Heatmap: Cluster_101 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.06 0.34 0.57 0.3 0.41 0.4 0.56 0.3 0.32 0.41 0.32 0.4 0.46 0.45 0.37 0.47 0.38 1.0 0.43 0.51 0.53 0.45 0.21 0.45 0.33 0.57 0.47 0.32
0.09 0.29 0.76 0.41 0.54 0.44 0.64 0.38 0.52 0.39 0.51 0.63 0.52 0.51 0.48 0.53 0.5 0.55 0.69 0.62 0.48 0.6 0.54 0.62 0.22 1.0 0.52 0.42
0.06 0.12 0.09 0.04 0.03 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.07 1.0 0.69 0.05 0.07 0.11 0.16 0.12 0.11 0.14 0.02 0.21 0.06 0.14 0.87 0.03
0.02 0.03 0.14 0.1 0.18 0.22 0.14 0.12 0.17 0.27 0.23 0.17 0.13 0.19 0.22 0.2 0.17 1.0 0.22 0.19 0.14 0.19 0.07 0.15 0.05 0.44 0.23 0.28
0.09 0.19 0.3 0.14 0.24 0.2 0.31 0.12 0.22 0.16 0.24 0.2 0.24 0.25 0.24 0.23 0.18 1.0 0.22 0.3 0.26 0.27 0.15 0.26 0.21 0.41 0.21 0.09
0.06 0.17 0.43 0.23 0.3 0.36 0.42 0.27 0.38 0.34 0.38 0.35 0.31 0.35 0.36 0.3 0.31 1.0 0.43 0.36 0.3 0.38 0.25 0.35 0.32 0.55 0.28 0.25
0.11 0.35 0.24 0.15 0.27 0.21 0.28 0.19 0.41 0.22 0.41 0.4 0.35 0.45 0.5 0.19 0.27 0.24 0.14 0.25 0.18 0.26 0.32 0.24 0.41 1.0 0.4 0.22
0.12 0.49 0.4 0.26 0.5 0.77 0.55 0.46 0.51 0.54 0.6 0.51 0.32 1.0 0.8 0.37 0.44 0.44 0.34 0.41 0.34 0.47 0.5 0.52 0.65 0.52 0.71 0.45
0.46 1.0 0.6 0.23 0.3 0.73 0.26 0.39 0.21 0.2 0.21 0.08 0.35 0.74 0.71 0.28 0.25 0.48 0.58 0.39 0.24 0.38 0.26 0.35 0.71 0.84 0.43 0.3
0.65 0.64 0.86 0.22 0.3 0.55 0.49 0.27 0.25 0.3 0.28 0.26 0.56 0.38 0.39 0.64 0.38 0.26 0.93 0.59 0.99 0.58 0.32 0.8 1.0 0.35 0.52 0.19
0.15 0.4 0.27 0.3 0.46 1.0 0.31 0.41 0.29 0.32 0.37 0.43 0.31 0.72 0.66 0.42 0.34 0.68 0.86 0.43 0.37 0.38 0.28 0.36 0.9 0.67 0.46 0.25
0.11 0.78 0.73 0.4 0.66 0.5 0.74 0.68 0.84 0.67 0.93 0.67 0.67 0.91 0.9 0.59 0.67 0.97 0.77 0.76 0.6 0.86 0.52 0.75 0.63 1.0 0.67 0.5
0.26 0.83 0.73 0.44 0.91 1.0 0.73 0.72 0.72 0.69 0.75 0.93 0.62 0.59 0.62 0.57 0.72 0.63 0.43 0.68 0.58 0.81 0.76 0.7 0.99 0.72 0.52 0.67
0.16 0.49 0.44 0.33 0.51 0.74 0.53 0.66 0.44 0.46 0.38 0.33 0.28 0.84 0.81 0.4 0.38 0.53 0.55 0.39 0.41 0.43 0.34 0.36 0.79 0.74 1.0 0.47
0.72 0.45 0.51 0.19 0.25 0.1 0.39 0.31 0.33 0.32 0.19 0.17 0.21 0.93 1.0 0.47 0.34 0.39 0.34 0.52 0.67 0.57 0.54 0.62 0.2 0.89 0.72 0.21
0.05 0.22 0.27 0.07 0.09 0.1 0.28 0.17 0.27 0.19 0.25 0.09 0.17 0.83 1.0 0.14 0.23 0.39 0.14 0.22 0.17 0.2 0.3 0.22 0.12 0.38 0.24 0.14
0.08 0.77 0.63 0.38 0.52 0.62 0.89 0.63 0.62 0.77 0.68 0.56 0.26 0.91 0.97 0.52 0.44 0.5 0.63 0.58 0.46 0.52 0.54 0.53 1.0 0.77 0.97 0.58
0.15 0.5 0.41 0.17 0.18 0.21 0.66 0.18 0.39 0.62 0.37 0.2 0.29 0.47 0.42 0.14 0.11 0.62 0.23 0.25 0.19 0.18 0.29 0.18 1.0 0.25 0.54 0.28
0.02 0.59 0.8 0.27 0.35 0.53 0.78 0.63 0.38 0.75 0.39 0.26 0.59 0.85 0.71 0.29 0.3 0.51 0.29 0.41 0.32 0.39 0.5 0.37 0.27 0.55 1.0 0.39
0.0 0.89 0.53 0.15 0.04 0.09 0.64 0.6 0.19 0.44 0.19 0.02 0.19 0.38 0.39 0.0 0.04 0.16 0.2 0.04 0.07 0.09 1.0 0.12 0.86 0.06 0.29 0.16
1.0 0.75 0.39 0.35 0.31 0.33 0.37 0.29 0.3 0.33 0.39 0.23 0.36 0.98 0.89 0.38 0.31 0.18 0.35 0.39 0.37 0.35 0.21 0.36 0.98 0.96 0.74 0.21
0.18 0.34 0.3 0.06 0.15 0.05 0.36 0.18 0.86 0.11 1.0 0.18 0.06 0.56 0.73 0.13 0.09 0.18 0.19 0.25 0.25 0.26 0.28 0.24 0.38 0.66 0.38 0.04
0.04 0.33 0.2 0.16 0.15 0.12 0.16 0.07 0.3 0.1 0.31 0.23 0.11 0.66 0.61 0.42 0.27 0.31 0.7 0.37 0.4 0.38 0.24 0.36 1.0 0.26 0.46 0.37
0.22 0.77 0.52 0.46 0.49 0.45 0.51 0.62 0.68 0.66 0.75 0.61 0.51 0.73 0.65 0.52 0.58 0.67 0.48 0.57 0.46 0.61 0.46 0.53 1.0 0.67 0.68 0.61
0.34 0.59 0.78 0.32 0.57 1.0 0.65 0.69 0.61 0.57 0.72 0.57 0.38 0.69 0.59 0.35 0.55 0.45 0.37 0.55 0.32 0.65 0.37 0.57 0.33 0.43 0.61 0.52
0.26 1.0 0.55 0.31 0.47 0.41 0.46 0.36 0.55 0.45 0.56 0.49 0.33 0.54 0.57 0.45 0.45 0.27 0.21 0.51 0.27 0.57 0.41 0.43 0.78 0.51 0.58 0.48
0.33 0.92 0.38 0.31 0.51 0.5 0.47 0.44 0.78 0.57 0.71 0.6 0.34 0.71 0.76 0.44 0.51 0.32 0.19 0.47 0.46 0.46 0.57 0.48 0.62 1.0 0.61 0.54
0.08 0.39 0.1 0.1 0.12 0.09 0.11 0.38 0.3 0.34 0.53 0.13 0.1 0.52 0.32 0.07 0.02 1.0 0.0 0.1 0.0 0.08 0.04 0.02 0.62 0.1 0.44 0.0
0.13 0.35 0.42 0.26 0.39 0.45 0.43 0.33 0.43 0.41 0.45 0.41 0.33 0.56 0.53 0.29 0.35 0.36 0.67 0.35 0.33 0.38 0.32 0.29 1.0 0.35 0.51 0.39
0.18 0.27 0.58 0.28 0.32 0.37 0.48 0.29 0.27 0.27 0.3 0.34 0.42 0.43 0.38 0.47 0.45 1.0 0.47 0.47 0.45 0.51 0.25 0.48 0.74 0.59 0.33 0.26
0.4 0.57 0.57 0.45 0.44 0.46 0.59 0.36 0.41 0.37 0.37 0.4 0.48 0.67 0.65 0.39 0.35 0.33 0.67 0.41 0.37 0.43 0.45 0.41 1.0 0.86 0.53 0.52
0.14 0.84 0.7 0.51 0.73 0.73 0.7 0.65 0.74 0.67 0.78 0.82 0.66 0.83 0.8 0.65 0.67 0.57 0.65 0.76 0.71 0.74 0.59 0.76 0.65 1.0 0.75 0.69
0.36 0.88 0.71 0.39 0.76 0.82 0.78 0.56 0.78 0.7 0.81 0.72 0.55 0.82 0.77 0.56 0.58 0.92 0.63 0.75 0.53 0.69 0.52 0.64 0.59 0.95 1.0 0.6
0.09 0.24 0.46 0.29 0.43 0.44 0.58 0.24 0.41 0.46 0.46 0.51 0.42 0.57 0.6 0.4 0.35 0.6 0.42 0.41 0.36 0.41 0.31 0.41 1.0 0.25 0.57 0.33
0.03 0.47 0.61 0.03 0.06 0.06 0.2 0.14 0.1 0.31 0.1 0.05 0.17 0.49 0.37 0.03 0.04 0.46 0.05 0.05 0.07 0.04 0.19 0.04 1.0 0.31 0.22 0.02
0.04 0.0 0.22 0.17 0.04 0.06 0.1 0.45 0.27 0.35 0.18 0.08 0.11 0.67 1.0 0.15 0.02 0.15 0.05 0.12 0.1 0.17 0.16 0.24 0.0 0.92 0.55 0.04
0.16 0.36 0.51 0.38 0.43 0.36 0.46 0.3 0.43 0.35 0.48 0.46 0.37 0.54 0.5 0.44 0.39 0.37 0.77 0.44 0.38 0.48 0.34 0.45 0.58 1.0 0.38 0.41
0.38 0.83 0.93 0.42 0.69 0.84 1.0 0.6 0.73 0.97 0.73 0.68 0.75 0.9 0.83 0.44 0.49 0.48 0.62 0.67 0.55 0.63 0.56 0.55 0.77 0.97 0.96 0.59
0.37 0.54 0.91 0.57 0.58 0.59 0.85 0.5 0.43 0.55 0.51 0.59 0.74 0.8 0.69 0.41 0.4 0.43 0.9 0.51 0.53 0.52 0.57 0.53 0.49 1.0 0.82 0.55
0.2 0.44 0.74 0.41 0.6 1.0 0.65 0.61 0.66 0.68 0.65 0.58 0.56 0.86 0.8 0.57 0.6 0.55 0.29 0.64 0.58 0.68 0.52 0.67 0.66 0.88 0.68 0.65
0.14 0.69 0.55 0.5 0.5 0.5 0.49 0.42 0.53 0.4 0.55 0.55 0.44 0.72 0.68 0.54 0.42 0.41 0.92 0.61 0.66 0.56 0.59 0.61 1.0 0.92 0.56 0.49
0.13 0.62 0.5 0.38 0.48 0.62 0.69 0.35 0.47 0.39 0.5 0.49 0.44 0.68 0.65 0.48 0.41 0.88 0.77 0.46 0.56 0.44 0.37 0.42 1.0 0.91 0.61 0.35
0.24 0.74 0.75 0.47 0.61 0.64 0.68 0.5 0.64 0.51 0.72 0.67 0.49 0.66 0.66 0.5 0.49 0.36 0.81 0.55 0.49 0.6 0.44 0.56 0.92 1.0 0.59 0.46
0.11 0.36 0.6 0.29 0.4 0.35 0.49 0.27 0.36 0.5 0.42 0.36 0.4 0.6 0.56 0.3 0.45 0.44 0.81 0.44 0.3 0.47 0.32 0.41 0.31 1.0 0.45 0.5
0.1 0.57 0.67 0.33 0.66 0.62 0.44 0.31 0.44 0.27 0.52 0.75 0.46 0.67 0.62 0.38 0.48 0.59 0.8 0.57 0.36 0.55 0.55 0.53 0.5 1.0 0.64 0.43
0.05 0.59 0.52 0.48 0.7 0.54 0.67 0.4 0.78 0.58 0.81 0.89 0.59 0.91 0.88 0.57 0.52 1.0 0.95 0.7 0.6 0.69 0.58 0.65 0.91 0.85 0.61 0.6
0.13 0.58 0.76 0.49 0.59 0.6 0.59 0.47 0.55 0.45 0.66 0.65 0.51 0.69 0.66 0.7 0.73 0.81 0.65 0.76 0.79 0.78 0.45 0.72 0.75 1.0 0.61 0.46
0.07 0.37 0.31 0.14 0.61 1.0 0.39 0.56 0.31 0.3 0.33 0.35 0.21 0.75 0.62 0.18 0.28 0.35 0.41 0.34 0.25 0.44 0.25 0.29 0.35 0.64 0.59 0.22
0.08 0.52 1.0 0.32 0.73 0.86 0.62 0.89 0.55 0.51 0.58 0.62 0.47 0.46 0.46 0.39 0.36 0.32 0.28 0.59 0.51 0.67 0.43 0.55 0.25 0.44 0.37 0.46
0.07 0.24 0.46 0.29 0.36 0.32 0.45 0.12 0.19 0.17 0.23 0.34 0.4 0.39 0.34 0.33 0.41 1.0 0.35 0.35 0.33 0.35 0.14 0.32 0.31 0.26 0.39 0.32
0.17 0.53 0.63 0.29 0.75 0.79 0.59 0.86 0.54 0.55 0.43 0.77 0.27 0.71 0.63 0.43 0.42 0.39 0.39 0.66 0.66 0.74 0.64 0.7 1.0 0.75 0.68 0.27
0.04 0.79 0.48 0.23 0.49 0.63 0.72 0.56 0.56 0.75 0.65 0.56 1.0 0.89 0.75 0.37 0.31 0.59 0.52 0.32 0.31 0.31 0.52 0.39 0.28 0.1 0.54 0.25
0.17 0.74 0.56 0.47 0.83 0.95 0.67 0.57 0.72 0.76 0.74 1.0 0.5 0.81 0.77 0.64 0.7 0.62 0.81 0.74 0.64 0.75 0.68 0.72 0.56 0.63 0.66 0.64
0.11 0.33 0.31 0.2 0.31 0.26 0.3 0.21 0.38 0.26 0.4 0.4 0.22 0.51 0.47 0.19 0.21 0.19 0.34 0.27 0.2 0.28 0.27 0.23 0.22 1.0 0.41 0.25
0.83 0.9 0.58 0.62 0.45 0.45 0.55 0.34 0.42 0.37 0.42 0.42 0.49 0.83 0.77 0.43 0.4 0.2 0.23 0.56 0.4 0.5 0.3 0.45 1.0 0.89 0.89 0.71
0.35 0.8 0.66 0.43 0.41 0.42 0.49 0.5 0.73 0.4 0.79 0.43 0.45 0.63 0.63 0.66 0.41 0.34 0.82 0.67 1.0 0.61 0.71 0.7 0.95 0.99 0.64 0.4
0.09 0.69 0.73 0.45 0.74 0.71 0.77 1.0 0.88 0.9 0.95 0.85 0.65 0.89 0.83 0.52 0.53 0.62 0.25 0.68 0.53 0.74 0.66 0.64 0.56 0.76 0.68 0.73

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)