Heatmap: Cluster_37 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.05 0.09 0.3 0.49 0.06 0.45 0.49 0.12 0.0 0.0 0.12 0.06 0.12 0.07 0.07 0.23 0.89 0.0 0.55 0.85 0.38 0.61 0.45 1.0 0.11 0.05 0.38 0.4
0.3 0.34 0.82 0.74 1.0 0.86 0.72 0.83 0.77 0.8 0.78 0.84 0.61 0.5 0.59 0.79 0.85 0.77 0.92 0.88 0.61 0.85 0.7 0.75 0.33 0.43 0.57 0.67
0.12 0.31 0.73 0.61 0.64 0.33 0.65 1.0 0.86 0.71 0.99 0.48 0.88 0.41 0.46 0.61 0.35 0.43 0.78 0.66 0.61 0.55 0.47 0.6 0.21 0.44 0.39 0.24
1.0 0.45 0.46 0.28 0.49 0.33 0.49 0.77 0.83 0.41 0.78 0.36 0.73 0.11 0.14 0.23 0.2 0.3 0.14 0.22 0.18 0.21 0.22 0.21 0.34 0.14 0.15 0.2
0.28 0.12 1.0 0.49 0.51 0.36 0.74 0.39 0.43 0.32 0.47 0.38 0.67 0.24 0.21 0.46 0.3 0.43 0.46 0.54 0.62 0.55 0.31 0.5 0.09 0.27 0.24 0.22
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.4 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.35 0.78 0.58 0.74 0.52 0.61 0.74 1.0 0.56 0.98 0.6 0.68 0.35 0.42 0.87 0.98 0.58 0.54 0.71 0.61 0.8 0.46 0.74 0.18 0.45 0.51 0.41
0.17 0.03 0.62 0.23 1.0 0.34 0.42 0.59 0.38 0.36 0.42 0.46 0.52 0.27 0.18 0.59 0.28 0.46 0.17 0.45 0.4 0.38 0.24 0.38 0.02 0.05 0.46 0.06
0.24 0.29 1.0 0.51 0.54 0.52 0.68 0.44 0.43 0.45 0.47 0.43 0.52 0.35 0.36 0.7 0.58 0.32 0.56 0.75 0.6 0.66 0.31 0.66 0.43 0.46 0.38 0.6
0.13 0.61 1.0 0.93 0.69 0.48 0.92 0.7 0.7 0.79 0.68 0.49 0.9 0.57 0.78 0.98 0.79 0.66 0.72 0.91 0.9 0.84 0.71 0.93 0.17 0.46 0.61 0.93
0.16 0.31 0.92 0.54 1.0 0.93 0.73 0.74 0.63 0.62 0.64 0.69 0.82 0.41 0.37 0.89 0.71 0.46 0.3 0.73 0.73 0.66 0.45 0.64 0.59 0.19 0.83 0.34
0.16 0.42 0.97 0.58 0.86 0.54 0.7 0.99 0.87 0.73 1.0 0.54 0.51 0.39 0.37 0.66 0.46 0.44 0.78 0.66 0.64 0.59 0.54 0.67 0.53 0.58 0.63 0.38
0.01 0.01 0.15 0.54 0.38 0.28 0.32 1.0 0.58 0.61 0.64 0.44 0.49 0.09 0.09 0.59 0.81 0.32 0.27 0.53 0.45 0.52 0.89 0.56 0.02 0.03 0.17 0.47
0.1 0.15 0.39 0.32 0.88 0.08 0.29 0.29 0.22 0.34 0.2 0.53 0.27 0.07 0.16 0.25 0.32 0.56 0.05 0.64 0.4 0.15 0.45 0.2 0.11 0.1 1.0 0.08
0.35 0.22 1.0 0.46 0.46 0.35 0.72 0.25 0.24 0.22 0.28 0.35 0.67 0.23 0.22 0.45 0.42 0.16 0.27 0.52 0.53 0.47 0.45 0.48 0.25 0.28 0.26 0.6
0.26 0.52 0.4 0.33 0.57 0.42 0.39 0.43 0.28 0.36 0.24 0.22 0.65 0.35 0.35 0.33 0.22 1.0 0.25 0.27 0.28 0.2 0.26 0.19 0.39 0.32 0.74 0.21
0.09 0.57 0.97 0.82 0.48 0.66 0.61 0.88 0.93 0.61 0.74 0.57 0.87 0.2 0.41 0.45 0.46 0.72 0.38 0.66 0.52 0.71 0.71 0.91 0.11 1.0 0.28 0.46
0.23 0.23 0.82 0.41 0.35 0.3 0.59 0.58 0.91 0.43 1.0 0.24 0.55 0.33 0.39 0.53 0.56 0.52 0.46 0.68 0.6 0.59 0.6 0.55 0.16 0.28 0.52 0.45
1.0 0.35 0.44 0.36 0.36 0.19 0.35 0.46 0.42 0.32 0.48 0.21 0.39 0.34 0.34 0.45 0.35 0.2 0.25 0.48 0.52 0.41 0.38 0.45 0.36 0.12 0.87 0.25
0.75 0.8 0.99 0.67 0.83 0.64 0.63 0.49 0.62 0.55 0.68 0.63 0.61 0.51 0.46 0.81 0.77 0.8 0.92 1.0 0.81 0.9 0.57 0.8 0.5 0.54 0.74 0.59
0.1 0.11 0.4 0.67 0.55 0.41 0.4 0.61 0.62 0.36 0.74 0.57 0.43 0.38 0.41 0.79 0.72 0.46 0.58 1.0 0.87 0.95 0.67 0.78 0.18 0.89 0.4 0.75
0.2 0.61 1.0 0.67 0.84 0.57 0.97 0.71 0.63 0.74 0.47 0.45 0.93 0.26 0.33 0.86 0.67 0.77 0.37 0.96 0.92 0.83 0.79 0.65 0.44 0.81 0.53 0.61
0.13 0.07 0.64 0.27 0.94 0.35 0.48 0.44 0.47 0.33 0.32 0.35 0.71 0.35 0.35 0.45 0.19 0.19 0.17 0.28 0.27 0.23 0.44 0.27 0.15 0.01 1.0 0.09
0.0 0.0 0.38 0.1 0.01 0.01 0.49 0.01 0.06 0.01 0.09 0.02 0.02 0.02 0.1 0.18 0.48 0.01 0.66 0.62 0.22 0.58 1.0 0.25 0.0 0.0 0.07 0.07
0.29 0.36 0.81 0.44 0.96 0.68 0.6 0.97 0.66 0.72 0.76 0.52 1.0 0.3 0.31 0.3 0.19 0.51 0.16 0.34 0.28 0.29 0.48 0.27 0.26 0.45 0.57 0.18
0.33 0.16 1.0 0.34 0.7 0.3 0.59 0.65 0.61 0.53 0.59 0.35 0.47 0.23 0.22 0.42 0.26 0.25 0.2 0.44 0.44 0.36 0.34 0.4 0.18 0.16 0.4 0.15
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06
0.25 0.21 0.51 0.61 0.31 0.28 0.32 0.15 0.42 0.23 0.37 0.37 0.17 0.23 0.36 0.38 0.36 0.2 0.75 0.48 0.28 0.46 0.45 0.42 0.18 1.0 0.24 0.51
0.16 0.66 0.34 0.71 0.26 0.23 0.39 0.41 0.41 0.49 0.44 0.29 0.48 1.0 0.85 0.46 0.33 0.55 0.46 0.53 0.67 0.38 0.28 0.45 0.71 0.52 0.83 0.28
0.21 0.24 0.76 0.58 0.25 0.6 0.71 0.63 0.89 0.42 0.9 0.26 0.73 0.64 0.66 0.66 1.0 0.65 0.3 0.72 0.64 0.74 0.73 0.84 0.2 0.55 0.51 0.54
0.03 0.78 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.2 0.27 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.09 0.44 0.02 0.01
0.16 0.38 0.28 0.89 0.13 0.21 0.62 0.38 0.35 0.29 0.29 0.1 0.55 0.41 0.36 0.22 0.21 0.47 0.27 0.33 0.32 0.33 0.24 0.34 0.32 0.59 0.56 1.0
0.01 0.05 0.17 1.0 0.1 0.21 0.09 0.07 0.06 0.14 0.01 0.11 0.19 0.11 0.08 0.01 0.0 0.28 0.0 0.03 0.01 0.05 0.08 0.01 0.08 0.14 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.34 0.09 0.04 0.45 0.18 0.5 0.19 0.21 0.03 0.16 0.06 0.15 0.12 0.17 0.09 0.0 0.14 0.08 0.0 0.23 0.12 0.11 0.11 0.0 0.11 1.0 0.18 0.1
0.03 0.88 0.74 0.73 0.1 0.24 0.4 0.3 0.23 0.48 0.44 0.21 0.56 0.33 0.34 1.0 0.83 0.35 0.6 0.85 0.64 0.49 0.35 0.52 0.08 0.99 0.12 0.45
0.24 1.0 0.35 0.75 0.2 0.09 0.44 0.24 0.72 0.41 0.88 0.45 0.38 0.34 0.47 0.45 0.3 0.28 0.41 0.64 0.48 0.55 0.49 0.56 0.05 0.7 0.36 0.45
0.34 0.01 0.23 0.81 0.49 0.32 0.45 0.25 0.28 0.58 0.3 0.43 0.39 0.14 0.19 0.73 0.48 0.26 0.22 0.47 0.51 0.46 0.26 0.46 0.01 0.23 0.21 1.0
0.1 0.1 0.39 0.31 1.0 0.61 0.25 0.36 0.26 0.23 0.28 0.74 0.61 0.22 0.22 0.44 0.4 0.28 0.18 0.36 0.33 0.34 0.2 0.37 0.1 0.13 0.69 0.15
0.03 0.08 0.05 1.0 0.05 0.06 0.11 0.07 0.14 0.51 0.09 0.07 0.24 0.07 0.1 0.06 0.06 0.27 0.02 0.05 0.08 0.1 0.1 0.09 0.09 0.3 0.16 0.0
0.06 0.31 0.76 0.51 0.37 0.36 0.48 0.69 0.84 0.43 1.0 0.23 0.6 0.37 0.4 0.64 0.45 0.39 0.3 0.69 0.61 0.56 0.63 0.75 0.26 0.25 0.52 0.42
0.21 0.24 0.53 1.0 0.22 0.41 0.93 0.75 0.8 0.57 0.72 0.28 0.45 0.4 0.33 0.23 0.32 0.39 0.29 0.41 0.49 0.62 0.84 0.66 0.13 0.76 0.54 0.74
0.16 0.02 1.0 0.32 0.48 0.27 0.59 0.26 0.46 0.27 0.35 0.47 0.37 0.14 0.12 0.38 0.4 0.35 0.18 0.43 0.32 0.48 0.26 0.4 0.03 0.21 0.28 0.39
0.02 0.02 0.18 0.17 1.0 0.57 0.3 0.65 0.3 0.47 0.21 0.37 0.44 0.17 0.19 0.45 0.27 0.39 0.1 0.27 0.22 0.23 0.12 0.21 0.03 0.18 0.33 0.25
0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01
0.0 0.08 0.02 1.0 0.04 0.02 0.01 0.0 0.0 0.02 0.04 0.0 0.0 0.05 0.03 0.05 0.02 0.13 0.21 0.07 0.0 0.14 0.0 0.02 0.03 0.02 0.11 0.06
0.22 0.25 0.47 1.0 0.35 0.38 0.6 0.68 0.74 0.51 0.76 0.41 0.66 0.61 0.68 0.85 0.97 0.3 0.41 0.84 0.63 0.75 0.54 0.72 0.12 0.54 0.76 0.83
0.03 0.03 0.68 1.0 0.32 0.27 0.6 0.46 0.67 0.45 0.72 0.3 0.4 0.14 0.13 0.47 0.3 0.34 0.38 0.56 0.66 0.44 0.51 0.62 0.01 0.39 0.17 0.43
0.01 0.33 0.39 0.73 0.7 1.0 0.32 0.26 0.58 0.34 0.53 0.78 0.29 0.26 0.26 0.25 0.29 0.66 0.12 0.31 0.09 0.34 0.52 0.3 0.02 0.19 0.15 0.67
0.43 0.34 0.24 0.31 0.8 0.32 0.22 0.68 0.28 0.48 0.18 0.23 0.28 0.19 0.2 0.51 0.44 0.26 0.46 0.29 0.28 0.24 0.22 0.26 0.25 0.1 1.0 0.13
0.08 0.01 0.19 0.53 0.19 0.1 0.34 0.39 0.29 0.32 0.31 0.18 0.4 0.1 0.12 0.49 0.5 0.32 0.18 0.5 0.47 0.45 1.0 0.57 0.01 0.06 0.11 0.41
0.51 0.35 0.76 0.54 0.41 0.24 0.36 0.62 0.68 0.3 0.83 0.21 0.44 0.36 0.38 0.76 0.32 0.32 0.52 0.68 1.0 0.49 0.46 0.61 0.6 0.23 0.34 0.2
0.32 0.31 0.77 0.43 1.0 0.82 0.64 0.84 0.54 0.67 0.7 0.6 0.6 0.31 0.31 0.56 0.38 0.46 0.63 0.47 0.53 0.42 0.38 0.47 0.54 0.44 0.41 0.22
0.17 0.3 0.66 0.46 0.74 0.55 0.56 0.64 0.75 0.48 1.0 0.64 0.79 0.34 0.34 0.65 0.7 0.67 0.68 0.72 0.83 0.81 0.39 0.82 0.17 0.23 0.34 0.39
0.25 0.45 0.59 0.36 0.83 0.49 0.44 0.63 0.29 0.52 0.27 0.34 0.49 0.36 0.39 0.34 0.29 1.0 0.09 0.28 0.19 0.23 0.5 0.23 0.47 0.8 0.94 0.17
0.14 0.43 0.9 0.64 0.55 0.33 0.8 0.59 0.85 0.65 1.0 0.62 0.65 0.59 0.65 0.82 0.73 0.51 0.92 0.85 0.85 0.91 0.76 0.92 0.45 0.39 0.62 0.65
0.26 0.81 0.54 0.52 0.89 0.67 0.39 0.51 0.45 0.43 0.43 0.39 0.59 0.27 0.31 0.47 0.42 0.97 1.0 0.5 0.44 0.4 0.32 0.43 0.46 0.41 0.56 0.28
0.11 0.28 0.26 0.58 0.22 0.25 0.39 0.28 0.21 0.21 0.18 0.12 0.27 0.2 0.2 0.0 0.0 0.61 0.0 0.01 0.0 0.02 0.31 0.0 0.12 0.09 1.0 0.0
0.13 0.16 0.71 0.43 0.4 0.22 0.42 1.0 0.82 0.55 0.88 0.26 0.41 0.34 0.29 0.43 0.25 0.41 0.25 0.55 0.61 0.51 0.62 0.53 0.15 0.14 0.62 0.29
0.11 0.16 0.87 0.26 0.59 0.3 0.67 0.58 0.32 0.36 0.24 0.17 1.0 0.19 0.22 0.49 0.31 0.45 0.13 0.38 0.47 0.26 0.44 0.33 0.17 0.15 0.55 0.13
0.46 0.4 0.49 0.6 0.41 0.36 0.4 0.87 0.69 0.38 0.78 0.33 0.62 0.45 0.55 0.8 0.65 0.49 0.6 0.79 1.0 0.71 1.0 0.82 0.36 0.48 0.49 0.53
0.07 0.19 0.76 0.57 0.4 0.32 0.66 0.44 0.65 0.42 0.61 0.5 0.85 0.47 0.54 0.79 0.75 0.73 0.6 0.94 0.75 0.86 0.98 1.0 0.16 0.43 0.59 0.47
0.06 0.29 0.27 0.91 0.21 0.1 0.08 0.18 0.37 0.39 0.31 0.14 0.41 0.18 0.41 0.24 0.35 0.42 0.26 0.45 0.39 0.3 0.37 0.33 0.0 0.13 0.3 1.0
0.8 0.56 0.58 0.37 0.97 0.63 0.31 0.77 0.32 0.46 0.32 0.23 0.79 0.2 0.26 0.52 0.39 0.53 0.34 0.38 0.43 0.3 0.36 0.32 0.53 0.21 1.0 0.14
0.22 0.67 0.53 0.21 0.37 0.16 0.57 0.26 0.4 0.13 0.63 0.56 0.73 0.23 0.25 0.47 0.29 0.88 0.14 0.29 0.31 0.21 0.65 0.42 1.0 0.36 0.99 0.11
0.36 0.22 0.51 0.32 1.0 0.47 0.33 0.43 0.29 0.31 0.2 0.32 0.86 0.11 0.11 0.56 0.2 0.53 0.52 0.33 0.39 0.23 0.22 0.34 0.2 0.16 0.88 0.09
0.0 0.05 0.66 0.92 0.75 0.5 0.86 0.44 0.82 1.0 0.82 1.0 0.55 0.4 0.43 0.82 0.82 0.51 0.52 0.85 0.69 0.84 0.84 0.83 0.04 0.09 0.51 0.7
1.0 0.3 0.62 0.37 0.72 0.23 0.49 0.54 0.47 0.51 0.41 0.31 0.84 0.28 0.27 0.7 0.39 0.47 0.3 0.54 0.59 0.42 0.26 0.51 0.38 0.17 0.62 0.2
0.07 0.16 0.41 0.58 0.29 0.2 1.0 0.33 0.48 0.51 0.72 0.32 0.19 0.32 0.14 0.37 0.51 0.46 0.2 0.52 0.48 0.53 0.18 0.23 0.04 0.16 0.24 0.0
0.22 0.28 0.62 0.2 0.33 0.09 0.62 0.04 0.32 0.29 0.55 0.27 0.68 0.14 0.11 0.34 0.23 0.22 0.0 0.52 0.09 0.28 0.3 0.26 1.0 0.37 0.4 0.43
0.11 0.14 0.37 0.37 0.05 0.04 0.58 0.11 0.3 0.07 0.3 0.05 0.29 0.11 0.23 0.4 0.4 0.16 0.19 0.45 0.27 0.45 1.0 0.42 0.14 0.05 0.09 0.4
0.05 0.14 1.0 0.46 0.27 0.23 0.84 0.36 0.38 0.27 0.49 0.2 0.38 0.4 0.42 0.62 0.57 0.29 0.28 0.63 0.65 0.6 0.48 0.74 0.19 0.22 0.59 0.46

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)