Heatmap: Cluster_44 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene	FB cap+lamellae,YMG,strain #326	FB stipe,YMG,strain #326	Hyphal knots,control,strain #326	Mycelium	Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h	Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h	Mycelium,LiCl,strain #326	Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO	Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO	Mycelium,control,20C,matA/matB KO	Mycelium,control,28C,8h	Mycelium,control,strain #326	Stg 1 primordium,YMG,strain #326	Stg 2 primordium,YMG,strain #326	Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130	Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130	Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO	Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130	Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130	Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130	Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130	Vegetative mycelium,YMG,strain #326	Mycelium,control,YMG,37C,strain #130	YFB cap,YMG,strain #326	YFB lamellae,YMG,strain #326	secondary hyphal knots,YMG,strain #326	strain #130
EAU80159	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.92	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80222	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80229	0.0	0.0	0.0	0.06	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80366	0.0	0.0	0.0	0.04	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80534	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80668	0.3	0.39	0.29	0.03	0.13	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.28	0.0	1.0	0.25	0.45	0.17	0.41	0.11	0.11	0.58	0.38
EAU80766	0.02	0.02	0.28	0.63	0.7	0.5	0.2	1.0	0.17	0.15	0.18	0.46	0.24	0.08	0.07	0.42	0.09	0.46	0.12	0.13	0.1	0.14	0.15	0.15	0.05	0.03	0.07	0.25
EAU80858	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU80864	0.02	0.16	0.23	0.06	0.01	0.02	0.37	0.03	0.03	0.16	0.02	0.02	0.21	0.05	0.03	1.0	0.47	0.01	0.15	0.16	0.65	0.17	0.02	0.14	0.01	0.02	0.08	0.09
EAU81056	0.0	0.12	0.0	0.02	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.31	0.0	0.0	0.34	1.0	0.0	0.19	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU81292	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU81635	0.02	0.01	1.0	0.02	0.18	0.08	0.41	0.18	0.38	0.38	0.53	0.26	0.18	0.38	0.41	0.05	0.08	0.34	0.1	0.11	0.1	0.07	0.72	0.12	0.06	0.34	0.68	0.02
EAU81759	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU81816	0.42	0.08	0.15	0.19	0.0	0.0	0.18	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.05	0.07	0.45	0.24	0.41	0.09	0.56	0.49	1.0	0.18	0.35	0.18	0.4	0.1	0.13
EAU81869	0.13	0.07	0.55	0.14	0.12	0.16	0.43	0.19	0.42	0.57	0.47	0.13	0.45	0.48	0.32	0.16	0.19	0.45	0.51	0.36	0.24	0.23	0.26	0.24	0.02	0.24	1.0	0.27
EAU82209	0.03	0.01	0.18	0.08	0.0	0.0	0.47	0.04	0.09	0.0	0.1	0.0	0.0	0.85	0.58	0.15	0.05	0.03	0.22	0.2	0.11	0.12	0.1	0.21	0.14	0.0	1.0	0.09
EAU82228	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU82304	0.0	0.03	0.03	0.02	0.0	0.0	0.05	0.11	0.15	0.04	0.53	0.02	0.0	1.0	0.53	0.09	0.04	0.16	0.12	0.05	0.01	0.04	0.03	0.07	0.0	0.02	0.67	0.04
EAU82428	0.0	0.01	0.11	0.01	0.02	0.01	0.03	0.02	0.14	0.06	0.11	0.03	0.02	0.25	0.16	0.01	0.01	0.05	0.02	0.05	0.01	0.02	0.02	0.03	0.04	0.22	1.0	0.02
EAU82593	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU82894	0.08	0.04	0.69	0.31	0.04	0.1	0.49	0.57	0.22	0.47	0.25	0.02	0.14	0.22	0.3	0.27	0.17	1.0	0.48	0.36	0.44	0.29	0.35	0.36	0.08	0.26	0.21	0.18
EAU82973	0.0	0.01	0.62	0.01	0.02	0.0	0.02	0.15	0.22	0.03	0.28	0.03	0.04	0.22	0.23	0.06	0.02	1.0	0.22	0.21	0.24	0.16	0.15	0.3	0.0	0.0	0.12	0.0
EAU83040	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU83181	0.16	0.41	0.37	0.2	0.05	0.0	0.28	0.4	0.05	0.64	0.15	0.15	0.15	0.44	0.15	0.51	0.46	0.13	0.43	0.44	0.2	0.49	0.15	0.55	0.09	0.13	1.0	0.16
EAU83274	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU83441	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU84044	0.22	0.27	0.79	0.19	0.79	0.68	0.7	0.53	0.73	0.42	0.39	0.5	0.53	0.44	0.37	0.28	0.23	0.83	0.22	0.4	0.56	0.44	0.74	0.39	0.77	0.18	1.0	0.0
EAU85053	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU85124	0.08	0.17	0.47	0.05	0.09	0.39	0.52	0.68	0.0	0.1	0.19	0.18	0.0	0.41	0.12	1.0	0.33	0.24	0.21	0.23	0.0	0.47	0.2	0.47	0.09	0.07	0.11	0.3
EAU85681	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU85695	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU86384	0.03	0.34	0.05	0.09	0.02	0.04	0.02	0.09	0.15	0.04	0.1	0.04	0.03	1.0	0.71	0.33	0.47	0.4	0.4	0.28	0.34	0.33	0.3	0.58	0.22	0.35	0.23	0.08
EAU86896	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU87948	0.19	0.09	0.03	0.06	0.03	0.0	0.01	0.03	0.05	0.17	0.01	0.0	0.02	0.74	0.71	0.03	0.06	0.4	0.15	0.07	0.06	0.06	0.01	0.26	0.01	0.01	1.0	0.0
EAU88982	0.02	0.04	0.09	0.15	0.08	0.16	0.15	0.07	0.09	0.1	0.1	0.09	0.14	1.0	0.38	0.27	0.28	0.3	0.22	0.22	0.18	0.31	0.08	0.28	0.04	0.04	0.16	0.14
EAU89139	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.94	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU89161	0.17	0.49	0.27	0.37	0.22	0.1	0.36	0.35	0.22	0.32	0.24	0.13	0.54	0.16	0.26	0.6	0.3	1.0	0.47	0.53	0.65	0.48	0.14	0.37	0.1	0.47	0.15	0.21
EAU89640	0.0	0.0	0.0	0.03	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU90002	0.03	0.07	0.1	0.34	0.02	0.02	0.1	1.0	0.25	0.51	0.49	0.03	0.06	0.09	0.12	0.59	0.47	0.07	0.28	0.25	0.67	0.39	0.19	0.27	0.11	0.03	0.07	0.1
EAU90352	0.04	0.45	0.14	0.15	0.02	0.03	0.17	0.06	0.05	0.05	0.04	0.02	0.3	0.66	0.68	0.02	0.06	1.0	0.02	0.07	0.12	0.06	0.12	0.04	0.03	0.09	0.64	0.2
EAU90699	0.07	0.18	0.23	0.11	0.13	0.1	0.19	0.2	0.25	0.15	0.2	0.12	0.16	0.8	0.61	0.14	0.07	0.18	0.07	0.13	0.16	0.13	0.29	0.12	0.3	0.14	1.0	0.16
EAU90878	0.0	0.0	0.16	0.13	0.13	0.13	0.07	0.26	0.13	0.0	0.12	0.26	0.0	0.0	0.15	1.0	0.0	0.0	0.0	0.16	0.0	0.0	0.2	0.0	0.23	0.2	0.33	0.42
EAU91300	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.51	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU91690	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EAU91918	0.13	0.06	0.52	0.08	0.14	0.15	0.24	0.25	0.33	0.24	0.45	0.15	0.05	0.52	0.36	0.15	0.15	0.17	0.12	0.31	0.22	0.18	0.28	0.16	0.07	0.34	1.0	0.08
EAU92083	0.0	0.08	0.29	0.36	0.66	0.46	0.16	0.1	0.1	0.09	0.11	0.98	0.23	0.46	0.51	0.35	0.27	0.74	0.91	0.59	0.54	0.72	0.09	1.0	0.03	0.8	0.14	0.17
EAU93668	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI26593	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI26596	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI26626	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI26800	0.0	0.19	0.0	0.06	0.0	0.0	0.15	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.47	0.0	0.0	0.17	0.28	0.5	0.0	0.32	0.0	0.0	0.33	0.0
EFI26913	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI27100	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI27289	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.98	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI27306	0.0	0.0	0.21	0.02	0.09	0.04	0.08	0.06	0.15	0.08	0.15	0.12	0.02	0.89	0.74	0.03	0.05	0.13	0.03	0.07	0.05	0.07	0.18	0.06	0.0	0.29	1.0	0.01
EFI27415	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.5	0.0	0.0	0.0
EFI27526	0.0	0.0	0.0	0.08	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.67	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.46	0.0	0.0	0.0
EFI27635	0.01	0.05	0.7	0.1	0.13	0.11	0.35	0.92	0.35	0.2	0.34	0.15	0.18	0.06	0.05	0.43	0.24	0.44	1.0	0.48	0.53	0.5	0.75	0.52	0.01	0.03	0.06	0.09
EFI27850	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI27925	0.0	1.0	0.0	0.07	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.37	0.0	0.0	0.0	0.0	0.76	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI28273	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI28274	0.0	0.0	0.0	0.09	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0
EFI28491	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	1.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0	0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)