1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_29 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.08 0.11 0.02 0.01 0.09 0.22 0.02 0.0 0.0 0.01 0.01 0.15 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.03 1.0 0.0 0.01
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0
0.0 0.07 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.01 0.0 0.05 0.14 0.2 0.0 0.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0
0.03 0.0 0.22 0.03 0.04 0.11 0.5 0.03 0.04 0.19 0.0 0.0 0.0 0.02 0.04 0.09 0.0 0.17 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.03 1.0 0.09 0.0
0.11 0.18 0.34 0.17 0.13 0.05 0.1 0.52 0.61 0.23 0.45 0.2 0.08 0.39 0.48 0.15 0.09 0.12 0.11 0.15 0.09 0.14 1.0 0.04 0.01 0.8 0.38 0.23
0.17 0.41 0.06 0.12 0.05 0.08 0.07 0.02 0.03 0.06 0.04 0.05 0.08 0.12 0.13 0.03 0.04 0.11 0.05 0.05 0.08 0.05 0.06 0.06 1.0 0.96 0.06 0.1
0.2 0.1 0.04 0.18 0.16 0.23 0.15 0.25 0.35 0.14 0.28 0.21 0.09 0.06 0.07 0.39 0.16 0.87 0.0 0.2 0.51 0.16 0.31 0.19 0.03 1.0 0.08 0.1
0.03 0.26 0.02 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.02 0.0 0.02 0.13 0.09 0.05 0.0 0.05 0.0 0.05 0.0 0.0 0.1 0.09 0.39 1.0 0.21 0.0
0.08 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0 0.02 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.07 0.02 0.0 0.34 0.27 0.11 0.19 0.02 0.09 0.06 1.0 0.01 0.27
0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.06 0.16 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.03 1.0 0.03 0.01
0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.0 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 1.0 0.05 0.0
0.19 0.05 0.18 0.11 0.14 0.23 0.05 0.11 0.15 0.07 0.15 0.14 0.07 0.16 0.28 0.26 0.1 0.12 0.1 0.22 0.18 0.21 0.08 0.21 0.18 1.0 0.16 0.11
0.05 0.23 0.01 0.02 0.03 0.02 0.01 0.02 0.04 0.04 0.06 0.03 0.0 0.07 0.1 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.02 0.01 0.09 1.0 0.06 0.03
0.0 0.31 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.81 1.0 0.33 0.0
0.03 0.07 0.13 0.17 0.18 0.12 0.12 0.13 0.19 0.24 0.23 0.25 0.15 0.25 0.24 0.12 0.09 0.11 0.06 0.17 0.16 0.18 0.25 0.17 0.04 1.0 0.18 0.15
0.18 0.03 0.0 0.01 0.0 0.02 0.03 0.02 0.02 0.02 0.0 0.05 0.02 0.23 0.39 0.04 0.0 0.09 0.04 0.0 0.08 0.0 0.01 0.09 0.23 1.0 0.07 0.0
0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.06 0.0
0.04 0.03 0.09 0.04 0.02 0.02 0.12 0.01 0.02 0.05 0.03 0.02 0.29 0.02 0.02 0.09 0.07 0.04 0.04 0.07 0.19 0.08 0.04 0.11 0.04 1.0 0.01 0.05
0.02 0.25 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 1.0 0.01 0.0
0.25 0.14 0.03 0.12 0.05 0.06 0.05 0.02 0.02 0.04 0.03 0.05 0.06 0.13 0.11 0.05 0.06 0.03 0.03 0.04 0.04 0.04 0.03 0.04 0.76 1.0 0.13 0.1
0.75 0.63 0.07 0.23 0.06 0.06 0.04 0.06 0.04 0.1 0.04 0.07 0.03 0.61 0.59 0.48 0.29 0.33 0.38 0.56 0.28 0.44 0.09 0.33 0.95 1.0 0.65 0.32
0.0 0.04 0.01 0.14 0.02 0.0 0.11 0.09 0.08 0.03 0.07 0.04 0.01 0.11 0.06 0.12 0.17 0.16 0.45 0.37 0.18 0.29 0.21 0.18 0.02 1.0 0.22 0.22
0.01 0.03 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.09 0.19 0.01 0.01 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.06 1.0 0.04 0.01
0.02 0.07 0.8 0.16 0.12 0.14 0.23 0.7 0.86 0.41 1.0 0.18 0.17 0.16 0.12 0.26 0.3 0.26 0.15 0.36 0.37 0.33 0.31 0.25 0.07 0.43 0.14 0.16
0.04 0.11 0.44 0.15 0.11 0.17 0.14 0.6 0.64 0.32 0.69 0.12 0.15 0.2 0.24 0.44 0.36 0.72 0.65 0.56 0.67 0.36 0.29 0.49 0.08 1.0 0.2 0.14
0.01 0.1 0.09 0.07 0.09 0.09 0.06 0.09 0.12 0.08 0.13 0.09 0.05 0.12 0.13 0.06 0.04 0.05 0.04 0.06 0.03 0.05 0.07 0.06 0.3 1.0 0.08 0.07
0.05 0.34 0.25 0.02 0.03 0.04 0.22 0.96 0.05 0.73 0.03 0.01 0.05 1.0 0.92 0.06 0.13 0.01 0.03 0.04 0.15 0.06 0.34 0.03 0.95 0.92 0.85 0.02
0.0 0.0 0.07 0.16 0.2 0.11 0.07 0.12 0.09 0.05 0.08 0.19 0.08 0.01 0.01 0.11 0.11 0.06 0.03 0.1 0.07 0.1 0.12 0.11 0.01 1.0 0.03 0.12
0.48 0.53 0.05 0.0 0.02 0.01 0.01 0.82 0.04 0.15 0.07 0.03 0.01 0.41 0.54 0.03 0.01 0.04 0.01 0.02 0.01 0.01 0.71 0.01 0.03 1.0 0.31 0.01
0.08 0.03 0.06 0.08 0.03 0.06 0.11 0.11 0.35 0.18 0.21 0.11 0.07 0.76 0.62 0.19 0.14 0.23 0.23 0.33 0.27 0.12 0.21 0.04 0.03 1.0 0.71 0.13
0.38 0.45 0.05 0.09 0.12 0.09 0.07 0.17 0.11 0.11 0.21 0.07 0.12 0.1 0.12 0.17 0.08 0.25 0.16 0.07 0.05 0.11 0.13 0.05 1.0 1.0 0.24 0.05
0.04 0.17 0.08 0.29 0.32 0.42 0.08 0.17 0.2 0.12 0.12 0.41 0.08 0.15 0.18 0.13 0.14 0.05 0.04 0.12 0.07 0.14 0.19 0.13 0.14 1.0 0.14 0.39
0.08 0.18 0.17 0.22 0.25 0.24 0.24 0.18 0.19 0.21 0.21 0.23 0.31 0.33 0.3 0.22 0.2 0.14 0.1 0.25 0.18 0.23 0.18 0.2 1.0 0.77 0.43 0.25
0.08 0.1 0.29 0.16 0.35 0.38 0.35 0.63 1.0 0.81 0.97 0.32 0.34 0.76 0.64 0.27 0.19 0.6 0.25 0.33 0.22 0.35 0.47 0.31 0.07 0.82 0.82 0.34
0.29 0.18 0.23 0.1 0.17 0.28 0.34 0.27 0.22 0.22 0.22 0.13 0.27 0.68 0.59 0.15 0.11 0.18 0.1 0.2 0.2 0.22 0.43 0.19 0.27 1.0 0.63 0.16
0.31 0.2 0.23 0.22 0.22 0.37 0.33 0.42 0.34 0.35 0.32 0.16 0.24 0.69 0.63 0.36 0.31 0.26 0.39 0.44 0.49 0.38 0.48 0.38 0.29 1.0 0.61 0.28
0.59 0.32 0.01 0.02 0.01 0.01 0.04 0.0 0.03 0.07 0.07 0.02 0.0 0.16 0.2 0.01 0.02 0.03 0.0 0.02 0.02 0.04 0.02 0.01 0.46 1.0 0.17 0.06
0.28 0.65 0.32 0.41 0.37 0.32 0.35 0.35 0.39 0.44 0.36 0.38 0.4 0.62 0.58 0.31 0.31 0.28 0.42 0.36 0.31 0.33 0.39 0.31 0.92 1.0 0.5 0.54
0.2 0.41 0.14 0.03 0.11 0.12 0.17 0.13 0.09 0.73 0.1 0.15 0.19 0.44 0.4 0.04 0.03 0.19 0.03 0.07 0.05 0.04 0.02 0.04 0.81 1.0 0.25 0.02
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0 0.0 0.35 1.0 0.0 0.0
0.0 0.11 0.02 0.01 0.02 0.06 0.05 0.06 0.02 0.04 0.02 0.03 0.01 0.21 0.13 0.04 0.02 0.02 0.05 0.04 0.05 0.03 0.01 0.05 0.17 1.0 0.19 0.02
0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.04 0.0 0.07 0.03 0.11 0.04 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.11 1.0 0.0 0.0
0.06 0.0 0.0 0.05 0.25 0.59 0.07 0.19 0.01 0.08 0.01 0.08 0.01 0.01 0.02 0.03 0.02 0.0 0.01 0.0 0.01 0.02 0.01 0.01 0.8 1.0 0.02 0.11
0.1 0.09 0.01 0.06 0.06 0.02 0.05 0.01 0.02 0.01 0.04 0.15 0.04 0.07 0.08 0.11 0.04 0.02 0.16 0.07 0.02 0.04 0.04 0.06 0.05 1.0 0.02 0.06
0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0
0.26 0.03 0.03 0.05 0.01 0.01 0.01 0.04 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.02 0.03 0.04 0.03 0.05 0.01 0.03 0.03 0.03 0.03 0.02 0.14 1.0 0.04 0.03
0.2 0.16 0.2 0.17 0.29 0.32 0.22 0.2 0.21 0.19 0.24 0.26 0.23 0.37 0.37 0.18 0.15 0.52 0.15 0.19 0.18 0.2 0.15 0.17 0.93 1.0 0.22 0.19
0.02 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.02 0.02 0.07 0.0 0.0 0.0 0.07 0.03 0.0 0.03 0.16 0.0 0.03 0.0 0.0 0.11 0.02 0.02 1.0 0.03 0.0
0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.1 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.09 1.0 0.01 0.0
0.07 0.01 0.07 0.02 0.01 0.01 0.08 0.02 0.02 0.02 0.02 0.01 0.05 0.16 0.31 0.03 0.03 0.02 0.01 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.17 1.0 0.05 0.05
0.14 0.51 0.04 0.01 0.0 0.0 0.07 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.16 0.41 0.26 0.04 0.14 0.23 0.04 0.04 0.06 0.09 0.1 0.04 0.37 1.0 0.35 0.01

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)