1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.17 0.79 0.38 0.42 0.56 0.34 0.55 0.31 0.7 0.42 0.68 0.77 0.51 0.65 0.66 0.6 0.48 0.33 0.32 0.61 0.55 0.59 0.57 0.58 0.25 1.0 0.58 0.62
0.48 1.0 0.66 0.45 0.7 0.83 0.49 0.37 0.56 0.51 0.61 0.76 0.55 0.64 0.63 0.36 0.35 0.93 0.73 0.48 0.34 0.57 0.58 0.36 0.3 0.46 0.63 0.59
0.03 0.08 0.32 0.22 0.42 0.25 0.35 0.32 1.0 0.4 0.98 0.95 0.53 0.52 0.47 0.42 0.28 0.42 0.26 0.52 0.37 0.5 0.62 0.71 0.01 0.01 0.34 0.42
0.06 0.36 0.4 0.35 0.35 0.18 0.47 0.44 0.95 0.55 0.91 0.48 0.42 0.82 0.78 0.96 0.78 0.44 0.72 0.85 0.88 0.82 0.47 1.0 0.52 0.2 0.81 0.36
0.4 0.99 0.29 0.2 0.38 0.07 0.28 0.46 0.73 0.64 0.41 0.28 1.0 0.9 0.87 0.29 0.23 0.79 0.12 0.34 0.18 0.16 0.73 0.16 0.19 0.48 0.67 0.1
0.32 0.89 0.43 0.16 0.5 1.0 0.47 0.29 0.46 0.29 0.51 0.51 0.43 0.43 0.42 0.49 0.75 0.33 0.22 0.41 0.27 0.4 0.47 0.42 0.36 0.46 0.38 0.24
0.33 0.52 0.08 0.01 0.05 0.02 0.05 0.47 0.64 0.32 1.0 0.06 0.03 0.25 0.24 0.12 0.03 0.09 0.03 0.09 0.13 0.07 0.08 0.07 0.06 0.0 0.15 0.02
1.0 0.69 0.17 0.06 0.06 0.03 0.09 0.36 0.62 0.13 0.62 0.04 0.04 0.22 0.32 0.24 0.17 0.37 0.16 0.45 0.46 0.27 0.47 0.3 0.61 0.02 0.3 0.13
0.44 0.61 0.38 0.39 0.52 0.3 0.46 0.35 0.85 0.51 0.69 0.72 0.51 0.94 1.0 0.18 0.2 0.71 0.23 0.27 0.28 0.3 0.58 0.25 0.35 0.52 0.69 0.55
0.01 0.08 0.03 0.16 0.07 0.02 0.88 0.08 0.94 0.25 0.6 0.29 0.3 0.16 0.08 1.0 0.5 0.18 0.66 0.97 0.29 0.63 0.03 0.99 0.73 0.05 0.11 0.04
0.67 1.0 0.68 0.48 0.25 0.18 0.44 0.74 0.38 0.48 0.28 0.15 0.25 0.32 0.4 0.81 0.4 0.3 0.65 0.84 0.81 0.68 0.86 0.71 0.76 0.66 0.51 0.74
0.29 0.89 0.42 0.07 0.58 1.0 0.25 0.39 0.86 0.41 0.92 0.65 0.21 0.77 0.9 0.29 0.3 0.35 0.49 0.28 0.38 0.33 0.77 0.37 0.99 0.45 0.47 0.24
0.16 0.79 0.29 0.27 0.52 0.21 0.48 0.64 0.73 0.7 0.68 0.75 0.89 0.97 0.74 0.4 0.35 0.96 0.18 0.43 0.28 0.34 1.0 0.31 0.26 0.11 0.79 0.2
0.28 0.98 0.43 0.7 0.77 0.76 0.53 0.37 0.62 0.51 0.72 0.91 0.68 1.0 0.93 0.8 0.82 0.57 0.44 0.81 0.77 0.87 0.76 0.83 0.84 0.9 0.77 0.91
0.79 0.84 0.48 0.39 0.32 0.33 0.47 0.55 0.9 0.49 1.0 0.3 0.37 0.51 0.52 0.4 0.37 0.41 0.37 0.51 0.55 0.52 0.51 0.49 0.5 0.27 0.94 0.41
0.34 1.0 0.65 0.51 0.52 0.89 0.6 0.66 0.67 0.8 0.59 0.57 0.46 0.83 0.76 0.53 0.54 0.73 0.65 0.58 0.52 0.65 0.53 0.6 0.68 0.74 1.0 0.62
0.33 0.67 0.47 0.3 0.27 0.25 0.39 0.44 0.88 0.33 0.87 0.32 0.32 0.56 0.63 0.37 0.4 0.5 0.52 0.51 0.63 0.61 1.0 0.6 0.3 0.2 0.6 0.42
0.37 0.76 0.36 0.27 0.38 0.31 0.32 0.38 0.8 0.43 1.0 0.52 0.35 0.69 0.63 0.29 0.33 0.63 0.49 0.44 0.37 0.43 0.49 0.38 0.28 0.46 0.66 0.4
0.81 0.87 0.39 0.28 0.57 0.48 0.41 0.67 0.86 0.58 1.0 0.61 0.29 0.69 0.74 0.35 0.3 0.33 0.49 0.46 0.39 0.5 0.78 0.4 0.71 0.37 0.56 0.28
0.18 0.55 0.42 0.35 0.64 0.65 0.46 0.46 0.85 0.6 1.0 0.73 0.44 0.72 0.76 0.6 0.51 0.78 0.78 0.66 0.66 0.72 0.49 0.61 0.23 0.74 0.53 0.49
0.28 0.64 0.69 0.36 0.62 0.53 0.56 0.48 0.85 0.35 1.0 0.63 0.49 0.54 0.56 0.61 0.71 0.46 0.32 0.72 0.52 0.8 0.73 0.73 0.33 0.46 0.44 0.38
0.17 0.85 0.65 0.58 1.0 0.63 0.71 0.49 0.66 0.49 0.73 0.85 0.73 0.75 0.77 0.92 0.68 0.56 0.43 0.9 0.99 0.84 0.65 0.72 0.41 0.68 0.89 0.53
0.19 0.84 0.23 0.23 0.42 0.34 0.33 0.61 0.6 0.53 1.0 0.44 0.21 0.22 0.3 0.23 0.19 0.39 0.12 0.19 0.17 0.19 0.55 0.17 0.22 0.35 0.21 0.17
0.06 0.43 0.67 0.19 0.85 0.8 0.92 0.5 0.75 0.75 0.8 1.0 0.69 0.61 0.56 0.28 0.34 0.47 0.15 0.36 0.19 0.4 0.53 0.34 0.26 0.21 0.54 0.49
1.0 0.5 0.5 0.11 0.14 0.06 0.27 0.38 0.88 0.21 0.84 0.13 0.1 0.24 0.28 0.32 0.24 0.14 0.26 0.51 0.52 0.42 0.34 0.42 0.12 0.05 0.63 0.1
0.12 0.12 0.23 0.19 0.23 0.13 0.36 0.61 0.64 0.45 0.71 0.31 0.38 0.74 1.0 0.29 0.4 0.43 0.19 0.46 0.3 0.39 0.88 0.41 0.17 0.69 0.87 0.59
0.27 0.27 0.65 0.43 0.75 0.62 0.55 0.54 0.52 0.59 0.53 0.7 0.44 0.95 1.0 0.75 0.56 0.39 0.42 0.77 0.79 0.75 0.63 0.73 0.47 0.81 0.68 0.61
0.08 0.88 0.24 0.37 0.82 0.84 0.37 0.55 0.8 0.61 0.79 0.99 0.49 0.94 1.0 0.6 0.64 0.6 0.34 0.56 0.43 0.54 0.73 0.57 0.3 0.4 0.78 0.79
0.13 0.67 0.12 0.19 0.23 0.21 0.12 0.54 0.94 0.58 1.0 0.32 0.21 0.29 0.32 0.11 0.12 0.23 0.13 0.21 0.08 0.17 0.28 0.16 0.12 0.2 0.1 0.32
0.61 1.0 0.32 0.43 0.34 0.38 0.34 0.47 0.75 0.4 0.81 0.41 0.34 0.44 0.52 0.45 0.53 0.34 0.61 0.64 0.72 0.74 0.75 0.77 0.57 0.63 0.43 0.57
0.54 0.85 0.34 0.3 0.47 0.42 0.52 0.55 0.99 0.57 1.0 0.62 0.46 0.44 0.48 0.45 0.43 0.37 0.26 0.46 0.44 0.47 0.51 0.47 0.46 0.51 0.44 0.3
0.31 1.0 0.27 0.34 0.54 0.86 0.55 0.31 0.47 0.45 0.53 0.72 0.48 0.54 0.55 0.32 0.41 0.63 0.48 0.25 0.2 0.3 0.43 0.27 0.33 0.46 0.47 0.4
1.0 0.67 0.28 0.3 0.47 0.35 0.28 0.54 0.71 0.41 0.74 0.59 0.22 0.42 0.55 0.47 0.53 0.3 0.28 0.54 0.36 0.52 0.93 0.56 0.48 0.44 0.37 0.42
0.11 0.65 0.11 0.32 0.27 0.18 0.22 0.32 1.0 0.43 0.97 0.41 0.27 0.27 0.41 0.64 0.69 0.49 0.72 0.65 0.68 0.51 0.65 0.55 0.07 0.77 0.22 0.49
0.6 1.0 0.77 0.44 0.72 0.74 0.69 0.52 0.77 0.65 0.84 0.83 0.54 0.73 0.77 0.97 0.92 0.38 0.43 0.81 0.82 0.84 0.73 0.85 0.7 0.56 0.55 0.51
0.25 1.0 0.47 0.4 0.37 0.71 0.54 0.44 0.74 0.41 0.76 0.55 0.37 0.63 0.64 0.5 0.74 0.35 0.38 0.56 0.48 0.63 0.59 0.53 0.42 0.86 0.49 0.51
0.38 0.71 0.42 0.47 0.67 0.82 0.49 0.5 0.55 0.62 0.56 0.63 0.36 0.74 0.75 0.51 0.45 0.26 0.21 0.5 0.47 0.51 0.74 0.46 0.56 1.0 0.75 0.53
0.36 0.66 0.56 0.4 0.58 0.4 0.45 0.36 0.93 0.53 1.0 0.72 0.38 0.77 0.75 0.49 0.55 0.4 0.68 0.68 0.5 0.69 0.64 0.6 0.54 0.38 0.65 0.7
0.18 1.0 0.39 0.26 0.18 0.14 0.31 0.54 0.49 0.44 0.59 0.1 0.51 0.38 0.45 0.53 0.26 0.36 0.28 0.52 0.51 0.41 0.46 0.4 0.13 0.16 0.5 0.28
1.0 0.68 0.15 0.16 0.36 0.15 0.33 0.76 0.52 0.64 0.66 0.55 0.38 0.41 0.49 0.11 0.06 0.29 0.06 0.08 0.09 0.09 0.52 0.08 0.17 0.12 0.21 0.05
0.44 0.6 0.4 0.46 0.78 0.66 0.36 0.44 0.91 0.46 0.85 0.92 0.31 0.89 0.97 0.58 0.61 0.3 0.34 0.58 0.55 0.54 1.0 0.71 0.42 0.63 0.7 0.88
0.22 0.79 0.39 0.35 0.53 0.53 0.55 0.53 0.89 0.49 1.0 0.66 0.46 0.54 0.54 0.54 0.63 0.47 0.32 0.62 0.46 0.68 0.76 0.7 0.21 0.62 0.42 0.51
0.58 0.5 0.42 0.35 0.52 0.35 0.42 0.4 0.97 0.58 1.0 0.74 0.25 0.44 0.48 0.31 0.38 0.34 0.19 0.42 0.24 0.47 0.45 0.43 0.18 0.27 0.38 0.63
0.19 1.0 0.44 0.14 0.28 0.24 0.42 0.4 0.66 0.46 0.54 0.42 0.57 0.31 0.34 0.39 0.49 0.57 0.26 0.5 0.3 0.42 0.88 0.35 0.16 0.1 0.28 0.25
0.12 1.0 0.18 0.12 0.28 0.21 0.29 0.21 0.5 0.46 0.5 0.32 0.29 0.48 0.42 0.3 0.36 0.46 0.21 0.29 0.2 0.23 0.67 0.2 0.19 0.17 0.3 0.24
0.07 0.74 0.29 0.18 0.45 0.69 0.21 0.25 0.59 0.27 0.72 0.69 0.23 0.57 0.75 1.0 0.87 0.36 0.42 0.69 0.71 0.7 0.88 0.81 0.26 0.16 0.32 0.16
0.04 0.64 0.36 0.25 0.67 1.0 0.36 0.47 0.51 0.58 0.59 0.74 0.62 0.32 0.48 0.6 0.68 0.49 0.2 0.48 0.3 0.49 0.91 0.33 0.17 0.09 0.32 0.3
0.0 0.01 0.02 0.02 0.02 0.0 0.02 0.1 0.86 0.08 1.0 0.01 0.0 0.31 0.41 0.0 0.02 0.02 0.05 0.12 0.0 0.08 0.06 0.03 0.03 0.04 0.49 0.13
0.89 0.74 0.52 0.3 0.46 0.48 0.45 0.79 0.94 0.58 1.0 0.51 0.29 0.48 0.63 0.72 0.59 0.32 0.55 0.73 0.78 0.68 0.95 0.76 0.79 0.36 0.45 0.34
0.43 1.0 0.62 0.48 0.65 0.75 0.64 0.57 0.69 0.61 0.75 0.78 0.45 0.8 0.71 0.52 0.48 0.45 0.29 0.6 0.62 0.64 0.65 0.57 0.57 0.94 0.73 0.58
0.23 0.34 0.26 0.25 0.27 0.23 0.56 0.87 0.38 0.76 0.52 0.26 0.34 0.73 0.65 0.09 0.09 0.42 0.04 0.15 0.13 0.1 0.65 0.09 0.1 0.79 1.0 0.3
0.88 1.0 0.2 0.37 0.39 0.27 0.43 0.35 0.76 0.67 0.6 0.59 0.41 0.38 0.45 0.26 0.21 0.33 0.14 0.29 0.2 0.27 0.84 0.25 0.05 0.15 0.36 0.39
0.21 0.67 0.51 0.53 0.86 0.89 0.45 0.5 0.77 0.5 0.88 1.0 0.46 0.81 0.91 0.83 0.82 0.44 0.41 0.77 0.76 0.83 0.85 0.87 0.66 0.97 0.54 0.53
1.0 0.74 0.13 0.07 0.19 0.16 0.18 0.43 0.84 0.42 0.52 0.28 0.08 0.52 0.43 0.08 0.11 0.08 0.04 0.1 0.07 0.07 0.28 0.07 0.13 0.19 0.57 0.07

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)