Heatmap: Cluster_91 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.21 0.63 0.24 0.32 0.27 0.39 0.54 0.26 0.26 0.42 0.28 0.25 0.44 0.6 0.54 0.28 0.32 0.47 0.23 0.42 0.3 0.38 0.28 0.35 0.74 1.0 0.49 0.57
0.01 0.37 0.08 0.03 0.04 0.11 0.07 0.18 0.04 0.1 0.03 0.02 0.05 0.32 0.37 0.03 0.02 0.05 0.01 0.02 0.05 0.02 0.02 0.01 0.11 1.0 0.22 0.05
0.0 0.22 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.13 0.21 0.0 0.0 0.01 0.02 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.09 1.0 0.04 0.0
0.22 0.51 0.6 0.29 0.25 0.15 0.8 0.1 0.38 0.17 0.33 0.34 0.49 0.47 0.49 0.33 0.41 0.22 1.0 0.45 0.27 0.42 0.36 0.4 0.36 0.74 0.39 0.63
0.34 0.62 0.48 0.42 0.28 0.25 0.72 0.24 0.45 0.46 0.41 0.33 0.58 0.68 0.64 0.36 0.38 0.32 0.41 0.45 0.42 0.4 0.39 0.39 0.71 1.0 0.55 0.78
0.12 0.05 0.09 0.07 0.11 0.11 0.08 0.05 0.09 0.13 0.13 0.18 0.13 0.22 0.22 0.06 0.08 0.07 0.02 0.06 0.05 0.04 0.06 0.05 0.81 1.0 0.21 0.11
0.12 0.09 0.02 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.0 0.0 0.4 0.48 0.01 0.0 0.06 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.08 1.0 0.36 0.01
0.86 1.0 0.47 0.26 0.48 0.73 0.47 0.33 0.5 0.29 0.66 0.47 0.34 0.68 0.69 0.47 0.58 0.38 0.42 0.57 0.45 0.58 0.59 0.59 0.74 0.77 0.8 0.48
0.11 0.23 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.25 0.22 0.02 0.02 0.02 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.5 1.0 0.21 0.01
0.05 0.32 0.1 0.0 0.08 0.05 0.07 0.02 0.03 0.02 0.03 0.03 0.13 0.06 0.06 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.32 1.0 0.11 0.0
0.16 0.18 0.13 0.11 0.12 0.4 0.05 0.09 0.05 0.1 0.09 0.15 0.06 0.83 0.76 0.32 0.43 0.67 0.13 0.27 0.32 0.35 0.08 0.3 0.4 1.0 0.71 0.15
0.5 0.52 0.11 0.07 0.08 0.12 0.24 0.28 0.21 0.22 0.2 0.11 0.36 0.49 0.64 0.17 0.12 0.11 0.12 0.14 0.11 0.13 0.12 0.16 1.0 0.96 0.16 0.09
0.07 0.35 0.29 0.31 0.36 0.29 0.26 0.28 0.44 0.32 0.39 0.45 0.19 0.36 0.38 0.35 0.33 0.47 0.47 0.38 0.34 0.37 0.31 0.37 0.23 1.0 0.32 0.34
0.06 0.66 0.25 0.26 0.24 0.22 0.23 0.12 0.22 0.19 0.25 0.22 0.3 0.33 0.3 0.15 0.18 0.2 0.2 0.19 0.17 0.17 0.17 0.16 0.46 1.0 0.3 0.25
0.1 0.24 0.03 0.15 0.02 0.07 0.15 0.07 0.05 0.06 0.01 0.06 0.09 0.45 0.33 0.09 0.03 0.11 0.02 0.08 0.09 0.17 0.07 0.0 0.96 1.0 0.36 0.21
0.44 0.17 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.32 0.42 0.01 0.01 0.02 0.05 0.02 0.01 0.02 0.01 0.02 0.78 1.0 0.09 0.02
0.2 0.23 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.17 0.19 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 1.0 0.63 0.1 0.01
0.23 0.7 0.21 0.37 0.27 0.31 0.25 0.21 0.19 0.25 0.18 0.26 0.35 0.42 0.4 0.21 0.19 0.12 0.2 0.2 0.22 0.18 0.21 0.18 0.74 1.0 0.36 0.36
0.31 0.43 0.6 0.42 0.7 0.55 0.63 0.52 0.49 0.5 0.58 0.57 0.67 0.89 0.77 0.38 0.29 0.27 0.17 0.41 0.41 0.34 0.36 0.34 1.0 0.87 0.96 0.34
0.03 0.51 0.24 0.23 0.3 0.19 0.18 0.15 0.31 0.17 0.28 0.3 0.18 0.28 0.26 0.17 0.2 0.24 0.26 0.21 0.18 0.21 0.14 0.18 0.34 1.0 0.24 0.24
0.33 0.44 0.26 0.2 0.17 0.09 0.24 0.14 0.27 0.14 0.27 0.2 0.22 0.32 0.38 0.3 0.31 0.12 0.14 0.29 0.26 0.29 0.33 0.3 1.0 0.54 0.33 0.23
0.83 0.26 0.1 0.04 0.03 0.02 0.09 0.05 0.12 0.02 0.12 0.04 0.08 0.23 0.23 0.03 0.08 0.02 0.02 0.03 0.02 0.04 0.08 0.04 1.0 0.35 0.22 0.08
0.14 0.89 0.36 0.39 0.38 0.43 0.48 0.15 0.28 0.22 0.3 0.43 0.5 0.55 0.5 0.33 0.49 0.28 0.3 0.45 0.28 0.4 0.29 0.33 0.57 1.0 0.57 0.44
0.03 0.25 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.02 0.3 0.3 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 1.0 0.29 0.1 0.01
0.17 0.73 0.42 0.46 0.46 0.36 0.57 0.3 0.4 0.53 0.42 0.4 0.58 0.65 0.62 0.44 0.46 0.53 0.44 0.49 0.46 0.42 0.41 0.4 0.62 1.0 0.55 0.77
0.32 0.52 0.35 0.33 0.68 0.61 0.39 0.26 0.47 0.47 0.5 0.78 0.67 0.62 0.51 0.24 0.28 0.26 0.13 0.25 0.17 0.29 0.35 0.17 0.31 1.0 0.56 0.32
0.12 0.47 0.11 0.06 0.22 0.13 0.09 0.16 0.24 0.34 0.33 0.3 0.09 0.97 0.91 0.07 0.09 0.12 0.12 0.27 0.08 0.11 0.09 0.09 0.49 1.0 0.45 0.05
0.3 0.6 0.14 0.04 0.09 0.08 0.13 0.05 0.14 0.05 0.26 0.13 0.24 0.28 0.22 0.12 0.14 0.12 0.08 0.1 0.11 0.1 0.33 0.11 0.15 1.0 0.18 0.03
0.1 0.48 0.39 0.33 0.43 0.29 0.43 0.31 0.4 0.46 0.44 0.49 0.42 1.0 0.8 0.37 0.36 0.38 0.39 0.35 0.4 0.39 0.36 0.34 0.73 0.99 0.65 0.39
0.03 0.23 0.26 0.11 0.19 0.25 0.17 0.2 0.18 0.16 0.19 0.15 0.19 0.24 0.23 0.28 0.2 0.2 0.38 0.28 0.28 0.23 0.18 0.22 0.23 1.0 0.23 0.25
0.0 0.05 0.06 0.05 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.12 0.0 0.02 0.0 0.41 0.58 0.09 0.05 0.11 0.0 0.28 0.0 0.08 0.0 0.03 0.16 1.0 0.22 0.0
0.06 0.1 0.12 0.08 0.04 0.03 0.06 0.08 0.09 0.19 0.12 0.04 0.1 0.5 0.46 0.04 0.03 0.54 0.02 0.07 0.06 0.05 0.07 0.07 0.75 1.0 0.39 0.07
0.05 0.39 0.14 0.12 0.08 0.05 0.13 0.09 0.18 0.08 0.16 0.1 0.09 0.38 0.34 0.17 0.18 0.09 0.16 0.16 0.12 0.16 0.09 0.17 1.0 0.96 0.22 0.14
0.11 0.56 1.0 0.5 0.95 0.68 0.69 0.71 0.69 0.7 0.71 0.82 0.73 0.78 0.71 0.61 0.42 0.59 0.41 0.65 0.6 0.61 0.54 0.58 0.74 0.78 0.8 0.47
0.02 0.23 0.04 0.06 0.02 0.02 0.03 0.32 0.22 0.16 0.17 0.02 0.07 0.39 0.49 0.08 0.04 0.64 0.1 0.04 0.06 0.07 0.13 0.04 0.54 1.0 0.06 0.02
0.25 0.61 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.05 0.08 0.08 0.1 0.02 0.03 0.29 0.27 0.01 0.01 0.12 0.02 0.01 0.01 0.01 0.06 0.01 0.44 1.0 0.2 0.02
0.14 0.25 0.14 0.07 0.11 0.08 0.13 0.14 0.18 0.27 0.14 0.15 0.11 0.19 0.19 0.1 0.11 0.17 0.3 0.14 0.1 0.16 0.15 0.14 0.56 1.0 0.14 0.12
0.04 0.27 0.53 0.15 0.55 0.57 0.39 0.25 0.28 0.26 0.37 0.56 0.55 0.51 0.4 0.33 0.39 0.51 0.41 0.31 0.27 0.3 0.2 0.3 0.3 1.0 0.52 0.16
0.3 0.57 0.35 0.31 0.4 0.48 0.38 0.22 0.32 0.25 0.36 0.44 0.31 0.43 0.45 0.3 0.3 0.25 0.21 0.36 0.37 0.38 0.25 0.35 1.0 0.91 0.26 0.39
0.12 0.53 0.19 0.26 0.11 0.08 0.27 0.32 0.26 0.28 0.24 0.15 0.24 0.39 0.36 0.18 0.12 0.17 0.18 0.21 0.19 0.22 0.18 0.18 1.0 0.98 0.33 0.32
0.05 0.39 0.24 0.14 0.23 0.21 0.57 0.11 0.21 0.15 0.11 0.29 0.45 0.51 0.4 0.09 0.11 0.18 0.07 0.22 0.09 0.13 0.29 0.12 0.48 1.0 0.4 0.28
0.06 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.25 0.29 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 1.0 0.13 0.0
0.09 0.56 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.02 0.0 0.0 1.0 0.91 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.18 0.53 0.64 0.01
0.1 0.35 0.24 0.2 0.2 0.26 0.38 0.13 0.22 0.25 0.19 0.23 0.28 0.33 0.31 0.21 0.19 1.0 0.14 0.22 0.24 0.23 0.24 0.25 0.44 0.76 0.27 0.39
0.11 0.77 0.33 0.34 0.28 0.25 0.48 0.13 0.32 0.21 0.32 0.39 0.44 0.59 0.56 0.32 0.26 0.6 0.34 0.32 0.32 0.3 0.25 0.26 1.0 0.83 0.43 0.67
0.02 0.17 0.1 0.06 0.1 0.07 0.13 0.06 0.11 0.13 0.13 0.1 0.12 0.43 0.31 0.1 0.11 0.09 0.06 0.13 0.08 0.09 0.03 0.08 0.11 1.0 0.41 0.14
0.04 0.51 0.03 0.05 0.13 0.11 0.06 0.04 0.11 0.09 0.09 0.17 0.06 0.18 0.16 0.04 0.03 0.04 0.04 0.05 0.03 0.02 0.06 0.03 0.79 1.0 0.18 0.05
0.21 0.26 0.15 0.07 0.14 0.25 0.24 0.09 0.24 0.21 0.12 0.11 0.11 0.31 0.33 0.09 0.16 0.08 0.03 0.09 0.07 0.08 0.14 0.07 1.0 0.53 0.27 0.17
0.08 0.4 0.17 0.2 0.24 0.22 0.28 0.11 0.19 0.2 0.22 0.3 0.28 0.31 0.29 0.15 0.17 0.52 0.24 0.18 0.16 0.18 0.18 0.14 0.41 1.0 0.26 0.28
0.06 0.46 0.51 0.36 0.47 0.46 0.47 0.33 0.36 0.39 0.37 0.51 0.51 0.44 0.4 0.34 0.35 0.31 0.14 0.41 0.29 0.43 0.3 0.35 0.46 1.0 0.38 0.46
0.27 1.0 0.74 0.51 0.62 0.88 0.83 0.53 0.49 0.53 0.52 0.6 0.6 0.9 0.83 0.35 0.37 0.43 0.43 0.45 0.42 0.44 0.54 0.43 0.96 0.85 0.88 0.53
0.13 0.49 0.37 0.31 0.26 0.15 0.26 0.24 0.32 0.2 0.32 0.31 0.23 0.93 0.78 0.23 0.21 0.25 0.18 0.29 0.18 0.26 0.27 0.25 0.43 0.55 1.0 0.23
0.34 1.0 0.13 0.11 0.27 0.84 0.2 0.27 0.25 0.12 0.32 0.28 0.2 0.29 0.23 0.34 0.47 0.14 0.13 0.29 0.21 0.36 0.4 0.35 0.43 0.69 0.2 0.14
0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 1.0 0.21 0.0
0.11 0.54 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.54 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 1.0 0.31 0.0
0.02 0.21 0.01 0.08 0.05 0.11 0.09 0.17 0.03 0.26 0.05 0.02 0.11 0.02 0.05 0.03 0.05 0.04 0.02 0.04 0.02 0.03 0.02 0.02 0.44 1.0 0.04 0.14
0.17 0.83 0.13 0.26 0.29 0.47 0.19 0.1 0.1 0.08 0.1 0.34 0.14 0.36 0.34 0.09 0.16 0.1 0.1 0.11 0.06 0.11 0.09 0.1 1.0 0.76 0.29 0.24
0.12 0.14 0.14 0.11 0.06 0.05 0.19 0.09 0.11 0.13 0.11 0.08 0.12 0.22 0.24 0.06 0.08 0.04 0.06 0.09 0.08 0.09 0.09 0.08 0.24 1.0 0.15 0.19
0.19 0.75 0.62 0.37 0.42 0.46 0.64 0.25 0.36 0.35 0.33 0.55 0.48 0.69 0.55 0.27 0.35 0.21 0.63 0.37 0.23 0.35 0.2 0.29 0.43 1.0 0.46 0.36
0.12 0.61 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.88 0.88 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.77 0.72 0.01
0.27 0.97 0.62 0.38 0.64 0.69 0.73 0.47 0.51 0.52 0.55 0.66 0.49 0.66 0.62 0.53 0.61 0.41 0.31 0.6 0.51 0.69 0.44 0.55 0.82 1.0 0.58 0.48
0.08 0.4 0.13 0.1 0.27 0.21 0.12 0.28 0.3 0.28 0.37 0.3 0.11 0.7 0.62 0.23 0.2 0.13 0.11 0.27 0.22 0.25 0.12 0.2 1.0 0.59 0.39 0.11
0.13 0.6 0.48 0.27 0.42 0.46 0.38 0.29 0.33 0.36 0.34 0.45 0.35 0.58 0.45 0.29 0.32 0.28 0.2 0.39 0.33 0.38 0.3 0.38 1.0 0.6 0.53 0.31
0.14 0.83 0.26 0.29 0.52 0.53 0.31 0.24 0.34 0.32 0.39 0.5 0.38 0.41 0.36 0.22 0.28 0.37 0.27 0.27 0.22 0.27 0.29 0.23 1.0 0.6 0.52 0.35
0.13 0.47 0.25 0.27 0.42 0.35 0.29 0.23 0.28 0.3 0.26 0.44 0.33 0.61 0.58 0.22 0.22 0.18 0.12 0.23 0.19 0.24 0.3 0.21 0.62 1.0 0.5 0.31
0.06 0.16 0.02 0.05 0.09 0.08 0.14 0.1 0.09 0.12 0.12 0.13 0.13 0.55 0.41 0.06 0.03 0.33 0.03 0.06 0.01 0.04 0.02 0.04 0.2 1.0 0.47 0.06
0.6 0.8 0.5 0.36 0.49 0.46 0.48 0.28 0.4 0.31 0.41 0.51 0.43 0.98 0.78 0.23 0.31 0.37 0.13 0.32 0.22 0.28 0.25 0.29 1.0 0.89 0.64 0.5
0.01 0.14 0.22 0.06 0.26 0.14 0.09 0.06 0.18 0.12 0.2 0.32 0.16 0.35 0.3 0.08 0.04 0.1 0.04 0.08 0.04 0.12 0.07 0.11 0.09 1.0 0.23 0.06
0.07 0.37 0.24 0.11 0.15 0.13 0.16 0.08 0.15 0.11 0.14 0.14 0.17 0.29 0.27 0.15 0.12 0.09 0.22 0.22 0.17 0.15 0.12 0.15 0.82 1.0 0.21 0.16
0.04 0.62 0.17 0.06 0.03 0.04 0.16 0.04 0.06 0.05 0.05 0.03 0.13 0.08 0.09 0.17 0.09 0.03 0.13 0.12 0.22 0.11 0.05 0.12 1.0 0.66 0.09 0.06
0.0 0.17 0.09 0.05 0.03 0.0 0.03 0.18 0.07 0.13 0.1 0.1 0.1 0.25 0.19 0.06 0.03 0.25 0.11 0.12 0.15 0.09 0.02 0.15 0.2 1.0 0.15 0.24
0.17 0.35 0.31 0.31 0.47 0.3 0.28 0.42 0.28 0.55 0.2 0.45 0.34 0.64 0.56 0.31 0.26 0.18 0.2 0.24 0.29 0.25 0.16 0.2 0.79 1.0 0.57 0.27
0.01 1.0 0.25 0.34 0.27 0.28 0.59 0.11 0.18 0.14 0.17 0.36 0.65 0.56 0.49 0.14 0.16 0.31 0.2 0.19 0.15 0.2 0.14 0.18 0.99 0.83 0.43 0.48
0.21 0.59 0.23 0.25 0.23 0.22 0.28 0.18 0.19 0.22 0.24 0.21 0.31 0.43 0.36 0.24 0.21 0.17 0.2 0.24 0.25 0.23 0.15 0.19 0.72 1.0 0.36 0.18
0.21 1.0 0.45 0.1 0.15 0.48 0.21 0.17 0.1 0.1 0.07 0.12 0.14 0.57 0.55 0.19 0.13 0.11 0.08 0.52 0.18 0.23 0.66 0.21 0.41 0.81 0.89 0.32
0.37 0.79 0.27 0.2 0.25 0.14 0.12 0.12 0.32 0.21 0.3 0.32 0.13 0.86 1.0 0.15 0.18 0.16 0.3 0.2 0.14 0.16 0.2 0.13 0.54 0.34 0.59 0.26
0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.53 0.47 0.0
0.02 0.15 0.01 0.02 0.01 0.0 0.03 0.01 0.06 0.08 0.03 0.01 0.02 0.21 0.2 0.04 0.03 0.05 0.06 0.02 0.03 0.03 0.01 0.07 0.12 1.0 0.13 0.04
0.07 0.11 0.02 0.07 0.01 0.03 0.03 0.23 0.05 0.27 0.02 0.01 0.02 0.27 0.24 0.11 0.26 0.26 0.02 0.03 0.23 0.12 0.01 0.03 0.12 1.0 0.4 0.11
0.04 0.31 0.27 0.18 0.24 0.23 0.22 0.11 0.21 0.16 0.21 0.28 0.18 0.26 0.25 0.19 0.19 0.12 0.14 0.22 0.16 0.2 0.15 0.18 0.32 1.0 0.24 0.21
0.03 0.4 0.42 0.06 0.05 0.04 0.22 0.0 0.01 0.04 0.0 0.09 0.63 0.71 0.61 0.11 0.09 0.75 0.14 0.17 0.23 0.22 0.13 0.23 0.17 1.0 0.63 0.08
0.0 0.13 0.15 0.03 0.03 0.02 0.1 0.01 0.01 0.02 0.02 0.04 0.36 0.16 0.2 0.11 0.05 0.21 0.12 0.19 0.06 0.1 0.04 0.1 0.08 1.0 0.18 0.06
0.03 0.37 0.37 0.02 0.12 0.04 0.61 0.07 0.2 0.26 0.2 0.15 0.62 0.33 0.31 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.01 0.0 0.09 0.0 0.3 1.0 0.22 0.0
0.07 0.94 0.08 0.04 0.02 0.02 0.05 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.06 0.21 0.26 0.01 0.01 0.05 0.09 0.05 0.02 0.04 0.03 0.03 0.36 1.0 0.12 0.04
0.15 0.43 0.41 0.1 0.39 0.3 0.32 0.27 0.31 0.37 0.33 0.41 0.42 0.31 0.28 0.18 0.24 0.69 0.09 0.25 0.19 0.24 0.18 0.19 0.62 1.0 0.33 0.29

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)