1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_127 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.18 0.75 0.52 0.05 0.22 0.21 0.48 0.26 0.8 0.11 0.7 0.2 0.27 1.0 0.81 0.1 0.07 0.38 0.1 0.09 0.15 0.11 0.38 0.09 0.18 0.01 0.67 0.04
0.04 0.24 0.09 0.09 0.23 1.0 0.14 0.26 0.05 0.06 0.05 0.09 0.14 0.16 0.14 0.09 0.07 0.05 0.04 0.08 0.07 0.06 0.03 0.06 0.25 0.12 0.18 0.08
0.1 0.5 0.2 0.3 0.36 1.0 0.38 0.23 0.24 0.13 0.25 0.28 0.14 0.57 0.45 0.56 0.46 0.1 0.61 0.55 0.44 0.44 0.17 0.48 0.71 0.35 0.71 0.42
0.29 1.0 0.37 0.46 0.19 0.18 0.39 0.09 0.17 0.1 0.19 0.23 0.47 0.69 0.69 0.39 0.34 0.58 0.33 0.36 0.35 0.39 0.39 0.42 0.4 0.79 0.48 0.5
0.1 1.0 0.25 0.11 0.63 0.81 0.22 0.6 0.57 0.87 0.7 0.7 0.33 0.57 0.57 0.05 0.03 0.79 0.12 0.07 0.12 0.11 0.16 0.09 0.57 0.14 0.21 0.1
0.24 0.5 0.31 0.12 0.33 0.2 1.0 0.31 0.7 0.45 0.89 0.61 0.21 0.77 0.68 0.26 0.31 0.49 0.12 0.48 0.27 0.33 0.33 0.19 0.18 0.44 0.56 0.17
0.07 0.72 0.64 0.22 0.14 0.12 0.47 0.64 0.4 0.53 0.54 0.19 0.24 1.0 0.77 0.35 0.27 0.39 0.21 0.29 0.37 0.48 0.46 0.29 0.21 0.11 0.65 0.09
0.06 0.76 0.77 0.36 0.66 0.65 1.0 0.62 0.68 0.67 0.75 0.59 0.88 0.46 0.39 0.61 0.44 0.4 0.47 0.61 0.75 0.54 0.23 0.61 0.44 0.17 0.63 0.27
0.03 0.29 0.36 0.04 0.04 0.05 0.53 0.13 0.21 0.07 0.27 0.04 1.0 0.18 0.16 0.23 0.29 0.16 0.3 0.15 0.2 0.18 0.04 0.29 0.1 0.12 0.07 0.05
0.4 0.83 0.72 0.52 0.54 0.97 0.87 0.63 0.81 0.59 0.85 0.6 0.8 1.0 0.93 0.75 0.84 0.47 0.99 0.77 0.74 0.79 0.68 0.73 0.68 0.89 0.95 0.69
0.08 0.79 0.47 0.4 0.57 0.63 0.53 0.66 0.91 0.58 1.0 0.65 0.46 0.95 0.92 0.73 0.63 0.51 0.36 0.82 0.75 0.78 0.61 0.8 0.51 0.61 0.64 0.48
1.0 0.87 0.65 0.48 0.73 0.66 0.65 0.45 0.61 0.47 0.64 0.69 0.63 0.81 0.77 0.54 0.57 0.31 0.55 0.65 0.61 0.65 0.47 0.61 0.97 0.87 0.8 0.6
0.17 0.44 0.15 0.22 0.22 0.2 0.11 0.85 0.45 1.0 0.49 0.2 0.11 0.6 0.57 0.18 0.1 0.21 0.12 0.17 0.14 0.16 0.12 0.12 0.87 0.65 0.43 0.1
0.05 0.34 0.56 0.41 0.62 0.53 0.54 0.44 0.92 0.9 0.91 0.96 0.33 0.7 0.72 0.72 0.68 0.47 0.42 0.8 0.63 0.78 0.49 0.74 0.44 1.0 0.68 0.58
0.11 0.75 0.47 0.41 0.42 0.54 0.4 0.38 0.53 0.39 0.56 0.49 0.38 1.0 0.84 0.65 0.61 0.33 0.35 0.63 0.68 0.73 0.35 0.62 0.5 0.23 0.76 0.29
0.46 0.96 0.63 0.45 0.62 0.66 0.52 0.48 0.65 0.62 0.67 0.62 0.53 0.82 0.7 0.42 0.59 0.42 0.26 0.57 0.49 0.49 0.54 0.54 0.64 0.63 1.0 0.56
0.51 0.9 0.84 0.36 0.92 0.94 0.98 0.21 0.37 0.2 0.49 1.0 0.57 0.86 0.68 0.28 0.78 0.94 0.3 0.53 0.27 0.73 0.6 0.55 0.43 0.1 0.34 0.6
0.11 0.32 0.76 0.21 0.57 0.67 0.96 0.89 1.0 0.91 0.98 0.41 0.52 0.54 0.68 0.34 0.49 0.43 0.16 0.46 0.27 0.49 0.63 0.49 0.8 0.38 0.54 0.77
0.16 0.44 0.51 0.39 0.88 0.79 0.66 0.59 0.74 0.72 0.76 1.0 0.54 0.61 0.62 0.34 0.41 0.49 0.26 0.39 0.37 0.41 0.43 0.4 0.49 0.85 0.46 0.54
0.47 0.53 0.61 0.48 0.72 0.7 0.77 0.74 0.75 1.0 0.73 0.72 0.6 0.58 0.58 0.64 0.55 0.46 0.27 0.56 0.54 0.54 0.76 0.53 0.56 0.68 0.57 0.59
0.11 0.4 0.26 0.14 0.26 0.28 0.19 0.77 0.49 0.69 0.53 0.35 0.28 0.34 0.33 0.12 0.22 0.53 0.23 0.2 0.17 0.21 0.14 0.22 1.0 0.48 0.2 0.14
0.26 0.43 0.02 0.0 0.04 0.17 0.04 0.41 0.17 0.24 0.2 0.14 0.03 0.14 0.19 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 1.0 0.17 0.25 0.0
0.12 0.79 0.28 0.18 0.28 0.28 0.44 0.36 0.35 1.0 0.86 0.7 0.19 0.58 0.37 0.35 0.0 0.2 0.09 0.38 0.31 0.29 0.32 0.09 0.14 0.13 0.81 0.37
0.05 0.78 1.0 0.45 0.7 0.73 0.58 0.4 0.77 0.73 0.88 0.86 0.67 0.72 0.64 0.5 0.45 0.64 0.37 0.95 0.61 0.58 0.38 0.47 0.35 0.23 0.69 0.67
0.14 0.54 0.58 0.66 0.68 0.53 0.67 0.5 0.81 0.65 0.88 0.86 0.53 0.79 0.78 0.93 0.66 0.37 0.59 0.96 1.0 0.85 0.75 0.88 0.48 0.63 0.73 0.71
0.19 0.33 0.4 0.36 0.74 0.66 0.53 0.69 0.76 0.86 0.8 1.0 0.39 0.45 0.4 0.34 0.26 0.34 0.16 0.38 0.32 0.41 0.3 0.37 0.69 0.38 0.44 0.38
0.56 1.0 0.64 0.43 0.54 0.82 0.78 0.22 0.37 0.32 0.4 0.62 0.66 0.73 0.65 0.51 0.66 0.34 0.34 0.6 0.44 0.57 0.36 0.5 0.34 0.64 0.64 0.58
0.12 0.35 0.52 0.25 0.87 1.0 0.57 0.57 0.78 0.64 0.71 0.98 0.34 0.55 0.45 0.22 0.18 0.28 0.3 0.24 0.22 0.23 0.21 0.24 0.52 0.34 0.71 0.21
0.31 0.32 0.69 0.4 0.83 0.85 1.0 0.48 0.7 0.64 0.63 0.92 0.68 0.54 0.53 0.38 0.47 0.44 0.24 0.48 0.37 0.5 0.63 0.44 0.73 0.78 0.59 0.58
0.93 0.97 0.91 0.45 0.72 0.76 0.87 0.54 0.86 0.65 1.0 0.81 0.5 0.59 0.6 0.64 0.57 0.79 0.96 0.79 0.77 0.77 0.64 0.84 0.32 0.59 0.53 0.43
0.2 1.0 0.45 0.38 0.44 0.55 0.62 0.3 0.3 0.38 0.35 0.44 0.44 0.77 0.75 0.43 0.41 0.33 0.26 0.55 0.55 0.52 0.62 0.46 0.85 0.53 0.67 0.6
0.03 0.73 0.78 0.4 0.84 0.69 0.7 0.75 1.0 0.73 0.84 0.93 0.5 0.88 0.92 0.56 0.62 0.61 0.25 0.95 0.62 0.96 0.99 0.78 0.37 0.99 0.67 0.57
0.31 0.48 0.06 0.1 0.1 0.08 0.12 0.13 0.3 0.32 0.33 0.14 0.16 0.21 0.21 0.02 0.02 0.84 0.02 0.02 0.02 0.02 0.14 0.02 1.0 0.43 0.17 0.0
0.03 0.48 0.18 0.12 0.47 0.41 0.12 0.6 0.71 1.0 0.83 0.57 0.13 0.43 0.34 0.06 0.05 0.54 0.11 0.09 0.08 0.09 0.14 0.09 0.75 0.33 0.33 0.05
0.21 0.81 1.0 0.42 0.67 0.72 0.72 0.67 0.68 0.61 0.74 0.74 0.45 0.75 0.65 0.63 0.76 0.38 0.34 0.72 0.6 0.82 0.46 0.72 0.78 0.37 0.82 0.32
0.05 0.77 0.23 0.11 0.41 0.28 0.28 0.32 0.45 0.67 0.48 0.47 0.46 0.46 0.38 0.16 0.17 1.0 0.21 0.18 0.11 0.2 0.33 0.15 0.32 0.25 0.39 0.22
0.38 1.0 0.25 0.26 0.85 0.82 0.43 0.22 0.51 0.3 0.54 0.98 0.25 0.31 0.4 0.29 0.36 0.46 0.51 0.41 0.18 0.34 0.39 0.32 0.21 0.52 0.36 0.32
0.32 0.77 0.39 0.25 0.18 0.18 0.44 0.31 0.55 0.4 0.6 0.23 0.23 1.0 0.78 0.31 0.22 0.26 0.22 0.41 0.38 0.45 0.33 0.4 0.19 0.12 0.68 0.25
0.18 1.0 0.47 0.41 0.28 0.25 0.43 0.54 0.67 0.42 0.62 0.29 0.35 0.74 0.66 0.43 0.45 0.26 0.19 0.47 0.47 0.49 0.52 0.46 0.52 0.5 0.8 0.5
0.15 0.7 0.72 0.26 0.26 0.32 1.0 0.34 0.29 0.5 0.3 0.17 0.48 0.56 0.49 0.62 0.37 0.45 0.64 0.57 0.62 0.47 0.24 0.51 0.53 0.31 0.51 0.31
0.03 0.77 0.56 0.43 0.58 0.78 0.43 0.28 0.59 0.93 0.9 0.87 0.33 0.69 0.67 0.54 0.51 0.23 0.34 1.0 0.41 0.61 0.76 0.58 0.31 0.4 0.69 0.47
0.06 0.47 0.58 0.5 0.55 0.39 0.62 0.46 0.87 0.59 1.0 0.77 0.43 0.72 0.69 0.72 0.59 0.4 0.39 0.77 0.68 0.76 0.53 0.69 0.45 0.5 0.55 0.59
0.3 1.0 0.33 0.18 0.35 0.29 0.53 0.28 0.27 0.66 0.24 0.32 0.32 0.56 0.55 0.37 0.32 0.39 0.21 0.49 0.42 0.4 0.35 0.38 0.48 0.47 0.5 0.23
0.18 0.51 0.06 0.03 0.11 0.08 0.06 0.44 0.55 1.0 0.6 0.21 0.14 0.43 0.47 0.05 0.06 0.24 0.06 0.16 0.17 0.13 0.11 0.12 0.33 0.37 0.34 0.05
0.29 0.95 0.7 0.34 0.84 0.72 0.75 0.71 0.71 1.0 0.7 0.84 0.59 0.91 0.76 0.51 0.47 0.4 0.28 0.62 0.47 0.57 0.41 0.52 0.83 0.5 0.84 0.27
0.31 0.98 0.49 0.57 0.49 0.54 0.65 0.35 0.47 0.48 0.48 0.52 0.67 0.78 0.75 0.42 0.5 0.37 0.65 0.52 0.44 0.57 0.49 0.46 1.0 0.83 0.67 0.79
0.08 0.62 0.24 0.26 0.75 0.48 0.26 0.15 0.36 0.09 0.43 1.0 0.3 0.31 0.31 0.33 0.29 0.61 0.36 0.26 0.35 0.33 0.4 0.31 0.46 0.33 0.18 0.24
0.61 0.64 0.48 0.31 0.78 1.0 0.65 0.36 0.71 0.53 0.73 0.82 0.36 0.71 0.68 0.37 0.33 0.4 0.62 0.47 0.34 0.42 0.4 0.41 0.52 0.7 0.61 0.4
0.39 0.98 0.51 0.42 0.75 0.62 0.59 0.7 0.96 0.92 1.0 0.78 0.51 0.93 0.85 0.41 0.39 0.34 0.23 0.52 0.5 0.55 0.43 0.47 0.81 0.53 0.9 0.49
0.14 1.0 0.92 0.09 0.41 0.42 0.81 0.22 0.38 0.35 0.36 0.51 0.97 0.5 0.48 0.31 0.24 0.81 0.14 0.66 0.17 0.36 0.47 0.32 0.14 0.52 0.51 0.24
0.12 0.37 0.25 0.06 0.69 1.0 0.15 0.44 0.37 0.23 0.18 0.51 0.16 0.12 0.14 0.14 0.11 0.28 0.13 0.18 0.14 0.14 0.13 0.15 0.04 0.16 0.21 0.08
0.47 0.98 0.44 0.3 0.59 0.51 0.73 0.45 0.82 0.68 1.0 0.65 0.34 0.76 0.7 0.4 0.38 0.34 0.13 0.44 0.34 0.49 0.37 0.38 0.32 0.36 0.5 0.36
0.13 0.53 0.32 0.19 0.27 0.36 0.29 0.24 0.28 0.24 0.32 0.34 0.22 0.68 0.58 0.35 0.3 0.23 0.34 0.41 0.34 0.39 0.3 0.36 1.0 0.51 0.58 0.34
0.15 1.0 0.53 0.26 0.7 0.77 0.65 0.46 0.55 0.57 0.56 0.7 0.49 0.47 0.39 0.37 0.45 0.4 0.18 0.44 0.26 0.43 0.48 0.41 0.34 0.39 0.4 0.21
0.13 0.58 0.07 0.34 0.08 0.1 0.08 0.06 0.22 0.07 0.12 0.17 0.08 0.66 0.53 0.03 0.0 0.89 0.04 0.0 0.0 0.0 0.24 0.05 1.0 0.53 0.34 0.26
0.14 0.57 0.18 0.1 0.54 0.33 0.29 0.61 0.79 0.52 1.0 0.67 0.48 0.62 0.65 0.3 0.3 0.64 0.5 0.5 0.65 0.43 0.46 0.42 0.7 0.86 0.57 0.27
0.25 0.69 0.68 0.47 0.74 0.62 0.93 0.7 0.95 0.97 1.0 0.81 0.56 0.63 0.59 0.45 0.53 0.48 0.2 0.57 0.38 0.61 0.57 0.51 0.5 0.55 0.55 0.42

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)