Heatmap: Cluster_7 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
30C,OErmtA
30C,rmtA KO
control,30C,WT
WT
control,WT,24h
control,WT,48h
control,WT,72h
2-phenylethanol,WT,24h
2-phenylethanol,WT,48h
2-phenylethanol,WT,72h
AF2202
icubation with peanut,AF2202,7days
10mM culture media,Tox4
25mM culture media,Tox4
10mM culture media,WT
10mM culture media,AF13
25mM culture media,AF13
0mM culture media,Tox4
20mM culture media,WT
0mM culture media,AF13
0mM culture media,WT
wetA KO
91aw,350 ppm CO2,37C,WT
99aw,350 ppm CO2,30C,WT
91aw,1000ppm CO2,30C,WT
91aw,30C,WT
91aw,350 ppm CO2,30C,WT
PDB+5-AC,WT
PDB+GA,WT
YEP,WT
YEP,rafA KO
YEP,afStuA KO
treatment,YC15
control,YC15
CA43
37C,WT
28C,WT
20C,WT
hbx1 restored
control,AF70
hbx1 KO
AF36
AF70
spc105 KO
0.0 0.0 0.0 9.24 0.16 17.73 26.92 0.06 12.14 17.51 1.85 5.93 5.99 9.07 14.34 8.29 9.76 7.21 17.83 5.56 13.68 0.04 0.12 9.71 0.02 0.17 0.03 2.54 1.94 0.0 0.0 0.0 1.0 0.5 3.93 12.25 14.23 14.53 1.84 3.28 0.18 4.18 0.54 2.4
0.09 0.35 0.0 124.15 0.1 1.05 0.85 0.03 0.79 0.75 0.24 16.48 1.16 1.04 0.73 0.54 0.72 0.6 0.66 0.64 1.09 1.62 1.59 0.88 1.08 1.09 1.19 0.08 0.17 0.59 0.11 0.08 0.09 0.11 0.23 0.27 0.66 0.2 0.13 0.19 0.13 0.07 1.56 2.29
1.86 5.2 6.55 8.21 0.5 1.69 2.28 0.24 1.86 1.78 1.47 25.62 1.14 1.11 1.4 1.77 1.14 0.55 1.91 1.48 1.61 2.06 4.39 10.35 3.38 3.13 3.4 1.64 0.69 0.89 1.51 0.47 0.86 0.28 4.48 2.23 1.85 1.78 2.39 2.55 2.26 2.29 5.43 2.44
0.05 0.0 0.0 1.12 0.0 0.35 1.05 0.02 0.22 2.15 0.0 0.61 0.98 0.64 0.97 0.94 0.53 0.58 0.33 0.93 1.73 1.0 0.16 0.87 0.16 0.29 0.25 0.9 5.69 0.05 0.14 0.11 0.81 0.12 0.23 0.42 0.13 0.45 0.17 0.21 0.3 1.91 0.61 0.37
0.0 0.69 0.0 2.73 0.0 0.68 0.35 0.0 0.33 2.17 0.32 0.0 1.27 0.47 4.44 1.8 1.32 1.5 1.43 2.14 5.46 0.08 0.86 0.0 1.86 0.89 3.4 0.26 0.0 1.85 9.41 0.0 0.24 0.38 0.0 1.46 1.37 0.0 0.0 0.06 2.93 2.12 1.89 0.05
0.0 0.0 0.64 2.86 0.05 0.47 0.29 0.0 0.71 3.56 0.16 3.2 2.08 0.78 5.11 1.79 1.41 2.66 1.96 1.77 5.81 0.0 1.54 0.24 2.46 0.81 2.53 1.44 0.72 0.65 8.08 0.09 0.16 0.09 0.09 3.49 1.43 0.06 0.14 0.17 5.0 2.33 1.21 0.34
0.12 0.0 0.0 22.14 0.0 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.14 2.63 0.11 0.2 0.12 0.08 0.0 0.07 0.0 0.3 0.1 1.48 14.51 0.0 4.64 3.86 7.54 0.0 0.12 0.02 0.2 0.0 0.12 0.0 0.0 0.11 0.06 0.0 0.06 0.09 0.05 0.1 0.07 0.64
1.01 1.43 1.58 26.41 21.8 3.94 2.41 39.08 9.33 20.05 1.98 3.19 3.3 1.59 12.41 1.23 2.03 3.74 2.62 2.51 7.93 8.2 1.2 2.56 0.87 1.5 0.88 0.93 18.7 12.27 13.04 50.78 4.63 2.36 0.09 15.63 13.01 5.7 7.56 9.03 8.83 1.45 1.93 12.48
0.0 0.43 0.0 34.9 11.09 2.32 0.85 14.4 4.88 11.11 1.97 4.62 2.49 1.55 14.38 0.98 1.35 3.79 3.08 0.88 13.76 3.25 0.0 2.38 0.0 0.0 0.73 0.0 3.57 6.96 13.98 47.04 2.51 2.83 0.51 6.55 16.32 2.57 4.03 7.99 4.23 1.15 2.88 4.91
0.0 0.35 0.26 32.96 12.53 1.54 1.05 18.94 5.51 15.58 3.38 3.23 3.18 1.26 16.18 1.6 0.38 3.15 2.36 1.79 5.97 2.16 0.2 0.97 0.87 0.14 0.33 0.53 7.58 3.42 10.92 30.09 2.22 2.11 0.62 11.82 13.83 4.84 3.8 5.92 4.36 1.18 5.15 6.9
0.0 0.0 0.0 101.02 0.06 0.03 0.34 0.03 0.0 0.34 0.0 75.42 0.64 0.6 0.63 0.53 0.47 0.64 1.22 0.21 0.49 0.02 1.14 219.3 1.54 1.14 0.99 0.0 0.09 0.05 2.78 0.05 0.0 0.0 0.06 3.19 0.45 1.13 0.38 0.43 38.51 0.0 1.36 0.41
0.0 0.36 0.0 28.28 0.08 0.1 0.26 0.15 0.13 0.06 6.62 0.65 0.1 0.07 0.07 0.3 0.17 0.05 0.09 0.0 0.4 0.46 3.03 0.0 3.08 2.07 3.07 0.08 0.09 4.47 9.12 11.96 1.31 0.09 0.16 18.37 15.9 40.31 0.78 0.76 1.24 0.64 3.25 0.45
0.0 0.89 0.0 28.23 3.91 2.87 5.61 5.74 2.4 19.11 0.46 0.46 0.73 0.45 1.29 0.34 0.78 0.77 0.99 2.25 2.32 2.15 1.91 2.5 7.42 3.94 5.66 23.13 60.56 0.44 1.15 0.92 1.31 0.88 3.07 7.31 3.16 12.26 1.17 0.82 2.45 1.08 0.53 5.97
1.33 0.08 0.6 0.65 0.29 0.28 0.54 0.19 0.51 0.59 0.08 0.62 0.23 0.22 0.22 0.65 0.39 0.17 0.22 0.33 0.16 0.04 0.28 0.0 0.41 0.22 0.43 0.49 0.27 0.56 0.57 0.72 0.16 0.0 0.95 1.25 0.89 0.12 0.7 1.13 0.66 1.2 0.54 0.24
0.0 0.11 0.0 3.78 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.02 0.0 0.0 0.01 0.0 0.82 1.53 0.07 0.0 0.17 0.2 2.89 0.12 0.04 0.24
0.36 0.25 0.0 17.11 0.4 0.58 1.27 0.41 0.44 2.79 0.6 77.4 0.05 0.08 6.06 0.0 0.03 0.08 2.31 0.45 8.25 0.31 0.98 6.09 0.84 0.79 0.69 1.19 1.83 0.06 0.36 0.0 0.06 0.0 0.2 17.89 6.65 3.16 5.25 6.31 4.27 0.24 0.7 1.13
0.45 0.21 0.0 0.67 0.06 0.41 0.28 0.0 0.54 1.24 0.03 0.43 0.06 0.09 0.15 0.08 0.09 0.1 0.03 0.0 0.13 0.49 0.0 0.19 1.36 0.0 0.41 0.52 0.64 0.27 0.11 0.11 0.04 0.0 0.9 0.13 0.0 0.13 0.13 0.26 1.36 0.14 0.22 0.09
0.9 0.98 0.0 2.03 0.33 0.65 0.66 0.0 0.6 0.29 0.23 0.31 0.22 0.18 0.37 0.29 0.35 0.1 0.27 0.0 0.37 0.8 0.0 0.97 3.08 0.08 0.8 1.51 0.58 0.49 0.81 0.2 0.17 0.05 1.45 0.19 0.08 0.37 0.86 0.78 0.89 0.0 0.18 0.59
0.1 0.16 0.0 0.8 0.03 0.02 0.0 0.0 0.01 0.03 0.0 0.13 0.07 0.04 0.0 0.07 0.14 0.02 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 1.62 0.07 0.29 0.06 0.07 0.05 0.26 0.04 0.04 0.0 0.27 0.02 0.0 0.0 0.17 0.22 0.22 0.03 0.44 0.13
0.17 0.4 0.0 1.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.09 0.71 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.15 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.01 0.0 0.0 0.14
0.12 0.36 0.0 2.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.16 0.08 0.12 0.17 0.0 0.15 0.0 0.21 0.09 1.01 4.97 0.18 0.54 0.22 0.12 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.18
10.36 18.17 20.62 55.15 9.43 8.5 6.62 2.61 5.16 5.74 30.68 101.34 9.05 8.34 26.46 10.94 8.3 7.58 24.47 9.5 29.7 4.29 2.97 40.8 3.26 2.46 3.1 6.61 10.77 3.04 8.25 4.66 5.03 3.31 1.48 13.27 11.05 14.91 6.26 4.02 51.82 4.89 2.79 5.94
3.35 2.84 2.18 11.92 0.26 20.92 12.57 0.14 4.81 26.55 0.2 1.37 3.92 7.49 20.59 3.85 6.85 3.78 8.88 3.13 12.35 2.09 2.81 0.75 2.3 4.44 3.99 1.3 5.92 1.42 0.49 0.42 1.0 0.3 0.47 1.28 1.17 5.38 1.79 4.42 32.51 3.76 0.53 3.25
0.0 0.58 0.0 1.15 0.0 0.82 0.25 0.04 0.05 0.05 0.0 0.12 0.0 0.0 0.81 0.0 0.05 0.0 2.49 0.0 0.41 0.0 0.17 3.4 0.27 0.78 0.33 0.12 0.51 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.6 1.03 0.04 0.04 0.2 0.0 0.09 0.38
0.0 0.0 0.0 2.82 0.12 0.52 2.68 0.46 0.51 1.38 9.83 0.31 0.58 0.18 0.48 0.0 0.0 0.35 0.18 0.41 0.2 0.09 0.0 0.0 0.28 0.32 0.0 2.73 2.34 0.07 0.44 0.0 2.32 0.89 3.35 0.6 0.15 1.5 0.32 0.18 0.21 2.7 0.41 3.63
0.05 0.0 0.0 0.89 0.02 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 4.44 0.0 0.06 0.09 0.03 0.04 0.0 0.07 0.03 0.0 0.0 0.11 0.42 0.0 0.0 0.06 0.09 0.25 0.11 0.04 0.02 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.09 0.07
0.0 0.2 0.0 1.24 0.12 0.14 0.18 0.08 0.17 0.7 1.18 0.62 0.95 1.69 1.05 0.85 1.5 1.19 1.57 0.69 0.93 0.05 0.91 0.37 0.76 0.35 0.95 0.41 0.45 0.79 0.25 0.07 1.47 0.82 0.24 0.71 0.57 2.02 0.52 0.32 0.49 0.54 0.41 0.49
0.3 0.28 0.38 2.02 0.29 0.05 0.54 0.06 0.07 0.1 2.05 0.0 0.19 0.2 0.68 0.34 0.04 0.39 0.59 0.15 0.76 0.02 0.04 0.0 0.05 0.13 0.06 0.06 0.12 0.15 0.04 0.04 0.15 0.04 0.13 0.14 0.08 0.25 0.07 0.07 0.19 0.15 0.1 0.28
0.0 0.0 0.0 2.11 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 5.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.19 0.03 0.12 0.0 0.04 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 4.55 0.0 0.05 0.14 0.0 0.04 0.0 6.26 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.0 0.0 0.0 2.22 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 4.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.0 0.03 0.02
0.08 0.05 0.02 0.75 0.14 0.1 0.08 0.17 0.21 0.17 1.15 0.03 0.47 0.05 0.27 0.04 0.09 0.27 0.09 0.08 0.17 0.04 0.01 0.18 0.04 0.05 0.05 1.1 0.83 0.11 0.34 0.3 0.28 0.05 2.53 0.22 0.38 1.42 0.09 0.11 0.5 0.11 0.05 0.42
0.3 0.35 0.27 10.97 6.37 0.77 2.17 3.31 1.81 3.21 1.39 0.96 0.79 0.45 1.99 0.5 0.5 0.57 1.28 0.63 1.85 0.28 0.29 0.86 1.76 1.28 2.46 21.66 10.87 3.05 4.07 1.93 0.63 0.13 2.87 2.17 1.31 4.2 0.95 1.32 28.66 0.5 0.24 4.68
0.0 0.0 0.0 1.98 0.74 0.0 0.25 0.0 0.0 0.09 6.27 0.1 0.07 0.11 0.17 0.07 0.12 0.37 0.06 0.0 0.08 0.14 0.72 0.0 0.57 0.49 0.97 0.0 0.0 0.06 0.23 0.03 0.03 0.07 1.17 0.1 0.0 0.0 0.13 0.14 1.59 0.17 0.11 0.47
0.0 0.0 0.0 1.76 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.72 0.48 10.28 0.54 0.2 0.3 0.02 0.04 0.09 5.31 0.15 0.2 0.15 0.14 0.18 0.09 0.48 0.14 0.07 0.15 2.02 0.22 0.0 0.12 0.2 0.27 0.24 0.22 0.03 0.27 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.51
0.0 1.19 0.0 6.47 0.32 0.71 0.12 0.0 0.0 0.14 3.13 0.55 0.0 0.32 0.61 0.2 0.38 0.21 0.0 0.0 0.0 2.21 0.0 0.49 0.0 0.15 0.31 0.27 0.3 0.52 0.46 0.19 0.18 0.0 0.0 0.13 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.38
0.0 1.4 0.69 2.39 0.0 0.8 0.47 0.14 0.3 0.16 4.82 0.0 0.6 0.21 0.26 0.81 0.64 0.28 0.63 0.0 0.31 1.61 0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.36 0.0 0.82 1.89 0.72 0.13 0.25 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 1.27 0.0 0.66
0.15 0.7 0.44 1.96 0.32 1.03 0.96 0.05 0.35 0.24 2.65 0.67 1.03 0.74 0.65 0.86 0.6 1.25 0.51 0.75 0.45 2.79 0.13 0.06 0.26 0.3 0.28 0.9 0.69 0.36 0.68 1.0 0.29 0.13 0.0 0.38 0.23 0.71 0.0 0.0 0.0 1.73 0.0 0.85
2.74 0.83 1.02 12.0 0.0 0.1 0.3 0.0 0.25 0.34 0.04 0.99 0.45 0.18 0.55 0.17 0.12 0.2 0.22 0.3 0.13 0.29 2.87 0.27 1.57 0.83 2.4 1.56 0.57 0.34 1.34 1.08 0.3 0.05 0.76 0.19 0.11 0.08 1.47 2.1 0.19 1.66 2.4 1.67
12.06 10.9 18.7 25.98 4.3 18.85 19.87 0.52 15.66 16.62 7.78 100.39 9.37 8.31 10.76 7.74 7.46 10.12 7.37 9.83 11.05 4.3 1.4 16.92 2.93 2.46 2.32 24.06 13.53 9.04 15.47 10.6 5.41 3.77 16.11 16.78 12.79 14.9 9.54 9.48 9.45 6.77 6.14 8.72
6.77 0.63 3.75 62.19 0.19 0.64 1.69 0.0 0.2 0.25 0.0 108.23 7.06 3.43 7.03 4.73 5.64 6.96 2.31 7.16 7.9 1.16 0.0 11.5 2.02 2.11 2.51 8.17 4.77 0.37 4.06 2.97 1.05 1.08 18.42 10.01 2.24 2.15 4.88 5.18 3.28 5.14 5.2 2.1
4.04 0.64 1.1 15.35 0.04 0.46 0.55 0.0 0.05 0.62 0.0 97.54 3.21 0.74 1.05 1.45 0.73 2.18 0.27 2.14 0.25 0.13 0.69 6.03 0.9 0.32 1.1 1.35 1.5 0.15 0.72 0.0 0.17 0.08 15.64 0.98 0.24 0.11 1.04 1.77 0.5 0.1 6.09 1.57
0.6 0.45 0.27 19.26 0.0 0.27 0.88 0.0 0.03 0.71 0.0 73.64 2.68 1.27 1.57 2.19 0.73 2.69 0.29 0.84 0.86 0.16 8.88 6.97 2.97 4.48 5.75 1.03 1.14 0.03 0.44 0.09 0.23 0.1 16.02 1.8 0.39 0.28 0.62 0.81 0.6 0.37 3.4 2.65
0.0 0.0 0.0 191.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.98 71.05 175.86 2.23 0.97 26.19 1.24 1.13 1.7 27.41 2.21 37.48 0.83 1.33 5.01 0.25 0.63 0.31 0.0 0.0 2.81 0.0 134.18 4.48 0.0 0.0 91.38 95.84 42.24 1.06 1.51 1.44 0.0 3.16 0.49
7.26 5.44 0.59 77.12 0.0 0.25 0.0 0.0 0.26 0.82 7.02 153.31 2.64 2.89 9.64 0.46 3.27 2.97 8.01 2.47 4.05 0.46 2.98 14.58 2.57 4.62 0.0 0.61 2.02 1.93 0.2 0.61 4.64 5.42 0.42 6.12 10.79 11.2 1.03 1.01 1.47 1.09 0.94 30.54
2.09 4.6 1.46 58.49 0.08 0.0 0.19 0.0 0.09 0.42 4.43 70.99 1.6 1.27 4.84 1.3 1.9 1.76 5.11 2.03 3.43 0.29 1.23 10.26 2.02 1.12 0.61 0.86 1.89 2.37 0.99 0.38 1.99 2.05 0.82 9.74 14.54 11.94 0.99 0.79 1.1 0.95 4.14 19.72
0.38 0.07 0.58 1.21 0.14 0.05 0.0 0.36 0.0 0.23 0.0 0.0 0.06 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.55 0.0 0.0 0.0 0.13 0.15 0.24 0.91 0.24 0.42 0.4 0.11 0.17 0.0 2.46 0.43 0.24 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 1.9
3.77 3.6 4.92 19.04 1.88 0.64 0.45 2.41 0.41 1.29 0.95 0.94 0.78 0.55 0.32 0.49 0.57 0.46 0.26 0.29 0.71 1.6 0.51 1.0 0.74 0.22 0.66 1.19 6.05 0.56 1.43 0.28 0.26 0.16 0.0 20.45 5.38 2.96 0.01 0.0 0.01 2.81 0.0 8.6
0.19 0.43 0.02 10.23 0.95 0.29 0.32 1.24 0.15 0.68 0.33 0.48 0.5 0.41 0.28 0.37 0.24 0.37 0.17 0.3 0.45 0.87 0.51 0.66 0.39 0.33 0.3 0.61 3.25 0.29 0.99 0.24 0.13 0.1 0.02 18.08 3.99 2.27 0.02 0.02 0.13 1.48 0.01 2.23
24.94 26.54 36.11 114.04 1.3 1.34 0.99 0.9 1.47 1.85 11.44 13.65 6.19 1.13 1.53 3.02 0.3 4.6 0.63 4.54 0.98 2.52 0.73 1.11 1.84 1.15 1.69 0.57 41.11 0.21 0.07 0.61 1.38 0.56 327.19 172.3 26.73 0.66 68.02 55.18 180.03 29.37 0.75 16.15
1.05 0.63 0.0 1.82 0.13 0.0 0.43 0.12 0.54 0.15 0.39 0.0 1.16 0.58 0.17 0.24 0.42 0.44 0.38 1.31 0.0 0.1 0.0 0.59 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.11 0.54 0.07 0.0 0.0 0.16 0.34 0.0 0.17 0.44 2.72 0.0 0.0 0.21
0.0 0.0 0.0 0.61 0.01 0.02 0.16 0.0 0.01 0.0 0.01 2.97 0.15 0.2 0.1 0.2 0.1 0.14 0.09 0.18 0.05 0.0 0.4 0.0 0.72 0.41 0.62 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.06 0.1 0.1 0.34 0.1

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)