Heatmap: Cluster_101 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
-2.72 -0.3 0.45 -0.49 -0.04 -0.06 0.42 -0.5 -0.38 -0.05 -0.38 -0.08 0.12 0.1 -0.17 0.16 -0.16 1.25 0.02 0.27 0.33 0.09 -1.02 0.09 -0.37 0.45 0.16 -0.39
-2.57 -0.81 0.55 -0.32 0.07 -0.22 0.31 -0.45 0.0 -0.39 -0.0 0.28 0.03 -0.02 -0.1 0.03 -0.04 0.1 0.43 0.26 -0.11 0.23 0.07 0.27 -1.2 0.96 0.03 -0.29
-1.39 -0.32 -0.73 -1.77 -2.43 -2.9 -3.06 -8.38 -4.52 -8.23 -8.35 -1.56 -1.16 2.71 2.18 -1.6 -1.22 -0.49 0.05 -0.35 -0.42 -0.14 -3.04 0.45 -1.46 -0.13 2.51 -2.42
-3.1 -2.59 -0.56 -1.06 -0.17 0.1 -0.56 -0.72 -0.23 0.44 0.21 -0.24 -0.65 -0.1 0.12 -0.04 -0.22 2.31 0.11 -0.12 -0.5 -0.12 -1.57 -0.4 -1.98 1.13 0.16 0.46
-1.48 -0.4 0.29 -0.87 -0.04 -0.31 0.32 -1.01 -0.2 -0.64 -0.02 -0.28 -0.03 0.0 -0.06 -0.11 -0.47 2.02 -0.15 0.28 0.08 0.13 -0.77 0.08 -0.23 0.72 -0.24 -1.43
-2.5 -1.05 0.3 -0.63 -0.21 0.04 0.25 -0.38 0.11 -0.03 0.14 -0.01 -0.15 -0.01 0.04 -0.24 -0.17 1.51 0.29 0.05 -0.22 0.11 -0.5 0.01 -0.11 0.65 -0.31 -0.46
-1.51 0.2 -0.35 -1.06 -0.19 -0.58 -0.15 -0.73 0.4 -0.49 0.41 0.36 0.17 0.53 0.68 -0.7 -0.19 -0.38 -1.13 -0.28 -0.75 -0.23 0.06 -0.39 0.4 1.7 0.38 -0.47
-2.04 -0.03 -0.32 -0.93 0.02 0.62 0.14 -0.12 0.02 0.12 0.25 0.03 -0.64 1.0 0.68 -0.44 -0.18 -0.18 -0.57 -0.28 -0.55 -0.09 0.0 0.07 0.38 0.05 0.51 -0.15
0.12 1.23 0.49 -0.89 -0.51 0.77 -0.74 -0.14 -1.02 -1.09 -1.03 -2.41 -0.28 0.8 0.73 -0.59 -0.8 0.18 0.43 -0.14 -0.82 -0.17 -0.73 -0.28 0.74 0.98 -0.0 -0.5
0.39 0.35 0.79 -1.15 -0.74 0.13 -0.03 -0.88 -1.0 -0.75 -0.82 -0.91 0.16 -0.39 -0.36 0.35 -0.4 -0.94 0.91 0.25 0.99 0.22 -0.66 0.68 1.01 -0.5 0.07 -1.38
-1.59 -0.21 -0.76 -0.59 0.0 1.13 -0.55 -0.17 -0.65 -0.5 -0.29 -0.09 -0.56 0.65 0.53 -0.14 -0.44 0.57 0.91 -0.1 -0.31 -0.26 -0.7 -0.33 0.98 0.54 0.02 -0.88
-2.7 0.17 0.07 -0.82 -0.07 -0.47 0.08 -0.03 0.27 -0.07 0.42 -0.05 -0.05 0.39 0.37 -0.23 -0.05 0.47 0.15 0.12 -0.2 0.3 -0.42 0.11 -0.15 0.52 -0.06 -0.48
-1.42 0.27 0.08 -0.64 0.4 0.54 0.08 0.07 0.06 0.0 0.13 0.44 -0.15 -0.22 -0.16 -0.28 0.06 -0.14 -0.69 -0.03 -0.24 0.23 0.15 0.02 0.52 0.07 -0.41 -0.05
-1.63 -0.04 -0.21 -0.63 0.02 0.55 0.06 0.38 -0.2 -0.14 -0.41 -0.6 -0.84 0.73 0.67 -0.36 -0.42 0.07 0.11 -0.4 -0.31 -0.24 -0.59 -0.5 0.64 0.55 0.98 -0.1
0.68 -0.0 0.19 -1.26 -0.84 -2.16 -0.22 -0.52 -0.43 -0.47 -1.25 -1.37 -1.1 1.06 1.16 0.06 -0.4 -0.22 -0.38 0.22 0.59 0.34 0.27 0.46 -1.19 1.0 0.68 -1.12
-2.18 -0.14 0.11 -1.77 -1.53 -1.31 0.16 -0.53 0.12 -0.41 0.02 -1.51 -0.53 1.75 2.01 -0.78 -0.12 0.64 -0.85 -0.16 -0.54 -0.33 0.3 -0.16 -1.06 0.61 -0.07 -0.85
-2.94 0.32 0.02 -0.7 -0.26 -0.01 0.52 0.04 0.01 0.31 0.14 -0.14 -1.26 0.56 0.64 -0.24 -0.5 -0.3 0.02 -0.09 -0.43 -0.25 -0.21 -0.21 0.69 0.32 0.65 -0.09
-1.21 0.55 0.29 -0.97 -0.92 -0.7 0.98 -0.91 0.21 0.87 0.11 -0.74 -0.2 0.48 0.3 -1.27 -1.59 0.88 -0.54 -0.46 -0.87 -0.89 -0.24 -0.93 1.56 -0.45 0.68 -0.28
-4.39 0.29 0.73 -0.82 -0.48 0.15 0.69 0.39 -0.33 0.63 -0.3 -0.9 0.28 0.82 0.56 -0.75 -0.69 0.09 -0.71 -0.23 -0.57 -0.3 0.06 -0.37 -0.84 0.18 1.05 -0.31
- 1.67 0.93 -0.88 -2.96 -1.65 1.19 1.1 -0.54 0.67 -0.55 -4.09 -0.57 0.44 0.48 - -2.83 -0.77 -0.51 -2.77 -2.03 -1.71 1.84 -1.2 1.62 -2.27 0.07 -0.77
1.1 0.69 -0.27 -0.4 -0.59 -0.49 -0.33 -0.7 -0.63 -0.52 -0.26 -0.99 -0.38 1.07 0.93 -0.31 -0.57 -1.34 -0.4 -0.25 -0.33 -0.42 -1.17 -0.39 1.08 1.03 0.67 -1.16
-0.74 0.18 -0.02 -2.24 -1.01 -2.69 0.25 -0.75 1.52 -1.39 1.73 -0.73 -2.43 0.88 1.26 -1.18 -1.68 -0.78 -0.64 -0.27 -0.28 -0.2 -0.11 -0.35 0.34 1.14 0.32 -2.83
-3.18 0.03 -0.69 -1.06 -1.07 -1.46 -1.0 -2.18 -0.11 -1.77 -0.05 -0.5 -1.61 1.03 0.9 0.38 -0.27 -0.07 1.12 0.17 0.31 0.21 -0.41 0.14 1.62 -0.34 0.51 0.2
-1.45 0.4 -0.18 -0.35 -0.27 -0.38 -0.2 0.07 0.21 0.16 0.36 0.05 -0.2 0.31 0.15 -0.18 -0.03 0.19 -0.29 -0.03 -0.37 0.05 -0.35 -0.16 0.76 0.2 0.22 0.05
-0.67 0.13 0.53 -0.76 0.09 0.89 0.27 0.34 0.18 0.07 0.41 0.07 -0.5 0.35 0.14 -0.64 0.01 -0.25 -0.55 0.03 -0.74 0.26 -0.54 0.06 -0.7 -0.34 0.17 -0.07
-0.84 1.08 0.21 -0.61 0.0 -0.2 -0.04 -0.4 0.21 -0.07 0.24 0.06 -0.53 0.2 0.28 -0.08 -0.06 -0.81 -1.19 0.11 -0.78 0.26 -0.2 -0.15 0.72 0.12 0.3 0.02
-0.69 0.79 -0.49 -0.79 -0.06 -0.09 -0.2 -0.29 0.53 0.1 0.4 0.17 -0.64 0.4 0.5 -0.29 -0.07 -0.72 -1.5 -0.18 -0.23 -0.23 0.09 -0.15 0.2 0.9 0.18 0.0
-1.42 0.85 -1.08 -1.08 -0.86 -1.34 -1.01 0.82 0.47 0.63 1.29 -0.77 -1.14 1.26 0.57 -1.73 -3.43 2.2 - -1.1 - -1.4 -2.55 -3.53 1.5 -1.15 1.02 -
-1.68 -0.23 0.04 -0.65 -0.07 0.14 0.07 -0.32 0.06 0.0 0.14 0.01 -0.31 0.45 0.37 -0.49 -0.23 -0.18 0.7 -0.21 -0.33 -0.11 -0.34 -0.51 1.28 -0.23 0.32 -0.07
-1.19 -0.62 0.48 -0.56 -0.37 -0.17 0.21 -0.53 -0.63 -0.63 -0.49 -0.28 0.0 0.06 -0.15 0.17 0.1 1.27 0.16 0.18 0.12 0.29 -0.72 0.19 0.84 0.51 -0.32 -0.66
-0.32 0.21 0.2 -0.14 -0.19 -0.12 0.25 -0.48 -0.27 -0.43 -0.41 -0.31 -0.06 0.43 0.39 -0.36 -0.51 -0.59 0.44 -0.29 -0.41 -0.2 -0.15 -0.27 1.01 0.8 0.1 0.08
-2.27 0.27 0.0 -0.45 0.06 0.06 0.0 -0.1 0.09 -0.05 0.17 0.24 -0.09 0.26 0.21 -0.11 -0.05 -0.29 -0.09 0.13 0.02 0.09 -0.24 0.13 -0.1 0.52 0.1 -0.01
-0.95 0.35 0.04 -0.84 0.13 0.24 0.17 -0.31 0.17 0.01 0.23 0.07 -0.33 0.25 0.16 -0.32 -0.24 0.42 -0.14 0.11 -0.39 -0.01 -0.42 -0.11 -0.23 0.46 0.53 -0.2
-2.32 -0.82 0.11 -0.57 0.02 0.04 0.44 -0.87 -0.06 0.1 0.09 0.25 -0.03 0.42 0.48 -0.1 -0.29 0.47 -0.05 -0.06 -0.24 -0.07 -0.45 -0.07 1.22 -0.8 0.41 -0.39
-2.68 1.21 1.59 -2.94 -1.88 -1.83 -0.05 -0.56 -1.06 0.61 -1.01 -2.17 -0.22 1.26 0.86 -2.55 -2.44 1.19 -1.99 -2.08 -1.58 -2.26 -0.11 -2.32 2.3 0.61 0.11 -3.57
-2.48 - -0.08 -0.47 -2.62 -1.82 -1.27 0.97 0.22 0.62 -0.38 -1.45 -1.02 1.56 2.13 -0.65 -3.88 -0.57 -2.06 -0.9 -1.17 -0.41 -0.55 0.09 - 2.0 1.28 -2.52
-1.44 -0.29 0.18 -0.24 -0.06 -0.31 0.05 -0.55 -0.06 -0.36 0.09 0.04 -0.29 0.27 0.16 -0.03 -0.2 -0.29 0.79 -0.03 -0.22 0.1 -0.39 0.02 0.38 1.16 -0.24 -0.14
-0.88 0.26 0.41 -0.74 -0.01 0.27 0.52 -0.23 0.07 0.47 0.05 -0.05 0.1 0.36 0.25 -0.66 -0.5 -0.54 -0.17 -0.06 -0.34 -0.14 -0.32 -0.34 0.13 0.47 0.46 -0.24
-0.72 -0.15 0.6 -0.08 -0.05 -0.03 0.49 -0.27 -0.48 -0.13 -0.24 -0.03 0.29 0.4 0.2 -0.55 -0.58 -0.47 0.57 -0.24 -0.19 -0.22 -0.08 -0.19 -0.31 0.73 0.44 -0.14
-1.65 -0.5 0.26 -0.59 -0.05 0.69 0.05 -0.03 0.08 0.13 0.06 -0.11 -0.16 0.47 0.36 -0.13 -0.05 -0.17 -1.1 0.05 -0.09 0.14 -0.24 0.1 0.08 0.5 0.12 0.06
-1.98 0.28 -0.04 -0.19 -0.19 -0.18 -0.21 -0.44 -0.11 -0.51 -0.05 -0.06 -0.38 0.34 0.25 -0.09 -0.45 -0.47 0.7 0.09 0.21 -0.02 0.06 0.1 0.81 0.69 -0.03 -0.23
-2.07 0.2 -0.11 -0.49 -0.16 0.2 0.36 -0.63 -0.18 -0.48 -0.12 -0.12 -0.3 0.33 0.27 -0.17 -0.38 0.72 0.53 -0.22 0.07 -0.28 -0.54 -0.36 0.9 0.76 0.18 -0.6
-1.33 0.31 0.32 -0.35 0.02 0.1 0.19 -0.26 0.11 -0.24 0.27 0.15 -0.29 0.13 0.14 -0.26 -0.28 -0.71 0.43 -0.13 -0.28 -0.0 -0.44 -0.09 0.62 0.74 -0.02 -0.37
-2.0 -0.27 0.46 -0.61 -0.14 -0.32 0.16 -0.7 -0.3 0.18 -0.06 -0.3 -0.12 0.45 0.35 -0.54 0.05 0.0 0.89 -0.0 -0.56 0.1 -0.44 -0.11 -0.5 1.19 0.04 0.2
-2.35 0.1 0.33 -0.69 0.33 0.23 -0.27 -0.79 -0.26 -0.98 -0.02 0.5 -0.21 0.34 0.22 -0.46 -0.13 0.15 0.6 0.11 -0.56 0.07 0.04 0.01 -0.08 0.92 0.28 -0.29
-3.61 -0.17 -0.35 -0.47 0.07 -0.31 0.01 -0.72 0.23 -0.2 0.28 0.42 -0.18 0.45 0.41 -0.23 -0.36 0.59 0.51 0.07 -0.14 0.05 -0.19 -0.03 0.46 0.35 -0.13 -0.14
-2.31 -0.13 0.28 -0.37 -0.1 -0.08 -0.09 -0.41 -0.18 -0.47 0.08 0.06 -0.29 0.14 0.07 0.15 0.21 0.36 0.06 0.28 0.33 0.31 -0.47 0.2 0.25 0.67 -0.04 -0.45
-2.54 -0.09 -0.31 -1.45 0.64 1.36 0.02 0.53 -0.32 -0.39 -0.25 -0.18 -0.89 0.95 0.68 -1.12 -0.47 -0.16 0.08 -0.19 -0.62 0.17 -0.63 -0.43 -0.17 0.73 0.59 -0.84
-2.68 0.01 0.97 -0.65 0.52 0.76 0.27 0.8 0.11 -0.01 0.19 0.27 -0.11 -0.14 -0.16 -0.38 -0.5 -0.66 -0.89 0.2 0.01 0.39 -0.26 0.11 -1.05 -0.2 -0.47 -0.14
-2.34 -0.46 0.48 -0.21 0.13 -0.06 0.44 -1.45 -0.76 -0.99 -0.54 0.03 0.29 0.24 0.06 0.02 0.32 1.6 0.08 0.07 0.02 0.08 -1.21 -0.04 -0.07 -0.32 0.25 -0.04
-1.78 -0.12 0.12 -1.01 0.38 0.44 0.03 0.57 -0.11 -0.08 -0.44 0.41 -1.09 0.29 0.13 -0.42 -0.46 -0.59 -0.58 0.19 0.18 0.35 0.15 0.27 0.78 0.36 0.24 -1.12
-3.65 0.66 -0.05 -1.12 -0.01 0.34 0.53 0.18 0.17 0.59 0.39 0.17 1.01 0.84 0.6 -0.42 -0.66 0.26 0.06 -0.64 -0.67 -0.67 0.06 -0.36 -0.82 -2.28 0.13 -1.0
-1.96 0.12 -0.28 -0.53 0.29 0.49 -0.03 -0.27 0.09 0.15 0.13 0.55 -0.46 0.26 0.17 -0.1 0.05 -0.14 0.25 0.12 -0.09 0.14 0.0 0.09 -0.27 -0.12 -0.04 -0.09
-1.45 0.09 0.01 -0.64 0.01 -0.29 -0.04 -0.58 0.28 -0.28 0.35 0.36 -0.5 0.71 0.59 -0.71 -0.58 -0.72 0.13 -0.22 -0.61 -0.18 -0.21 -0.46 -0.49 1.68 0.39 -0.31
0.59 0.71 0.07 0.16 -0.28 -0.29 -0.01 -0.71 -0.38 -0.56 -0.39 -0.4 -0.17 0.6 0.48 -0.36 -0.45 -1.45 -1.23 0.03 -0.47 -0.14 -0.86 -0.28 0.86 0.7 0.69 0.37
-0.79 0.39 0.11 -0.51 -0.56 -0.52 -0.31 -0.29 0.27 -0.61 0.37 -0.51 -0.43 0.06 0.05 0.11 -0.56 -0.85 0.44 0.14 0.72 0.0 0.23 0.21 0.65 0.7 0.08 -0.61
-2.87 0.03 0.1 -0.6 0.12 0.07 0.18 0.56 0.37 0.41 0.48 0.32 -0.07 0.38 0.29 -0.39 -0.36 -0.14 -1.44 -0.01 -0.36 0.13 -0.04 -0.08 -0.27 0.16 -0.0 0.11

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.