Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	FB cap+lamellae,YMG,strain #326	FB stipe,YMG,strain #326	Hyphal knots,control,strain #326	Mycelium	Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h	Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h	Mycelium,LiCl,strain #326	Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO	Mycelium,control,20C,matA/matB KO	Mycelium,control,28C,8h	Mycelium,control,strain #326	Stg 1 primordium,YMG,strain #326	Stg 2 primordium,YMG,strain #326	Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130	Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130	Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO	Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130	Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130	Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130	Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130	Vegetative mycelium,YMG,strain #326	Mycelium,control,YMG,37C,strain #130	YFB cap,YMG,strain #326	YFB lamellae,YMG,strain #326	secondary hyphal knots,YMG,strain #326	strain #130
EAU80200	0.0	0.0	0.0	0.22	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.97	0.0	0.96	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80228	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80278	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80413	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80427	0.58	1.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.92	0.0	0.0	0.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80431	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80738	0.26	1.0	0.15	0.38	0.24	0.33	0.12	0.12	0.35	0.33	0.25	0.25	0.12	0.13	0.37	0.21	0.19	0.06	0.22	0.29	0.13	0.12	0.35	0.13	0.3	0.15	0.09	0.21
EAU81085	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU81105	0.2	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.92	0.09	0.0	0.0	0.47	1.0	0.42	0.18	0.23	0.08	0.0	0.0	0.0
EAU81147	0.32	0.2	0.02	0.67	0.01	0.01	0.0	0.03	0.29	0.11	0.2	0.0	0.01	0.36	1.0	0.02	0.0	0.05	0.01	0.02	0.02	0.02	0.03	0.02	0.16	0.19	0.1	0.12
EAU81252	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU82031	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU82258	0.0	0.0	0.19	0.16	0.31	0.11	0.74	0.1	0.16	0.06	0.26	1.0	0.0	0.42	0.19	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.19	0.0	0.23	0.54	0.26	0.33
EAU82260	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.33	0.73	0.0	0.7	0.52	0.26	1.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.0	0.99
EAU82287	0.01	0.03	0.01	0.11	0.12	0.06	0.01	0.0	0.02	0.0	0.02	0.19	0.0	0.0	0.0	0.03	0.05	0.03	0.02	0.01	0.01	0.02	0.03	0.01	1.0	0.66	0.01	0.05
EAU82307	0.0	0.0	0.0	0.44	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.27	0.19	0.0	0.41	0.21	0.21	0.26	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	1.0
EAU82931	0.14	1.0	0.72	0.41	0.27	0.41	0.45	0.96	0.73	0.61	0.76	0.23	0.7	0.46	0.47	0.28	0.25	0.62	0.55	0.35	0.3	0.35	0.54	0.36	0.67	0.21	0.36	0.2
EAU83652	0.28	0.32	0.35	0.34	0.14	0.13	0.29	0.31	0.63	0.46	0.54	0.21	0.38	0.18	0.23	0.57	0.46	0.93	1.0	0.47	0.4	0.61	0.27	0.57	0.34	0.23	0.18	0.39
EAU83695	0.02	0.04	0.12	0.45	0.33	0.17	0.34	0.26	1.0	0.43	0.91	0.32	0.64	0.13	0.27	0.2	0.13	0.29	0.13	0.22	0.18	0.2	0.09	0.18	0.25	0.21	0.13	0.18
EAU85014	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU85073	0.01	0.71	0.19	1.0	0.13	0.16	0.06	0.12	0.14	0.08	0.17	0.11	0.03	0.15	0.08	0.04	0.03	0.14	0.06	0.24	0.17	0.19	0.16	0.03	0.04	0.49	0.17	0.18
EAU85882	0.0	0.26	0.0	0.1	0.19	1.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.24	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU86475	0.06	0.08	0.53	0.99	0.14	0.26	0.12	0.06	0.03	0.05	0.03	0.13	0.14	0.22	0.18	0.92	0.54	0.92	0.79	0.9	0.77	0.88	0.09	0.9	0.1	0.09	0.16	1.0
EAU86482	0.0	0.0	0.0	0.38	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.59	0.39	0.0	0.48	1.0	0.16	0.34	0.0	0.6	0.0	0.0	0.0	0.43
EAU86496	0.0	0.0	0.29	0.27	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.34	0.57	0.0	0.0	0.0	0.48	0.62	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU86765	0.01	0.55	0.58	0.43	0.64	0.64	0.28	0.92	0.89	1.0	0.78	0.82	0.29	0.23	0.2	0.57	0.48	0.24	0.23	0.52	0.79	0.58	0.35	0.48	0.08	0.1	0.19	0.84
EAU87081	0.1	0.54	0.39	1.0	0.0	0.0	0.07	0.0	0.06	0.2	0.13	0.06	0.06	0.62	0.72	0.0	0.0	0.3	0.13	0.54	0.0	0.0	0.23	0.14	0.34	0.75	0.61	0.2
EAU87228	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU87464	0.58	0.61	0.06	0.37	0.1	0.19	0.15	0.2	0.34	0.28	0.43	0.09	0.02	0.23	0.37	0.17	0.26	1.0	0.13	0.3	0.21	0.42	0.32	0.26	0.06	0.28	0.36	0.29
EAU88275	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU89825	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU89832	0.0	0.05	0.38	0.49	0.2	0.43	0.3	0.0	0.21	1.0	0.2	0.1	0.31	0.12	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.33	0.0	0.33
EAU89889	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU90788	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.36	0.0	0.0	0.0	1.0
EAU91974	0.05	0.08	0.08	0.41	0.16	0.23	0.17	0.16	0.48	0.39	0.42	0.21	0.06	0.14	0.19	0.29	1.0	0.12	0.03	0.15	0.06	0.18	0.09	0.21	0.03	0.32	0.31	0.4
EAU92041	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.01
EAU92061	0.0	0.13	0.0	0.31	0.35	0.0	0.55	0.0	0.0	0.34	0.0	0.32	0.63	0.38	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.66	0.0	0.49	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
EAU92396	0.08	0.67	0.56	0.49	0.05	0.0	0.08	0.45	0.37	0.0	0.46	0.09	0.0	0.26	0.16	0.17	0.05	0.0	0.42	0.33	0.0	0.4	0.35	0.05	1.0	0.43	0.28	0.44
EFI26524	0.0	0.0	0.0	0.54	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.59	0.0	0.93	0.72	0.63	0.6	0.0	0.64	0.0	0.0	0.0	0.66
EFI26528	0.09	0.03	0.04	0.84	0.02	0.05	0.02	0.15	0.05	0.09	0.04	0.01	0.02	0.14	0.15	0.26	0.45	0.06	0.2	0.24	0.3	0.32	0.28	0.3	0.15	0.05	0.29	1.0
EFI26556	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0
EFI26643	0.35	0.19	0.09	0.51	0.61	0.79	0.18	0.69	0.62	0.42	0.63	1.0	0.17	0.2	0.21	0.6	0.72	0.09	0.08	0.28	0.05	0.37	1.0	0.32	0.09	0.56	0.2	0.28
EFI26725	0.0	0.0	0.0	0.75	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
EFI27077	0.25	0.01	0.81	0.49	0.21	0.15	0.5	0.16	0.29	0.06	0.21	0.15	0.95	0.09	0.09	0.0	0.0	0.57	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.03	0.04	0.25	0.0
EFI27091	0.0	0.0	0.0	0.63	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.25	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0
EFI27232	0.0	0.0	0.0	0.14	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.95	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI27489	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI27818	0.09	0.17	0.28	0.25	0.18	0.21	0.29	0.32	0.79	0.45	1.0	0.18	0.38	0.15	0.14	0.15	0.14	0.54	0.29	0.3	0.18	0.19	0.27	0.25	0.33	0.3	0.16	0.44
EFI28280	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)