1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_13 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

 Transpose table  Download table
Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.11 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 3.8 0.57 1.46 0.91 1.26 0.46 0.46 1.32 1.27 0.93 0.94 0.46 0.5 1.42 0.8 0.7 0.21 0.85 1.1 0.51 0.47 1.34 0.51 1.15 0.58 0.36 0.81
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.1 0.01 0.0 0.0 0.05 0.11 0.05 0.02 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0
3.13 2.0 0.16 6.59 0.13 0.08 0.03 0.33 2.89 1.1 1.93 0.05 0.13 3.52 9.84 0.2 0.0 0.51 0.05 0.2 0.15 0.16 0.26 0.15 1.59 1.86 0.99 1.14
0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.16 0.13 0.26 0.09 0.6 0.08 0.13 0.05 0.22 0.82 0.0 0.34 0.15 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.19 0.44 0.21 0.27
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.17 0.0 0.17 0.12 0.06 0.24 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.24
0.93 2.65 1.31 10.54 10.6 5.23 0.58 0.13 1.8 0.3 1.75 17.54 0.2 0.2 0.4 2.43 4.25 2.39 1.53 1.05 0.67 2.17 3.11 0.78 91.68 60.22 0.6 4.89
0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.09 0.0 0.2 0.1 0.1 0.12 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.48
6.83 48.36 34.92 19.94 13.06 19.9 21.79 46.33 35.49 29.52 36.75 11.1 33.73 22.1 22.53 13.67 12.2 29.99 26.82 17.08 14.35 16.81 26.17 17.53 32.37 10.24 17.64 9.84
2.25 2.55 2.83 2.79 1.11 1.03 2.33 2.54 5.09 3.7 4.36 1.69 3.07 1.45 1.89 4.6 3.71 7.51 8.08 3.76 3.24 4.94 2.22 4.58 2.72 1.83 1.48 3.17
0.1 0.15 0.48 1.76 1.31 0.65 1.33 1.04 3.95 1.69 3.61 1.28 2.53 0.53 1.06 0.77 0.49 1.13 0.53 0.85 0.7 0.78 0.35 0.71 0.98 0.82 0.5 0.69
0.0 0.0 0.0 0.69 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.92 0.25 1.3 0.17 0.21 0.08 0.15 0.19 0.1 0.22 0.14 0.04 0.19 0.11 0.05 0.04 0.18 0.08 0.31 0.22 0.25 0.21 0.04 0.05 0.63 0.23 0.23
0.0 0.41 0.0 0.15 0.31 1.59 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
9.62 13.54 86.01 160.6 22.37 42.72 19.51 9.11 5.23 8.55 5.39 20.89 22.91 35.3 28.8 148.5 87.88 148.91 128.16 146.09 124.96 143.05 15.36 146.3 15.74 14.94 25.36 161.76
0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.52 0.0 0.64 1.34 0.22 0.45 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.58
0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0
11.46 524.55 552.29 411.43 605.6 613.26 262.7 881.37 850.1 953.57 744.12 784.2 274.99 216.89 192.35 539.73 460.83 230.96 218.23 492.29 750.18 556.91 332.9 457.56 79.28 99.96 181.4 801.83
0.04 0.22 0.16 0.41 0.0 0.0 0.03 0.0 0.03 0.08 0.05 0.03 0.03 0.26 0.29 0.0 0.0 0.12 0.05 0.22 0.0 0.0 0.09 0.06 0.14 0.31 0.25 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.98 2.07 0.19 1.26 0.34 0.65 0.52 0.67 1.16 0.95 1.48 0.3 0.05 0.79 1.27 0.58 0.87 3.39 0.46 1.01 0.73 1.42 1.08 0.9 0.19 0.96 1.21 1.0
0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.03 0.22 0.29 0.12 0.25 0.18 0.0 0.12 0.58 0.12 0.06 0.18 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.19 0.0 0.19
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.13
0.07 0.11 0.11 0.58 0.23 0.32 0.24 0.22 0.67 0.55 0.58 0.3 0.09 0.2 0.27 0.4 1.4 0.16 0.05 0.21 0.09 0.25 0.12 0.29 0.04 0.44 0.43 0.57
0.0 0.0 0.0 45.86 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3
0.0 0.03 0.0 0.07 0.08 0.0 0.12 0.0 0.0 0.08 0.0 0.07 0.14 0.09 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.11 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0
2.17 19.22 16.17 14.27 1.3 0.0 2.19 12.85 10.66 0.0 13.21 2.55 0.0 7.44 4.65 4.83 1.5 0.0 12.08 9.4 0.0 11.43 10.14 1.5 28.86 12.48 8.09 12.57
0.02 0.04 0.03 32.38 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 59.94 35.5 0.22 55.9 43.43 37.82 35.7 0.0 38.53 0.11 0.0 0.03 39.35
4.66 1.67 2.42 45.26 1.3 2.87 0.88 8.33 2.89 4.74 2.26 0.48 0.86 7.55 8.34 14.12 24.16 3.44 11.04 13.16 16.4 17.44 14.92 16.26 7.92 2.74 15.47 54.08
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
21.24 11.56 5.23 31.06 37.38 48.25 10.89 42.01 37.52 25.71 38.54 60.89 10.07 11.99 12.75 36.84 43.67 5.42 4.64 16.85 3.22 22.35 60.76 19.58 5.29 33.81 12.37 16.93
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0
93.23 4.17 299.26 179.6 78.31 56.82 185.48 57.8 107.33 21.51 78.66 56.11 350.22 31.27 32.45 0.0 0.0 209.25 0.0 0.0 0.0 0.0 367.52 0.0 10.63 14.36 91.58 0.0
0.0 0.0 0.0 1.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 2.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.58 1.06 1.8 1.59 1.13 1.33 1.82 2.05 5.0 2.84 6.32 1.14 2.41 0.94 0.89 0.95 0.88 3.4 1.85 1.88 1.16 1.19 1.72 1.55 2.09 1.88 0.99 2.75
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)