Heatmap: Cluster_75 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 0.13 0.47 0.07 0.1 0.18 0.06 0.1 0.11 0.04 0.03 0.36 0.02 0.03 0.12 0.18 0.15 1.0 0.17 0.09 0.12 0.14 0.16 0.01 0.01 0.14 0.29
0.0 0.0 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.42 0.0 1.0 0.75 0.73 0.29 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.28
0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.24 0.0 0.53 0.55 0.4 0.68 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 1.0
0.51 0.32 0.43 0.5 0.33 0.41 0.49 0.18 0.33 0.47 0.42 0.08 0.3 0.77 0.72 0.16 0.33 0.08 0.05 0.43 0.11 0.21 0.61 0.11 0.3 0.66 1.0 0.13
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.34 0.0 0.12 0.21 0.23 0.28 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 1.0
0.02 0.03 0.17 0.58 0.43 0.95 0.27 0.43 0.1 0.16 0.06 0.53 0.51 0.19 0.18 0.33 0.26 0.24 0.41 0.29 0.34 0.29 0.08 0.32 1.0 0.11 0.14 0.84
0.09 0.31 0.8 0.63 0.34 0.22 0.5 0.83 0.49 0.41 0.52 0.35 0.46 0.46 0.42 0.47 0.42 0.77 0.46 0.64 0.62 0.76 0.58 0.72 1.0 0.44 0.43 0.31
0.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.21 0.21 0.0 1.0 0.67 0.0 0.87 0.0 0.86 0.0 0.0 0.0 0.84
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.08 0.1 0.03 0.35 0.09 0.03 0.21 0.11 0.14 0.24 0.15 0.24 0.09 0.42 0.25 0.77 0.86 0.22 0.73 0.87 0.83 0.84 0.06 1.0 0.15 0.02 0.23 0.2
0.35 0.08 0.01 0.26 0.02 0.0 0.15 0.04 0.02 0.08 0.05 0.03 0.01 0.27 0.19 0.71 0.37 0.07 0.69 0.9 1.0 0.69 0.01 0.98 0.92 0.05 0.12 0.2
0.0 0.01 0.05 0.46 0.07 0.0 0.29 0.12 0.06 0.22 0.07 0.08 0.07 0.01 0.01 0.93 0.62 0.3 0.72 0.9 1.0 0.76 0.02 0.94 0.0 0.0 0.02 0.2
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.96 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.82 0.0 0.54 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.01 0.11 0.42 0.02 0.01 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.14 0.0 0.0 0.01 0.05 0.04 0.05 0.14 0.1 0.15 0.17 0.09 0.0 0.0 0.01 0.3
0.01 0.0 1.0 0.76 0.07 0.02 0.31 0.01 0.06 0.0 0.01 0.03 0.25 0.01 0.01 0.07 0.13 0.4 0.25 0.48 0.38 0.54 0.59 0.25 0.03 0.0 0.06 0.16
1.0 0.98 0.0 0.49 0.09 0.0 0.62 0.08 0.17 0.53 0.0 0.08 0.0 0.0 0.05 0.0 0.1 0.4 0.75 0.2 0.33 0.0 0.18 0.1 0.0 0.0 0.41 0.0
0.18 0.3 0.4 0.39 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.14 0.14 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.41 0.0 0.14 1.0 0.0 0.0 0.7
0.0 0.06 0.16 0.52 0.0 0.0 0.16 0.13 0.4 0.14 0.0 0.0 0.0 0.41 1.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.33 0.12 0.33 0.32 0.42
0.0 0.12 0.0 0.37 0.0 0.51 0.37 0.26 0.0 0.13 0.12 0.24 0.24 0.07 0.07 0.29 0.42 0.31 0.0 0.33 0.5 0.45 0.56 1.0 0.33 0.29 0.15 0.39
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.32 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.82
0.04 0.56 0.81 0.47 0.2 0.59 0.69 0.67 1.0 0.48 0.84 0.33 0.55 0.41 0.47 0.89 0.15 0.97 0.29 0.97 0.43 0.32 0.43 0.63 0.33 0.43 0.35 0.0
0.0 0.21 0.76 0.35 0.43 0.0 0.45 0.0 0.21 0.0 0.0 0.19 0.21 0.37 0.49 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.83 0.26 0.0 0.0 0.19 0.35 1.0 0.0
0.23 0.07 0.34 0.19 0.55 0.43 0.08 0.27 0.14 0.0 0.0 0.55 0.83 0.25 0.17 0.33 0.0 0.0 0.0 0.87 0.57 0.17 0.52 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.44 0.0 0.48 0.07 0.53 0.06 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.15 0.31 0.02 0.01 0.16 0.02 0.05 0.02 0.02 0.01 0.01 0.03 0.01 0.14 0.03 0.07 0.1 1.0 0.08 0.13 0.07 0.13 0.0 0.0 0.44 0.26
0.0 0.48 0.0 0.06 0.0 0.09 0.0 0.08 0.08 0.27 0.0 0.32 0.0 1.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.39 0.07 0.0 0.0
0.07 0.12 0.66 0.5 0.78 0.5 0.62 0.57 0.29 0.78 0.27 0.38 1.0 0.21 0.18 0.66 0.31 0.55 0.48 0.79 0.63 0.5 0.37 0.55 0.19 0.1 0.27 0.67
0.25 0.11 0.56 0.32 0.36 0.47 0.44 0.72 0.1 0.6 0.2 0.14 0.76 0.22 0.27 0.66 0.73 0.9 0.78 0.31 0.73 0.57 1.0 0.67 0.05 0.29 0.38 0.49
0.01 0.1 0.25 0.63 0.21 0.23 0.35 0.29 0.48 0.36 0.51 0.25 0.23 0.16 0.17 0.4 0.32 0.36 0.48 0.97 1.0 0.69 0.53 0.8 0.06 0.09 0.25 0.33
0.01 0.02 0.45 1.0 0.22 0.31 0.35 0.13 0.18 0.34 0.18 0.29 0.44 0.08 0.06 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.58 0.13 0.16 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.4 0.22 0.0 0.0 0.09 0.76 0.42 0.44 0.33 0.08 0.58 0.05 0.18 0.41 0.1 0.19 0.54 0.2 1.0 0.41 0.13 0.47 0.0 0.06 0.3 0.26
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.77 0.0 0.81 1.0 1.0 0.86 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.97
0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.57 0.0 0.17 0.51 0.48 0.3 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.52
0.1 0.37 0.15 0.15 0.0 0.0 0.07 0.26 0.0 0.13 0.13 0.0 0.12 0.3 0.15 0.17 0.15 0.0 0.0 0.33 0.0 0.31 0.09 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.22 0.62 0.0 0.17 1.0 0.1 1.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.72
0.0 0.0 1.0 0.93 0.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.75 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 1.0 0.58 0.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.67 0.72 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.74 0.67 0.0 0.0
0.0 0.0 0.59 0.4 0.08 0.04 1.0 0.03 0.06 0.06 0.07 0.09 0.38 0.01 0.01 0.02 0.01 0.48 0.09 0.03 0.03 0.03 0.07 0.04 0.01 0.01 0.0 0.06
0.0 0.0 0.43 0.31 0.08 0.03 0.83 0.04 0.11 0.15 0.12 0.1 0.53 0.01 0.01 0.05 0.02 1.0 0.03 0.07 0.03 0.05 0.03 0.07 0.0 0.0 0.01 0.09
0.05 0.66 0.49 0.31 0.47 0.93 0.48 1.0 0.34 0.37 0.68 0.6 0.17 0.43 0.37 0.35 1.0 1.0 0.37 0.52 0.24 0.42 0.3 0.35 0.36 0.52 0.07 0.36
0.02 0.26 0.16 0.48 0.23 0.16 0.24 0.17 0.26 0.17 0.28 0.4 0.24 1.0 0.69 0.07 0.04 0.14 0.03 0.11 0.06 0.04 0.08 0.06 0.16 0.19 0.65 0.18
0.24 0.35 0.38 0.19 0.16 0.16 0.78 0.08 1.0 0.08 0.23 0.07 0.23 0.19 0.05 0.2 0.09 0.19 0.0 0.39 0.0 0.0 0.33 0.19 0.28 0.33 0.1 0.0
0.16 0.7 0.0 1.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.4 0.21 0.3 0.09 0.0 0.06 0.12 0.75 0.48 0.25 0.22 0.25 0.61 0.49 0.07 0.47 0.09 0.08 0.13 0.94
0.01 0.03 0.16 0.23 0.1 0.07 0.09 0.55 0.24 0.3 0.2 0.06 0.09 0.16 0.18 0.29 0.14 1.0 0.51 0.34 0.72 0.33 0.38 0.3 0.13 0.13 0.2 0.3
0.01 0.04 0.37 0.27 0.08 0.03 0.15 0.48 0.21 0.26 0.16 0.03 0.15 0.18 0.23 0.33 0.24 0.63 0.45 0.43 1.0 0.42 0.38 0.4 0.13 0.2 0.24 0.37
0.06 0.06 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.19 0.26 0.35 0.15 0.63 1.0 0.79 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.22
0.0 0.21 0.39 0.56 0.23 0.0 0.31 0.16 0.23 0.08 0.24 0.46 0.47 0.2 0.04 0.31 0.56 0.0 0.17 0.59 0.48 0.39 0.24 0.47 0.29 0.19 0.29 1.0
0.0 0.21 0.0 0.31 0.0 1.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.48 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.38 0.0 0.0 0.82 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)