Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	FB cap+lamellae,YMG,strain #326	FB stipe,YMG,strain #326	Hyphal knots,control,strain #326	Mycelium	Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h	Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h	Mycelium,LiCl,strain #326	Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO	Mycelium,control,20C,matA/matB KO	Mycelium,control,28C,8h	Mycelium,control,strain #326	Stg 1 primordium,YMG,strain #326	Stg 2 primordium,YMG,strain #326	Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130	Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130	Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO	Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130	Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130	Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130	Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130	Vegetative mycelium,YMG,strain #326	Mycelium,control,YMG,37C,strain #130	YFB cap,YMG,strain #326	YFB lamellae,YMG,strain #326	secondary hyphal knots,YMG,strain #326	strain #130
EAU80814	0.01	0.11	0.29	0.18	0.13	0.14	0.41	0.08	0.14	0.14	0.14	0.14	0.35	0.16	0.15	0.54	0.45	1.0	0.55	0.5	0.54	0.5	0.14	0.49	0.05	0.09	0.14	0.32
EAU81066	0.04	0.14	0.42	0.29	0.2	0.19	0.42	0.21	0.23	0.25	0.28	0.17	0.39	0.27	0.24	0.28	0.22	1.0	0.22	0.3	0.34	0.24	0.23	0.25	0.15	0.24	0.36	0.18
EAU81219	0.02	0.14	0.36	0.22	0.19	0.13	0.35	0.11	0.21	0.15	0.26	0.21	0.43	0.2	0.16	0.5	0.35	1.0	0.25	0.4	0.5	0.4	0.24	0.43	0.06	0.07	0.2	0.17
EAU81225	0.11	0.27	0.25	0.74	0.07	0.05	0.29	0.07	0.12	0.12	0.11	0.09	0.3	0.19	0.21	0.8	0.77	0.5	0.84	0.97	1.0	0.77	0.26	0.78	0.43	0.22	0.22	0.93
EAU81238	0.16	0.43	0.25	0.38	0.17	0.18	0.42	0.23	0.27	0.21	0.32	0.16	0.45	0.27	0.23	0.56	0.43	1.0	0.86	0.5	0.54	0.47	0.22	0.49	0.11	0.16	0.23	0.28
EAU82262	0.06	0.09	0.44	0.33	0.12	0.08	0.45	0.09	0.33	0.15	0.25	0.14	0.29	0.29	0.3	0.51	0.39	1.0	0.58	0.55	0.45	0.49	0.24	0.45	0.09	0.49	0.26	0.63
EAU82337	0.1	0.15	0.32	0.32	0.33	0.31	0.36	0.14	0.2	0.27	0.19	0.31	0.36	0.24	0.2	0.26	0.24	1.0	0.2	0.27	0.28	0.22	0.16	0.22	0.16	0.34	0.21	0.32
EAU82358	0.44	0.32	0.36	0.24	0.18	0.21	0.35	0.16	0.22	0.19	0.25	0.22	0.31	0.23	0.2	0.3	0.28	1.0	0.39	0.32	0.33	0.28	0.18	0.33	0.11	0.29	0.23	0.21
EAU82367	0.02	0.07	0.3	0.39	0.19	0.08	0.31	0.2	0.36	0.62	0.52	0.26	0.31	0.17	0.17	0.64	0.54	1.0	0.77	0.67	0.92	0.73	0.2	0.72	0.15	0.11	0.17	0.33
EAU82377	0.21	0.21	0.59	0.2	0.27	0.36	0.59	0.18	0.21	0.21	0.25	0.22	0.37	0.37	0.37	0.43	0.35	1.0	0.42	0.46	0.41	0.41	0.19	0.43	0.14	0.29	0.37	0.23
EAU82402	0.05	0.22	0.49	0.31	0.42	0.35	0.49	0.24	0.32	0.27	0.33	0.32	0.55	0.37	0.32	0.36	0.31	1.0	0.33	0.4	0.36	0.38	0.23	0.37	0.14	0.29	0.41	0.28
EAU82409	0.22	0.35	0.48	0.35	0.19	0.22	0.44	0.24	0.27	0.23	0.29	0.14	0.34	0.3	0.27	0.5	0.33	1.0	0.39	0.51	0.56	0.44	0.29	0.45	0.19	0.29	0.39	0.28
EAU82413	0.35	0.26	0.83	0.31	0.32	0.23	0.91	0.34	0.31	0.4	0.33	0.29	0.6	0.48	0.42	0.34	0.27	1.0	0.39	0.38	0.43	0.33	0.33	0.35	0.31	0.58	0.55	0.25
EAU82444	0.02	0.07	0.21	0.17	0.13	0.1	0.17	0.12	0.13	0.13	0.16	0.13	0.15	0.14	0.13	0.43	0.32	1.0	0.44	0.43	0.43	0.4	0.11	0.38	0.07	0.1	0.13	0.19
EAU82496	0.05	0.25	0.26	0.32	0.22	0.15	0.2	0.22	0.19	0.28	0.2	0.15	0.27	0.23	0.22	0.53	0.43	1.0	0.54	0.49	0.69	0.45	0.19	0.44	0.16	0.29	0.26	0.41
EAU82527	0.01	0.15	0.29	0.31	0.17	0.1	0.31	0.09	0.18	0.15	0.2	0.13	0.24	0.2	0.19	0.47	0.36	1.0	0.67	0.46	0.47	0.39	0.15	0.44	0.08	0.2	0.19	0.39
EAU82688	0.03	0.07	0.23	0.22	0.13	0.08	0.24	0.09	0.17	0.11	0.16	0.15	0.22	0.3	0.26	0.35	0.3	1.0	0.28	0.48	0.43	0.39	0.1	0.43	0.05	0.18	0.24	0.34
EAU82725	0.35	0.35	0.52	0.39	0.24	0.2	0.41	0.17	0.21	0.2	0.24	0.27	0.33	0.27	0.24	0.54	0.43	1.0	0.64	0.56	0.63	0.52	0.29	0.5	0.05	0.34	0.31	0.29
EAU82746	0.07	0.2	0.14	0.16	0.08	0.1	0.2	0.16	0.28	0.22	0.28	0.11	0.23	0.29	0.26	0.35	0.25	1.0	0.31	0.37	0.38	0.33	0.27	0.32	0.09	0.14	0.26	0.32
EAU82807	0.15	0.47	0.43	0.18	0.24	0.25	0.47	0.29	0.56	0.33	0.47	0.33	0.29	0.18	0.16	0.76	0.51	1.0	0.88	0.7	0.75	0.66	0.21	0.69	0.03	0.11	0.22	0.26
EAU82811	0.56	0.74	0.79	0.44	0.44	0.55	1.0	0.4	0.62	0.39	0.68	0.44	0.67	0.77	0.7	0.7	0.56	0.89	0.58	0.88	0.6	0.65	0.41	0.65	0.18	0.52	0.79	0.5
EAU82846	0.09	0.22	0.41	0.25	0.33	0.26	0.4	0.19	0.21	0.19	0.19	0.2	0.38	0.21	0.21	0.42	0.29	1.0	0.33	0.45	0.44	0.35	0.23	0.37	0.21	0.3	0.4	0.14
EAU82941	0.04	0.17	0.17	0.11	0.12	0.11	0.19	0.13	0.19	0.17	0.18	0.11	0.17	0.23	0.24	0.16	0.14	1.0	0.15	0.17	0.18	0.16	0.17	0.15	0.1	0.17	0.17	0.13
EAU82972	0.04	0.16	0.13	0.14	0.12	0.13	0.1	0.11	0.19	0.16	0.22	0.13	0.08	0.24	0.24	0.17	0.2	1.0	0.11	0.21	0.17	0.24	0.14	0.21	0.11	0.22	0.19	0.3
EAU83049	0.08	0.3	0.2	0.25	0.16	0.12	0.25	0.19	0.22	0.2	0.26	0.1	0.27	0.26	0.25	0.31	0.22	1.0	0.3	0.36	0.38	0.29	0.2	0.29	0.17	0.19	0.25	0.2
EAU83637	0.09	0.2	0.12	0.14	0.16	0.15	0.14	0.11	0.24	0.11	0.22	0.2	0.12	0.17	0.19	0.43	0.36	1.0	0.64	0.4	0.44	0.42	0.22	0.42	0.13	0.25	0.13	0.31
EAU83657	0.17	0.43	0.25	0.31	0.28	0.33	0.24	0.39	0.32	0.42	0.33	0.2	0.46	0.16	0.16	0.68	0.3	0.21	0.7	1.0	0.63	0.57	0.19	0.64	0.2	0.43	0.2	0.21
EAU83778	0.06	0.07	0.33	0.16	0.17	0.12	0.41	0.17	0.31	0.21	0.32	0.15	0.38	0.32	0.27	0.5	0.31	1.0	0.39	0.42	0.47	0.41	0.28	0.42	0.1	0.23	0.3	0.15
EAU84211	0.02	0.11	0.25	0.15	0.23	0.09	0.34	0.11	0.16	0.14	0.18	0.2	0.25	0.19	0.18	0.47	0.32	1.0	0.29	0.3	0.47	0.34	0.19	0.36	0.1	0.25	0.14	0.17
EAU86271	0.13	0.28	0.36	0.44	0.25	0.25	0.36	0.33	0.35	0.25	0.38	0.25	0.48	0.38	0.35	0.83	0.75	0.99	1.0	0.85	0.82	0.78	0.23	0.81	0.23	0.38	0.49	0.41
EAU86353	0.08	0.16	0.25	0.25	0.13	0.09	0.24	0.12	0.16	0.18	0.17	0.08	0.31	0.16	0.15	0.32	0.28	1.0	0.39	0.4	0.39	0.32	0.14	0.25	0.2	0.25	0.2	0.28
EAU86440	0.03	0.05	0.64	0.47	0.1	0.04	0.43	0.25	0.42	0.27	0.51	0.08	0.43	0.31	0.29	0.8	0.63	0.74	0.87	0.75	1.0	0.7	0.32	0.67	0.03	0.14	0.32	0.34
EAU86441	0.07	0.17	0.19	0.19	0.14	0.11	0.26	0.16	0.24	0.17	0.26	0.11	0.14	0.24	0.22	0.32	0.2	1.0	0.3	0.31	0.28	0.27	0.2	0.26	0.1	0.46	0.19	0.25
EAU86453	0.06	0.13	0.14	0.22	0.1	0.09	0.15	0.11	0.12	0.11	0.13	0.09	0.21	0.16	0.15	0.68	0.51	1.0	0.54	0.57	0.6	0.54	0.11	0.55	0.1	0.15	0.22	0.2
EAU86704	0.08	0.43	1.0	0.32	0.69	0.53	0.49	0.53	0.39	0.73	0.48	0.63	0.62	0.73	0.64	0.76	0.41	0.48	0.53	0.78	0.72	0.64	0.67	0.67	0.24	0.7	0.71	0.13
EAU87282	0.04	0.29	0.21	0.21	0.16	0.15	0.37	0.12	0.22	0.19	0.21	0.14	0.3	0.32	0.3	0.36	0.24	1.0	0.35	0.33	0.39	0.29	0.24	0.3	0.24	0.31	0.27	0.27
EAU87421	0.12	0.26	0.14	0.34	0.28	0.3	0.33	0.24	0.29	0.27	0.37	0.36	0.48	0.37	0.28	0.54	0.45	0.92	1.0	0.67	0.67	0.59	0.24	0.65	0.19	0.19	0.39	0.17
EAU87481	0.05	0.21	0.37	0.48	0.15	0.1	0.36	0.22	0.31	0.27	0.37	0.1	0.35	0.37	0.37	0.4	0.26	1.0	0.41	0.43	0.54	0.31	0.24	0.37	0.29	0.38	0.31	0.34
EAU87482	0.08	0.28	0.29	0.52	0.16	0.15	0.31	0.2	0.26	0.22	0.33	0.16	0.3	0.62	0.57	0.5	0.31	1.0	0.45	0.57	0.63	0.45	0.3	0.43	0.52	0.48	0.39	0.36
EAU87799	0.06	0.14	0.59	0.27	0.34	0.32	0.47	0.19	0.46	0.27	0.47	0.47	0.57	0.38	0.37	0.58	0.54	1.0	0.45	0.63	0.64	0.67	0.28	0.67	0.23	0.3	0.34	0.46
EAU87817	0.04	0.07	0.36	0.34	0.18	0.13	0.33	0.19	0.36	0.21	0.38	0.16	0.37	0.32	0.3	0.46	0.29	1.0	0.35	0.47	0.5	0.4	0.22	0.43	0.07	0.26	0.25	0.3
EAU87900	0.49	0.5	0.54	0.29	0.23	0.18	0.41	0.27	0.3	0.25	0.3	0.17	0.46	0.33	0.3	0.53	0.38	1.0	0.57	0.54	0.59	0.46	0.32	0.44	0.32	0.2	0.37	0.23
EAU87956	0.21	0.19	0.45	0.29	0.28	0.26	0.56	0.2	0.22	0.37	0.24	0.16	0.54	0.35	0.33	0.32	0.28	1.0	0.18	0.34	0.34	0.34	0.2	0.31	0.17	0.39	0.4	0.39
EAU87981	0.28	0.45	0.35	0.15	0.12	0.06	0.37	0.32	0.25	0.17	0.27	0.13	0.17	0.17	0.16	0.35	0.13	1.0	0.28	0.31	0.35	0.3	0.13	0.3	0.16	0.28	0.19	0.15
EAU87994	0.08	0.16	0.68	0.35	0.31	0.3	0.51	0.21	0.21	0.22	0.24	0.26	0.44	0.33	0.28	0.42	0.33	1.0	0.3	0.49	0.49	0.47	0.25	0.4	0.2	0.29	0.34	0.3
EAU89292	0.04	0.23	0.67	0.56	0.63	0.43	0.6	0.44	0.48	0.62	0.41	0.42	0.7	0.42	0.37	0.64	0.45	1.0	0.59	0.58	0.62	0.49	0.37	0.43	0.22	0.36	0.42	0.34
EAU89321	0.03	0.14	0.33	0.32	0.24	0.18	0.26	0.15	0.21	0.23	0.22	0.24	0.21	0.25	0.24	0.6	0.43	1.0	0.53	0.58	0.72	0.52	0.2	0.53	0.22	0.2	0.22	0.38
EAU89369	0.13	0.29	0.33	0.33	0.27	0.23	0.31	0.19	0.3	0.31	0.3	0.28	0.3	0.35	0.32	0.42	0.27	1.0	0.29	0.36	0.45	0.38	0.24	0.38	0.25	0.35	0.3	0.31
EAU89745	0.04	0.22	0.56	0.21	0.33	0.52	0.59	0.34	0.25	0.29	0.25	0.37	0.43	0.34	0.31	0.38	0.4	1.0	0.41	0.44	0.49	0.43	0.18	0.47	0.16	0.44	0.32	0.28
EAU89794	0.03	0.1	0.3	0.19	0.28	0.2	0.34	0.19	0.29	0.29	0.29	0.3	0.37	0.24	0.24	0.15	0.12	1.0	0.11	0.16	0.16	0.15	0.2	0.13	0.09	0.37	0.27	0.11
EAU90076	0.11	0.42	0.5	0.49	0.82	0.58	0.42	0.4	0.49	0.47	0.45	0.67	0.47	0.66	0.61	0.75	0.56	1.0	0.41	0.54	0.52	0.58	0.49	0.45	0.27	0.42	0.71	0.6
EAU90176	0.03	0.21	0.2	0.13	0.26	0.22	0.22	0.11	0.14	0.16	0.14	0.22	0.26	0.23	0.22	0.17	0.2	1.0	0.1	0.2	0.15	0.19	0.08	0.18	0.14	0.12	0.19	0.12
EAU90191	0.24	0.39	0.17	0.18	0.25	0.21	0.2	0.16	0.23	0.2	0.26	0.21	0.19	0.21	0.21	0.3	0.22	1.0	0.16	0.32	0.3	0.27	0.16	0.25	0.23	0.47	0.24	0.18
EAU90236	0.2	0.24	0.81	0.48	0.32	0.3	0.47	0.28	0.42	0.47	0.44	0.31	0.57	0.51	0.48	0.72	0.56	1.0	0.79	0.9	0.84	0.68	0.29	0.67	0.22	0.4	0.48	0.66
EAU90533	0.12	0.27	0.55	0.39	0.42	0.42	0.52	0.31	0.38	0.44	0.43	0.38	0.53	0.46	0.42	0.39	0.34	1.0	0.22	0.45	0.42	0.4	0.39	0.36	0.22	0.41	0.56	0.36
EAU90717	0.02	0.21	1.0	0.22	0.47	0.39	0.65	0.51	0.72	0.31	0.82	0.46	0.54	0.63	0.64	0.48	0.28	0.66	0.49	0.57	0.64	0.51	0.62	0.53	0.08	0.17	0.72	0.19
EAU92069	0.03	0.1	0.24	0.28	0.13	0.12	0.3	0.14	0.25	0.19	0.24	0.12	0.24	0.2	0.19	0.46	0.35	1.0	0.37	0.45	0.48	0.42	0.24	0.4	0.11	0.22	0.19	0.29
EAU92070	0.06	0.23	0.46	0.44	0.12	0.11	0.64	0.3	0.41	0.36	0.37	0.09	0.61	0.4	0.4	0.45	0.41	1.0	0.63	0.47	0.49	0.4	0.44	0.45	0.23	0.43	0.39	0.35
EAU92092	0.2	0.27	0.35	0.3	0.16	0.18	0.62	0.2	0.21	0.3	0.25	0.15	0.69	0.32	0.28	0.51	0.49	1.0	0.51	0.57	0.5	0.51	0.19	0.48	0.19	0.23	0.35	0.36
EAU92232	0.01	0.07	0.14	0.19	0.16	0.11	0.24	0.11	0.17	0.18	0.21	0.17	0.27	0.11	0.09	0.32	0.25	1.0	0.23	0.27	0.25	0.26	0.08	0.25	0.04	0.27	0.11	0.17
EAU93306	0.15	0.14	0.41	0.24	0.24	0.17	0.35	0.25	0.34	0.28	0.31	0.22	0.48	0.42	0.4	0.48	0.4	1.0	0.37	0.56	0.56	0.53	0.3	0.5	0.16	0.24	0.35	0.3
EAU93414	0.04	0.11	0.3	0.23	0.19	0.14	0.2	0.2	0.24	0.14	0.28	0.15	0.17	0.17	0.18	0.52	0.34	1.0	0.37	0.45	0.56	0.37	0.26	0.42	0.08	0.11	0.16	0.21
EAU93477	0.12	0.38	0.77	0.59	0.2	0.17	0.96	0.44	0.73	0.47	0.63	0.21	0.9	0.87	0.95	0.7	0.74	0.54	0.84	0.92	0.93	0.86	0.83	0.73	0.28	0.93	0.91	1.0
EAU93561	0.06	0.12	0.29	0.29	0.23	0.2	0.34	0.19	0.26	0.23	0.27	0.18	0.32	0.32	0.29	0.29	0.21	1.0	0.45	0.29	0.29	0.25	0.2	0.24	0.24	0.27	0.33	0.25
EFI26874	0.13	0.14	0.38	0.39	0.25	0.17	0.36	0.22	0.31	0.23	0.3	0.23	0.42	0.4	0.33	0.44	0.49	1.0	0.4	0.53	0.49	0.44	0.29	0.43	0.12	0.17	0.47	0.34
EFI27122	0.04	0.08	0.2	0.17	0.11	0.06	0.27	0.16	0.19	0.16	0.19	0.07	0.24	0.15	0.14	0.43	0.25	1.0	0.42	0.42	0.44	0.36	0.18	0.36	0.06	0.17	0.15	0.22
EFI27345	0.18	0.3	0.87	0.37	0.45	0.33	0.88	0.57	0.88	0.71	0.88	0.53	0.52	0.83	0.78	0.84	0.79	0.58	0.76	1.0	0.79	0.91	0.44	0.89	0.49	0.47	0.91	0.56
EFI27436	0.05	0.32	0.5	0.28	0.25	0.33	0.52	0.24	0.36	0.26	0.44	0.27	0.39	0.51	0.45	0.57	0.44	1.0	0.43	0.55	0.6	0.53	0.31	0.57	0.3	0.34	0.41	0.37
EFI28453	0.36	0.24	1.0	0.4	0.43	0.36	0.69	0.31	0.44	0.33	0.36	0.31	0.61	0.36	0.38	0.44	0.31	0.58	0.58	0.46	0.48	0.42	0.45	0.46	0.19	0.53	0.51	0.37
EFI28539	0.1	0.16	0.34	0.23	0.17	0.12	0.39	0.17	0.18	0.19	0.23	0.13	0.32	0.35	0.35	0.17	0.2	1.0	0.13	0.26	0.2	0.22	0.23	0.26	0.15	0.21	0.42	0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)