1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_104 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.02 0.15 0.67 0.23 0.3 0.34 0.63 0.34 0.55 0.42 0.55 0.32 0.55 0.43 0.44 0.5 0.4 0.73 1.0 0.71 0.74 0.62 0.5 0.76 0.08 0.27 0.37 0.46
0.05 0.01 1.0 0.05 0.47 0.57 0.52 0.85 0.31 0.91 0.76 0.52 0.26 0.23 0.17 0.66 0.9 0.32 0.25 0.57 0.37 0.54 0.93 0.56 0.03 0.18 0.4 0.12
0.01 0.03 0.76 0.09 0.05 0.04 0.74 0.27 0.46 0.41 0.39 0.08 0.36 0.08 0.09 0.49 0.3 0.25 0.51 0.78 1.0 0.66 0.28 0.81 0.02 0.07 0.27 0.21
0.04 0.13 0.71 0.11 0.39 0.36 0.36 0.64 0.52 0.84 0.53 0.48 0.26 0.7 0.37 0.87 1.0 0.74 0.3 0.71 0.83 1.0 0.51 0.74 0.2 0.54 0.91 0.25
0.12 0.22 0.66 0.5 0.53 0.41 0.77 0.42 0.68 0.46 0.74 0.57 0.49 0.63 0.59 1.0 0.68 0.4 0.72 0.93 0.99 0.89 0.75 0.88 0.24 0.55 0.56 0.61
0.05 0.03 0.24 0.22 0.15 0.27 0.1 0.38 0.23 0.38 0.28 0.11 0.11 0.07 0.07 0.44 0.23 0.2 0.61 1.0 0.31 0.35 0.54 0.52 0.04 0.12 0.45 0.53
0.0 0.02 0.86 0.0 0.03 0.01 0.05 0.11 0.28 0.02 0.29 0.15 0.0 0.18 0.15 0.15 0.23 0.13 0.25 0.24 0.21 0.32 0.19 0.37 0.04 0.04 1.0 0.01
0.02 0.0 1.0 0.04 0.02 0.01 0.56 0.08 0.1 0.1 0.04 0.01 0.04 0.15 0.14 0.07 0.03 0.04 0.14 0.25 0.47 0.25 0.14 0.23 0.04 0.02 0.16 0.04
0.03 0.01 0.2 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.14 0.1 0.17 0.09 0.12 0.11 0.63 0.14 0.17 1.0 0.21 0.02 0.28 0.79 0.26
0.39 0.05 0.19 0.1 0.07 0.05 0.05 0.11 0.1 0.09 0.14 0.03 0.02 0.06 0.06 0.25 0.14 0.49 0.17 1.0 0.18 0.44 0.88 0.32 0.03 0.08 0.5 0.29
0.04 0.09 0.43 0.26 0.23 0.12 0.36 0.14 0.4 0.21 0.4 0.23 0.2 0.32 0.33 1.0 0.65 0.5 0.78 0.88 0.69 0.69 0.7 0.7 0.13 0.13 0.71 0.27
0.05 1.0 0.18 0.12 0.03 0.05 0.12 0.19 0.2 0.22 0.22 0.02 0.15 0.14 0.14 0.51 0.36 0.94 0.92 0.47 0.61 0.46 0.12 0.51 0.28 0.09 0.18 0.18
0.01 0.01 0.35 0.15 0.12 0.1 0.11 0.45 0.39 0.31 0.4 0.14 0.12 0.05 0.19 0.5 0.54 1.0 0.34 0.47 0.39 0.5 0.3 0.51 0.0 0.03 0.03 0.18
0.03 0.21 0.52 0.44 0.58 0.42 0.76 0.45 0.7 0.43 0.67 0.62 1.0 0.56 0.64 0.69 0.55 0.39 0.33 0.62 0.75 0.66 0.79 0.72 0.05 0.44 0.49 0.39
0.0 0.0 0.29 0.26 0.0 0.01 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.1 0.03 0.0 0.07 0.58 0.11 0.12 0.25 0.17 0.02 0.01 0.3 1.0
0.0 0.02 0.02 0.08 0.02 0.01 0.01 0.06 0.11 0.04 0.11 0.02 0.01 0.03 0.01 0.21 0.04 0.01 0.17 1.0 0.18 0.18 0.05 0.27 0.01 0.0 0.22 0.17
0.0 0.0 0.11 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.32 0.06 0.0 0.11 1.0 0.2 0.21 0.23 0.3 0.0 0.0 0.19 0.67
0.0 0.0 1.0 0.01 0.03 0.03 0.46 0.15 0.14 0.12 0.13 0.03 0.2 0.1 0.09 0.2 0.15 0.52 0.15 0.22 0.35 0.24 0.62 0.28 0.06 0.12 0.16 0.01
0.48 0.43 0.54 0.31 0.45 0.39 0.49 0.38 0.57 0.36 0.7 0.5 0.35 0.41 0.37 0.6 0.39 0.4 0.67 1.0 0.57 0.66 0.72 0.65 0.17 0.37 0.46 0.45
0.13 0.58 0.51 0.46 0.82 0.68 0.73 0.36 0.67 0.43 0.77 1.0 0.97 0.41 0.44 0.77 0.71 0.59 0.76 0.83 0.68 0.87 0.51 0.83 0.48 0.74 0.34 0.42
0.02 0.1 0.62 0.19 0.27 0.3 0.16 0.11 0.21 0.11 0.16 0.15 0.07 0.17 0.14 0.38 0.3 0.07 0.28 1.0 0.33 0.54 0.13 0.38 0.05 0.04 0.49 0.25
0.01 0.06 1.0 0.33 0.16 0.1 0.85 0.24 0.46 0.18 0.48 0.25 0.35 0.21 0.22 0.55 0.32 0.3 0.74 0.64 0.98 0.56 0.48 0.7 0.05 0.59 0.29 0.31
0.08 0.06 0.29 0.29 0.19 0.27 0.1 0.34 0.41 0.43 0.39 0.28 0.11 0.13 0.14 0.27 0.2 0.09 0.14 1.0 0.24 0.27 0.69 0.26 0.03 0.19 0.46 0.8
0.0 0.02 0.24 0.17 0.45 0.2 0.38 0.1 0.27 0.08 0.46 1.0 0.43 0.17 0.18 0.77 0.84 0.36 0.47 0.65 0.73 0.94 0.14 0.97 0.02 0.1 0.24 0.13
0.04 0.21 1.0 0.19 0.33 0.26 0.68 0.61 0.66 0.4 0.82 0.38 0.3 0.15 0.16 0.44 0.34 0.24 0.51 0.68 0.57 0.52 0.57 0.65 0.22 0.13 0.18 0.16
0.37 0.27 0.51 0.23 0.33 0.45 0.4 0.34 0.46 0.2 0.75 0.44 0.16 0.56 0.42 0.37 0.28 0.22 0.24 1.0 0.41 0.49 0.66 0.45 0.04 0.22 0.6 0.43
0.06 0.26 0.69 0.42 0.77 0.6 0.67 0.57 0.7 0.55 0.8 0.8 0.55 0.5 0.48 0.67 0.69 1.0 0.81 0.82 0.66 0.89 0.4 1.0 0.13 0.31 0.39 0.5
0.0 0.03 0.23 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.26 0.06 0.01 0.29 1.0 0.19 0.17 0.15 0.31 0.9 0.04 0.27 0.24
0.81 0.09 0.28 0.08 0.06 0.04 0.09 0.03 0.03 0.02 0.04 0.04 0.08 0.19 0.16 0.38 0.33 0.08 0.43 0.99 0.34 0.3 1.0 0.38 0.04 0.16 0.55 0.48
0.16 0.07 0.27 0.14 0.07 0.06 0.19 0.19 0.16 0.15 0.19 0.09 0.12 0.4 0.3 0.43 0.3 0.09 0.27 0.35 0.33 0.34 0.26 0.38 1.0 0.03 0.23 0.12
0.01 0.03 0.22 0.07 0.01 0.01 0.3 0.04 0.05 0.12 0.05 0.02 0.02 0.06 0.07 0.26 0.21 0.05 0.24 1.0 0.48 0.43 0.2 0.41 0.0 0.06 0.09 0.24
0.04 0.04 0.45 0.39 0.27 0.31 0.32 0.16 0.22 0.21 0.25 0.22 0.22 0.17 0.18 0.36 0.24 0.29 0.49 1.0 0.26 0.45 0.54 0.38 0.09 0.72 0.53 0.56
0.32 0.06 0.34 0.12 0.09 0.27 0.13 0.16 0.1 0.06 0.08 0.07 0.07 0.07 0.06 0.39 0.24 0.14 0.53 1.0 0.37 0.36 0.37 0.45 0.02 0.11 0.25 0.32
0.3 0.02 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.05 0.12 0.25 0.27 0.0 0.07 0.49 0.11 0.22 0.5 0.36 1.0 0.02 0.27 0.21
0.4 0.2 0.3 0.15 0.25 0.39 0.2 0.23 0.23 0.23 0.22 0.3 0.16 0.28 0.28 0.34 0.29 0.21 0.28 1.0 0.29 0.41 0.35 0.41 0.7 0.29 0.38 0.29
0.07 0.08 1.0 0.08 0.18 0.19 0.73 0.27 0.49 0.33 0.52 0.22 0.18 0.43 0.42 0.31 0.26 0.28 0.28 0.5 0.36 0.36 0.68 0.37 0.04 0.13 0.59 0.14
0.0 0.03 1.0 0.05 0.03 0.01 0.18 0.04 0.08 0.06 0.08 0.07 0.04 0.37 0.22 0.25 0.07 0.14 0.24 0.41 0.52 0.23 0.08 0.35 0.02 0.04 0.65 0.08
0.05 0.26 0.7 0.11 0.3 0.24 0.78 0.33 0.42 0.72 0.38 0.38 0.51 0.51 0.48 0.33 0.28 1.0 0.14 0.48 0.39 0.3 0.5 0.33 0.04 0.06 0.8 0.23
0.13 0.07 0.48 0.36 0.13 0.18 0.32 0.26 0.16 0.54 0.19 0.11 0.46 0.3 0.21 0.26 0.24 0.27 0.28 0.4 0.32 0.34 0.39 0.33 0.09 1.0 0.32 0.29
0.08 0.08 0.29 0.22 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.04 0.01 0.0 0.05 0.04 0.23 0.09 0.09 0.22 0.69 0.16 0.25 0.16 0.33 0.35 0.26 0.22 1.0
0.01 0.03 0.38 0.13 0.04 0.07 0.08 0.02 0.06 0.03 0.07 0.07 0.05 0.05 0.05 0.35 0.12 0.24 0.35 1.0 0.3 0.27 0.16 0.39 0.1 0.06 0.22 0.18
0.03 0.03 0.33 0.22 0.08 0.07 0.07 0.13 0.17 0.2 0.22 0.1 0.06 0.06 0.06 0.3 0.15 0.05 0.13 1.0 0.39 0.33 0.21 0.37 0.05 0.11 0.25 0.48
0.92 0.14 0.52 0.32 0.32 0.31 0.38 0.33 0.5 0.45 0.57 0.33 0.38 0.4 0.39 0.47 0.74 0.38 0.36 1.0 0.34 0.54 0.6 0.55 0.13 0.79 0.52 0.68
0.03 0.04 1.0 0.05 0.08 0.03 0.47 0.78 0.55 0.39 0.37 0.11 0.09 0.41 0.3 0.33 0.17 0.19 0.38 0.59 0.78 0.41 0.52 0.6 0.04 0.1 0.49 0.06
0.05 0.15 0.51 0.43 0.16 0.11 0.25 0.24 0.22 0.27 0.27 0.08 0.35 0.24 0.27 0.27 0.13 0.2 0.24 1.0 0.33 0.23 0.31 0.27 0.25 0.1 0.66 0.38
0.05 0.1 0.6 0.13 0.45 0.49 0.44 0.19 0.55 0.38 0.41 0.44 0.29 0.42 0.36 1.0 0.78 0.49 0.79 0.92 0.68 0.68 0.52 0.81 0.01 0.54 0.58 0.14
0.0 0.03 0.96 0.13 0.24 0.33 0.38 0.37 0.49 0.74 0.29 0.28 0.61 0.36 0.32 0.72 0.57 0.63 0.73 1.0 0.87 0.68 0.44 0.95 0.01 0.02 0.6 0.12
0.03 0.02 0.3 0.24 0.31 0.22 0.17 0.21 0.14 0.47 0.21 0.39 0.19 0.12 0.12 0.5 0.24 0.08 0.27 1.0 0.43 0.4 0.93 0.58 0.12 0.15 0.37 0.25
0.03 0.03 0.31 0.07 0.17 0.14 0.34 0.12 0.44 0.08 0.66 0.31 0.57 0.24 0.2 0.25 0.29 1.0 0.82 0.72 0.45 0.69 0.26 0.83 0.35 0.15 0.15 0.04
0.05 0.74 0.95 0.33 0.43 0.21 1.0 0.31 0.58 0.34 0.81 0.53 0.55 0.68 0.58 0.77 0.32 0.57 0.7 0.98 0.94 0.7 0.52 0.81 0.45 0.05 0.74 0.6
0.05 0.12 1.0 0.05 0.14 0.16 0.42 0.28 0.51 0.47 0.53 0.19 0.23 0.25 0.26 0.13 0.14 0.27 0.16 0.24 0.16 0.18 0.55 0.2 0.09 0.15 0.41 0.09
0.04 0.04 0.33 0.21 0.06 0.04 0.08 0.06 0.06 0.05 0.03 0.08 0.08 0.05 0.05 0.3 0.14 0.23 0.61 1.0 0.16 0.31 0.87 0.4 0.01 0.13 0.51 0.65
0.08 0.32 0.97 0.05 0.35 0.35 0.44 1.0 0.59 0.59 0.67 0.34 0.39 0.3 0.25 0.15 0.13 0.1 0.18 0.33 0.36 0.34 0.54 0.29 0.23 0.2 0.42 0.08
0.24 0.32 0.55 0.32 0.26 0.2 0.78 0.25 0.32 0.25 0.31 0.33 1.0 0.45 0.37 0.85 0.82 0.43 0.76 0.74 0.91 0.99 0.37 0.82 0.3 0.41 0.35 0.39
0.13 0.76 0.56 0.18 0.33 0.28 0.31 0.4 0.15 0.3 0.45 0.66 0.27 0.29 0.28 0.6 0.66 1.0 0.77 0.52 0.48 0.57 0.48 0.5 0.06 0.05 0.34 0.26
0.01 0.01 0.05 0.31 0.11 0.11 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.17 0.05 0.05 0.03 0.19 0.04 0.08 0.09 0.44 0.09 0.14 0.25 0.23 0.03 1.0 0.44 0.27
0.12 0.19 0.26 0.39 0.2 0.26 0.32 0.09 0.18 0.16 0.26 0.16 0.32 0.43 0.34 0.23 0.23 0.09 0.13 1.0 0.25 0.33 0.45 0.25 0.32 0.44 0.67 0.44
0.0 0.01 0.2 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.05 0.04 0.38 0.05 0.01 0.26 1.0 0.25 0.24 0.19 0.33 0.08 0.25 0.31 0.18

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)