Heatmap: Cluster_41 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.09 0.6 0.04 0.0 0.0 0.15 0.48 0.25 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.43 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.73 0.56 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.33 0.21 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.13 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.73 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.09 0.0 0.07 0.09 0.0 0.05 0.0 0.0 0.3 0.1 0.36 0.09 0.19 0.28 0.22 0.23 0.68 0.0 1.0 0.0 0.23 0.0 0.23 0.0 0.76 0.12 0.0
0.0 0.0 0.0 0.13 0.21 0.22 0.14 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.31 0.17 0.12 0.51 0.23 0.44 0.44 0.08 0.12 0.0 0.28 0.25 0.0 0.08 1.0 0.0 0.07 0.38 0.58 0.17 0.21 0.02 0.07 0.03 0.02 0.14 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.69 1.0 0.0 0.0 0.63 0.0 0.0 0.0 0.0
0.13 0.7 0.4 0.04 0.16 0.33 0.1 0.32 0.0 0.35 0.16 0.16 0.16 0.2 0.29 0.19 0.0 0.75 0.7 0.84 1.0 0.2 0.72 0.18 0.0 0.39 0.0 0.51
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.91 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 1.0 0.73 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.32 1.0 0.67 0.28 0.3 0.08 0.43 0.14 0.08 0.07 0.13 0.15 0.47 0.12 0.12 0.31 0.22 0.14 0.05 0.46 0.29 0.51 0.31 0.44 0.58 0.21 0.74 0.11
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.22 0.0 0.07 0.48 0.0 0.0 0.0 0.96 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.57 0.0 1.0 0.64 0.0 0.0 0.0 0.58 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.64 0.0 0.0 0.0 0.99 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.61 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.77 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0 0.46 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.55 0.0 0.99 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.78
0.0 0.0 0.59 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.45 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.97 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.28 0.18 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.86 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.47 0.0
0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.13 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.61 0.77 0.44 0.36 1.0 0.32 0.27 0.5 0.34 0.37 0.23 0.58 0.29 0.27 0.27 0.82 0.35 0.46 0.26 0.71 0.67 0.54 0.39 0.53 0.43 0.34 0.65 0.15
0.0 0.1 0.07 0.12 0.17 0.06 0.38 0.16 0.11 0.23 0.32 0.05 0.22 0.03 0.12 0.25 0.13 0.67 0.47 0.72 0.0 0.13 0.24 1.0 0.05 0.82 0.2 0.17
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 1.0 0.0 0.0 0.0 0.91 0.0 0.0 0.0 0.0
0.49 0.71 0.89 0.63 0.0 0.0 0.55 0.06 0.09 0.24 0.1 0.09 0.0 0.41 0.36 1.0 0.07 0.0 0.28 0.89 0.7 0.7 0.26 0.67 0.51 0.82 0.16 0.8
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.43 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.84 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.52 0.0 0.07 1.0 0.32 0.0 0.92 0.62 0.0 0.0 0.61 0.0 0.18 0.18 0.0 0.38 0.73 0.0 0.39 0.0 0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.43 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.34 0.0 0.0 0.0
0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.79 0.0 0.0 0.0 0.0 0.45 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.65 0.0 0.0 0.0
0.0 0.57 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.27 0.0 0.53 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.2 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.83 0.0 1.0 0.7 0.47 0.44 0.69 0.49 0.0 0.23 0.91 0.27 0.0 0.0 0.0 0.53 0.0 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.05 0.04 0.18 0.0 0.0 0.02 0.03 0.28 0.04 0.07 0.03 0.0 0.05 0.06 0.79 0.59 0.35 0.45 1.0 0.57 0.39 0.13 0.38 0.06 0.09 0.04 0.45
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.81 0.0 0.0 0.0 0.0 0.94 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.52 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.5 0.23 0.16 0.0 0.51 0.1 0.3 0.16 0.1 0.05 0.15 0.03 0.0 0.78 0.24 0.37 1.0 0.27 0.62 0.25 0.12 0.43 0.0 0.08 0.0 0.16
0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)