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Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
-0.88 -0.41 -0.46 -1.15 -0.9 -1.05 1.12 0.43 0.31 -1.29 -0.43 -0.01 -0.16 -0.65 1.1 0.24 0.34 0.88 0.05 -0.69
-0.23 0.67 0.71 0.35 -0.17 -0.83 0.97 -1.41 -0.24 -0.52 -0.18 -0.27 -0.62 -0.2 -0.38 -0.22 0.31 0.74 -0.59 -0.19
0.24 -0.07 -0.49 -0.48 -0.3 -0.51 0.07 0.3 -0.63 -0.71 -0.32 -0.22 0.14 0.29 0.02 0.3 -0.02 0.87 -0.06 0.46
-0.84 0.07 0.04 0.31 -0.09 -0.32 0.22 -1.07 0.79 -0.08 0.06 -0.48 -0.41 -0.11 -0.44 -0.26 0.05 0.97 -0.39 0.39
-1.29 0.1 0.04 0.41 -0.04 -0.68 0.44 -0.22 0.5 0.12 -0.09 -0.13 -0.13 0.09 -0.16 -0.23 -0.05 0.59 -0.44 0.08
0.08 0.28 0.55 0.07 -0.52 -0.76 0.6 -1.02 -0.06 -0.13 -0.29 0.15 -0.57 -0.15 -0.25 -0.03 0.02 0.51 -0.39 0.6
-1.54 0.51 -0.0 -0.42 -0.7 -1.12 0.45 -1.31 -0.45 -0.55 -0.07 0.31 0.04 -0.0 0.49 0.16 0.6 0.9 0.17 -0.03
0.61 0.03 0.25 -0.59 -1.78 -1.03 0.56 -1.43 0.57 0.76 -0.28 -0.26 -0.14 -0.37 0.58 -0.74 -0.09 0.47 -0.49 0.41
-0.88 -0.15 0.07 0.1 -0.51 -0.04 1.04 0.6 -0.4 -0.38 -0.11 -1.32 0.03 0.06 -0.24 -0.14 -0.05 0.65 -0.28 0.22
-0.39 0.32 0.02 0.91 0.65 0.33 -1.37 0.52 -0.3 -1.18 0.31 -1.6 -0.93 -0.24 -1.58 -0.27 0.03 0.86 -0.97 0.81
0.41 0.61 0.73 -0.75 -1.14 -0.8 1.0 -1.33 -0.69 -1.04 -0.44 0.51 -0.33 -0.48 0.0 -0.23 0.27 0.42 -0.39 0.61
-0.12 0.42 0.7 0.06 -0.41 -0.34 0.53 -0.91 0.55 -0.19 -0.08 -0.05 -0.48 -0.33 -0.24 -0.55 -0.07 0.23 -0.98 0.71
0.21 0.58 0.92 0.52 -0.33 -0.27 0.36 -0.6 -0.83 -0.83 -0.08 -0.01 -0.73 -0.63 -0.18 -0.52 0.55 0.49 -0.34 -0.16
0.63 -0.33 -0.38 0.02 0.12 0.26 -1.22 0.06 -1.82 -3.0 -0.3 -0.65 -0.47 -0.13 0.52 -0.8 0.47 0.73 -0.5 1.52
-0.2 0.15 -0.07 -0.32 -0.32 -0.48 -0.07 -0.19 0.43 0.64 0.25 -0.73 -0.22 -0.37 0.48 -1.09 0.08 0.42 -0.25 0.59
-0.39 0.29 0.3 -0.0 -0.38 -0.52 0.58 -1.35 0.68 0.94 0.19 -0.84 -1.06 -0.63 -0.38 -0.54 0.02 0.78 -0.09 -0.05
0.83 0.52 0.53 -1.11 -1.25 -0.9 0.99 -0.91 -1.43 -0.22 -0.14 -0.07 -0.73 -0.5 0.08 -0.41 0.66 0.75 -0.27 0.17
0.15 0.74 0.93 0.38 -1.07 -0.37 -0.0 -0.75 -1.31 -0.2 -0.14 -0.34 -0.47 -0.39 -0.34 -0.72 0.41 0.93 -0.41 0.42
-0.24 -0.14 -0.29 0.44 0.15 -0.06 0.4 0.0 0.23 -0.74 -0.01 0.18 -0.03 -0.14 -0.25 -0.35 0.19 0.76 -0.37 -0.58
0.35 0.27 0.35 0.26 -0.02 -0.29 0.66 -0.1 -0.47 -0.44 -0.03 -0.3 -1.04 -0.77 -0.04 -0.46 0.26 0.91 -0.13 -0.47
-0.25 0.7 0.74 0.03 -0.87 -0.74 0.84 -0.59 -0.6 -0.91 -0.52 -0.54 -0.62 -0.57 0.3 -0.52 0.51 0.59 -0.26 0.73
-0.89 0.26 0.09 -0.16 -0.43 -0.57 0.18 0.3 0.01 -0.37 0.18 0.4 -0.47 -0.1 0.09 -0.21 0.46 0.76 -0.15 -0.44
-1.19 -0.07 -0.14 -0.04 -0.34 0.02 0.54 0.34 1.45 -0.16 -0.12 -0.61 -0.4 -0.1 -0.45 -0.49 0.06 0.45 -0.41 -0.48
-1.11 0.76 0.02 -0.06 -0.4 -0.74 0.81 -0.9 -1.53 -2.36 -0.54 0.64 0.27 0.17 -0.08 -0.25 0.92 0.97 -0.2 -0.78
0.04 -0.26 -0.57 -0.42 -0.78 -0.82 1.04 -0.49 0.82 0.55 -0.03 -1.02 -0.7 -0.19 -0.47 -0.9 -0.07 0.99 0.4 0.12
-2.82 0.55 0.08 -0.17 -0.41 -0.26 0.46 -0.25 0.89 0.18 0.3 0.03 -0.53 0.08 -0.97 -0.58 0.16 0.95 -0.47 -0.49
-0.78 0.13 0.08 0.34 0.33 0.09 1.07 0.61 -0.07 -0.92 0.04 -0.36 -0.79 -0.61 -0.39 -0.14 0.27 0.68 -0.57 -1.39
0.24 0.52 0.49 -0.7 -0.74 -0.67 0.95 -0.65 -0.27 -0.33 -0.2 -0.01 -0.36 -0.25 0.08 -0.27 0.48 0.59 -0.1 -0.42
-0.09 0.46 0.22 0.3 0.06 -0.39 0.69 -0.66 -0.05 -0.49 0.09 -0.26 -0.69 -0.61 -0.15 -0.44 0.43 0.91 -0.54 -0.29
-0.57 0.41 0.24 0.48 0.09 -0.59 1.13 -0.22 -0.66 -0.12 -0.01 -0.81 -0.33 -0.51 0.11 -0.17 0.27 0.6 -0.37 -0.84
-0.63 0.77 0.9 -0.16 -0.45 -1.19 2.05 -0.99 -1.61 -0.95 -0.33 -0.4 -1.11 -1.37 -0.19 -0.72 0.24 0.61 -0.15 -0.44
-0.08 0.71 0.53 -0.29 -0.18 -1.01 1.49 -1.33 -0.34 -0.7 0.05 -0.24 -1.08 -0.82 -0.57 -0.39 0.35 0.71 -0.46 0.24
-0.45 0.64 0.03 0.13 -0.13 -0.32 0.46 0.17 0.17 -1.04 0.08 -0.62 -0.54 -0.23 0.0 -0.31 0.37 0.6 -0.68 0.34
-1.53 0.43 0.08 0.46 0.11 -0.58 -0.51 -0.29 0.8 0.17 0.37 -1.07 -0.76 -0.19 -1.06 -0.24 0.04 0.95 -0.59 0.63
0.24 0.46 0.46 -0.28 -0.81 -0.81 1.29 -1.61 -0.75 -1.41 -0.84 0.41 -0.28 0.03 -0.07 -0.12 0.41 0.7 -0.51 0.12
-0.6 0.52 -0.43 0.77 0.17 -0.3 0.09 -0.85 -0.92 -1.35 0.11 0.1 -0.15 -0.45 0.44 -0.47 0.67 1.12 -0.09 -1.33
0.06 0.69 0.89 -0.39 -0.5 -0.9 0.38 -1.17 -1.17 -0.53 -0.14 0.03 -0.88 -0.65 0.13 -0.5 0.53 0.57 -0.66 1.09
-1.37 0.8 0.77 0.14 -0.23 -0.73 1.1 -0.83 -0.75 -0.6 -0.22 -0.04 -0.65 -0.2 -0.12 -0.19 0.37 0.73 -0.44 -0.26
-0.17 0.35 0.44 -0.12 -0.8 -1.02 1.14 -0.88 -0.35 -0.23 -0.3 -0.19 -0.18 0.11 -0.26 -0.38 0.22 0.83 -0.62 0.36
-0.92 0.14 0.08 -0.17 -0.31 -0.41 0.21 -0.26 0.04 -0.6 -0.03 -0.07 0.4 0.21 0.37 -0.19 0.25 0.62 -0.3 0.11
-0.57 0.74 0.41 -0.28 -0.88 -0.37 1.4 -0.45 0.09 -0.08 -0.39 -0.5 -0.77 -0.35 -0.5 -0.34 0.61 0.59 -0.22 -0.81
-0.25 0.39 0.5 -0.43 -0.61 -2.23 1.04 -1.42 0.26 -0.48 -0.22 -0.01 -0.09 0.06 0.17 -0.28 0.25 0.66 -0.57 0.33
-0.24 -0.27 -0.57 -0.58 -0.72 -1.3 1.05 -1.42 0.54 -0.66 -0.57 0.35 -0.05 0.02 0.29 -0.15 0.34 1.11 -0.2 0.14
-1.4 0.77 0.43 0.29 -0.45 -0.27 0.58 -0.29 -0.09 -0.3 -0.22 -0.09 -0.75 -0.45 -0.05 -0.43 0.62 0.82 -0.19 -0.48
-0.01 0.56 0.7 -0.43 -0.6 -0.39 0.79 -0.68 0.25 0.32 0.06 -0.4 -0.57 -0.21 -0.19 -0.43 0.45 0.35 -0.67 -0.48
0.1 0.39 0.49 0.13 -0.54 -0.43 0.57 -0.34 0.34 0.23 -0.2 -0.43 -0.45 -0.17 -0.16 -0.49 -0.01 0.15 -0.45 0.37
-0.29 0.31 0.0 -0.17 -0.57 -0.44 1.14 -0.01 0.08 -0.8 -0.34 -0.63 0.06 0.08 -0.07 -0.26 0.07 0.68 -0.65 0.25
-0.2 0.22 0.33 0.44 -0.34 -0.77 0.77 -0.72 -0.51 0.56 0.1 0.02 -0.21 -0.27 0.3 -0.87 0.29 0.6 -0.21 -1.61
0.2 0.77 0.74 -0.98 -1.32 -1.51 0.68 -1.43 0.35 0.05 -0.26 -0.18 -0.26 -0.14 -0.29 -0.32 0.27 0.42 -0.7 0.78
0.27 0.26 0.52 -0.28 -1.21 -1.33 0.88 -1.4 0.03 0.45 -0.24 0.18 -0.05 0.11 -0.44 -0.21 -0.08 0.88 -0.64 -0.21
-0.79 0.65 0.16 0.49 0.31 -0.09 0.87 -0.14 -0.37 -1.31 -0.08 -0.18 -0.41 -0.58 -0.32 -0.35 0.39 0.49 -0.47 -0.05
-0.65 0.61 0.8 0.02 -0.36 -1.23 0.87 -1.27 -1.81 -1.15 -0.27 0.34 -0.37 0.05 0.4 -0.14 0.46 1.02 -0.58 -0.52
-0.27 0.33 0.16 0.83 0.3 0.05 0.36 0.26 -0.75 -1.65 0.1 -0.38 -0.51 -0.49 0.03 -0.52 0.42 0.52 -0.73 0.02
0.73 -0.02 0.0 0.32 0.15 -0.27 0.46 0.49 0.28 -0.61 0.04 -0.84 -0.49 -0.25 -0.32 -0.62 0.18 0.83 -0.6 -1.56

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.