1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_96 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Clade
Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.02 0.74 0.71 0.33 0.31 0.25 0.42 0.25 0.4 0.4 0.43 0.32 0.35 0.62 0.53 0.39 0.27 0.16 0.26 0.5 0.44 0.44 0.21 0.4 1.0 0.65 0.64 0.33
0.06 0.49 0.54 0.38 0.2 0.2 0.42 0.16 0.21 0.16 0.32 0.29 0.44 0.24 0.25 0.33 0.35 0.28 0.51 0.42 0.38 0.37 0.19 0.45 0.39 1.0 0.21 0.28
0.12 1.0 0.33 0.09 0.27 0.51 0.32 0.24 0.29 0.23 0.33 0.29 0.21 0.41 0.34 0.32 0.38 0.2 0.28 0.31 0.24 0.34 0.23 0.33 0.14 0.57 0.19 0.11
0.1 1.0 0.31 0.34 0.23 0.2 0.28 0.1 0.39 0.18 0.39 0.31 0.24 0.93 0.88 0.16 0.26 0.46 0.16 0.31 0.17 0.25 0.22 0.23 0.64 0.73 0.5 0.55
0.43 0.86 0.81 0.48 0.48 0.24 0.81 0.22 1.0 0.22 0.77 0.74 0.51 0.56 0.54 0.57 0.5 0.29 0.34 0.55 0.41 0.62 0.31 0.6 0.45 0.4 0.49 0.42
0.27 0.97 0.87 0.6 0.86 0.81 0.74 0.8 0.85 0.57 1.0 0.93 0.66 0.93 0.87 0.72 0.68 0.48 0.9 0.87 0.81 0.87 0.56 0.93 0.58 0.68 0.79 0.49
0.19 1.0 0.7 0.26 0.41 0.39 0.59 0.3 0.27 0.34 0.27 0.35 0.6 0.23 0.2 0.42 0.38 0.37 0.5 0.51 0.4 0.45 0.27 0.45 0.98 0.99 0.24 0.31
0.08 1.0 0.75 0.35 0.43 0.38 0.52 0.22 0.42 0.3 0.5 0.48 0.33 0.53 0.5 0.48 0.39 0.26 0.4 0.57 0.45 0.55 0.27 0.49 0.44 0.76 0.4 0.44
0.16 0.51 1.0 0.35 0.52 0.49 0.72 0.32 0.62 0.44 0.64 0.6 0.64 0.67 0.68 0.4 0.43 0.34 0.25 0.56 0.46 0.58 0.38 0.51 0.52 0.38 0.7 0.37
0.21 0.32 1.0 0.26 0.49 0.41 0.6 0.41 0.43 0.37 0.47 0.45 0.36 0.76 0.59 0.38 0.31 0.4 0.37 0.48 0.39 0.46 0.34 0.38 0.28 0.61 0.88 0.16
0.08 1.0 0.49 0.24 0.44 0.41 0.39 0.34 0.47 0.39 0.52 0.53 0.31 0.53 0.48 0.31 0.27 0.64 0.37 0.31 0.3 0.34 0.44 0.28 0.48 0.5 0.43 0.34
0.16 0.45 0.7 0.49 0.77 1.0 0.85 0.31 0.58 0.29 0.63 0.74 0.48 0.51 0.46 0.54 0.53 0.55 0.29 0.54 0.39 0.46 0.21 0.52 0.3 0.48 0.62 0.49
0.06 0.59 0.99 0.3 0.42 0.24 0.46 0.52 0.53 0.46 0.57 0.29 0.31 0.38 0.37 0.3 0.2 0.23 0.36 0.47 0.4 0.45 0.23 0.34 1.0 0.92 0.3 0.19
0.12 1.0 0.21 0.25 0.31 0.22 0.27 0.19 0.35 0.25 0.42 0.43 0.26 0.71 0.79 0.35 0.32 0.25 0.28 0.29 0.29 0.3 0.4 0.31 0.21 0.37 0.47 0.27
0.22 1.0 0.99 0.43 0.41 0.3 0.72 0.27 0.45 0.35 0.47 0.43 0.57 0.46 0.44 0.51 0.4 0.27 0.4 0.54 0.55 0.47 0.3 0.49 0.91 0.82 0.6 0.4
0.18 0.83 0.38 0.3 0.33 0.19 0.21 0.13 0.34 0.28 0.41 0.37 0.25 0.43 0.44 0.24 0.29 0.34 0.22 0.22 0.28 0.23 0.11 0.18 0.15 1.0 0.27 0.44
0.08 0.67 0.82 0.32 0.49 0.35 0.87 0.41 0.73 0.55 0.77 0.56 0.69 0.64 0.59 0.39 0.41 0.25 0.24 0.44 0.38 0.43 0.37 0.43 0.84 1.0 0.64 0.24
0.19 1.0 0.54 0.55 0.46 0.63 0.43 0.42 0.38 0.4 0.39 0.35 0.42 0.59 0.63 0.74 0.61 0.35 0.52 0.84 0.83 0.7 0.37 0.67 0.52 0.75 0.5 0.56
0.15 1.0 0.83 0.24 0.51 0.28 0.33 0.27 0.45 0.62 0.47 0.41 0.59 0.4 0.34 0.23 0.2 0.16 0.08 0.36 0.2 0.21 0.12 0.22 0.34 0.89 0.41 0.15
0.19 1.0 0.38 0.37 0.48 0.49 0.37 0.44 0.52 0.44 0.57 0.58 0.34 0.71 0.67 0.34 0.31 0.35 0.3 0.47 0.34 0.49 0.43 0.39 0.76 0.72 0.48 0.43
0.19 0.45 1.0 0.36 0.52 0.37 0.7 0.39 0.64 0.46 0.7 0.64 0.46 0.64 0.57 0.53 0.47 0.44 0.64 0.61 0.56 0.61 0.38 0.62 0.49 0.6 0.58 0.31
0.12 0.8 0.63 0.7 0.83 0.77 0.69 0.53 0.89 0.75 1.0 0.96 0.62 0.82 0.74 0.63 0.63 0.42 0.61 0.75 0.54 0.79 0.49 0.75 0.62 0.71 0.67 0.91
0.15 0.62 0.61 0.59 0.48 0.36 0.7 0.46 0.81 0.56 0.79 0.59 0.52 0.56 0.57 0.71 0.57 0.33 1.0 0.77 0.84 0.67 0.53 0.75 0.62 0.87 0.51 0.76
0.6 1.0 0.56 0.3 0.3 0.25 0.44 0.35 0.49 0.45 0.62 0.34 0.32 0.53 0.48 0.31 0.28 0.2 0.2 0.34 0.36 0.35 0.25 0.36 0.68 0.76 0.42 0.24
0.3 0.87 0.75 0.55 0.79 0.8 0.67 0.46 0.78 0.62 0.79 1.0 0.48 0.6 0.6 0.56 0.54 0.52 0.47 0.71 0.6 0.72 0.63 0.66 0.51 0.94 0.57 0.61
0.07 0.32 0.58 0.29 0.27 0.26 0.52 0.33 0.37 0.3 0.45 0.25 0.36 0.68 0.63 0.48 0.39 1.0 0.31 0.54 0.54 0.54 0.22 0.59 0.15 0.38 0.41 0.24
0.07 0.84 0.59 0.26 0.1 0.1 0.49 0.13 0.22 0.16 0.16 0.1 0.35 0.24 0.26 0.56 0.4 0.2 0.94 0.52 0.65 0.5 0.15 0.58 0.93 1.0 0.32 0.23
0.03 0.23 0.92 0.58 0.75 0.55 0.75 0.42 0.85 0.93 0.76 1.0 0.57 0.74 0.6 0.42 0.48 0.28 0.38 0.52 0.43 0.53 0.29 0.43 0.33 0.59 0.64 0.77
0.23 1.0 0.66 0.58 0.81 0.79 0.58 0.52 0.83 0.68 0.85 0.93 0.46 0.74 0.71 0.76 0.74 0.72 0.77 0.86 0.74 0.84 0.61 0.84 0.63 0.79 0.63 0.61
0.33 0.59 1.0 0.46 0.63 0.59 0.82 0.68 0.64 0.62 0.82 0.62 0.74 0.8 0.72 0.8 0.65 0.38 0.34 0.9 0.82 0.85 0.4 0.78 0.57 0.6 0.83 0.47
0.12 1.0 0.3 0.19 0.3 0.23 0.31 0.35 0.48 0.32 0.47 0.4 0.25 0.41 0.47 0.31 0.27 0.27 0.11 0.32 0.22 0.3 0.34 0.26 0.57 0.64 0.39 0.26
0.23 0.67 0.91 0.68 0.85 0.59 0.88 0.43 0.64 0.95 0.63 0.96 0.83 0.96 0.76 0.41 0.45 0.41 0.54 0.48 0.42 0.45 0.28 0.44 0.87 0.87 1.0 0.94
0.12 0.48 0.57 0.44 0.39 0.38 0.6 0.41 0.41 0.57 0.54 0.39 0.61 1.0 1.0 0.34 0.41 0.4 0.35 0.36 0.37 0.39 0.27 0.37 0.65 0.9 0.75 0.41
0.21 1.0 0.59 0.44 0.53 0.73 0.62 0.43 0.78 0.57 0.89 0.56 0.43 0.72 0.72 0.69 0.55 0.43 0.61 0.71 0.59 0.77 0.53 0.66 0.45 0.91 0.51 0.59
0.16 1.0 0.75 0.43 0.42 0.43 0.86 0.51 0.58 0.54 0.61 0.39 0.55 0.69 0.63 0.3 0.28 0.38 0.27 0.33 0.27 0.3 0.45 0.34 0.33 0.51 0.6 0.43
0.16 0.65 0.91 0.55 0.61 0.78 0.88 0.86 0.84 0.89 1.0 0.53 0.41 0.71 0.67 0.75 0.6 0.82 0.82 0.8 0.64 0.78 0.67 0.73 0.5 0.75 0.68 0.54
0.08 0.56 1.0 0.58 0.65 0.64 0.76 0.55 0.51 0.48 0.52 0.51 0.62 0.43 0.42 0.62 0.58 0.48 0.42 0.65 0.57 0.6 0.35 0.62 0.44 0.45 0.62 0.5
0.26 0.65 0.81 0.29 0.41 0.36 0.7 0.38 0.39 0.46 0.45 0.39 0.69 0.66 0.61 0.46 0.41 0.28 0.3 0.53 0.54 0.5 0.26 0.5 0.43 1.0 0.64 0.26
0.3 0.67 0.6 0.55 0.63 0.56 0.49 0.56 1.0 0.71 0.91 0.66 0.49 0.76 0.67 0.44 0.47 0.52 0.4 0.55 0.46 0.5 0.47 0.43 0.78 0.83 0.75 0.57
0.07 0.78 0.81 0.43 1.0 0.53 0.53 0.42 0.53 0.5 0.61 0.85 0.68 0.92 0.76 0.42 0.44 0.6 0.32 0.45 0.33 0.42 0.31 0.38 0.34 0.47 0.95 0.23
0.09 0.48 0.93 0.4 0.54 0.47 0.65 0.45 0.54 0.49 0.65 0.63 0.47 1.0 0.9 0.43 0.37 0.36 0.29 0.51 0.5 0.51 0.46 0.54 0.68 0.6 0.97 0.37
0.12 0.94 0.82 0.69 0.64 0.69 0.97 0.64 0.82 0.74 0.98 0.77 0.55 0.8 0.74 0.59 0.52 0.72 0.74 0.68 0.65 0.72 0.5 0.66 1.0 0.87 0.65 0.71
0.23 0.89 0.52 0.5 0.48 0.5 0.56 0.23 0.36 0.35 0.38 0.55 0.65 0.8 0.68 0.38 0.46 0.32 0.18 0.44 0.34 0.48 0.38 0.37 0.49 1.0 0.78 0.66
0.26 0.72 0.68 0.49 0.78 0.54 0.59 0.61 0.68 0.66 0.78 0.84 0.58 0.89 0.8 0.61 0.51 0.45 0.53 0.67 0.58 0.58 0.46 0.58 1.0 0.87 0.8 0.38
0.09 0.5 0.89 0.31 0.42 0.41 0.6 0.44 0.65 0.36 0.71 0.48 0.47 0.51 0.49 0.4 0.46 0.37 1.0 0.61 0.47 0.68 0.43 0.64 0.96 0.81 0.46 0.26
0.34 0.73 1.0 0.41 0.62 0.61 0.88 0.46 0.74 0.64 0.68 0.72 0.63 0.75 0.67 0.78 0.81 0.4 0.38 0.86 0.69 0.86 0.47 0.76 0.35 0.58 0.85 0.49
0.1 0.62 0.33 0.37 0.87 1.0 0.36 0.11 0.29 0.33 0.3 0.93 0.36 0.43 0.34 0.34 0.48 0.17 0.32 0.34 0.17 0.33 0.13 0.27 0.45 0.51 0.32 0.49
0.15 1.0 0.34 0.4 0.59 0.7 0.45 0.29 0.54 0.38 0.53 0.74 0.5 0.59 0.56 0.43 0.6 0.33 0.4 0.53 0.37 0.46 0.26 0.54 0.38 0.52 0.62 0.51
0.19 0.88 0.6 0.6 0.7 1.0 0.91 0.27 0.63 0.35 0.74 0.77 0.47 0.52 0.45 0.57 0.54 0.38 0.38 0.61 0.44 0.46 0.21 0.54 0.42 0.45 0.58 0.7
0.38 0.5 1.0 0.34 0.56 0.56 0.53 0.67 0.81 0.54 0.95 0.6 0.33 0.66 0.57 0.5 0.49 0.88 0.31 0.53 0.45 0.53 0.39 0.58 0.9 0.44 0.65 0.22
0.03 1.0 0.49 0.38 0.45 0.33 0.46 0.25 0.26 0.26 0.3 0.37 0.5 0.89 0.86 0.3 0.32 0.39 0.56 0.39 0.31 0.4 0.41 0.38 0.29 0.81 0.8 0.22
0.18 0.89 1.0 0.32 0.58 0.38 0.59 0.44 0.77 0.72 0.82 0.65 0.74 0.73 0.64 0.4 0.34 0.41 0.26 0.48 0.45 0.43 0.27 0.43 0.25 0.84 0.65 0.31
0.04 0.14 1.0 0.1 0.12 0.12 0.51 0.46 0.4 0.35 0.45 0.17 0.32 0.42 0.44 0.12 0.21 0.11 0.15 0.18 0.4 0.2 0.29 0.3 0.91 0.77 0.37 0.14

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)