Heatmap: Cluster_17 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.26 0.4 0.24 0.18 0.29 0.47 0.24 0.6 0.35 0.51 0.31 0.19 0.27 1.0 0.81 0.33 0.27 0.34 0.4 0.37 0.43 0.26 0.32 0.26 0.76 0.35 0.91 0.25
0.26 0.38 0.33 0.22 0.31 0.61 0.31 0.65 0.41 0.56 0.35 0.24 0.34 1.0 0.83 0.5 0.34 0.34 0.33 0.48 0.61 0.37 0.36 0.34 0.79 0.33 0.83 0.26
0.07 0.72 0.15 0.13 0.22 0.13 0.12 0.2 0.25 0.16 0.27 0.19 0.19 1.0 0.8 0.31 0.26 0.51 0.32 0.26 0.28 0.24 0.12 0.25 0.6 0.35 0.86 0.15
0.05 0.27 1.0 0.05 0.07 0.11 0.39 0.37 0.1 0.55 0.13 0.06 0.26 0.64 0.46 0.38 0.55 0.64 0.28 0.33 0.8 0.31 0.72 0.33 0.69 0.24 0.52 0.12
0.34 1.0 0.44 0.46 0.34 0.25 0.63 0.41 0.43 0.64 0.41 0.25 0.85 0.99 0.91 0.83 0.55 0.44 0.71 0.72 0.95 0.61 0.39 0.65 0.54 0.68 0.6 0.58
0.0 1.0 0.05 0.06 0.09 0.0 0.0 0.18 0.14 0.0 0.36 0.08 0.04 0.17 0.1 0.18 0.11 0.1 0.0 0.17 0.09 0.11 0.07 0.05 0.0 0.11 0.06 0.14
0.19 1.0 0.05 0.09 0.09 0.1 0.09 0.16 0.23 0.2 0.24 0.14 0.1 0.47 0.42 0.14 0.1 0.83 0.09 0.18 0.13 0.12 0.35 0.13 0.31 0.22 0.2 0.19
0.01 0.3 0.12 0.08 0.03 0.05 0.04 0.09 0.18 0.03 0.18 0.05 0.04 0.61 0.38 0.27 0.11 0.76 0.26 0.39 0.21 0.23 0.07 0.28 0.13 0.04 1.0 0.05
0.07 0.13 0.53 0.24 0.18 0.22 0.6 0.2 0.2 0.23 0.17 0.15 0.44 1.0 0.79 0.18 0.12 0.49 0.12 0.28 0.25 0.2 0.16 0.21 0.15 0.09 0.71 0.11
0.0 0.04 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.31 0.26 0.71 0.5 0.0 0.87 1.0 0.8 0.65 0.0 0.76 0.71 0.0 0.15 0.64
0.14 1.0 0.11 0.07 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.05 0.08 0.04 0.01 0.71 0.58 0.32 0.24 0.21 0.19 0.88 0.22 0.2 0.06 0.28 0.37 0.73 0.62 0.18
0.43 1.0 0.58 0.46 0.13 0.07 0.74 0.24 0.38 0.48 0.58 0.13 0.44 0.79 0.65 0.2 0.11 0.88 0.16 0.23 0.14 0.19 0.33 0.2 0.19 0.24 0.94 0.24
0.14 1.0 0.11 0.02 0.02 0.01 0.06 0.07 0.05 0.07 0.07 0.01 0.02 0.89 0.68 0.06 0.01 0.08 0.15 0.06 0.06 0.02 0.07 0.07 0.38 0.47 0.6 0.03
0.08 0.2 0.03 0.07 0.06 0.06 0.05 0.03 0.04 0.05 0.06 0.06 0.03 0.57 0.54 0.04 0.04 0.05 0.02 0.04 0.03 0.03 0.01 0.03 1.0 0.06 0.7 0.07
0.05 1.0 0.24 0.14 0.23 0.25 0.28 0.2 0.2 0.15 0.2 0.17 0.34 0.58 0.58 0.14 0.19 0.24 0.13 0.21 0.2 0.22 0.3 0.22 0.44 0.22 0.27 0.2
0.02 0.9 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.01 0.9 0.7 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.97 1.0 0.51 0.01
0.02 0.08 0.31 0.1 0.08 0.07 0.34 0.06 0.2 0.07 0.18 0.1 0.11 1.0 0.78 0.27 0.22 0.16 0.21 0.32 0.31 0.29 0.35 0.25 0.06 0.09 0.82 0.11
0.02 0.63 0.32 0.14 0.23 0.13 0.14 0.09 0.16 0.15 0.17 0.21 0.2 1.0 0.77 0.12 0.11 0.1 0.11 0.17 0.12 0.12 0.06 0.13 0.13 0.13 0.45 0.12
0.07 1.0 0.18 0.05 0.15 0.19 0.24 0.2 0.35 0.08 0.26 0.26 0.2 0.9 0.72 0.11 0.18 0.22 0.04 0.11 0.11 0.13 0.06 0.24 0.05 0.25 0.13 0.06
0.0 1.0 0.19 0.03 0.28 0.08 0.2 0.36 0.16 0.0 0.52 0.34 0.04 0.94 0.94 0.05 0.0 0.39 0.0 0.3 0.0 0.2 0.0 0.04 0.11 0.38 0.34 0.13
0.02 0.38 0.08 0.07 0.14 0.1 0.09 0.08 0.25 0.16 0.29 0.2 0.06 1.0 0.57 0.24 0.25 0.31 0.14 0.19 0.15 0.25 0.1 0.26 0.23 0.11 0.1 0.04
0.08 1.0 0.12 0.2 0.1 0.13 0.46 0.25 0.19 0.18 0.22 0.14 0.61 0.65 0.54 0.23 0.24 0.48 0.18 0.25 0.18 0.16 0.2 0.16 0.26 0.38 0.36 0.25
0.17 1.0 0.45 0.51 0.32 0.4 0.5 0.7 0.64 0.59 0.69 0.26 0.39 0.75 0.67 0.36 0.29 0.39 0.3 0.44 0.39 0.42 0.47 0.35 0.72 0.44 0.64 0.25
0.18 1.0 0.34 0.15 0.19 0.19 0.26 0.13 0.23 0.16 0.24 0.27 0.24 0.97 0.78 0.18 0.22 0.27 0.22 0.27 0.22 0.35 0.18 0.31 0.23 0.18 0.79 0.14
0.01 0.7 0.25 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.05 0.0 0.05 0.01 0.01 1.0 0.88 0.02 0.02 0.06 0.05 0.06 0.09 0.04 0.3 0.11 0.0 0.02 0.16 0.0
0.06 0.43 0.35 0.4 0.5 0.34 0.44 0.38 0.59 0.5 0.56 0.58 0.45 1.0 0.83 0.4 0.44 0.33 0.29 0.52 0.38 0.57 0.46 0.52 0.6 0.61 0.82 0.43
0.07 0.21 0.51 0.23 0.33 0.16 0.53 0.43 0.5 0.41 0.53 0.33 0.44 0.71 0.67 0.43 0.31 1.0 0.57 0.36 0.37 0.37 0.19 0.33 0.15 0.26 0.71 0.14
0.6 1.0 0.37 0.27 0.5 0.48 0.45 0.36 0.31 0.35 0.39 0.44 0.43 0.74 0.56 0.52 0.42 0.3 0.43 0.55 0.58 0.54 0.39 0.63 0.25 0.07 0.34 0.19
0.01 0.37 0.05 0.06 0.02 0.04 0.16 0.14 0.03 0.07 0.03 0.02 0.02 0.73 0.64 0.03 0.01 0.03 0.02 0.03 0.03 0.02 0.02 0.03 1.0 0.86 0.54 0.07
0.09 0.52 0.28 0.13 0.16 0.17 0.24 0.37 0.13 0.25 0.15 0.16 0.18 0.84 0.66 0.43 0.3 0.24 0.45 0.35 0.37 0.28 0.31 0.27 0.74 0.71 1.0 0.1
0.25 0.82 0.46 0.38 0.55 0.45 0.44 0.25 0.3 0.28 0.39 0.51 0.58 0.88 0.76 0.3 0.27 0.33 0.28 0.32 0.34 0.3 0.41 0.3 0.51 1.0 0.59 0.3
0.01 0.04 0.79 0.08 0.1 0.1 0.24 0.11 0.09 0.28 0.1 0.04 0.12 1.0 0.58 0.16 0.09 0.2 0.3 0.27 0.34 0.16 0.46 0.2 0.01 0.03 0.49 0.07
0.01 0.61 0.19 0.22 0.17 0.08 0.09 0.12 0.15 0.14 0.12 0.13 0.15 1.0 0.97 0.53 0.32 0.27 0.26 0.45 0.42 0.59 0.11 0.53 0.03 0.01 0.37 0.06
0.03 0.1 0.33 0.05 0.03 0.0 0.14 0.22 0.11 0.2 0.16 0.04 0.15 0.87 1.0 0.22 0.22 0.53 0.53 0.2 0.56 0.35 0.11 0.31 0.19 0.71 0.39 0.2
0.15 0.13 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.44 0.38 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 1.0 0.13 0.06 0.0
0.13 0.31 0.16 0.12 0.24 0.17 0.27 0.16 0.25 0.26 0.3 0.32 0.39 0.09 0.08 0.31 0.29 1.0 0.25 0.29 0.17 0.26 0.09 0.24 0.06 0.06 0.08 0.15
0.06 1.0 0.23 0.15 0.12 0.07 0.27 0.1 0.44 0.15 0.15 0.08 0.53 0.81 0.62 0.27 0.33 0.6 0.22 0.43 0.29 0.24 0.43 0.19 0.28 0.18 0.3 0.24
0.26 0.87 0.53 0.26 0.36 0.58 0.67 0.67 0.79 0.66 1.0 0.37 0.64 0.63 0.58 0.8 0.84 0.73 0.84 0.82 0.94 1.0 0.54 0.98 0.8 0.64 0.44 0.26
0.18 0.89 0.54 0.47 0.77 0.91 0.66 0.89 0.55 0.31 0.53 0.59 0.75 0.84 0.76 0.57 0.45 0.3 0.25 0.4 0.48 0.51 0.24 0.45 0.61 0.34 1.0 0.24
0.02 0.2 0.4 0.08 0.09 0.08 0.34 0.07 0.1 0.05 0.07 0.09 0.08 0.75 0.6 0.18 0.15 0.06 0.14 0.32 0.28 0.22 0.19 0.25 0.27 0.11 1.0 0.1
0.18 0.67 0.87 0.21 0.17 0.19 0.94 0.26 0.26 0.32 0.24 0.18 0.48 1.0 0.85 0.39 0.34 0.22 0.26 0.49 0.46 0.47 0.67 0.51 0.21 0.35 0.87 0.15
0.03 0.32 0.25 0.05 0.15 0.12 0.18 0.19 0.26 0.22 0.18 0.16 0.13 1.0 0.78 0.17 0.14 0.26 0.26 0.23 0.19 0.26 0.15 0.22 0.5 0.14 0.75 0.05
0.03 0.23 0.26 0.05 0.0 0.02 0.18 0.05 0.03 0.35 0.08 0.01 0.03 1.0 0.9 0.1 0.18 0.12 0.16 0.26 0.35 0.16 0.91 0.17 0.03 0.02 0.34 0.24
0.05 0.3 0.54 0.37 0.32 0.34 0.43 0.5 0.49 0.99 0.47 0.3 0.38 0.59 0.66 0.85 0.67 0.75 0.45 0.5 1.0 0.53 0.2 0.53 0.14 0.12 0.39 0.26
0.31 0.83 0.32 0.24 0.3 0.12 0.17 0.28 0.23 0.23 0.29 0.11 0.3 0.85 0.72 0.55 0.26 0.38 0.3 0.37 0.49 0.27 0.17 0.32 1.0 0.26 0.95 0.11
0.19 0.2 0.39 0.25 0.14 0.1 0.32 0.29 0.22 0.21 0.23 0.08 0.32 0.8 0.66 0.6 0.35 0.25 0.51 0.62 0.74 0.43 0.28 0.47 0.64 0.15 1.0 0.22
0.03 0.23 0.08 0.15 0.1 0.04 0.12 0.02 0.12 0.15 0.3 0.12 0.08 1.0 0.48 0.03 0.09 0.14 0.05 0.09 0.07 0.07 0.06 0.08 0.07 0.21 0.08 0.84
0.27 0.36 0.71 0.07 0.3 0.64 0.51 0.58 0.86 0.8 0.67 0.66 0.51 1.0 0.67 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.52 0.0 0.66 0.47 0.92 0.0
0.02 0.2 0.15 0.17 0.1 0.08 0.21 0.08 0.11 0.08 0.1 0.06 0.08 0.77 0.56 0.18 0.15 0.45 0.15 0.42 0.23 0.28 0.31 0.15 0.09 0.09 1.0 0.25
1.0 0.57 0.5 0.16 0.4 0.42 0.39 0.52 0.42 0.6 0.65 0.52 0.35 0.42 0.36 0.37 0.29 0.39 0.53 0.36 0.42 0.29 0.37 0.37 0.09 0.2 0.39 0.11
0.0 0.85 0.02 0.02 0.01 0.01 0.02 0.0 0.02 0.0 0.03 0.02 0.01 0.66 0.52 0.03 0.02 0.05 0.02 0.06 0.03 0.05 0.01 0.05 1.0 0.4 0.5 0.08
0.02 0.47 0.01 0.17 0.01 0.02 0.47 0.0 0.02 0.06 0.0 0.01 0.02 0.9 1.0 0.09 0.07 0.01 0.01 0.05 0.08 0.01 0.01 0.01 0.02 0.15 0.15 0.18
0.07 0.5 0.17 0.2 0.22 0.18 0.22 0.16 0.09 0.17 0.09 0.12 0.19 0.8 0.64 0.25 0.16 0.29 0.39 0.25 0.25 0.18 0.16 0.17 0.3 0.29 1.0 0.17
0.54 0.35 0.26 0.23 0.17 0.12 0.32 0.13 0.12 0.12 0.15 0.1 0.41 0.62 0.51 0.41 0.29 0.4 0.52 0.4 0.46 0.34 0.17 0.35 0.35 1.0 0.47 0.17
0.03 0.7 0.19 0.1 0.25 0.22 0.49 0.2 0.14 0.25 0.14 0.22 0.23 0.55 0.52 0.11 0.11 0.2 0.16 0.14 0.12 0.1 0.09 0.09 0.49 1.0 0.33 0.11
0.0 0.08 1.0 0.07 0.1 0.03 0.67 0.09 0.18 0.22 0.15 0.15 0.19 0.5 0.42 0.19 0.18 0.16 0.17 0.3 0.32 0.24 0.26 0.3 0.18 0.38 0.14 0.06
0.06 1.0 0.13 0.29 0.15 0.03 0.32 0.38 0.52 0.43 0.57 0.17 0.26 0.54 0.65 0.18 0.08 0.28 0.15 0.19 0.19 0.15 0.27 0.12 0.37 0.88 0.22 0.16
0.01 0.34 0.28 0.11 0.15 0.1 0.36 0.26 0.46 0.29 0.43 0.25 0.78 0.33 0.35 0.39 0.53 1.0 0.36 0.45 0.36 0.48 0.28 0.41 0.09 0.08 0.12 0.13
0.07 0.8 0.31 0.18 0.49 0.39 0.22 0.21 0.36 0.45 0.44 0.62 0.33 1.0 0.8 0.11 0.12 0.2 0.1 0.16 0.1 0.1 0.12 0.1 0.1 0.28 0.75 0.22
0.46 0.97 0.08 0.04 0.03 0.05 0.1 0.05 0.05 0.19 0.07 0.01 0.1 1.0 0.85 0.02 0.01 0.03 0.01 0.05 0.03 0.01 0.01 0.01 0.33 0.82 0.42 0.03
0.32 1.0 0.42 0.14 0.35 0.21 0.36 0.45 0.58 0.63 0.58 0.46 0.88 0.54 0.55 0.35 0.35 0.58 0.16 0.37 0.28 0.33 0.23 0.28 0.22 0.24 0.39 0.11
1.0 0.43 0.61 0.32 0.31 0.31 0.45 0.34 0.39 0.34 0.46 0.29 0.51 0.85 0.74 0.37 0.45 0.22 0.24 0.52 0.36 0.52 0.32 0.47 0.36 0.6 0.43 0.35
0.01 0.24 0.05 0.04 0.04 0.06 0.06 0.02 0.04 0.03 0.04 0.03 0.02 1.0 0.75 0.05 0.07 0.03 0.03 0.05 0.03 0.05 0.03 0.04 0.1 0.13 0.35 0.06
0.05 0.47 0.41 0.33 0.1 0.04 0.24 0.24 0.14 0.31 0.13 0.13 0.11 1.0 0.85 0.13 0.07 0.22 0.15 0.21 0.19 0.13 0.18 0.13 0.11 0.65 0.46 0.33
0.49 0.17 0.17 0.06 0.1 0.09 0.4 0.08 0.16 0.23 0.17 0.12 0.27 1.0 0.76 0.08 0.08 0.33 0.08 0.11 0.1 0.09 0.11 0.1 0.37 0.08 0.44 0.17
0.19 0.65 0.45 0.36 0.43 0.32 0.53 0.35 0.6 0.6 0.55 0.45 0.67 1.0 0.92 0.41 0.42 0.63 0.42 0.39 0.31 0.3 0.62 0.33 0.29 0.89 0.71 0.6
0.07 1.0 0.15 0.08 0.14 0.09 0.25 0.17 0.17 0.25 0.2 0.12 0.37 0.51 0.44 0.18 0.09 0.17 0.26 0.25 0.24 0.19 0.13 0.23 0.66 0.28 0.3 0.04
0.0 0.28 0.57 0.08 0.09 0.19 0.2 0.15 0.28 1.0 0.38 0.04 0.28 0.84 0.95 0.06 0.28 0.24 0.0 0.34 0.09 0.29 0.28 0.05 0.04 0.41 0.51 0.3
0.03 0.33 0.05 0.02 0.03 0.03 0.05 0.03 0.04 0.03 0.04 0.03 0.01 0.83 0.64 0.04 0.02 0.12 0.07 0.06 0.06 0.05 0.02 0.04 0.44 0.34 1.0 0.02
0.02 0.3 0.04 0.01 0.01 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.03 0.01 0.01 0.76 0.59 0.02 0.01 0.1 0.07 0.04 0.03 0.04 0.01 0.03 0.42 0.31 1.0 0.0
0.02 0.44 0.37 0.23 0.39 0.36 0.29 0.21 0.49 0.38 0.52 0.54 0.26 1.0 0.8 0.25 0.23 0.26 0.2 0.29 0.25 0.29 0.31 0.27 0.12 0.71 0.89 0.21
0.05 0.39 0.18 0.09 0.23 0.24 0.18 0.12 0.2 0.18 0.26 0.32 0.27 1.0 0.86 0.1 0.04 0.22 0.1 0.18 0.09 0.15 0.14 0.11 0.16 0.27 0.78 0.12
0.03 0.61 0.01 0.01 0.03 0.03 0.01 0.04 0.01 0.02 0.02 0.01 0.02 0.97 1.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.01 0.61 0.55 1.0 0.03
0.01 0.53 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.0 0.01 0.01 0.0 0.02 0.91 0.9 0.0 0.01 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.52 0.47 1.0 0.02
0.07 0.7 0.1 0.2 0.05 0.03 0.38 0.29 0.66 0.39 0.57 0.1 0.63 1.0 0.86 0.57 0.59 0.61 0.53 0.49 0.4 0.38 0.09 0.44 0.28 0.15 0.2 0.16
0.09 0.44 0.08 0.08 0.15 0.48 0.11 0.17 0.09 0.07 0.11 0.1 0.08 0.85 0.8 0.11 0.09 0.05 0.07 0.11 0.1 0.11 0.06 0.11 0.08 0.09 1.0 0.1
0.03 0.39 0.27 0.08 0.1 0.14 0.23 0.2 0.1 0.25 0.13 0.07 0.12 0.59 0.61 0.11 0.11 0.06 0.07 0.12 0.11 0.1 0.15 0.11 1.0 0.5 0.57 0.08
0.03 0.63 0.04 0.02 0.04 0.03 0.03 0.02 0.03 0.02 0.04 0.05 0.02 0.37 0.43 0.04 0.04 0.02 0.05 0.06 0.05 0.05 0.03 0.06 1.0 0.49 0.11 0.03
0.24 0.98 0.52 0.29 0.6 0.47 0.44 0.46 0.45 0.39 0.48 0.66 0.43 0.87 0.7 0.29 0.34 0.75 0.33 0.37 0.27 0.38 0.3 0.34 1.0 0.73 0.62 0.23

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)