1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_88 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

 Transpose table  Download table
Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.01 0.08 0.39 0.41 0.09 0.07 0.41 0.27 0.13 0.35 0.08 0.05 0.96 0.17 0.2 1.0 0.6 0.54 0.34 0.27 0.71 0.37 0.12 0.32 0.01 0.04 0.83 0.31
0.45 0.38 0.83 0.55 0.62 0.92 0.8 0.78 0.27 0.54 0.3 0.32 0.73 0.57 0.55 0.64 0.44 0.73 0.34 0.68 0.54 0.5 0.49 0.44 1.0 0.35 0.54 0.65
0.0 0.1 0.38 0.38 0.88 0.18 0.3 0.55 0.21 0.51 0.75 0.62 0.37 0.12 0.14 0.13 0.25 0.5 0.3 1.0 0.42 0.42 0.55 0.45 0.0 0.78 0.26 0.54
0.77 0.03 0.63 0.36 0.68 0.15 0.6 0.35 0.55 0.29 0.41 0.23 1.0 0.07 0.05 0.47 0.14 0.28 0.25 0.43 0.37 0.24 0.24 0.32 0.07 0.8 0.17 0.13
0.43 0.06 0.46 0.33 1.0 0.81 0.5 0.61 0.73 0.56 0.77 0.91 0.75 0.28 0.28 0.5 0.6 0.47 0.33 0.5 0.37 0.57 0.45 0.46 0.22 0.36 0.32 0.59
0.08 0.05 0.52 0.21 1.0 0.41 0.21 0.28 0.46 0.39 0.29 0.51 0.47 0.26 0.23 0.45 0.23 0.36 0.29 0.28 0.3 0.31 0.17 0.26 0.25 0.19 0.77 0.3
0.14 0.21 0.63 0.36 0.89 0.9 0.33 0.57 0.66 0.35 0.8 1.0 0.54 0.37 0.32 0.33 0.35 0.93 0.97 0.57 0.44 0.63 0.3 0.64 0.26 0.63 0.37 0.39
0.11 0.03 0.68 0.31 0.45 0.12 0.51 0.18 0.32 0.18 0.3 0.23 0.56 0.06 0.06 0.34 0.26 1.0 0.35 0.32 0.31 0.32 0.25 0.25 0.86 0.18 0.05 0.25
0.02 0.11 1.0 0.19 0.14 0.07 0.37 0.03 0.02 0.01 0.02 0.08 0.14 0.12 0.12 0.1 0.13 0.49 0.19 0.25 0.26 0.25 0.39 0.18 0.38 0.02 0.19 0.17
0.01 0.12 0.28 0.1 0.23 0.32 0.49 0.13 0.11 0.17 0.13 0.18 0.2 0.08 0.07 0.09 0.1 0.21 0.05 0.13 0.14 0.12 0.19 0.14 0.07 0.02 0.12 1.0
0.02 0.01 0.02 0.07 0.02 0.05 0.74 0.11 0.01 0.19 0.03 0.01 0.26 0.02 0.03 0.13 0.11 0.16 0.05 0.11 0.05 0.07 0.06 0.04 0.01 0.03 0.04 1.0
0.03 0.12 0.33 0.37 0.29 0.24 0.58 0.15 0.2 0.19 0.21 0.26 1.0 0.14 0.14 0.38 0.35 0.73 0.49 0.39 0.31 0.3 0.17 0.32 0.19 0.09 0.16 0.33
0.12 0.32 0.47 0.66 0.49 0.48 0.63 0.67 0.73 0.54 0.88 0.52 0.84 0.33 0.32 1.0 0.65 0.61 0.65 0.92 1.0 0.82 0.51 0.82 0.08 0.22 0.35 0.55
0.18 0.31 0.73 0.54 0.84 0.71 0.53 0.79 0.8 0.59 0.75 0.63 0.54 0.47 0.5 1.0 0.84 0.99 0.91 0.85 0.78 0.81 0.59 0.77 0.3 0.39 0.79 0.49
0.45 0.28 0.82 0.46 0.6 0.44 0.62 0.52 0.62 0.41 0.58 0.5 0.43 0.45 0.46 0.65 0.65 0.34 1.0 0.74 0.58 0.72 0.57 0.67 0.2 0.38 0.49 0.51
0.24 0.24 0.47 0.32 0.63 0.83 0.66 0.34 0.6 0.57 0.56 0.74 0.58 0.88 0.74 0.4 0.35 0.31 0.23 0.58 0.49 0.53 0.32 0.47 0.42 0.89 1.0 0.74
0.42 0.44 0.67 0.25 0.52 0.67 0.72 0.42 0.57 0.47 0.58 0.51 0.76 1.0 0.89 0.39 0.42 0.66 0.59 0.58 0.5 0.6 0.6 0.47 0.31 0.65 0.75 0.66
0.03 0.1 0.55 0.3 0.79 0.32 0.66 0.36 0.57 0.61 0.7 0.95 1.0 0.27 0.28 0.62 0.84 0.69 0.44 0.81 0.63 0.81 0.28 0.9 0.17 0.27 0.38 0.38
0.08 0.23 0.36 0.45 0.38 0.32 0.51 0.38 0.4 0.58 0.47 0.38 0.65 0.49 0.55 0.68 0.48 0.76 0.44 0.68 0.66 0.73 1.0 0.78 0.27 0.29 0.57 0.97
0.14 0.05 0.25 0.45 0.5 0.81 0.59 0.32 0.29 0.38 0.26 0.42 0.73 0.13 0.13 0.26 0.29 0.32 0.37 0.47 0.32 0.34 0.43 0.34 0.06 1.0 0.15 0.59
0.11 0.11 1.0 0.53 0.52 0.47 0.8 0.5 0.81 0.47 0.86 0.55 0.87 0.44 0.46 0.67 0.53 0.63 0.29 0.77 0.62 0.82 0.51 0.72 0.1 0.83 0.45 0.5
0.11 0.51 1.0 0.64 0.48 0.26 0.85 0.29 0.41 0.35 0.39 0.48 0.92 0.25 0.23 0.63 0.44 0.36 0.59 0.56 0.71 0.6 0.24 0.7 0.18 0.13 0.2 0.32
0.02 0.03 0.65 0.35 0.78 0.23 0.31 0.53 0.54 0.31 0.44 0.56 0.78 0.08 0.1 1.0 0.45 0.34 0.43 0.6 0.75 0.64 0.16 0.73 0.04 0.01 0.2 0.09
0.03 0.08 0.45 0.22 0.7 0.33 0.28 1.0 0.57 0.79 0.43 0.33 0.31 0.14 0.14 0.63 0.29 0.32 0.29 0.47 0.57 0.35 0.24 0.47 0.07 0.14 0.51 0.12
0.11 0.61 0.73 0.54 0.85 0.71 0.59 0.84 0.66 0.93 0.55 0.49 0.98 0.68 0.7 0.9 0.65 0.77 0.47 0.91 0.81 0.71 1.0 0.69 0.49 0.62 0.84 0.39
0.05 0.23 0.74 0.28 0.68 0.51 0.63 0.48 0.31 1.0 0.36 0.32 0.59 0.33 0.32 0.45 0.38 0.54 0.14 0.36 0.47 0.45 0.46 0.34 0.2 0.59 0.67 0.26
0.14 0.3 0.28 0.37 0.34 0.31 0.37 0.28 0.41 0.32 0.36 0.3 0.35 0.34 0.3 0.26 0.2 0.66 0.33 0.4 0.2 0.3 0.47 0.21 0.19 1.0 0.44 0.29
0.27 0.58 0.48 0.46 0.44 0.43 0.44 0.66 0.66 0.59 0.72 0.28 0.35 0.36 0.47 1.0 0.68 0.44 0.49 1.0 0.85 0.9 0.61 0.64 0.56 0.55 0.59 0.22
0.04 0.25 0.19 0.47 0.74 0.79 0.45 0.6 0.36 0.41 0.27 0.6 1.0 0.4 0.47 0.08 0.1 0.0 0.16 0.13 0.06 0.21 0.45 0.15 0.08 0.34 0.28 0.56
0.1 0.36 0.69 0.49 0.57 0.81 0.98 0.38 0.5 0.36 0.41 0.26 0.94 0.46 0.44 0.86 0.49 0.79 1.0 0.91 0.69 0.74 0.42 0.72 0.75 0.36 0.8 0.39
1.0 0.46 0.45 0.25 0.82 0.46 0.34 0.56 0.47 0.42 0.4 0.4 0.54 0.14 0.21 0.26 0.29 0.62 0.27 0.31 0.2 0.36 0.7 0.37 0.8 0.79 0.5 0.23
0.29 0.38 0.28 0.44 0.55 0.25 0.33 0.74 0.41 0.5 0.33 0.26 0.81 0.45 0.59 0.71 0.28 0.38 0.15 0.45 0.48 0.3 0.43 0.25 0.44 0.53 1.0 0.32
0.02 0.01 1.0 0.31 0.29 0.03 0.11 0.0 0.01 0.0 0.02 0.47 0.5 0.02 0.03 0.08 0.11 0.02 0.34 0.15 0.05 0.13 0.87 0.19 0.35 0.01 0.04 0.04
0.13 0.1 0.03 0.02 0.02 0.05 0.42 0.02 0.01 0.11 0.01 0.0 0.01 0.15 0.19 0.07 0.09 0.08 0.04 0.06 0.1 0.06 0.01 0.08 0.3 0.05 0.1 1.0
0.07 0.02 0.37 0.12 0.39 0.22 0.55 0.24 0.17 0.23 0.28 0.86 0.66 0.03 0.05 0.33 0.41 1.0 0.38 0.51 0.52 0.77 0.19 0.79 0.01 0.02 0.14 0.22
0.08 0.22 0.52 0.33 0.47 0.18 0.39 0.4 0.27 0.34 0.25 0.16 1.0 0.22 0.19 0.43 0.26 0.75 0.42 0.36 0.42 0.34 0.21 0.32 0.41 0.02 0.31 0.11
0.32 0.45 0.44 0.5 0.67 0.47 0.4 0.44 0.49 0.41 0.45 0.58 0.41 0.4 0.4 0.77 0.49 0.8 1.0 0.72 0.69 0.66 0.65 0.69 0.42 0.28 0.61 0.51
0.21 0.08 0.83 0.38 0.8 0.22 1.0 0.8 0.49 0.7 0.73 0.56 0.73 0.08 0.19 0.26 0.23 0.81 0.36 0.61 0.59 0.51 0.94 0.58 0.1 0.45 0.17 0.12
0.04 0.23 0.38 0.46 0.37 0.48 0.91 0.61 0.17 0.27 0.16 0.2 0.97 0.23 0.18 0.58 0.52 1.0 0.27 0.54 0.55 0.51 0.12 0.51 0.33 0.07 0.3 0.63
0.0 0.0 0.19 0.24 0.16 0.04 0.22 0.09 0.05 0.06 0.02 0.03 0.18 0.01 0.01 1.0 0.18 0.41 0.29 0.43 0.3 0.24 0.03 0.22 0.01 0.07 0.02 0.07
0.14 0.26 0.59 0.52 0.46 0.68 0.83 0.41 0.23 0.79 0.34 0.24 1.0 0.29 0.26 0.52 0.61 0.74 0.31 0.48 0.7 0.45 0.19 0.46 0.38 0.2 0.4 0.44
0.03 0.04 0.56 0.22 0.23 0.05 0.29 0.26 0.36 0.18 0.22 0.07 0.11 0.05 0.06 1.0 0.18 0.4 0.38 0.82 0.65 0.42 0.16 0.75 0.01 0.36 0.25 0.04
0.26 0.45 0.32 0.39 0.65 0.46 0.37 0.55 0.53 0.53 0.51 0.51 0.42 0.41 0.41 0.72 0.49 1.0 0.61 0.66 0.7 0.61 0.51 0.57 0.37 0.56 0.44 0.37
0.09 0.31 0.73 0.3 0.57 0.37 0.48 0.66 0.49 0.35 0.58 0.46 0.38 0.32 0.31 0.55 0.43 0.49 1.0 0.52 0.67 0.56 0.34 0.83 0.25 0.32 0.38 0.11
0.92 0.47 0.41 0.65 0.52 0.63 0.57 0.6 0.42 0.44 0.39 0.37 1.0 0.58 0.53 0.77 0.59 0.77 0.63 0.54 0.56 0.54 0.51 0.53 0.71 0.69 0.65 0.47
0.95 0.23 0.75 0.42 0.98 0.68 0.55 0.51 0.48 0.6 0.28 0.64 0.6 0.36 0.28 0.97 0.31 0.57 0.25 0.74 0.88 0.65 0.7 0.54 0.18 1.0 0.91 0.16
0.08 0.14 0.66 0.63 0.46 0.34 0.51 0.21 0.27 0.23 0.25 0.42 0.99 0.11 0.1 0.68 0.71 1.0 0.38 0.6 0.56 0.59 0.14 0.52 0.16 0.13 0.32 0.29
0.24 0.3 0.61 0.4 0.47 0.28 0.52 0.47 0.44 0.48 0.4 0.29 0.41 0.35 0.34 0.45 0.38 0.51 1.0 0.44 0.48 0.42 0.33 0.41 0.22 0.23 0.51 0.2
0.17 0.43 0.47 0.41 0.79 0.56 0.4 0.52 0.38 0.5 0.39 0.52 0.71 0.47 0.47 0.67 0.52 1.0 0.23 0.58 0.69 0.52 0.64 0.43 0.33 0.77 0.56 0.4
0.12 0.34 0.51 0.33 0.5 0.32 0.48 0.37 0.32 0.41 0.38 0.41 0.43 0.48 0.46 0.46 0.32 0.45 1.0 0.46 0.36 0.42 0.45 0.32 0.14 0.42 0.63 0.4
0.14 0.4 0.62 0.46 0.49 0.69 0.29 0.86 0.65 0.41 0.71 0.26 0.38 0.4 0.46 0.46 0.41 0.65 1.0 0.57 0.5 0.5 0.4 0.59 0.45 0.25 0.64 0.19
0.07 0.07 0.94 0.31 0.63 0.13 0.74 0.4 0.55 0.54 0.26 0.26 0.33 0.21 0.17 0.49 0.22 1.0 0.14 0.45 0.28 0.38 0.26 0.3 0.2 0.15 0.57 0.17
0.01 0.0 1.0 0.24 0.19 0.13 0.21 0.01 0.01 0.02 0.02 0.15 0.07 0.01 0.01 0.09 0.13 0.29 0.19 0.38 0.32 0.55 0.73 0.38 0.01 0.04 0.02 0.24
0.31 0.65 0.89 0.49 0.61 0.39 0.55 0.89 0.85 0.74 1.0 0.36 0.35 0.33 0.35 0.72 0.59 0.86 0.62 0.93 0.7 0.85 0.39 0.82 0.26 0.48 0.55 0.3
0.16 0.76 0.65 0.39 0.79 0.52 0.5 1.0 0.47 0.65 0.6 0.41 0.59 0.63 0.51 0.64 0.46 0.49 0.88 0.54 0.62 0.45 0.39 0.56 0.84 0.68 0.64 0.26
0.25 0.08 0.65 0.23 0.44 0.11 0.48 0.55 1.0 0.57 0.66 0.28 0.54 0.09 0.11 0.0 0.0 0.39 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.26 0.09 0.46 0.0
0.07 0.06 0.53 0.53 0.45 0.33 0.74 0.5 0.58 0.32 0.74 0.37 1.0 0.18 0.21 0.64 0.72 0.36 0.37 0.4 0.46 0.37 0.33 0.42 0.04 0.47 0.23 0.42
0.01 0.04 0.38 0.32 0.16 0.15 0.32 0.06 0.06 0.07 0.07 0.14 0.42 0.14 0.15 0.36 0.41 1.0 0.58 0.26 0.22 0.35 0.18 0.28 0.01 0.07 0.09 0.29
0.4 0.37 0.58 0.43 0.82 0.74 0.41 0.9 0.32 0.59 0.34 0.29 0.47 0.35 0.36 0.9 0.72 0.45 1.0 0.85 0.79 0.72 0.41 0.65 0.38 0.44 0.71 0.25
1.0 0.18 0.08 0.23 0.1 0.04 0.28 0.44 0.06 0.33 0.06 0.08 0.39 0.11 0.15 0.13 0.22 0.26 0.37 0.31 0.25 0.28 0.9 0.1 0.06 0.28 0.1 0.07
0.0 0.0 0.66 0.11 0.05 0.02 1.0 0.16 0.13 0.46 0.07 0.06 0.16 0.04 0.04 0.42 0.26 0.2 0.16 0.69 0.28 0.44 0.35 0.37 0.0 0.0 0.22 0.15
0.03 0.12 0.83 0.53 0.75 0.33 0.65 0.33 0.39 0.3 0.35 0.46 0.64 0.14 0.15 1.0 0.67 0.33 0.54 0.72 0.73 0.69 0.18 0.69 0.04 0.1 0.18 0.36
0.2 0.22 1.0 0.41 0.57 0.58 0.53 0.77 0.57 0.39 0.62 0.32 0.59 0.27 0.27 0.4 0.37 0.48 0.85 0.49 0.47 0.5 0.39 0.52 0.29 0.15 0.5 0.18
0.71 0.19 0.82 0.58 0.36 0.27 0.82 0.44 0.5 0.33 0.59 0.29 0.42 0.33 0.3 1.0 0.69 0.38 0.54 0.94 0.94 0.75 0.53 0.81 0.44 0.86 0.42 0.44

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)