Heatmap: Cluster_135 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.01 0.02 0.29 0.17 0.02 0.02 0.36 0.1 0.09 0.17 0.1 0.02 0.11 0.05 0.06 0.34 0.28 1.0 0.23 0.4 0.43 0.44 0.17 0.46 0.02 0.25 0.07 0.43
0.03 0.05 0.27 0.37 0.02 0.01 0.49 0.32 0.2 0.36 0.19 0.01 0.41 0.14 0.1 0.33 0.38 1.0 0.21 0.26 0.41 0.25 0.21 0.27 0.08 0.02 0.13 0.58
0.09 0.11 0.33 0.38 0.15 0.08 0.28 0.17 0.36 0.14 0.41 0.15 0.21 0.2 0.23 0.92 0.63 0.7 0.69 0.88 1.0 0.74 0.33 0.85 0.15 0.14 0.23 0.38
0.02 0.04 0.33 0.23 0.16 0.5 0.21 0.34 0.09 0.1 0.08 0.17 0.14 0.17 0.13 0.39 1.0 0.42 0.15 0.35 0.36 0.41 0.14 0.21 0.05 0.06 0.17 0.17
0.03 0.04 0.11 0.39 0.42 0.61 0.13 0.13 0.24 0.12 0.32 0.51 0.15 0.04 0.05 1.0 0.81 0.35 0.6 0.61 0.4 0.65 0.23 0.68 0.06 0.02 0.02 0.34
0.41 0.07 0.22 0.41 0.64 0.6 0.15 0.11 0.24 0.11 0.17 1.0 0.17 0.18 0.19 0.82 0.62 0.25 0.5 0.49 0.49 0.77 0.17 0.86 0.09 0.28 0.34 0.38
0.48 0.06 0.82 1.0 0.98 0.8 0.6 0.41 0.3 0.48 0.36 0.62 0.68 0.07 0.11 0.71 0.62 0.42 0.28 0.58 0.36 0.65 0.36 0.62 0.17 0.11 0.16 0.81
0.13 0.32 0.24 0.18 0.13 0.13 0.33 0.14 0.19 0.21 0.24 0.16 0.56 0.12 0.1 0.55 0.28 1.0 0.98 0.7 0.61 0.63 0.09 0.77 0.12 0.15 0.15 0.12
0.18 0.11 0.19 0.35 0.19 0.1 0.17 0.1 0.33 0.09 0.32 0.31 0.14 0.13 0.18 0.84 0.66 0.81 1.0 0.68 0.64 0.67 0.37 0.72 0.03 0.55 0.1 0.57
0.02 0.02 0.44 0.44 0.19 0.17 0.34 0.22 0.13 0.2 0.13 0.1 0.35 0.16 0.15 0.34 0.19 0.16 0.19 0.3 0.28 0.29 0.15 0.27 0.03 0.5 0.16 1.0
0.01 0.18 0.29 0.44 0.44 0.41 0.42 0.07 0.03 0.09 0.02 0.44 0.25 0.02 0.05 0.57 0.34 0.12 0.09 0.22 0.11 0.36 0.28 0.25 0.03 0.0 0.04 1.0
0.23 0.48 0.29 0.56 0.75 0.63 0.94 0.22 0.45 0.32 0.35 0.89 0.53 0.41 0.35 0.71 0.5 1.0 0.63 0.45 0.38 0.49 0.51 0.44 0.25 0.28 0.34 0.46
0.89 0.1 0.37 0.47 0.22 0.29 0.55 0.32 0.41 0.43 0.59 0.21 0.25 0.08 0.1 0.9 1.0 0.34 0.45 0.85 0.43 0.66 0.34 0.69 0.05 0.07 0.13 0.41
0.58 0.27 0.56 0.33 0.73 1.0 0.4 0.24 0.52 0.4 0.49 0.75 0.26 0.32 0.33 0.76 0.68 0.5 0.59 0.74 0.58 0.74 0.42 0.75 0.12 0.2 0.25 0.62
0.46 0.03 0.85 0.55 0.5 0.35 0.39 0.24 0.1 0.14 0.11 0.39 0.26 0.05 0.06 0.3 0.22 0.26 0.17 0.36 0.22 0.4 0.27 0.34 0.02 0.19 0.08 1.0
0.14 0.04 0.51 0.5 0.56 0.52 0.51 0.36 0.3 0.26 0.41 0.47 0.47 0.13 0.26 1.0 0.76 0.45 0.27 0.71 0.52 0.75 0.84 0.67 0.04 0.31 0.17 0.5
0.32 0.07 0.01 0.44 0.03 0.04 0.09 0.11 0.03 0.05 0.04 0.01 0.3 0.08 0.1 0.1 0.06 0.08 0.01 0.06 0.04 0.03 0.07 0.02 0.05 0.02 0.26 1.0
0.01 0.04 0.37 0.48 0.52 0.42 0.72 0.47 0.27 0.4 0.3 0.53 0.69 0.15 0.16 1.0 0.71 0.55 0.27 0.49 0.51 0.76 0.36 0.51 0.04 0.05 0.21 0.99
0.04 0.02 0.37 0.73 0.22 0.45 0.7 0.33 0.24 0.22 0.28 0.17 0.46 0.07 0.07 0.57 0.59 1.0 0.46 0.61 0.55 0.75 0.18 0.64 0.04 0.13 0.13 0.97
0.06 0.2 0.7 0.63 0.55 0.37 0.7 0.23 0.42 0.19 0.55 0.69 0.56 0.3 0.33 1.0 0.96 0.39 0.48 0.84 0.71 0.85 0.99 0.96 0.04 0.64 0.24 0.65
0.01 0.02 0.0 0.2 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.0 0.01 0.01 1.0 0.79 0.03 0.29 0.37 0.5 0.65 0.0 0.43 0.0 0.03 0.01 0.04
0.0 0.01 0.01 0.19 0.08 0.01 0.02 0.01 0.03 0.01 0.09 0.07 0.0 0.03 0.03 0.89 1.0 0.15 0.44 0.64 0.46 0.76 0.1 0.65 0.01 0.14 0.0 0.13
0.0 0.01 0.01 0.38 0.02 0.0 0.02 0.01 0.04 0.02 0.05 0.04 0.04 0.0 0.01 1.0 0.73 0.01 0.36 0.76 0.46 0.77 0.03 0.69 0.01 0.08 0.01 0.33
0.06 0.0 0.11 0.26 0.11 0.17 0.49 0.4 0.06 0.17 0.08 0.03 0.1 0.01 0.02 0.19 0.08 0.03 0.07 0.1 0.07 0.13 0.09 0.11 0.0 0.01 0.02 1.0
0.08 0.33 0.21 0.3 0.1 0.18 0.39 0.33 0.29 0.19 0.37 0.09 0.19 0.23 0.22 0.66 0.51 1.0 0.51 0.7 0.66 0.8 0.22 0.74 0.2 0.24 0.31 0.64
0.12 0.3 0.48 0.74 0.5 0.35 0.36 0.19 0.22 0.32 0.26 0.37 0.76 0.42 0.43 0.31 0.5 0.7 0.26 0.46 0.37 0.3 0.73 0.31 0.14 0.25 1.0 0.6
0.18 0.03 0.05 0.29 0.18 0.3 0.26 0.07 0.02 0.13 0.03 0.1 0.1 0.03 0.03 0.93 1.0 0.49 0.25 0.23 0.37 0.41 0.08 0.26 0.24 0.09 0.04 0.58
0.0 0.0 1.0 0.53 0.05 0.03 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.05 0.01 0.01 0.14 0.1 0.1 0.43 0.41 0.46 0.41 0.08 0.32 0.0 0.0 0.02 0.54
0.0 0.01 0.0 0.22 0.09 0.07 0.0 0.02 0.02 0.04 0.07 0.03 0.0 0.01 0.02 0.18 0.06 0.0 1.0 0.61 0.76 0.45 0.01 0.9 0.0 0.01 0.0 0.16
0.01 0.01 1.0 0.42 0.13 0.07 0.32 0.02 0.02 0.01 0.01 0.08 0.25 0.01 0.01 0.1 0.07 0.13 0.1 0.21 0.15 0.22 0.16 0.17 0.03 0.03 0.01 0.68
0.31 0.24 0.64 0.65 1.0 0.56 0.82 0.6 0.84 0.38 0.77 0.61 0.68 0.28 0.38 1.0 0.76 0.62 0.31 0.88 0.78 0.81 0.83 0.73 0.12 0.38 0.63 0.75
0.05 0.09 0.51 0.47 0.37 0.78 0.98 0.38 0.24 0.21 0.21 0.4 0.18 0.4 0.46 0.84 0.78 0.69 0.21 0.4 0.2 0.47 1.0 0.42 0.08 0.25 0.46 0.47
0.75 0.78 0.57 0.45 0.65 1.0 0.69 0.42 0.78 0.32 0.92 0.78 0.41 0.61 0.7 0.9 0.71 0.65 0.49 0.92 0.68 0.96 0.75 0.84 0.26 0.47 0.35 0.58
0.05 0.13 0.7 0.56 0.55 0.32 0.67 0.27 0.46 0.3 0.47 0.71 0.39 0.12 0.13 0.38 0.31 0.59 1.0 0.5 0.43 0.47 0.41 0.47 0.23 0.29 0.18 0.63
0.01 0.01 0.47 0.57 0.42 0.09 0.64 0.4 0.66 0.46 0.8 0.75 0.72 0.2 0.23 0.76 0.84 0.81 0.94 0.75 0.79 0.83 0.72 1.0 0.01 0.03 0.41 0.6
0.29 0.03 0.23 0.24 0.59 1.0 0.36 0.28 0.11 0.05 0.21 0.7 0.21 0.08 0.08 0.72 0.94 0.77 0.71 0.46 0.18 0.64 0.09 0.34 0.17 0.0 0.05 0.3
0.18 0.56 0.53 0.51 0.64 0.92 1.0 0.28 0.46 0.32 0.44 0.79 0.95 0.36 0.42 0.82 0.73 0.72 0.36 0.69 0.64 0.73 0.53 0.83 0.71 0.46 0.28 0.45
0.38 0.07 0.07 0.39 0.33 0.65 0.37 0.34 0.06 0.22 0.06 0.09 0.14 0.4 0.35 0.33 0.17 0.05 0.07 0.12 0.09 0.14 0.08 0.11 0.76 0.06 0.32 1.0
0.33 0.31 0.53 0.53 1.0 0.79 0.47 0.27 0.45 0.22 0.43 1.0 0.46 0.24 0.29 0.58 0.67 0.41 0.27 0.61 0.45 0.72 0.43 0.56 0.25 0.42 0.21 0.51
0.27 0.14 0.5 0.35 0.57 0.24 0.42 0.23 0.22 0.16 0.22 0.23 1.0 0.11 0.14 0.63 0.37 0.31 0.29 0.49 0.45 0.41 0.27 0.45 0.06 0.36 0.23 0.39
0.12 0.13 0.84 0.49 0.35 0.37 1.0 0.28 0.35 0.36 0.33 0.23 0.5 0.34 0.29 0.49 0.48 0.84 0.32 0.76 0.55 0.76 0.35 0.52 0.11 0.28 0.67 0.73
0.3 0.26 0.64 0.6 1.0 0.63 0.61 0.56 0.62 0.56 0.61 0.96 0.78 0.5 0.56 0.98 0.73 0.65 0.57 0.89 0.92 0.82 0.86 0.81 0.39 0.69 0.69 0.7
0.02 0.04 0.06 0.26 0.23 0.16 0.33 0.02 0.04 0.04 0.08 0.22 0.26 0.02 0.03 0.81 1.0 0.21 0.33 0.46 0.47 0.59 0.2 0.57 0.01 0.03 0.03 0.57
0.04 0.01 0.13 0.27 0.78 0.96 0.3 0.14 0.05 0.09 0.05 0.46 0.32 0.04 0.05 0.84 0.43 0.9 0.33 0.5 0.58 0.54 0.1 0.52 0.01 0.08 0.05 1.0
0.09 0.33 0.23 0.21 0.36 0.5 0.25 0.17 0.12 0.1 0.13 0.42 0.22 0.07 0.06 0.39 0.25 0.7 0.95 0.49 0.72 0.48 0.08 1.0 0.29 0.06 0.21 0.22
0.03 0.09 0.31 0.4 0.29 0.21 0.36 0.16 0.4 0.18 0.38 0.41 0.34 0.08 0.13 0.89 0.89 0.54 0.67 0.77 0.92 0.86 0.46 1.0 0.07 0.22 0.09 0.74
0.01 0.01 0.06 0.24 0.04 0.02 0.07 0.06 0.09 0.05 0.09 0.07 0.08 0.02 0.04 0.45 0.61 1.0 0.53 0.42 0.33 0.46 0.2 0.67 0.01 0.01 0.05 0.24
0.05 0.12 0.07 0.49 0.06 0.13 0.49 0.12 0.18 0.07 0.0 0.17 0.0 0.12 0.11 0.76 1.0 0.16 0.39 0.65 0.25 0.38 0.09 0.37 0.05 0.91 0.0 0.0
0.02 0.05 0.15 0.47 0.48 0.69 0.27 0.15 0.1 0.06 0.14 0.39 0.4 0.04 0.04 0.84 1.0 0.87 0.84 0.56 0.75 0.73 0.2 0.74 0.03 0.04 0.03 0.55
0.0 0.09 0.2 0.23 0.08 0.08 0.27 0.09 0.09 0.05 0.14 0.1 0.36 0.02 0.04 0.42 0.42 1.0 0.61 0.29 0.23 0.33 0.41 0.42 0.01 0.03 0.02 0.26
0.03 0.01 0.0 0.22 0.01 0.0 0.05 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.16 0.04 0.0 0.61 1.0 0.07 0.63 0.16 0.29 0.23 0.04 0.43 0.0 0.07 0.05 0.18
0.17 0.22 0.28 0.28 0.06 0.09 0.41 0.54 0.35 0.41 0.38 0.05 0.47 0.26 0.22 0.42 0.44 0.95 1.0 0.42 0.47 0.5 0.5 0.53 0.14 0.22 0.28 0.37
0.09 0.18 0.34 0.31 0.66 1.0 0.29 0.14 0.1 0.11 0.15 0.57 0.36 0.1 0.1 0.47 0.84 0.63 0.39 0.48 0.39 0.58 0.15 0.55 0.13 0.17 0.09 0.35

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)