Heatmap: Cluster_23 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.0 0.0 1.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.26 0.18 0.14 0.27 0.0 0.24 0.32 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.69 0.52 0.34 0.0 0.82 0.17 0.3 0.13 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.47 0.24 1.0 0.46 0.21 0.78 0.0 0.0 0.06 0.68 0.0 0.0
0.0 0.25 0.91 0.56 0.0 0.0 0.0 0.0 0.82 1.0 0.0 0.33 0.0 0.22 0.0 0.0 0.1 0.0 0.25 0.07 0.0 0.0 0.0
0.61 0.51 0.52 0.07 0.03 0.17 1.0 0.28 0.85 0.42 0.46 0.23 0.33 0.17 0.35 0.04 0.09 0.05 0.02 0.27 0.11 0.21 0.19
0.0 0.21 0.76 0.07 0.0 0.03 0.0 0.12 0.04 0.49 0.1 0.0 0.0 0.31 0.14 0.06 0.02 0.0 0.02 0.03 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.2 0.16 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 1.0 0.78 0.41 0.2 0.4 0.25 0.0 0.31 0.98 0.13 0.56 0.43 0.41 0.14 0.26 0.18 0.07 0.06 0.54 0.91 0.0 0.5
0.0 0.09 1.0 0.07 0.0 0.07 0.82 0.18 0.0 0.51 0.0 0.1 0.2 0.04 0.09 0.16 0.04 0.06 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.21 0.36 0.08 0.2 0.14 0.3 0.0 0.64 1.0 0.16 0.07 0.2 0.74 0.48 0.04 0.08 0.03 0.0 0.12 0.62 0.0 0.0
0.0 0.09 0.46 0.55 0.42 0.57 0.25 0.08 1.0 0.79 0.14 0.3 0.68 0.58 0.41 0.13 0.17 0.23 0.07 0.54 0.0 0.0 0.0
0.0 0.25 0.3 0.28 0.25 0.36 0.75 0.16 0.27 1.0 0.22 0.16 0.38 0.82 0.73 0.05 0.15 0.03 0.07 0.23 0.3 0.18 0.33
0.0 0.37 0.0 0.11 0.0 0.11 0.0 0.0 0.74 0.48 0.73 0.0 0.08 1.0 0.08 0.0 0.06 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.27 0.43 0.4 0.08 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 1.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.06 0.19 0.67 0.0 0.43
0.48 0.21 0.62 0.29 0.2 0.41 0.25 0.19 0.33 0.66 0.29 0.24 0.26 1.0 0.56 0.14 0.15 0.08 0.06 0.22 0.4 0.24 0.33
0.0 1.0 0.0 0.0 0.88 0.96 0.0 0.0 0.54 0.0 0.45 0.0 0.33 0.84 0.31 0.14 0.0 0.11 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 1.0 0.0 0.0 0.0 0.83 0.0 0.15 0.81 0.0 0.0 0.0 0.21 0.04 0.04 0.04 0.24 0.0 0.05 0.78 0.0 0.0
0.0 0.09 1.0 0.07 0.06 0.32 0.0 0.18 0.0 0.0 0.31 0.37 0.19 0.04 0.04 0.12 0.14 0.0 0.05 0.11 0.22 0.0 0.0
0.62 0.2 0.64 0.54 0.58 0.48 0.48 0.28 0.63 0.72 0.67 0.34 0.23 0.46 0.78 0.38 0.43 0.1 0.13 0.18 1.0 0.39 0.41
0.0 0.35 0.65 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.14 0.36 0.38 0.46 0.37 0.39 0.09 0.08 0.0 0.03 0.0 0.25 1.0 0.0 0.0
1.0 0.28 0.0 0.13 0.11 0.04 0.0 0.0 0.09 0.42 0.08 0.07 0.17 0.39 0.11 0.05 0.02 0.0 0.03 0.17 0.07 0.0 0.0
0.0 0.26 0.64 0.26 0.11 0.0 0.0 0.09 0.11 0.26 0.44 0.43 0.32 1.0 0.66 0.1 0.12 0.09 0.12 0.16 0.68 0.0 0.52
0.27 0.31 0.9 0.2 0.07 1.0 0.13 0.04 0.43 0.7 0.1 0.45 0.84 0.83 0.42 0.08 0.04 0.01 0.03 0.25 0.65 0.0 0.09
0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.15 0.46 0.15 0.12 1.0 0.12 0.39 0.0 0.04 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0
0.0 0.26 1.0 0.05 0.23 0.1 0.0 0.0 0.72 0.29 0.18 0.14 0.18 0.18 0.23 0.09 0.14 0.0 0.04 0.22 0.76 0.0 0.0
0.12 0.32 0.86 0.07 0.04 0.08 0.29 0.04 0.33 1.0 0.11 0.12 0.16 0.69 0.6 0.06 0.05 0.02 0.06 0.17 0.66 0.05 0.08
0.51 0.25 0.13 0.1 0.1 0.41 0.04 0.03 0.2 1.0 0.17 0.17 0.05 0.62 0.18 0.09 0.1 0.06 0.03 0.05 0.37 0.08 0.16
0.0 0.27 0.0 0.11 0.2 0.05 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.17 0.04 0.03 0.06 0.0 0.04 0.05 1.0 0.0 0.0
0.45 0.56 0.66 0.0 0.08 0.06 0.3 0.0 0.16 1.0 0.32 0.36 0.37 0.86 0.29 0.08 0.05 0.03 0.03 0.18 0.65 0.0 0.0
0.0 0.47 0.75 0.31 0.3 0.2 0.52 0.07 0.25 0.53 0.49 0.22 0.28 0.51 0.2 0.18 0.31 0.08 0.02 0.23 1.0 0.3 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.09 0.08 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.83 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.19 0.86 0.0 0.15 0.0 0.1 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.42 0.08 0.0 0.25 0.34 0.0 0.09 1.0 0.35 0.0 0.13 0.65 0.39 0.05 0.05 0.04 0.0 0.02 0.82 0.0 0.45
0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.37 0.87 0.56 0.54 0.6 0.0 0.03 0.01 0.1 0.08 0.05 0.12 1.0 0.29 0.34 0.27 0.0 0.01 0.27 0.49 0.78 0.48
0.2 0.64 0.6 0.12 0.16 0.09 0.0 0.08 0.13 0.49 0.69 0.15 0.12 1.0 0.44 0.41 0.65 0.15 0.08 0.39 0.59 0.35 0.48
0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.23 0.1 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.35 0.55 0.46 0.54 0.96 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.42 0.41 0.53 0.3 0.54 0.53 0.0 0.0 0.24 0.73 1.0 0.53
0.0 0.28 1.0 0.15 0.05 0.05 0.21 0.0 0.05 0.2 0.22 0.0 0.28 0.32 0.2 0.03 0.05 0.0 0.14 0.13 0.41 0.3 0.0
0.62 0.4 0.93 0.33 0.31 0.29 0.37 0.21 0.22 1.0 0.38 0.05 0.05 0.46 0.37 0.34 0.42 0.02 0.0 0.15 0.82 0.13 0.2
0.23 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.53 0.22 0.55 0.0 1.0 0.83 0.49 0.26 0.12 0.11 0.37 0.3 0.8 0.0 0.0 0.0
0.99 0.74 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 1.0 0.24 0.0 0.0 0.06 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.11 0.2 0.71 0.29
1.0 0.78 0.63 0.19 0.23 0.06 0.78 0.85 0.28 0.48 0.34 0.2 0.54 0.44 0.63 0.15 0.27 0.03 0.3 0.39 0.95 0.37 0.34
0.0 0.07 0.26 0.27 0.05 0.26 0.21 0.0 0.0 0.08 0.05 0.33 0.54 0.25 1.0 0.12 0.11 0.0 0.04 0.31 0.17 0.0 0.0
0.0 0.45 0.0 0.43 0.29 0.1 0.0 0.28 0.46 1.0 0.11 0.29 0.37 0.6 0.63 0.25 0.06 0.05 0.0 0.35 0.35 0.0 0.57
0.0 0.3 0.75 0.32 0.07 0.08 0.0 0.0 0.17 0.3 0.67 0.25 0.63 0.88 1.0 0.04 0.16 0.24 0.06 0.51 0.63 0.0 0.0
0.25 0.4 0.24 0.1 0.06 0.05 1.0 0.17 0.31 0.5 0.24 0.19 0.22 0.14 0.1 0.01 0.01 0.12 0.16 0.29 0.24 0.1 0.0
0.46 0.54 1.0 0.49 0.29 0.51 0.55 0.35 0.34 0.97 0.33 0.3 0.33 0.53 0.44 0.3 0.35 0.19 0.15 0.35 0.63 0.65 0.67
0.16 0.18 0.0 0.05 0.03 0.01 1.0 0.33 0.24 0.49 0.09 0.11 0.23 0.2 0.1 0.02 0.08 0.07 0.07 0.1 0.42 0.03 0.03
0.0 0.24 1.0 0.22 0.18 0.19 0.82 0.0 0.0 0.79 0.0 0.29 0.42 0.38 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.98 0.0 0.0
0.42 1.0 0.0 0.44 0.13 0.13 0.0 0.0 0.15 0.54 0.13 0.31 0.09 0.88 0.63 0.08 0.22 0.0 0.0 0.45 0.67 0.0 0.0
0.25 0.2 0.17 0.06 0.0 0.04 0.05 0.03 0.14 0.03 0.02 0.18 0.03 1.0 0.07 0.15 0.11 0.01 0.02 0.12 0.15 0.0 0.0
0.4 0.14 0.44 1.0 0.05 0.15 0.07 0.0 0.1 0.49 0.18 0.02 0.09 0.11 0.31 0.03 0.02 0.0 0.0 0.18 0.38 0.0 0.0
0.0 0.35 0.38 0.17 0.0 0.07 0.31 0.0 0.0 0.72 0.17 0.29 0.16 0.22 0.31 0.05 0.12 0.18 0.0 0.1 1.0 0.0 0.0
0.77 0.72 0.66 0.59 0.72 0.72 0.0 0.0 0.81 0.83 0.29 0.12 0.62 1.0 0.4 0.32 0.21 0.12 0.29 0.66 0.22 0.39 0.72
0.28 0.65 1.0 0.34 0.43 0.64 0.22 0.34 0.36 0.43 0.12 0.6 0.37 0.98 0.87 0.27 0.26 0.26 0.24 0.61 0.72 0.11 0.29
0.0 0.38 0.8 0.18 0.14 0.0 0.66 0.0 0.7 0.83 1.0 0.0 0.11 1.0 0.0 0.1 0.43 0.0 0.81 0.08 0.26 0.95 0.0
0.0 0.03 0.27 0.12 0.03 0.05 0.11 0.07 0.09 0.38 0.11 0.0 0.23 1.0 0.53 0.05 0.04 0.0 0.0 0.1 0.22 0.0 0.0
0.0 0.15 0.64 0.9 0.71 0.76 0.0 0.34 1.0 0.31 0.13 0.0 0.09 0.49 0.68 0.61 0.2 0.12 0.0 0.35 0.21 0.0 0.69
0.0 0.35 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.62 0.76 1.0 0.1 0.0 0.0 0.82 0.0 0.11 0.0 0.1 0.0 0.73 0.13 0.0 0.0 0.11 0.09 0.0 0.15 0.99 0.0 0.0
0.91 0.55 0.72 0.67 0.53 0.75 0.73 0.65 0.4 0.68 0.96 0.44 0.45 0.75 0.27 0.75 0.91 0.52 0.51 0.38 0.5 1.0 0.98
0.44 0.23 0.09 0.07 0.05 0.24 0.29 0.14 0.49 1.0 0.06 0.7 0.89 0.26 0.15 0.04 0.06 0.11 0.09 0.08 0.59 0.1 0.09
0.23 0.09 0.36 0.05 0.04 0.02 0.1 0.0 0.03 1.0 0.07 0.1 0.35 0.23 0.18 0.03 0.08 0.03 0.09 0.11 0.24 0.14 0.13
0.0 0.04 1.0 0.08 0.04 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.13 0.08 0.12 0.11 0.0 0.0 0.07 0.0 0.25 0.0
0.0 0.17 1.0 0.1 0.02 0.05 0.51 0.07 0.11 0.23 0.22 0.07 0.07 0.11 0.5 0.09 0.03 0.02 0.0 0.03 0.74 0.15 0.13
0.83 0.41 0.71 0.5 0.21 0.42 1.0 0.69 0.89 0.9 0.69 0.45 0.49 0.27 0.49 0.29 0.32 0.28 0.28 0.74 0.78 0.42 0.57
0.0 0.06 1.0 0.2 0.0 0.13 0.27 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.15 0.55 0.22 0.04 0.0 0.03 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.32 0.32 1.0 0.14 0.07 0.12 0.25 0.06 0.11 0.26 0.12 0.13 0.17 0.89 0.49 0.08 0.11 0.05 0.06 0.18 0.26 0.22 0.26
0.0 0.06 0.9 0.12 0.0 0.06 0.0 0.16 0.2 0.17 0.06 0.17 0.04 1.0 0.32 0.04 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0
0.22 0.58 1.0 0.14 0.15 0.4 0.55 0.09 0.26 0.47 0.49 0.2 0.21 0.77 0.4 0.32 0.27 0.02 0.07 0.3 0.6 0.0 0.18
0.0 0.0 0.42 0.16 0.0 0.08 0.0 0.0 0.38 0.56 0.11 0.35 0.13 1.0 0.61 0.1 0.18 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.07 0.43 0.0 0.27 0.18 0.0 0.1 0.32 0.0 0.27 0.51 0.31 0.08 0.0 0.0 0.05 0.03 0.0 0.0 0.0
0.0 1.0 0.0 0.25 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.62 0.76 0.75 0.67 0.16 0.07 0.19 0.27 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.63 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.12 0.38 0.0 0.0
0.0 0.24 0.42 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.28 1.0 0.0 0.59 0.7 0.62 0.78 0.05 0.04 0.04 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0
0.22 0.2 0.38 0.12 0.07 0.17 1.0 0.27 0.28 0.35 0.2 0.27 0.31 0.26 0.38 0.1 0.11 0.11 0.1 0.39 0.39 0.08 0.08
0.0 0.15 1.0 0.12 0.21 0.03 0.0 0.0 0.09 0.12 0.09 0.26 0.14 0.16 0.08 0.05 0.09 0.12 0.1 0.16 0.24 0.0 0.0
0.2 0.11 0.3 0.19 0.34 0.34 0.25 0.32 0.13 0.26 0.06 0.31 0.0 0.38 1.0 0.22 0.1 0.05 0.09 0.01 0.29 0.0 0.65
1.0 0.78 0.29 0.3 0.24 0.55 0.63 0.64 0.5 0.63 0.45 0.37 0.39 0.52 0.12 0.52 0.65 0.3 0.3 0.35 0.53 0.41 0.47
0.0 0.63 0.0 0.0 0.1 0.11 0.48 0.0 0.0 0.74 0.72 0.28 0.32 1.0 0.23 0.14 0.06 0.16 0.09 0.15 0.38 0.0 0.0
0.68 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 1.0 0.0 0.37 0.53 0.0 0.24 0.0 0.11 0.13 0.0 0.05 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.4 0.43 0.42 0.48 0.31 0.25 0.52 0.11 0.14 0.57 0.33 0.14 0.15 0.34 0.25 0.48 0.41 0.13 0.49 0.34 0.34 1.0 0.46
0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 1.0 0.0 0.0 0.67 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.13 0.11 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.47 1.0 0.21 0.18 0.44 0.62 0.0 0.5 0.06 0.0 0.23 0.61 0.38 0.63 0.12 0.11 0.0 0.04 0.32 0.16 0.0 0.27
0.17 0.66 0.36 0.22 0.57 0.56 0.0 0.26 0.57 0.29 0.69 0.5 0.27 0.6 0.31 0.35 0.47 0.33 0.45 0.31 1.0 0.0 0.91
0.73 0.0 0.44 0.17 0.33 0.26 0.73 0.24 0.2 1.0 0.2 0.08 0.06 0.26 0.24 0.05 0.33 0.12 0.12 0.21 0.0 0.0 0.0
0.23 0.35 0.66 0.22 0.17 0.19 0.54 0.18 0.22 0.28 0.06 0.2 0.33 0.24 0.31 0.04 0.0 0.0 0.0 0.07 1.0 0.0 0.0
0.24 0.36 0.79 0.4 0.07 0.38 0.65 0.42 0.0 0.77 0.56 0.36 0.16 1.0 0.37 0.1 0.0 0.07 0.11 0.3 0.77 0.0 0.0
0.38 0.38 0.96 0.51 0.19 0.27 1.0 0.23 0.29 0.97 0.35 0.68 0.42 0.58 0.32 0.32 0.39 0.31 0.34 0.27 0.78 0.1 0.38
1.0 0.44 0.72 0.45 0.39 0.58 0.38 0.33 0.82 0.94 0.7 0.73 0.75 0.42 0.56 0.41 0.47 0.22 0.22 0.36 0.64 0.72 0.66
0.0 0.54 0.0 0.1 0.08 0.0 0.0 0.0 0.38 0.69 0.29 0.0 0.91 0.15 0.11 0.05 0.0 0.0 0.13 0.89 1.0 0.51 0.0
0.41 0.58 0.87 0.67 0.34 0.33 1.0 0.18 0.65 0.3 0.43 0.33 0.67 0.76 0.54 0.25 0.19 0.07 0.06 0.34 0.46 0.12 0.07
0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.93 0.45 0.19 0.63 0.46 0.05 0.24 0.73 0.37 0.1 0.06 0.08 0.0 0.13 0.28 1.0 0.0
1.0 0.58 0.6 0.13 0.18 0.19 0.49 0.26 0.09 0.62 0.4 0.23 0.22 0.41 0.13 0.14 0.33 0.04 0.1 0.14 0.34 0.0 0.19
0.0 0.21 1.0 0.21 0.0 0.85 0.0 0.0 0.33 0.4 0.31 0.09 0.2 0.33 0.13 0.0 0.05 0.0 0.0 0.05 0.0 0.59 0.0
0.07 0.37 0.87 0.56 0.54 0.6 0.0 0.03 0.01 0.1 0.08 0.05 0.12 1.0 0.29 0.34 0.27 0.0 0.01 0.27 0.49 0.78 0.48
0.0 0.36 0.42 0.33 0.0 0.09 0.35 0.0 0.28 0.0 0.17 0.27 0.6 0.84 0.45 0.2 0.18 0.15 0.19 0.79 0.29 1.0 0.46
0.32 0.5 0.4 0.32 0.12 0.18 0.23 0.11 0.26 1.0 0.34 0.24 0.24 0.43 0.44 0.11 0.06 0.06 0.08 0.2 0.49 0.29 0.27
0.0 0.25 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.44 0.32 0.24 0.24 0.32 1.0 0.46 0.1 0.03 0.0 0.0 0.12 0.57 0.0 0.0
0.0 0.41 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.18 0.0 0.66 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.24 0.0 0.0
0.8 0.17 0.0 0.13 0.0 0.0 0.5 0.0 0.54 1.0 0.13 0.0 0.0 0.08 0.08 0.0 0.07 0.11 0.09 0.18 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)