Heatmap: Cluster_10 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.0 0.3 51.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.12 0.0 0.1 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.19 0.31 0.2 3.39 1.41 1.25 0.64 1.5 2.62 2.01 2.87 2.6 1.87 0.82 0.67 2.56 0.81 0.42 1.23 1.57 1.49 2.11 0.76 1.52 0.51 0.42 0.1 2.34
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.39 0.32 1.6 0.37 0.36 0.43 0.17 0.0 0.09 0.62 0.09 0.44 0.28 0.31 0.46 0.65 1.51 1.8 1.39 0.36 0.65 0.6 0.52 0.32 1.22 0.11 0.56
6.84 19.28 10.78 23.66 27.24 30.08 21.97 23.56 24.1 28.35 22.46 27.22 24.56 27.82 23.06 12.56 8.98 15.91 16.61 15.28 16.29 12.2 20.81 13.88 19.61 28.67 23.51 8.48
0.0 0.0 0.0 2.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.13 0.0 0.16 0.02 0.06 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.09
0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.48 0.98 0.0 0.67 2.44 1.66 1.51 0.0 1.4 0.0 0.0 0.0 0.56
0.0 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78 0.51 0.0 0.0 0.58 0.39 0.43 0.0 1.08 0.0 0.0 0.0 0.61
5.34 1.28 3.8 239.19 8.79 2.64 41.81 29.22 13.86 59.15 3.04 5.09 49.99 1.1 1.26 6.95 5.07 2.29 7.63 12.02 4.21 7.02 0.92 7.11 0.42 0.67 2.19 23.23
0.0 0.0 0.0 2.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0
4.55 0.49 2.88 13.22 4.35 8.01 4.6 3.39 3.62 4.02 4.24 5.27 3.89 1.32 1.28 5.03 5.09 1.45 6.85 4.43 2.64 4.83 2.97 3.28 0.87 1.4 1.51 9.44
0.0 0.0 0.0 57.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.0 83.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 3.28 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.03 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.14 0.0 2.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.7 3.58 7.07 2.72 2.76 4.78 1.64 4.19 2.54 4.23 4.26 3.2 1.73 1.74 2.94 2.82 2.28 2.09 3.73 2.09 3.59 3.61 3.86 0.93 0.65 1.74 8.07
0.0 0.0 0.0 0.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.7 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 2.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.51 4.53 0.0 2.76 6.48 4.3 5.69 0.0 5.56 0.0 0.0 0.0 6.95
0.06 0.06 0.02 0.89 0.02 0.01 0.04 0.06 0.09 0.06 0.08 0.01 0.04 0.02 0.01 1.93 1.06 0.02 2.33 2.62 1.73 1.64 0.08 1.86 0.0 0.0 0.07 2.81
9.15 24.34 25.85 22.53 27.18 19.49 18.5 12.71 16.53 13.65 18.19 26.92 19.38 17.3 18.76 37.57 41.0 81.63 30.95 28.66 27.63 32.21 15.33 32.77 31.56 26.37 15.65 20.92
3.93 19.43 10.89 38.55 19.22 25.72 4.28 9.32 8.56 5.1 8.72 14.42 5.06 10.41 8.98 103.67 89.13 67.37 57.54 61.9 76.74 74.52 12.01 73.6 2.94 8.05 9.89 31.87
0.0 0.0 0.0 6.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 8.87 13.4 0.0 9.09 10.21 9.9 10.75 0.0 10.04 0.0 0.0 0.0 13.25
0.06 0.14 3.45 2.02 0.59 0.25 1.04 1.42 1.97 0.95 2.21 0.51 1.73 1.05 1.55 3.97 1.92 9.21 5.42 3.02 1.3 2.42 2.93 2.54 0.06 0.23 1.41 1.36
0.33 3.18 5.06 5.14 1.21 1.91 12.67 1.82 1.33 3.29 1.46 0.89 4.85 6.83 6.65 10.52 7.62 2.55 9.04 10.23 12.74 8.9 3.7 11.09 0.86 0.93 10.76 10.63
0.49 3.61 2.31 13.66 1.28 3.08 12.0 2.05 0.84 4.27 1.22 1.61 5.1 8.8 7.88 34.7 25.52 16.18 22.26 30.31 40.39 27.79 5.52 26.34 0.9 0.76 9.68 23.53
2.0 0.46 6.51 9.99 7.9 5.36 5.0 7.5 5.63 6.3 5.84 4.33 3.79 1.09 1.34 23.85 19.34 33.83 16.97 27.04 20.94 24.16 4.78 23.01 1.18 7.65 1.1 14.03
0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.35 1.68 0.0 0.92 0.95 1.84 2.03 0.0 1.6 0.0 0.0 0.0 3.95
0.16 0.1 5.89 1.14 0.99 2.7 9.31 1.36 0.58 1.35 0.13 0.12 8.49 2.08 2.49 2.73 10.11 3.23 2.21 2.87 8.24 2.74 1.71 3.61 0.23 0.04 8.66 9.61
0.03 0.02 0.05 0.11 0.0 0.01 0.03 0.03 0.05 0.04 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.07 0.06 0.02 0.0 0.04
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
31.69 2.97 2.35 12.76 30.38 8.16 3.75 2.22 4.73 1.84 4.55 32.6 4.36 3.7 3.73 2.64 4.05 2.57 2.61 3.49 3.45 3.49 4.09 3.8 4.55 8.34 2.64 2.76
2.98 2.82 14.77 23.16 16.86 8.83 8.04 8.75 14.3 4.87 14.03 14.6 6.39 18.81 19.22 15.37 5.55 15.52 18.99 15.72 14.85 13.49 20.03 16.07 2.61 7.93 19.64 2.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.2 0.53 5.22 118.08 23.64 5.54 23.29 91.79 58.04 19.68 40.27 16.95 20.53 0.31 1.36 75.58 158.06 11.9 37.31 82.98 70.82 106.79 27.6 96.14 0.58 0.0 7.95 116.75
0.0 0.0 0.0 2.46 0.0 2.49 1.46 0.0 0.0 0.0 0.0 2.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.43 5.58 5.8 9.15 2.19 1.21 5.5 4.1 4.55 3.27 5.21 2.03 5.21 5.48 5.92 19.16 16.09 5.74 26.45 24.81 24.29 22.46 5.2 22.26 4.05 28.95 8.1 26.07
0.0 0.0 0.0 1.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 4.07 2.29 0.0 1.78 3.88 3.39 3.1 0.0 3.39 0.0 0.0 0.0 2.19
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.62 1.38 5.18 2.31 1.13 2.37 2.62 2.19 7.76 3.28 2.42 4.76 0.18 0.25 3.27 3.64 4.49 6.17 2.83 3.7 2.56 0.97 2.8 0.31 6.39 0.28 2.81
0.0 0.0 0.0 4.89 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.5 5.43 2.26 8.87 2.06 1.94 3.15 5.36 6.48 8.69 6.53 2.11 3.29 1.56 1.83 2.8 2.22 2.29 1.37 3.32 1.99 2.76 3.08 2.02 1.2 1.24 2.33 5.25
0.0 0.0 0.0 2.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1828.68 27.41 791.48 826.39 392.62 162.36 367.57 27.59 117.45 19.07 92.02 424.24 1483.28 23.14 38.83 50.61 67.31 238.73 202.95 311.61 97.93 494.31 367.47 252.37 18.47 64.81 87.61 1355.68
2757.42 70.73 713.64 608.65 99.82 67.79 115.09 0.69 4.24 0.0 9.19 131.73 379.97 115.63 114.17 196.03 238.22 163.93 252.58 467.13 509.45 484.65 1337.97 458.86 1314.16 8.55 321.19 996.15
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.06 0.03 0.02 0.02 0.0 0.17 0.05 0.01 0.03 0.0 0.02 0.0 0.14
0.0 0.05 0.07 0.47 0.06 0.0 0.12 0.06 0.06 0.06 0.11 0.0 0.0 0.21 0.03 0.0 0.0 0.28 0.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.3 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 3.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02
0.0 0.14 0.39 0.49 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.72 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.08 3.06 3.0 0.07 0.07 0.62 0.0 0.14 0.2 0.4 0.23 1.25 0.36 0.95 0.06 0.28 10.99 1.01 0.55 0.82 0.79 0.34 1.06 0.02 0.15 0.09 0.22
0.0 1.19 3.26 1.86 2.9 2.77 1.35 0.0 0.0 0.0 0.0 5.17 0.0 8.33 8.2 3.5 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.36 0.0
0.89 3.16 1.0 2.07 0.92 0.28 2.81 0.97 1.35 1.54 0.54 0.51 1.61 1.14 1.13 10.85 14.36 0.67 4.19 9.03 14.4 10.46 1.5 11.28 1.14 1.77 2.24 1.15
0.07 0.0 0.0 5.63 0.64 2.87 0.63 3.09 0.22 0.84 0.13 0.46 3.38 0.0 0.0 0.17 0.83 2.6 0.75 0.05 0.87 0.86 0.03 0.79 0.0 0.0 0.0 3.88
0.0 0.0 0.0 1.92 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 2.66 3.48 0.0 1.81 4.0 3.11 4.09 0.0 3.4 0.0 0.0 0.0 3.85
0.0 0.0 0.0 9.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 9.06 11.32 0.0 6.34 11.05 13.82 11.72 0.0 8.77 0.0 0.0 0.0 6.49
0.64 0.5 0.08 0.48 0.31 0.31 0.19 0.23 0.43 0.39 0.43 0.52 0.06 0.11 0.25 0.97 2.55 1.67 0.27 1.79 0.87 2.4 0.59 1.95 0.16 0.3 0.15 0.77
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 1.85 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 5.75 6.36 0.0 3.35 5.5 5.86 6.68 0.0 5.61 0.0 0.0 0.0 2.8
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.21 0.04 0.0 0.2 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.52
0.15 0.0 0.12 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.36 0.22 0.0 0.2 0.0 0.38 0.23 0.14 0.34 0.0 0.0 0.0 0.89
0.43 0.14 0.13 0.17 0.06 0.0 0.09 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.04 0.2 0.0
0.4 1.15 0.92 1.97 0.75 1.01 1.36 1.16 1.11 1.21 1.37 0.67 1.3 1.28 1.01 1.99 2.65 0.79 1.34 1.72 2.17 2.57 1.44 2.31 0.71 0.63 1.98 2.48
0.13 2.12 1.69 3.7 0.29 0.59 2.47 1.92 2.67 1.95 3.62 0.65 1.64 3.29 2.96 0.81 1.02 8.56 1.05 0.74 1.43 1.46 4.12 1.21 0.32 1.14 2.18 3.14
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
3.54 15.41 9.45 64.53 13.71 6.17 9.88 4.74 15.11 3.87 19.14 24.71 7.09 18.94 26.12 22.09 26.17 6.45 13.59 28.1 23.7 27.79 38.5 30.77 14.77 28.3 14.88 66.41
1.49 2.59 21.87 19.26 15.44 18.25 34.28 33.92 26.74 52.14 29.69 14.18 21.94 15.1 16.37 19.22 16.47 17.86 7.98 19.05 19.23 16.78 18.89 16.64 3.44 3.28 21.15 16.17
7.6 1.67 17.64 18.67 12.09 14.75 3.61 9.25 2.57 4.86 3.64 5.61 2.77 1.81 1.8 1.95 2.93 3.3 3.57 4.95 2.67 3.05 5.89 3.07 2.7 70.06 2.62 7.86
41.64 18.02 27.14 35.87 28.83 39.73 25.35 40.83 32.22 37.13 36.9 24.98 30.05 11.98 12.88 29.22 27.9 19.83 19.13 30.26 25.74 28.41 23.88 28.1 33.33 34.39 20.02 36.8
2.74 8.25 0.71 9.63 0.53 1.56 2.59 0.48 0.64 2.13 0.94 0.6 0.94 6.17 5.38 18.46 17.5 1.95 18.35 21.91 17.27 17.27 1.54 19.13 7.27 1.1 5.05 14.97

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)