Heatmap: Cluster_53 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	ATCC 44394, early decay stage, 0-5 mm	ATCC 44394, middle late decay stage, 15-20 mm	ATCC 44394, late decay stage, 30-35 mm	SB12	MAD698-R, early decay stage, 0-5 mm	MAD698-R, middle late decay stage, 15-20 mm	MAD698-R, late decay stage, 30-35 mm	MAD698-R	Pure culture	week 6, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 6, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 6, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 3, untreated wood	week 4, untreated wood	week 3, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 3, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 3, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA10) treated wood	week 9, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 12, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 12, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 15, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 15, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 18, furfural alcohol (FA40) treated wood	week 18, furfural alcohol (FA70) treated wood	week 1, untreated wood	week 2, untreated wood	week 5, untreated wood
EED77238	0.05	0.04	0.01	0.33	0.07	0.04	0.01	0.21	0.24	0.01	0.03	0.33	0.02	0.08	0.01	0.07	0.16	0.51	0.0	0.32	0.01	0.05	0.01	0.22	0.02	0.12	1.0	0.06	0.02
EED77251	1.0	0.28	0.1	0.0	0.79	0.28	0.1	0.0	0.31	0.04	0.08	0.04	0.07	0.17	0.14	0.17	0.02	0.15	0.02	0.08	0.03	0.08	0.01	0.05	0.01	0.04	0.6	0.21	0.17
EED77477	0.01	0.01	0.0	0.0	0.02	0.01	0.0	0.05	0.16	0.05	0.03	0.23	0.06	0.12	0.05	0.15	0.3	0.4	0.03	0.21	0.04	0.09	0.03	0.16	0.03	0.11	1.0	0.13	0.04
EED77669	1.0	0.11	0.12	0.25	0.81	0.11	0.12	0.02	0.17	0.0	0.0	0.03	0.01	0.03	0.03	0.0	0.0	0.03	0.02	0.0	0.01	0.03	0.0	0.05	0.0	0.04	0.32	0.0	0.02
EED77804	1.0	0.38	0.24	0.53	0.95	0.38	0.24	0.22	0.17	0.18	0.18	0.19	0.18	0.37	0.28	0.37	0.17	0.42	0.1	0.24	0.17	0.26	0.12	0.24	0.1	0.3	0.77	0.33	0.18
EED78134	1.0	0.3	0.42	0.0	0.74	0.3	0.42	0.55	0.38	0.13	0.11	0.05	0.07	0.05	0.08	0.06	0.04	0.04	0.1	0.08	0.05	0.04	0.09	0.04	0.1	0.1	0.7	0.12	0.08
EED78195	0.05	0.03	0.02	0.0	0.08	0.03	0.02	0.16	0.34	0.07	0.06	0.16	0.09	0.05	0.05	0.06	0.17	0.4	0.04	0.15	0.08	0.14	0.04	0.18	0.09	0.41	1.0	0.07	0.04
EED78269	0.29	0.05	0.04	0.4	0.24	0.05	0.04	0.04	0.85	0.02	0.02	0.02	0.04	0.04	0.08	0.06	0.04	0.11	0.06	0.03	0.03	0.07	0.01	0.03	0.03	0.02	1.0	0.05	0.03
EED78363	0.22	0.15	0.12	0.26	0.21	0.15	0.12	0.34	0.36	0.21	0.22	0.38	0.2	0.29	0.26	0.26	0.19	0.4	0.19	0.32	0.22	0.31	0.21	0.35	0.29	0.4	1.0	0.27	0.25
EED78574	0.01	0.03	0.03	0.19	0.03	0.03	0.03	0.17	0.09	0.02	0.0	0.02	0.07	0.03	0.03	0.05	0.07	0.13	0.16	0.06	0.03	0.07	0.04	0.07	0.12	0.03	1.0	0.03	0.05
EED78601	0.32	0.29	0.39	0.39	0.33	0.29	0.39	0.21	0.24	0.35	0.29	0.28	0.33	0.38	0.31	0.35	0.42	0.46	0.3	0.3	0.39	0.34	0.42	0.37	0.58	0.33	1.0	0.38	0.36
EED78750	0.01	0.01	0.01	0.0	0.01	0.01	0.01	0.01	0.46	0.07	0.04	0.2	0.05	0.04	0.05	0.15	0.14	0.14	0.04	0.16	0.06	0.08	0.06	0.16	0.05	0.19	1.0	0.06	0.04
EED79256	1.0	0.31	0.2	0.16	0.87	0.31	0.2	0.71	0.46	0.16	0.13	0.17	0.16	0.21	0.15	0.2	0.13	0.32	0.05	0.18	0.11	0.25	0.13	0.21	0.14	0.24	0.63	0.16	0.14
EED79428	1.0	0.14	0.23	0.15	0.75	0.14	0.23	0.19	0.17	0.08	0.05	0.09	0.16	0.1	0.1	0.14	0.01	0.07	0.1	0.08	0.09	0.08	0.1	0.09	0.12	0.09	0.61	0.05	0.1
EED79741	0.18	0.18	0.19	0.21	0.16	0.18	0.19	0.31	0.39	0.06	0.04	0.2	0.03	0.07	0.04	0.05	0.09	0.14	0.02	0.23	0.02	0.02	0.01	0.21	0.06	0.23	1.0	0.06	0.04
EED79963	0.07	0.07	0.08	0.03	0.08	0.07	0.08	0.11	0.77	0.12	0.09	0.32	0.09	0.11	0.11	0.19	0.12	0.36	0.06	0.25	0.09	0.14	0.08	0.24	0.12	0.26	1.0	0.12	0.09
EED80114	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
EED80200	0.51	0.35	0.3	0.53	0.51	0.35	0.3	0.35	0.13	0.16	0.24	0.38	0.22	0.29	0.21	0.28	0.42	0.54	0.15	0.4	0.17	0.24	0.14	0.35	0.21	0.45	1.0	0.23	0.17
EED80472	0.21	0.26	0.23	0.46	0.21	0.26	0.23	0.2	0.26	0.21	0.16	0.21	0.22	0.26	0.29	0.28	0.23	0.35	0.12	0.32	0.2	0.23	0.22	0.34	0.39	0.46	1.0	0.25	0.36
EED80647	0.11	0.09	0.08	0.34	0.11	0.09	0.08	0.3	0.57	0.04	0.03	0.29	0.03	0.04	0.08	0.07	0.3	0.33	0.04	0.28	0.07	0.08	0.05	0.22	0.05	0.31	1.0	0.09	0.09
EED80848	0.08	0.1	0.08	0.22	0.08	0.1	0.08	0.18	0.35	0.11	0.09	0.22	0.13	0.13	0.12	0.14	0.23	0.31	0.1	0.25	0.09	0.15	0.1	0.16	0.18	0.21	1.0	0.14	0.16
EED80862	0.05	0.0	0.0	0.01	0.05	0.0	0.0	0.41	0.12	0.05	0.03	0.09	0.07	0.02	0.03	0.04	0.1	0.38	0.07	0.07	0.07	0.14	0.03	0.11	0.06	0.13	1.0	0.01	0.04
EED81351	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.1	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	1.0	0.0	0.0
EED81451	0.09	0.14	0.09	0.0	0.11	0.14	0.09	0.04	0.27	0.09	0.04	0.26	0.14	0.1	0.09	0.1	0.25	0.2	0.03	0.17	0.1	0.31	0.15	0.17	0.17	0.13	1.0	0.06	0.08
EED81572	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.11	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0
EED81657	0.24	0.19	0.19	0.2	0.24	0.19	0.19	0.42	0.27	0.21	0.22	0.29	0.24	0.25	0.25	0.35	0.19	0.4	0.19	0.35	0.28	0.28	0.28	0.41	0.33	0.46	1.0	0.32	0.25
EED81905	0.1	0.06	0.07	0.26	0.11	0.06	0.07	0.4	0.23	0.14	0.14	0.28	0.17	0.19	0.17	0.19	0.31	0.29	0.1	0.3	0.19	0.21	0.15	0.33	0.26	0.41	1.0	0.19	0.16
EED81992	1.0	0.15	0.12	0.01	0.82	0.15	0.12	0.01	0.44	0.15	0.07	0.07	0.07	0.16	0.2	0.16	0.07	0.18	0.19	0.04	0.05	0.08	0.05	0.09	0.03	0.06	0.69	0.06	0.17
EED82195	0.1	0.08	0.08	0.03	0.09	0.08	0.08	0.2	1.0	0.21	0.17	0.29	0.22	0.21	0.2	0.28	0.11	0.39	0.17	0.2	0.24	0.3	0.21	0.31	0.19	0.25	0.84	0.22	0.19
EED83112	0.12	0.1	0.1	0.12	0.13	0.1	0.1	0.54	0.22	0.15	0.1	0.34	0.17	0.2	0.19	0.22	0.46	0.25	0.15	0.34	0.13	0.14	0.15	0.52	0.18	0.59	1.0	0.21	0.18
EED83196	0.02	0.03	0.02	0.2	0.02	0.03	0.02	0.19	0.06	0.05	0.14	0.2	0.1	0.09	0.07	0.09	0.16	0.28	0.05	0.24	0.12	0.15	0.11	0.3	0.1	0.34	1.0	0.13	0.06
EED83414	0.45	0.11	0.07	0.0	0.41	0.11	0.07	0.01	1.0	0.02	0.01	0.07	0.05	0.07	0.05	0.06	0.03	0.25	0.02	0.07	0.06	0.05	0.08	0.08	0.11	0.15	0.98	0.02	0.04
EED83514	0.37	0.09	0.09	0.53	0.37	0.09	0.09	0.39	0.1	0.14	0.1	0.28	0.1	0.19	0.24	0.18	0.18	0.31	0.12	0.28	0.1	0.13	0.12	0.28	0.33	0.3	1.0	0.07	0.29
EED83549	0.14	0.15	0.19	0.13	0.12	0.15	0.19	0.23	0.93	0.12	0.09	0.28	0.07	0.15	0.1	0.16	0.18	0.2	0.05	0.21	0.11	0.11	0.19	0.27	0.17	0.28	1.0	0.12	0.11
EED83904	0.24	0.25	0.29	0.31	0.25	0.25	0.29	0.37	0.48	0.38	0.3	0.34	0.34	0.33	0.36	0.35	0.4	0.37	0.26	0.35	0.42	0.35	0.37	0.41	0.59	0.41	1.0	0.3	0.37
EED83976	0.54	0.08	0.06	0.0	0.46	0.08	0.06	0.01	1.0	0.19	0.09	0.08	0.08	0.21	0.3	0.2	0.05	0.23	0.28	0.05	0.07	0.09	0.07	0.09	0.04	0.07	0.8	0.08	0.23
EED84006	0.17	0.09	0.09	0.12	0.15	0.09	0.09	0.38	0.36	0.03	0.01	0.0	0.04	0.01	0.03	0.01	0.01	0.12	0.0	0.0	0.0	0.01	0.02	0.02	0.01	0.11	1.0	0.04	0.06
EED84203	0.0	0.0	0.0	0.17	0.0	0.0	0.0	0.05	0.05	0.08	0.06	0.02	0.01	0.01	0.04	0.02	0.03	0.11	0.06	0.09	0.02	0.01	0.03	0.02	0.01	0.03	1.0	0.01	0.03
EED84616	0.22	0.11	0.05	0.82	0.15	0.11	0.05	0.04	0.01	0.01	0.18	0.04	0.07	0.03	0.04	0.05	0.0	0.18	0.05	0.16	0.11	0.0	0.08	0.1	0.0	0.0	1.0	0.09	0.04
EED84631	0.03	0.04	0.03	0.23	0.04	0.04	0.03	0.03	0.14	0.04	0.03	0.09	0.06	0.04	0.03	0.05	0.11	0.48	0.04	0.08	0.06	0.13	0.07	0.14	0.08	0.22	1.0	0.04	0.03
EED84662	0.1	0.05	0.04	0.31	0.1	0.05	0.04	0.2	0.77	0.16	0.15	0.18	0.12	0.17	0.19	0.17	0.12	0.27	0.18	0.2	0.13	0.13	0.14	0.23	0.15	0.21	1.0	0.12	0.17
EED84791	0.18	0.02	0.01	0.03	0.14	0.02	0.01	0.01	0.6	0.05	0.0	0.01	0.04	0.01	0.08	0.02	0.01	0.14	0.03	0.02	0.02	0.04	0.02	0.16	0.15	0.11	1.0	0.01	0.05
EED85074	0.09	0.08	0.07	0.0	0.11	0.08	0.07	0.16	1.0	0.13	0.12	0.13	0.07	0.08	0.1	0.05	0.01	0.17	0.04	0.04	0.09	0.12	0.07	0.18	0.1	0.21	0.92	0.1	0.08
EED85385	0.47	0.38	0.38	0.64	0.47	0.38	0.38	0.51	0.34	0.44	0.42	0.45	0.37	0.4	0.45	0.4	0.44	0.47	0.39	0.4	0.45	0.46	0.47	0.53	0.53	0.52	1.0	0.4	0.42
EED85423	0.04	0.03	0.03	0.43	0.03	0.03	0.03	0.09	0.47	0.16	0.06	0.25	0.11	0.08	0.12	0.1	0.26	0.22	0.07	0.42	0.15	0.21	0.09	0.42	0.11	0.26	1.0	0.08	0.11
EED85425	0.01	0.01	0.01	0.24	0.02	0.01	0.01	0.07	1.0	0.03	0.01	0.13	0.04	0.03	0.03	0.06	0.03	0.2	0.02	0.21	0.01	0.01	0.01	0.1	0.01	0.17	0.97	0.05	0.01
EED85433	0.05	0.02	0.06	0.01	0.04	0.02	0.06	0.06	0.15	0.03	0.05	0.06	0.06	0.1	0.03	0.05	0.05	0.21	0.03	0.06	0.02	0.04	0.01	0.03	0.05	0.15	1.0	0.06	0.05
EED85543	0.1	0.19	0.2	0.39	0.1	0.19	0.2	0.15	0.16	0.33	0.21	0.26	0.31	0.31	0.21	0.28	0.2	0.36	0.22	0.35	0.43	0.29	0.36	0.39	0.52	0.41	1.0	0.35	0.32
EED85658	0.0	0.0	0.0	0.33	0.0	0.0	0.0	0.0	0.23	0.0	0.0	0.01	0.04	0.03	0.01	0.0	0.0	0.0	0.0	0.04	0.09	0.0	0.0	0.07	0.0	0.0	1.0	0.14	0.04
EED85711	0.01	0.0	0.0	0.0	0.01	0.0	0.0	0.0	0.92	0.04	0.02	0.01	0.03	0.01	0.06	0.02	0.01	0.13	0.04	0.02	0.03	0.03	0.05	0.1	0.11	0.09	1.0	0.02	0.04
EED85758	0.04	0.03	0.04	0.22	0.04	0.03	0.04	0.12	0.38	0.23	0.21	0.19	0.21	0.15	0.17	0.21	0.13	0.26	0.15	0.2	0.26	0.21	0.21	0.29	0.46	0.28	1.0	0.15	0.18
EED85846	0.17	0.08	0.16	0.74	0.19	0.08	0.16	0.33	0.04	0.0	0.0	0.0	0.03	0.06	0.02	0.0	0.0	0.03	0.01	0.01	0.0	0.01	0.0	0.0	0.02	0.15	1.0	0.01	0.03
EED85865	0.14	0.09	0.08	0.72	0.15	0.09	0.08	0.21	0.78	0.17	0.11	0.37	0.16	0.2	0.18	0.21	0.3	0.4	0.21	0.21	0.15	0.2	0.14	0.31	0.31	0.27	1.0	0.15	0.22
EED85873	0.18	0.0	0.07	0.0	0.12	0.0	0.07	0.1	0.08	0.0	0.04	0.03	0.0	0.02	0.03	0.0	0.0	0.03	0.0	0.07	0.03	0.03	0.08	0.0	0.03	0.0	1.0	0.01	0.03

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)