Heatmap: Cluster_23 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.0 0.0 1.78 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.46 0.33 0.25 0.48 0.0 0.42 0.57 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.28 0.21 0.14 0.0 0.33 0.07 0.12 0.05 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.04 0.02 0.09 0.04 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0
0.0 1.43 5.12 3.14 0.0 0.0 0.0 0.0 4.63 5.64 0.0 1.87 0.0 1.24 0.0 0.0 0.55 0.0 1.38 0.37 0.0 0.0 0.0
15.56 13.03 13.36 1.85 0.83 4.3 25.61 7.15 21.73 10.88 11.74 5.79 8.43 4.41 8.86 1.07 2.4 1.23 0.6 6.97 2.91 5.27 4.81
0.0 1.47 5.35 0.47 0.0 0.24 0.0 0.84 0.26 3.45 0.72 0.0 0.0 2.17 0.96 0.43 0.13 0.0 0.16 0.18 7.05 0.0 0.0
0.0 0.0 0.42 0.34 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.14
0.0 2.26 1.76 0.92 0.45 0.91 0.58 0.0 0.69 2.23 0.3 1.27 0.96 0.93 0.33 0.59 0.42 0.16 0.14 1.22 2.07 0.0 1.14
0.0 4.37 46.04 3.0 0.0 3.11 37.83 8.22 0.0 23.39 0.0 4.53 8.98 1.86 4.09 7.32 1.64 2.85 0.0 5.52 0.0 0.0 0.0
0.0 1.84 3.23 0.71 1.78 1.26 2.65 0.0 5.67 8.87 1.45 0.59 1.81 6.57 4.29 0.38 0.7 0.28 0.0 1.02 5.48 0.0 0.0
0.0 10.06 50.79 59.76 46.46 62.64 27.82 9.07 109.41 85.91 15.18 33.18 74.27 63.72 45.07 14.17 18.23 24.84 7.72 59.55 0.0 0.0 0.0
0.0 3.37 4.15 3.86 3.44 4.86 10.22 2.22 3.68 13.66 3.0 2.13 5.23 11.26 9.92 0.75 2.02 0.38 0.91 3.13 4.07 2.45 4.48
0.0 0.1 0.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.0 0.2 0.13 0.2 0.0 0.02 0.27 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.56 0.0 4.67 0.0 0.0 1.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.71 1.12 1.05 0.21 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 2.06 0.0 2.61 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.16 0.5 1.76 0.0 1.13
11.74 5.06 15.24 7.01 4.83 9.96 6.13 4.69 8.13 16.19 6.99 5.82 6.34 24.5 13.72 3.34 3.57 2.05 1.54 5.32 9.69 5.76 8.05
0.0 1.03 0.0 0.0 0.91 0.99 0.0 0.0 0.55 0.0 0.47 0.0 0.34 0.87 0.32 0.15 0.0 0.12 0.0 0.49 0.0 0.0 0.0
0.0 0.06 0.57 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.08 0.46 0.0 0.0 0.0 0.12 0.03 0.02 0.02 0.14 0.0 0.03 0.44 0.0 0.0
0.0 1.46 15.37 1.01 0.96 4.97 0.0 2.74 0.0 0.0 4.76 5.73 2.92 0.62 0.68 1.85 2.2 0.0 0.78 1.68 3.35 0.0 0.0
6.65 2.13 6.8 5.78 6.2 5.06 5.15 2.97 6.67 7.65 7.13 3.67 2.41 4.86 8.28 4.08 4.62 1.05 1.37 1.91 10.65 4.16 4.39
0.0 4.44 8.32 0.0 0.0 0.0 0.0 2.23 1.81 4.57 4.8 5.87 4.66 4.96 1.12 0.99 0.0 0.39 0.0 3.14 12.72 0.0 0.0
4.41 1.24 0.0 0.55 0.49 0.18 0.0 0.0 0.4 1.87 0.36 0.33 0.77 1.7 0.48 0.22 0.1 0.0 0.14 0.77 0.3 0.0 0.0
0.0 0.35 0.84 0.34 0.15 0.0 0.0 0.11 0.14 0.35 0.59 0.57 0.42 1.32 0.87 0.13 0.16 0.11 0.15 0.22 0.9 0.0 0.68
4.6 5.36 15.34 3.39 1.27 17.14 2.29 0.75 7.41 11.93 1.78 7.79 14.33 14.28 7.23 1.33 0.75 0.25 0.57 4.28 11.18 0.0 1.51
0.0 0.0 16.93 0.0 0.0 3.33 0.0 0.0 7.51 23.81 7.59 6.19 51.58 6.21 20.34 0.0 1.86 0.0 0.0 8.64 0.0 0.0 0.0
0.0 6.06 23.66 1.16 5.33 2.27 0.0 0.0 17.08 6.88 4.18 3.36 4.16 4.26 5.53 2.11 3.22 0.0 0.9 5.21 18.0 0.0 0.0
0.34 0.93 2.54 0.22 0.11 0.23 0.85 0.12 0.96 2.94 0.33 0.35 0.48 2.02 1.75 0.18 0.15 0.06 0.18 0.49 1.94 0.14 0.25
4.21 2.04 1.1 0.83 0.81 3.37 0.34 0.22 1.68 8.25 1.42 1.41 0.4 5.14 1.46 0.74 0.79 0.47 0.25 0.45 3.01 0.65 1.34
0.0 1.2 0.0 0.47 0.9 0.24 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.75 0.16 0.14 0.26 0.0 0.18 0.2 4.43 0.0 0.0
2.9 3.61 4.27 0.0 0.49 0.38 1.91 0.0 1.04 6.48 2.05 2.35 2.4 5.58 1.86 0.51 0.29 0.18 0.17 1.19 4.21 0.0 0.0
0.0 1.91 3.08 1.26 1.21 0.8 2.11 0.27 1.03 2.16 2.01 0.91 1.15 2.09 0.82 0.74 1.28 0.32 0.07 0.94 4.09 1.21 2.22
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.05 0.24 0.0 0.04 0.0 0.03 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.45 0.09 0.0 0.27 0.37 0.0 0.1 1.07 0.38 0.0 0.13 0.7 0.42 0.05 0.05 0.04 0.0 0.02 0.88 0.0 0.49
0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.45 2.26 5.28 3.41 3.28 3.62 0.0 0.21 0.07 0.59 0.5 0.27 0.74 6.04 1.76 2.04 1.62 0.02 0.04 1.62 2.96 4.73 2.88
0.66 2.09 1.94 0.39 0.53 0.28 0.0 0.26 0.44 1.59 2.24 0.5 0.4 3.24 1.42 1.33 2.09 0.48 0.27 1.28 1.9 1.15 1.57
1.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.73 0.32 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 3.23 0.0
6.42 10.07 8.46 9.94 17.48 11.72 0.0 0.0 0.0 0.0 9.34 7.73 7.45 9.67 5.4 9.89 9.66 0.0 0.0 4.3 13.24 18.26 9.72
0.0 0.77 2.74 0.42 0.13 0.13 0.56 0.0 0.15 0.54 0.59 0.0 0.76 0.87 0.55 0.08 0.15 0.0 0.39 0.34 1.12 0.81 0.0
7.4 4.75 11.1 3.99 3.69 3.48 4.42 2.46 2.59 11.97 4.56 0.56 0.55 5.48 4.46 4.03 5.07 0.24 0.0 1.76 9.79 1.54 2.45
0.09 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.07 3.83 9.31 0.0 17.02 14.1 8.26 4.49 2.05 1.81 6.25 5.14 13.65 0.0 0.0 0.0
0.89 0.67 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.9 0.21 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0 0.1 0.18 0.64 0.26
0.6 0.47 0.38 0.12 0.14 0.04 0.47 0.51 0.17 0.29 0.21 0.12 0.33 0.26 0.38 0.09 0.17 0.02 0.18 0.24 0.57 0.23 0.21
0.0 3.72 13.07 13.76 2.42 12.83 10.74 0.0 0.0 4.0 2.49 16.73 27.08 12.39 50.31 6.26 5.67 0.0 1.76 15.37 8.56 0.0 0.0
0.0 5.76 0.0 5.54 3.81 1.34 0.0 3.66 5.94 12.93 1.41 3.75 4.77 7.78 8.2 3.26 0.73 0.64 0.0 4.53 4.47 0.0 7.37
0.0 2.7 6.85 2.94 0.6 0.7 0.0 0.0 1.52 2.72 6.08 2.26 5.76 8.05 9.14 0.41 1.5 2.22 0.52 4.65 5.73 0.0 0.0
1.77 2.76 1.69 0.69 0.41 0.33 6.95 1.21 2.12 3.51 1.66 1.31 1.5 0.96 0.67 0.07 0.06 0.84 1.12 2.0 1.66 0.67 0.0
13.95 16.28 30.4 14.79 8.83 15.64 16.78 10.62 10.24 29.36 10.09 9.16 10.18 16.22 13.48 9.21 10.64 5.79 4.45 10.76 19.14 19.64 20.42
2.84 3.22 0.0 0.83 0.57 0.11 17.89 5.83 4.26 8.73 1.53 1.9 4.1 3.49 1.79 0.37 1.4 1.18 1.18 1.8 7.55 0.61 0.56
0.0 0.24 1.03 0.23 0.18 0.19 0.85 0.0 0.0 0.82 0.0 0.3 0.43 0.4 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 1.01 0.0 0.0
0.05 0.12 0.0 0.05 0.02 0.02 0.0 0.0 0.02 0.06 0.02 0.04 0.01 0.11 0.08 0.01 0.03 0.0 0.0 0.05 0.08 0.0 0.0
0.22 0.18 0.15 0.05 0.0 0.04 0.04 0.03 0.12 0.03 0.02 0.16 0.03 0.89 0.07 0.13 0.1 0.01 0.01 0.1 0.13 0.0 0.0
1.59 0.55 1.76 3.96 0.19 0.6 0.29 0.0 0.39 1.95 0.71 0.06 0.34 0.43 1.21 0.13 0.08 0.0 0.0 0.7 1.49 0.0 0.0
0.0 0.21 0.23 0.1 0.0 0.04 0.19 0.0 0.0 0.43 0.1 0.17 0.1 0.13 0.18 0.03 0.07 0.11 0.0 0.06 0.6 0.0 0.0
3.25 3.05 2.79 2.5 3.05 3.01 0.0 0.0 3.42 3.49 1.22 0.51 2.59 4.21 1.67 1.33 0.9 0.51 1.2 2.78 0.91 1.65 3.01
1.04 2.47 3.78 1.29 1.63 2.41 0.85 1.29 1.37 1.62 0.47 2.26 1.4 3.72 3.29 1.03 1.0 1.0 0.89 2.31 2.74 0.41 1.11
0.0 0.19 0.4 0.09 0.07 0.0 0.33 0.0 0.35 0.41 0.49 0.0 0.05 0.5 0.0 0.05 0.21 0.0 0.4 0.04 0.13 0.47 0.0
0.0 0.22 1.87 0.83 0.17 0.36 0.77 0.5 0.63 2.62 0.72 0.0 1.55 6.87 3.61 0.34 0.3 0.0 0.0 0.7 1.53 0.0 0.0
0.0 0.33 1.39 1.99 1.56 1.66 0.0 0.75 2.19 0.68 0.29 0.0 0.21 1.08 1.48 1.33 0.45 0.26 0.0 0.77 0.46 0.0 1.51
0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
1.29 1.6 2.1 0.21 0.0 0.0 1.73 0.0 0.23 0.0 0.22 0.0 1.52 0.28 0.0 0.0 0.23 0.2 0.0 0.32 2.07 0.0 0.0
31.74 19.3 25.12 23.54 18.66 26.18 25.32 22.78 13.79 23.79 33.46 15.47 15.57 26.3 9.4 26.1 31.62 18.31 17.64 13.27 17.3 34.89 34.36
2.73 1.39 0.54 0.44 0.29 1.46 1.78 0.87 3.04 6.16 0.34 4.32 5.49 1.61 0.93 0.26 0.35 0.7 0.53 0.51 3.66 0.64 0.58
0.5 0.19 0.78 0.11 0.09 0.05 0.21 0.0 0.06 2.16 0.16 0.22 0.75 0.5 0.38 0.06 0.17 0.07 0.2 0.24 0.51 0.31 0.28
0.0 0.08 2.0 0.16 0.07 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.26 0.16 0.24 0.22 0.0 0.0 0.13 0.0 0.5 0.0
0.0 0.78 4.51 0.46 0.1 0.22 2.32 0.3 0.5 1.03 0.97 0.32 0.32 0.48 2.25 0.4 0.12 0.1 0.0 0.12 3.32 0.67 0.61
32.14 15.76 27.35 19.5 8.11 16.1 38.62 26.77 34.3 34.61 26.5 17.54 18.82 10.4 18.81 11.38 12.24 10.99 10.94 28.58 29.98 16.19 22.15
0.0 1.42 21.99 4.5 0.0 2.88 6.02 0.0 13.07 0.0 0.0 0.0 3.2 12.02 4.9 0.87 0.0 0.69 0.0 2.55 0.0 0.0 0.0
1.12 1.13 3.47 0.47 0.23 0.43 0.86 0.22 0.4 0.91 0.43 0.43 0.57 3.08 1.71 0.28 0.37 0.17 0.22 0.61 0.91 0.76 0.9
0.0 0.71 10.95 1.43 0.0 0.74 0.0 1.95 2.47 2.01 0.75 2.0 0.5 12.11 3.9 0.44 4.32 0.0 0.0 0.0 0.0 4.32 0.0
0.1 0.26 0.44 0.06 0.07 0.18 0.24 0.04 0.12 0.21 0.22 0.09 0.09 0.34 0.18 0.14 0.12 0.01 0.03 0.13 0.27 0.0 0.08
0.0 0.0 1.92 0.75 0.0 0.36 0.0 0.0 1.72 2.58 0.49 1.62 0.57 4.57 2.8 0.46 0.82 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 3.68 0.27 1.59 0.0 1.01 0.66 0.0 0.38 1.18 0.0 1.0 1.86 1.15 0.29 0.0 0.0 0.19 0.09 0.0 0.0 0.0
0.0 25.69 0.0 6.39 0.0 6.13 0.0 0.0 0.0 0.0 15.89 19.63 19.23 17.32 4.07 1.82 4.94 7.02 0.0 10.79 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.34 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.25 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.06 0.21 0.0 0.0
0.0 6.17 10.94 0.0 0.0 4.26 0.0 0.0 7.23 26.04 0.0 15.45 18.32 16.2 20.33 1.32 1.17 1.01 0.0 12.03 0.0 0.0 0.0
497.87 435.79 839.81 267.54 152.43 368.85 2220.13 598.35 610.89 775.65 452.63 588.86 678.35 574.61 836.35 229.66 237.09 241.69 232.18 867.82 868.52 180.03 188.49
0.0 12.03 81.41 9.71 17.26 2.36 0.0 0.0 7.69 9.96 7.62 21.25 11.16 12.66 6.22 4.19 7.56 9.62 8.25 12.85 19.75 0.0 0.0
0.17 0.09 0.25 0.16 0.28 0.28 0.21 0.27 0.11 0.21 0.05 0.26 0.0 0.32 0.83 0.18 0.08 0.04 0.07 0.01 0.24 0.0 0.54
4.69 3.68 1.35 1.39 1.14 2.56 2.93 3.01 2.35 2.94 2.1 1.75 1.83 2.43 0.56 2.42 3.05 1.42 1.42 1.63 2.5 1.92 2.22
0.0 0.96 0.0 0.0 0.16 0.17 0.73 0.0 0.0 1.14 1.1 0.42 0.48 1.53 0.36 0.21 0.1 0.24 0.13 0.23 0.58 0.0 0.0
2.03 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 2.97 0.0 1.09 1.58 0.0 0.73 0.0 0.33 0.39 0.0 0.16 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0
0.49 0.52 0.51 0.59 0.38 0.31 0.63 0.14 0.17 0.69 0.4 0.17 0.18 0.41 0.31 0.58 0.5 0.16 0.59 0.41 0.42 1.21 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 3.02 6.46 1.35 1.17 2.84 3.98 0.0 3.23 0.39 0.0 1.51 3.96 2.48 4.08 0.77 0.7 0.0 0.25 2.08 1.05 0.0 1.74
1.07 4.18 2.3 1.39 3.6 3.58 0.0 1.64 3.6 1.83 4.38 3.2 1.69 3.81 1.94 2.21 2.96 2.11 2.85 1.98 6.34 0.0 5.8
2.66 0.0 1.61 0.63 1.2 0.96 2.65 0.86 0.73 3.65 0.72 0.3 0.22 0.95 0.86 0.19 1.21 0.44 0.44 0.78 0.0 0.0 0.0
0.59 0.9 1.69 0.56 0.45 0.49 1.39 0.45 0.56 0.72 0.16 0.5 0.85 0.6 0.78 0.1 0.0 0.0 0.0 0.18 2.55 0.0 0.0
4.2 6.31 13.66 6.87 1.28 6.62 11.22 7.31 0.0 13.35 9.75 6.23 2.81 17.3 6.33 1.65 0.0 1.24 1.84 5.21 13.41 0.0 0.0
1.65 1.64 4.12 2.21 0.82 1.16 4.3 1.0 1.26 4.18 1.52 2.95 1.82 2.5 1.4 1.38 1.7 1.33 1.47 1.17 3.37 0.44 1.62
423.11 187.42 303.74 192.01 163.78 246.85 162.29 139.43 348.57 396.79 297.39 308.69 318.24 179.0 237.15 172.3 197.78 91.38 91.5 150.85 270.28 304.06 281.18
0.0 1.45 0.0 0.26 0.22 0.0 0.0 0.0 1.04 1.86 0.79 0.0 2.47 0.41 0.31 0.14 0.0 0.0 0.36 2.41 2.71 1.39 0.0
5.88 8.4 12.57 9.74 4.88 4.79 14.47 2.63 9.44 4.31 6.28 4.76 9.65 10.94 7.87 3.62 2.69 0.94 0.93 4.9 6.65 1.79 0.95
0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 1.13 0.55 0.23 0.78 0.56 0.06 0.29 0.89 0.46 0.12 0.07 0.09 0.0 0.16 0.34 1.22 0.0
5.72 3.31 3.44 0.74 1.02 1.09 2.83 1.47 0.53 3.56 2.3 1.33 1.24 2.33 0.73 0.78 1.86 0.25 0.59 0.8 1.94 0.0 1.11
0.0 0.16 0.78 0.16 0.0 0.67 0.0 0.0 0.26 0.31 0.24 0.07 0.16 0.26 0.1 0.0 0.04 0.0 0.0 0.04 0.0 0.46 0.0
0.45 2.26 5.28 3.41 3.28 3.62 0.0 0.21 0.07 0.59 0.5 0.27 0.74 6.04 1.76 2.04 1.62 0.02 0.04 1.62 2.96 4.73 2.88
0.0 0.23 0.27 0.21 0.0 0.05 0.22 0.0 0.18 0.0 0.11 0.17 0.38 0.54 0.29 0.13 0.12 0.09 0.12 0.5 0.18 0.64 0.29
8.44 13.05 10.36 8.38 3.17 4.82 5.91 2.77 6.71 26.17 8.96 6.35 6.27 11.27 11.49 2.81 1.58 1.48 2.0 5.27 12.82 7.5 7.15
0.0 0.68 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.43 1.22 0.88 0.68 0.68 0.88 2.77 1.28 0.29 0.09 0.0 0.0 0.34 1.57 0.0 0.0
0.0 0.79 1.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.34 0.0 1.28 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.92 0.46 0.0 0.0
1.15 0.24 0.0 0.19 0.0 0.0 0.72 0.0 0.78 1.44 0.18 0.0 0.0 0.12 0.12 0.0 0.1 0.16 0.13 0.26 0.0 0.0 0.0

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)