Heatmap: Cluster_52 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
10DPI,PST,Avocet,leaf
11DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
9DPI,PST-87/66,Vuka,Yr5-,leaf
germinating,PST-87/66,in vitro
germinating,PST104E,leaf
n+n,PST,wheat,spore
n+n,PSTS7,Holeby,leaf
n+n,spore
Haustoria,Haustoria
Haustoria,PST104E,leaf
PST104E,wheat,leaf,monoisolate
PST,Ambition,leaf
PST,Oakley,leaf
PST,Solstice,leaf
PST,Torch,leaf
PST,Triticale,leaf
PST,Vuka,leaf
PST,leaf
PST,wheat,leaf
Avocet,leaf
0.25 0.35 0.33 0.21 0.25 0.22 1.0 0.62 0.57 0.19 0.34 0.46 0.41 0.29 0.99 0.54 0.58 0.85 0.48 0.29
0.44 0.82 0.84 0.65 0.45 0.29 1.0 0.19 0.43 0.36 0.45 0.43 0.33 0.45 0.39 0.44 0.63 0.85 0.34 0.45
0.65 0.52 0.39 0.39 0.45 0.39 0.58 0.68 0.35 0.34 0.44 0.47 0.61 0.67 0.55 0.68 0.54 1.0 0.53 0.75
0.28 0.53 0.52 0.63 0.48 0.41 0.6 0.24 0.88 0.48 0.53 0.37 0.39 0.47 0.38 0.42 0.53 1.0 0.39 0.67
0.27 0.71 0.68 0.88 0.64 0.41 0.9 0.57 0.94 0.72 0.62 0.6 0.61 0.71 0.6 0.57 0.64 1.0 0.49 0.7
0.69 0.8 0.97 0.69 0.46 0.39 1.0 0.33 0.63 0.6 0.54 0.73 0.44 0.59 0.56 0.65 0.67 0.94 0.5 1.0
0.18 0.76 0.53 0.4 0.33 0.25 0.73 0.22 0.39 0.37 0.51 0.66 0.55 0.53 0.75 0.6 0.81 1.0 0.6 0.52
0.9 0.6 0.7 0.39 0.17 0.29 0.87 0.22 0.88 1.0 0.49 0.49 0.54 0.46 0.88 0.35 0.56 0.82 0.42 0.79
0.26 0.44 0.51 0.52 0.34 0.47 1.0 0.73 0.37 0.37 0.45 0.19 0.5 0.51 0.41 0.44 0.47 0.76 0.4 0.57
0.4 0.66 0.54 1.0 0.83 0.67 0.21 0.76 0.43 0.23 0.66 0.18 0.28 0.45 0.18 0.44 0.54 0.96 0.27 0.93
0.66 0.76 0.83 0.3 0.23 0.29 1.0 0.2 0.31 0.24 0.37 0.71 0.4 0.36 0.5 0.43 0.6 0.67 0.38 0.76
0.56 0.82 1.0 0.64 0.46 0.48 0.88 0.33 0.9 0.54 0.58 0.59 0.44 0.49 0.52 0.42 0.58 0.72 0.31 1.0
0.61 0.79 1.0 0.76 0.42 0.44 0.68 0.35 0.3 0.3 0.5 0.52 0.32 0.34 0.47 0.37 0.77 0.74 0.42 0.47
0.54 0.28 0.27 0.35 0.38 0.42 0.15 0.36 0.1 0.04 0.28 0.22 0.25 0.32 0.5 0.2 0.48 0.58 0.25 1.0
0.56 0.72 0.61 0.51 0.51 0.46 0.62 0.56 0.87 1.0 0.76 0.39 0.55 0.5 0.9 0.3 0.68 0.86 0.54 0.97
0.4 0.64 0.64 0.52 0.4 0.36 0.78 0.2 0.83 1.0 0.6 0.29 0.25 0.34 0.4 0.36 0.53 0.9 0.49 0.51
0.89 0.72 0.73 0.23 0.21 0.27 1.0 0.27 0.19 0.43 0.46 0.48 0.3 0.36 0.53 0.38 0.8 0.85 0.42 0.57
0.58 0.88 1.0 0.68 0.25 0.41 0.52 0.31 0.21 0.45 0.47 0.41 0.38 0.4 0.41 0.32 0.7 0.99 0.39 0.7
0.5 0.54 0.48 0.8 0.65 0.56 0.77 0.59 0.69 0.35 0.58 0.67 0.58 0.53 0.5 0.46 0.67 1.0 0.46 0.39
0.68 0.64 0.68 0.64 0.53 0.43 0.85 0.5 0.39 0.39 0.52 0.43 0.26 0.31 0.52 0.39 0.64 1.0 0.49 0.39
0.47 0.9 0.93 0.57 0.3 0.33 1.0 0.37 0.37 0.3 0.39 0.38 0.36 0.37 0.68 0.39 0.79 0.84 0.46 0.92
0.32 0.71 0.63 0.53 0.44 0.4 0.67 0.73 0.59 0.46 0.67 0.78 0.43 0.55 0.63 0.51 0.82 1.0 0.53 0.44
0.16 0.35 0.33 0.36 0.29 0.37 0.53 0.47 1.0 0.33 0.34 0.24 0.28 0.34 0.27 0.26 0.38 0.5 0.28 0.26
0.24 0.87 0.52 0.49 0.39 0.31 0.9 0.27 0.18 0.1 0.35 0.8 0.62 0.57 0.49 0.43 0.97 1.0 0.45 0.3
0.5 0.41 0.33 0.36 0.28 0.28 1.0 0.35 0.86 0.71 0.48 0.24 0.3 0.43 0.35 0.26 0.46 0.97 0.64 0.53
0.07 0.76 0.55 0.46 0.39 0.43 0.71 0.43 0.96 0.59 0.64 0.53 0.36 0.55 0.26 0.35 0.58 1.0 0.37 0.37
0.28 0.52 0.5 0.6 0.6 0.51 1.0 0.73 0.45 0.25 0.49 0.37 0.28 0.31 0.36 0.43 0.58 0.76 0.32 0.18
0.61 0.74 0.73 0.32 0.31 0.33 1.0 0.33 0.43 0.41 0.45 0.52 0.4 0.44 0.55 0.43 0.72 0.78 0.48 0.39
0.5 0.73 0.62 0.65 0.55 0.41 0.86 0.34 0.51 0.38 0.57 0.44 0.33 0.35 0.48 0.39 0.72 1.0 0.37 0.43
0.31 0.61 0.54 0.64 0.48 0.3 1.0 0.39 0.29 0.42 0.45 0.26 0.36 0.32 0.49 0.41 0.55 0.69 0.35 0.25
0.16 0.41 0.45 0.22 0.18 0.11 1.0 0.12 0.08 0.12 0.19 0.18 0.11 0.09 0.21 0.15 0.28 0.37 0.22 0.18
0.34 0.58 0.52 0.29 0.31 0.18 1.0 0.14 0.28 0.22 0.37 0.3 0.17 0.2 0.24 0.27 0.45 0.58 0.26 0.42
0.47 1.0 0.66 0.7 0.59 0.51 0.88 0.72 0.72 0.31 0.68 0.42 0.44 0.55 0.64 0.52 0.83 0.97 0.4 0.81
0.18 0.7 0.55 0.71 0.56 0.35 0.36 0.42 0.9 0.58 0.67 0.25 0.31 0.45 0.25 0.44 0.53 1.0 0.34 0.8
0.48 0.56 0.56 0.34 0.23 0.23 1.0 0.13 0.24 0.15 0.23 0.54 0.34 0.42 0.39 0.38 0.54 0.66 0.29 0.44
0.3 0.66 0.34 0.79 0.52 0.37 0.49 0.26 0.24 0.18 0.5 0.49 0.42 0.34 0.62 0.33 0.73 1.0 0.43 0.18
0.49 0.75 0.87 0.36 0.33 0.25 0.61 0.21 0.21 0.32 0.42 0.48 0.25 0.3 0.51 0.33 0.67 0.69 0.3 1.0
0.18 0.81 0.8 0.51 0.4 0.28 1.0 0.26 0.28 0.31 0.4 0.46 0.3 0.41 0.43 0.41 0.6 0.78 0.35 0.39
0.4 0.58 0.62 0.42 0.26 0.22 1.0 0.25 0.36 0.39 0.37 0.4 0.4 0.49 0.38 0.35 0.53 0.81 0.3 0.58
0.34 0.71 0.69 0.58 0.52 0.49 0.75 0.54 0.67 0.43 0.64 0.62 0.85 0.75 0.84 0.57 0.77 1.0 0.53 0.7
0.26 0.63 0.5 0.31 0.21 0.29 1.0 0.28 0.4 0.36 0.29 0.27 0.22 0.3 0.27 0.3 0.58 0.57 0.32 0.22
0.41 0.64 0.69 0.36 0.32 0.1 1.0 0.18 0.58 0.35 0.42 0.48 0.46 0.51 0.55 0.4 0.58 0.77 0.33 0.61
0.39 0.38 0.31 0.31 0.28 0.19 0.96 0.17 0.67 0.29 0.31 0.59 0.45 0.47 0.57 0.42 0.58 1.0 0.4 0.51
0.21 0.96 0.76 0.69 0.41 0.47 0.84 0.46 0.53 0.46 0.48 0.53 0.34 0.41 0.54 0.42 0.87 1.0 0.49 0.4
0.58 0.85 0.94 0.43 0.38 0.44 1.0 0.36 0.69 0.72 0.6 0.44 0.39 0.5 0.51 0.43 0.79 0.74 0.36 0.42
0.72 0.88 0.95 0.73 0.46 0.5 1.0 0.53 0.85 0.79 0.59 0.5 0.49 0.6 0.6 0.48 0.67 0.75 0.49 0.87
0.37 0.56 0.45 0.4 0.31 0.33 1.0 0.45 0.48 0.26 0.36 0.29 0.47 0.48 0.43 0.38 0.48 0.73 0.29 0.54
0.51 0.68 0.74 0.8 0.46 0.35 1.0 0.36 0.41 0.87 0.63 0.6 0.51 0.49 0.72 0.32 0.72 0.89 0.51 0.19
0.67 1.0 0.98 0.3 0.23 0.21 0.93 0.22 0.74 0.6 0.49 0.52 0.49 0.53 0.48 0.47 0.7 0.78 0.36 1.0
0.65 0.65 0.78 0.45 0.24 0.22 1.0 0.21 0.55 0.74 0.46 0.61 0.52 0.58 0.4 0.47 0.51 1.0 0.35 0.47
0.32 0.85 0.61 0.77 0.67 0.51 1.0 0.49 0.42 0.22 0.52 0.48 0.41 0.36 0.44 0.43 0.71 0.77 0.39 0.53
0.31 0.75 0.86 0.5 0.38 0.21 0.9 0.2 0.14 0.22 0.41 0.63 0.38 0.51 0.65 0.45 0.68 1.0 0.33 0.34
0.47 0.7 0.63 1.0 0.69 0.58 0.72 0.67 0.33 0.18 0.6 0.43 0.39 0.4 0.57 0.39 0.75 0.81 0.34 0.57
0.93 0.56 0.56 0.7 0.63 0.47 0.77 0.79 0.68 0.37 0.58 0.31 0.4 0.47 0.45 0.37 0.64 1.0 0.37 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)