Heatmap: Cluster_50 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.26 0.29 1.0 0.28 0.25 0.28 0.56 0.32 0.27 0.15 0.21 0.24 0.23 0.44 0.44 0.22 0.16 0.11 0.1 0.4 0.39 0.35 0.35
0.55 0.41 0.64 0.42 0.18 0.32 0.64 0.38 0.38 0.66 0.35 0.91 0.52 1.0 0.34 0.25 0.2 0.26 0.18 0.48 0.86 0.46 0.52
0.0 0.46 0.67 0.03 0.06 0.0 0.0 0.09 0.0 0.36 0.0 0.33 0.41 1.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.07 0.93 0.33 0.0 0.0
0.0 0.39 1.0 0.08 0.0 0.23 0.0 0.11 0.09 0.0 0.27 0.09 0.0 0.39 0.48 0.14 0.16 0.0 0.0 0.11 0.21 0.0 0.0
0.0 0.39 0.29 0.11 0.21 0.17 0.24 0.0 0.25 0.09 0.31 0.0 0.12 1.0 0.16 0.03 0.0 0.0 0.0 0.17 0.1 0.0 0.0
0.22 0.07 1.0 0.1 0.06 0.08 0.17 0.12 0.19 0.08 0.04 0.21 0.03 0.63 0.14 0.1 0.1 0.02 0.02 0.23 0.23 0.12 0.15
0.1 0.34 0.75 0.16 0.17 0.13 0.93 0.27 0.38 0.26 0.5 0.25 0.23 1.0 0.32 0.23 0.24 0.11 0.1 0.27 0.46 0.35 0.36
0.04 0.28 1.0 0.09 0.06 0.12 0.34 0.11 0.15 0.22 0.07 0.19 0.23 0.44 0.1 0.11 0.04 0.05 0.05 0.23 0.13 0.14 0.07
0.0 0.06 1.0 0.13 0.09 0.11 0.28 0.15 0.01 0.0 0.06 0.03 0.06 0.04 0.03 0.08 0.02 0.01 0.02 0.18 0.02 0.0 0.0
0.08 0.21 1.0 0.15 0.08 0.1 0.48 0.06 0.16 0.19 0.09 0.12 0.23 0.79 0.13 0.07 0.08 0.05 0.04 0.1 0.08 0.07 0.06
0.0 0.18 1.0 0.0 0.0 0.03 0.3 0.0 0.02 0.09 0.0 0.03 0.06 0.26 0.3 0.0 0.01 0.0 0.0 0.13 0.06 0.0 0.0
0.12 0.38 1.0 0.08 0.06 0.15 0.07 0.11 0.21 0.39 0.23 0.23 0.12 0.45 0.16 0.2 0.23 0.11 0.08 0.15 0.22 0.1 0.09
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.27 0.1 0.0 0.07 0.66 0.0 0.06 0.05 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.54
0.24 0.29 1.0 0.08 0.05 0.04 0.17 0.07 0.16 0.31 0.12 0.11 0.23 0.58 0.21 0.04 0.03 0.03 0.01 0.13 0.37 0.0 0.13
0.18 0.54 0.12 0.08 0.08 0.11 0.2 0.07 0.16 0.29 0.28 0.18 0.09 1.0 0.32 0.08 0.05 0.03 0.03 0.18 0.35 0.11 0.17
0.0 0.34 0.31 0.13 0.11 0.15 0.13 0.0 0.21 0.09 0.34 0.14 0.2 1.0 0.31 0.06 0.03 0.1 0.02 0.16 0.21 0.0 0.0
0.0 0.29 1.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.18 0.04 0.04 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0
0.03 0.45 1.0 0.09 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.16 0.15 0.51 0.05 0.09 0.1 0.0 0.0 0.1 0.07 0.11 0.09
0.16 0.08 1.0 0.01 0.01 0.06 0.11 0.07 0.15 0.09 0.06 0.03 0.05 0.39 0.16 0.03 0.03 0.01 0.06 0.07 0.06 0.0 0.0
0.13 0.15 1.0 0.07 0.04 0.05 0.09 0.07 0.11 0.04 0.11 0.18 0.28 0.48 0.06 0.07 0.07 0.06 0.04 0.09 0.1 0.05 0.05
0.12 0.19 1.0 0.17 0.19 0.11 0.04 0.19 0.11 0.41 0.16 0.28 0.24 0.57 0.14 0.11 0.07 0.09 0.1 0.2 0.18 0.27 0.2
0.35 0.34 1.0 0.16 0.06 0.21 0.55 0.18 0.29 0.15 0.33 0.25 0.2 0.86 0.36 0.17 0.17 0.07 0.07 0.22 0.57 0.13 0.06
0.04 0.04 1.0 0.03 0.04 0.02 0.09 0.12 0.01 0.19 0.07 0.11 0.1 0.56 0.12 0.05 0.04 0.02 0.05 0.03 0.07 0.0 0.3
0.0 0.4 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.32 0.22 0.0 0.0 0.21 1.0 0.38 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0
0.12 0.28 1.0 0.08 0.15 0.09 0.07 0.04 0.11 0.11 0.11 0.11 0.2 0.19 0.17 0.11 0.12 0.04 0.03 0.21 0.27 0.14 0.2
0.09 0.34 1.0 0.08 0.15 0.09 0.05 0.02 0.08 0.06 0.06 0.08 0.18 0.34 0.12 0.09 0.05 0.03 0.02 0.18 0.36 0.03 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.15 0.54 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 1.0 0.03 0.0 0.03 0.0 0.08 0.25 0.0 0.04 0.2 0.02 0.37 0.1 0.02 0.02 0.05 0.0 0.02 0.15 0.0 0.0
0.34 0.16 1.0 0.07 0.09 0.13 0.55 0.15 0.22 0.06 0.12 0.17 0.14 0.89 0.16 0.07 0.05 0.12 0.09 0.25 0.46 0.2 0.18
0.22 0.25 1.0 0.2 0.28 0.17 0.15 0.18 0.23 0.14 0.3 0.22 0.25 0.78 0.3 0.24 0.27 0.18 0.2 0.13 0.27 0.14 0.15
0.46 0.73 1.0 0.24 0.2 0.2 0.18 0.09 0.19 0.18 0.26 0.29 0.24 0.98 0.27 0.22 0.2 0.07 0.04 0.68 0.61 0.19 0.24
0.45 0.53 0.36 0.16 0.08 0.05 0.83 0.19 0.37 0.46 0.1 0.36 0.35 1.0 0.57 0.24 0.29 0.07 0.15 0.53 0.74 0.0 0.0
0.0 0.2 1.0 0.08 0.02 0.04 0.41 0.0 0.09 0.05 0.16 0.03 0.13 0.52 0.07 0.01 0.02 0.02 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.22 0.3 1.0 0.15 0.13 0.14 0.34 0.19 0.22 0.23 0.2 0.09 0.18 0.48 0.2 0.15 0.2 0.05 0.08 0.19 0.39 0.14 0.16
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.37 0.15 0.4 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.53 0.24 0.67 0.2 0.14 0.25 0.55 0.31 0.25 1.0 0.52 0.42 0.25 0.84 0.3 0.41 0.33 0.31 0.22 0.42 0.52 0.06 0.19
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.04 1.0 0.03 0.0 0.0 0.04 0.0 0.08 0.3 0.06 0.01 0.12 0.2 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.07 0.12 0.0 0.0
0.2 0.28 1.0 0.21 0.18 0.21 0.32 0.1 0.15 0.19 0.09 0.09 0.17 0.75 0.2 0.1 0.09 0.06 0.05 0.14 0.33 0.2 0.21
0.0 0.47 1.0 0.15 0.05 0.1 0.0 0.13 0.17 0.21 0.23 0.25 0.14 0.52 0.5 0.21 0.0 0.0 0.25 0.05 0.0 0.3 0.0
0.09 0.27 0.95 0.05 0.12 0.0 1.0 0.0 0.51 0.28 0.21 0.12 0.43 0.24 0.23 0.08 0.01 0.0 0.0 0.08 0.09 0.16 0.0
0.16 0.09 1.0 0.05 0.1 0.09 0.09 0.0 0.05 0.27 0.03 0.1 0.14 0.33 0.06 0.01 0.01 0.01 0.0 0.07 0.0 0.0 0.12
0.15 0.11 1.0 0.12 0.04 0.06 0.27 0.12 0.02 0.03 0.12 0.0 0.08 0.62 0.1 0.11 0.11 0.12 0.08 0.07 0.22 0.0 0.0
0.67 0.29 0.93 0.05 0.08 0.05 0.59 0.23 0.11 0.43 0.12 0.14 0.62 1.0 0.33 0.08 0.12 0.07 0.07 0.62 0.69 0.2 0.09
0.14 0.1 0.89 0.37 0.15 0.37 0.63 0.18 0.27 0.24 0.1 0.2 0.25 1.0 0.38 0.1 0.07 0.02 0.02 0.14 0.15 0.25 0.26
0.2 0.27 1.0 0.37 0.17 0.31 0.26 0.16 0.19 0.11 0.12 0.19 0.17 0.22 0.19 0.17 0.06 0.06 0.06 0.25 0.17 0.35 0.27
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.13 0.0 0.0 0.2 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.2 0.07 0.0 0.0 0.05 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 1.0 0.07 0.06 0.1 0.0 0.0 0.04 0.0 0.03 0.05 0.02 0.31 0.04 0.1 0.07 0.0 0.0 0.04 0.17 0.2 0.0
0.06 0.2 1.0 0.16 0.06 0.18 0.41 0.04 0.22 0.24 0.07 0.22 0.22 0.46 0.31 0.12 0.19 0.04 0.01 0.13 0.03 0.0 0.0
0.05 0.25 1.0 0.05 0.03 0.0 0.06 0.08 0.08 0.13 0.02 0.09 0.22 0.32 0.14 0.0 0.02 0.0 0.04 0.04 0.1 0.0 0.0
0.16 0.2 1.0 0.05 0.13 0.07 0.24 0.13 0.17 0.67 0.16 0.27 0.29 0.48 0.48 0.06 0.08 0.05 0.07 0.15 0.46 0.07 0.0
0.39 0.43 0.85 0.29 0.32 0.29 0.46 0.2 0.44 1.0 0.22 0.54 0.52 0.83 0.16 0.26 0.32 0.15 0.18 0.5 0.31 0.23 0.33
0.17 0.16 1.0 0.1 0.18 0.1 0.21 0.0 0.33 0.08 0.28 0.09 0.14 0.35 0.1 0.12 0.11 0.02 0.03 0.04 0.0 0.0 0.27
0.17 0.1 1.0 0.05 0.01 0.04 0.0 0.0 0.03 0.09 0.05 0.03 0.02 0.91 0.06 0.02 0.02 0.0 0.03 0.02 0.02 0.0 0.0
0.22 0.37 1.0 0.22 0.17 0.18 0.1 0.05 0.15 0.23 0.1 0.19 0.42 0.37 0.27 0.11 0.08 0.05 0.05 0.15 0.37 0.24 0.18
0.0 0.27 1.0 0.05 0.0 0.08 0.31 0.07 0.11 0.0 0.0 0.18 0.53 0.32 0.08 0.0 0.01 0.01 0.0 0.07 0.08 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.03 0.03 0.0 0.14 0.0 0.11 0.05 0.0 0.19 0.19 0.47 0.22 0.02 0.04 0.03 0.0 0.09 0.11 0.0 0.0
0.0 0.08 1.0 0.05 0.04 0.07 0.09 0.0 0.15 0.34 0.19 0.08 0.13 0.36 0.09 0.01 0.04 0.04 0.0 0.03 0.02 0.0 0.06
0.18 0.08 1.0 0.17 0.11 0.1 0.03 0.04 0.1 0.11 0.03 0.06 0.04 0.29 0.1 0.26 0.21 0.13 0.11 0.11 0.14 0.13 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.14 0.05 1.0 0.08 0.18 0.0 0.49 0.43 0.31 0.0 0.09 0.0 0.09 1.0 0.19 0.07 0.02 0.02 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0
0.09 0.15 0.63 0.05 0.07 0.15 0.31 0.27 0.58 0.12 0.4 0.1 0.05 1.0 0.49 0.15 0.14 0.02 0.13 0.18 0.37 0.0 0.14
0.39 0.34 1.0 0.09 0.0 0.14 0.06 0.0 0.03 0.34 0.03 0.15 0.16 0.85 0.09 0.07 0.07 0.02 0.04 0.11 0.49 0.17 0.08
0.0 0.07 1.0 0.18 0.12 0.11 0.0 0.19 0.11 0.38 0.13 0.03 0.07 0.39 0.13 0.22 0.13 0.07 0.08 0.11 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.44 0.53 1.0 0.21 0.33 0.2 0.32 0.26 0.3 0.35 0.25 0.49 0.19 0.98 0.43 0.34 0.34 0.26 0.15 0.37 0.34 0.51 0.42
0.0 0.47 0.88 0.01 0.01 0.09 0.18 0.0 0.0 0.07 0.33 0.22 0.47 1.0 0.36 0.05 0.02 0.0 0.04 0.08 0.17 0.0 0.24
0.21 0.64 0.74 0.35 0.19 0.21 0.81 0.11 0.35 0.58 0.45 0.36 0.69 1.0 0.35 0.18 0.1 0.09 0.07 0.49 0.52 0.08 0.15
0.0 0.2 1.0 0.1 0.0 0.0 0.21 0.27 0.11 0.26 0.12 0.0 0.03 0.38 0.0 0.09 0.0 0.04 0.0 0.13 0.08 0.0 0.0
0.06 0.11 1.0 0.02 0.02 0.02 0.38 0.04 0.02 0.05 0.09 0.05 0.05 0.13 0.21 0.02 0.04 0.03 0.03 0.26 0.11 0.03 0.03
0.12 0.83 1.0 0.52 0.43 0.35 0.39 0.21 0.21 0.37 0.55 0.64 0.61 0.81 0.39 0.26 0.33 0.14 0.2 0.38 0.63 0.36 0.42
0.12 0.15 1.0 0.07 0.02 0.07 0.0 0.0 0.04 0.35 0.08 0.01 0.03 0.34 0.04 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.24 0.1 0.09
0.0 0.47 1.0 0.08 0.08 0.2 0.06 0.0 0.39 0.26 0.24 0.19 0.35 0.58 0.31 0.14 0.08 0.09 0.01 0.15 0.13 0.18 0.08
0.24 0.66 0.91 0.16 0.09 0.14 0.26 0.18 0.13 0.12 0.31 0.37 0.23 0.98 0.52 0.1 0.12 0.13 0.16 0.51 1.0 0.04 0.1
0.0 0.0 1.0 0.03 0.03 0.0 0.0 0.0 0.06 0.12 0.0 0.07 0.04 0.4 0.08 0.02 0.0 0.0 0.02 0.03 0.09 0.0 0.0
0.22 0.47 0.7 0.24 0.33 0.24 0.33 0.17 0.14 0.11 0.28 0.41 0.56 1.0 0.29 0.29 0.25 0.17 0.15 0.31 0.37 0.25 0.18
0.38 0.15 0.56 0.04 0.1 0.08 0.81 0.26 0.2 0.89 0.27 0.53 0.3 0.93 1.0 0.39 0.26 0.13 0.15 0.58 0.75 0.25 0.3

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)