	1.46	1.24	0.16	-1.21

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.