Heatmap: Cluster_57 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.07 0.37 0.85 0.17 0.31 0.28 0.93 0.47 0.65 0.67 0.62 0.42 0.5 0.68 0.63 0.56 0.38 0.41 0.43 0.67 0.5 0.57 0.33 0.61 0.3 0.58 1.0 0.28
0.25 0.58 0.39 0.45 0.4 0.32 0.43 0.35 0.55 0.35 0.62 0.45 0.35 0.93 0.97 0.37 0.41 0.33 0.31 0.52 0.35 0.46 0.62 0.46 0.47 1.0 0.77 0.8
0.02 0.32 0.41 0.31 0.57 0.31 0.42 0.37 0.46 0.42 0.63 0.74 0.39 0.98 0.84 0.42 0.32 0.3 0.52 0.38 0.23 0.28 0.44 0.32 0.2 1.0 0.77 0.31
0.04 0.3 1.0 0.25 0.81 0.65 0.82 0.55 0.86 0.83 0.85 0.78 0.83 0.69 0.59 0.4 0.3 0.99 0.38 0.49 0.44 0.49 0.42 0.45 0.2 0.2 0.78 0.29
0.07 0.46 0.71 0.33 0.82 0.82 0.87 0.55 0.82 0.98 0.93 0.94 0.73 1.0 0.83 0.23 0.24 0.68 0.24 0.35 0.24 0.36 0.33 0.33 0.39 0.19 0.93 0.35
0.01 1.0 0.17 0.25 0.17 0.1 0.1 0.03 0.08 0.08 0.09 0.16 0.2 0.47 0.45 0.16 0.09 0.14 0.21 0.16 0.11 0.08 0.07 0.13 0.2 0.76 0.28 0.23
0.06 0.26 0.57 0.29 0.48 0.34 1.0 0.45 0.82 0.52 0.89 0.75 0.66 0.69 0.64 0.44 0.47 0.29 0.29 0.47 0.36 0.42 0.5 0.44 0.13 0.53 0.52 0.63
0.24 0.83 0.82 0.45 0.74 0.67 0.75 0.55 0.53 0.67 0.6 0.66 0.74 0.89 0.84 0.94 0.73 0.46 0.49 0.84 0.88 0.85 0.59 0.76 0.63 1.0 0.85 0.77
0.06 1.0 0.33 0.43 0.36 0.33 0.37 0.24 0.48 0.15 0.49 0.59 0.31 0.72 0.74 0.42 0.43 0.33 0.31 0.58 0.46 0.6 0.52 0.49 0.44 0.79 0.59 0.67
0.07 0.68 0.14 0.36 0.41 0.3 0.34 0.17 0.35 0.37 0.46 0.51 0.38 1.0 1.0 0.44 0.43 0.38 0.25 0.24 0.28 0.35 0.68 0.43 0.39 0.85 0.49 0.79
0.39 0.71 0.77 0.41 0.97 0.79 0.71 0.45 0.76 0.46 0.83 0.97 0.27 0.91 0.97 0.86 0.73 0.46 0.52 1.0 0.79 0.92 0.89 0.89 0.7 0.84 0.75 0.57
0.1 0.78 0.62 0.37 0.56 0.51 0.74 0.41 0.76 0.49 0.9 0.6 0.67 1.0 0.88 0.72 0.65 0.69 0.74 0.88 0.79 0.65 0.48 0.77 0.35 0.72 0.72 0.49
0.15 0.34 1.0 0.17 0.55 0.49 0.66 0.47 0.96 0.52 0.67 0.77 0.46 0.76 0.72 0.17 0.32 0.42 0.09 0.28 0.23 0.28 0.69 0.21 0.46 0.35 0.8 0.46
0.09 0.65 0.79 0.32 0.56 0.5 0.67 0.52 0.84 0.71 0.75 0.69 0.56 0.95 1.0 0.58 0.68 0.71 0.49 0.75 0.56 0.82 0.82 0.67 0.62 0.71 0.83 0.6
0.15 0.84 1.0 0.17 0.35 0.32 0.92 0.41 0.39 0.52 0.45 0.37 0.64 0.64 0.5 0.4 0.32 0.24 0.34 0.52 0.51 0.44 0.46 0.49 0.55 0.97 0.57 0.48
0.07 0.3 0.77 0.22 0.29 0.33 0.82 0.48 0.75 0.85 0.86 0.25 0.42 0.6 0.58 0.39 0.41 0.25 0.19 0.44 0.4 0.49 0.4 0.46 0.28 0.46 1.0 0.45
0.02 0.88 0.59 0.23 0.44 0.34 0.49 0.6 0.83 0.78 0.75 0.55 0.58 1.0 0.83 0.26 0.2 0.63 0.19 0.36 0.23 0.29 0.81 0.34 0.56 0.4 0.62 0.23
0.14 0.54 0.68 0.3 0.33 0.32 0.63 0.39 0.53 0.45 0.63 0.42 0.39 0.87 0.79 0.52 0.6 0.39 0.26 0.69 0.52 0.63 1.0 0.61 0.38 0.56 0.65 0.39
0.01 0.02 0.08 0.14 0.04 0.02 0.05 0.02 0.05 0.05 0.07 0.05 0.15 0.64 0.78 0.06 0.01 0.07 0.05 0.1 0.05 0.05 0.06 0.07 0.07 1.0 0.34 0.08
0.07 0.27 0.72 0.17 0.55 0.44 0.4 0.64 0.89 0.72 1.0 0.67 0.48 0.7 0.61 0.3 0.17 0.48 0.23 0.38 0.38 0.32 0.36 0.33 0.21 0.76 0.54 0.17
0.03 0.06 0.3 0.12 0.28 0.2 0.19 0.09 0.19 0.16 0.2 0.22 0.33 0.94 1.0 0.13 0.16 0.19 0.12 0.2 0.16 0.13 0.26 0.17 0.07 0.49 0.81 0.18
0.08 0.22 0.17 0.1 0.12 0.18 0.16 0.18 0.24 0.2 0.33 0.19 0.13 1.0 0.96 0.13 0.15 0.2 0.12 0.16 0.09 0.15 0.34 0.15 0.14 0.61 0.62 0.09
0.25 0.4 0.39 0.28 0.47 0.46 0.63 0.37 0.7 0.38 0.7 0.6 0.46 0.71 0.8 0.28 0.37 0.41 0.17 0.4 0.3 0.43 0.7 0.39 0.39 1.0 0.58 0.47
0.07 0.47 0.68 0.41 0.58 0.55 0.7 0.45 0.5 0.77 0.49 0.65 0.44 1.0 0.77 0.43 0.31 0.3 0.29 0.44 0.47 0.42 0.38 0.37 0.29 0.79 0.81 0.51
0.69 0.77 0.56 0.43 0.44 0.4 0.65 0.5 0.53 0.47 0.58 0.62 0.4 0.98 1.0 0.56 0.54 0.4 0.31 0.7 0.54 0.79 0.7 0.79 0.67 0.67 0.74 0.62
0.03 0.52 0.57 0.51 0.65 0.56 0.34 0.23 0.73 0.55 0.72 0.87 0.55 0.86 0.84 0.29 0.42 0.33 0.44 0.46 0.27 0.44 0.37 0.36 0.22 1.0 0.49 0.79
0.07 0.46 0.51 0.33 0.51 0.67 0.7 0.45 0.67 0.79 0.64 0.67 0.52 1.0 0.88 0.44 0.5 0.43 0.22 0.53 0.48 0.52 0.65 0.4 0.41 0.69 0.8 0.63
0.04 0.57 0.45 0.36 0.39 0.38 0.32 0.14 0.41 0.25 0.43 0.55 0.4 0.92 0.85 0.13 0.29 0.22 0.03 0.2 0.16 0.31 0.41 0.24 0.39 0.5 1.0 0.6
0.46 0.82 0.52 0.48 0.71 0.67 0.53 0.37 0.62 0.54 0.53 0.76 0.48 1.0 0.97 0.53 0.62 0.43 0.34 0.62 0.6 0.62 0.69 0.52 0.38 0.95 0.98 0.78
0.31 0.48 0.56 0.33 0.62 0.69 0.79 0.65 0.76 0.87 1.0 0.48 0.58 0.97 0.96 0.55 0.55 0.53 0.4 0.66 0.51 0.55 0.71 0.52 0.47 0.82 0.7 0.46
0.05 0.46 0.32 0.34 0.53 0.37 0.28 0.2 0.48 0.5 0.42 0.68 0.34 0.58 0.56 0.21 0.27 0.33 0.11 0.32 0.14 0.2 0.25 0.19 0.26 1.0 0.53 0.47
0.23 0.84 0.54 0.21 0.5 0.67 0.66 0.36 0.62 0.37 0.77 0.67 0.49 0.76 0.68 0.28 0.33 1.0 0.22 0.33 0.3 0.39 0.42 0.35 0.51 0.32 0.71 0.28
0.22 0.35 0.54 0.32 0.67 0.47 0.41 0.33 0.65 0.61 0.61 0.85 0.52 0.73 0.68 0.18 0.21 0.5 0.12 0.29 0.2 0.23 0.48 0.22 0.35 1.0 0.66 0.35
0.09 0.56 0.87 0.27 0.49 0.38 1.0 0.59 0.83 0.71 0.78 0.51 0.73 0.86 0.76 0.66 0.62 0.8 0.69 0.94 0.97 0.84 0.71 0.95 0.49 0.81 0.86 0.83
0.06 0.49 0.4 0.33 0.41 0.25 0.39 0.16 0.37 0.29 0.32 0.54 0.4 1.0 0.95 0.21 0.2 0.31 0.14 0.32 0.23 0.23 0.51 0.23 0.4 0.93 0.81 0.5
0.02 0.12 0.3 0.2 0.03 0.03 0.05 0.02 0.03 0.03 0.03 0.03 0.04 0.98 1.0 0.27 0.07 0.15 0.18 0.92 0.27 0.21 0.34 0.29 0.02 0.2 0.59 0.56
0.11 0.43 0.51 0.41 0.66 0.59 0.62 0.26 0.74 0.53 0.67 0.84 0.75 1.0 0.85 0.38 0.48 0.25 0.13 0.46 0.32 0.42 0.36 0.37 0.28 0.71 0.92 0.68
0.63 0.29 0.53 0.43 0.37 0.32 0.5 0.31 0.45 0.29 0.47 0.45 0.41 0.94 0.9 0.49 0.54 0.38 0.51 0.6 0.47 0.67 0.67 0.46 1.0 0.66 0.79 0.76
0.29 0.58 0.71 0.29 0.47 0.38 0.63 0.44 0.49 0.42 0.49 0.45 0.45 1.0 1.0 0.43 0.47 0.29 0.26 0.51 0.4 0.49 0.86 0.5 0.61 0.74 0.87 0.44
0.11 0.27 0.41 0.36 0.54 0.6 0.59 0.41 0.6 0.42 0.66 0.74 0.49 0.59 0.57 0.47 0.55 0.36 0.27 0.57 0.46 0.56 0.48 0.5 0.39 1.0 0.53 0.44
0.09 0.32 0.16 0.2 0.59 0.42 0.29 0.11 0.17 0.15 0.22 0.64 0.22 0.61 0.64 0.07 0.1 0.15 0.07 0.08 0.05 0.11 0.13 0.09 0.32 1.0 0.54 0.16
0.2 0.64 0.45 0.36 0.71 0.35 0.31 0.28 0.69 0.72 0.7 1.0 0.45 0.99 0.84 0.2 0.25 0.37 0.13 0.39 0.18 0.26 0.35 0.21 0.28 0.87 0.78 0.56
0.01 1.0 0.32 0.24 0.31 0.2 0.16 0.15 0.43 0.28 0.28 0.41 0.32 0.62 0.59 0.23 0.2 0.12 0.13 0.3 0.14 0.2 0.22 0.19 0.1 0.62 0.57 0.46
0.71 1.0 0.31 0.28 0.29 0.26 0.3 0.13 0.49 0.21 0.58 0.45 0.25 0.5 0.56 0.24 0.13 0.15 0.33 0.32 0.23 0.31 0.49 0.27 0.04 0.5 0.24 0.41
0.16 0.58 0.69 0.42 0.36 0.29 0.58 0.17 0.67 0.23 0.48 0.55 0.45 0.67 0.69 0.26 0.36 0.37 0.28 0.47 0.31 0.45 0.36 0.3 0.59 1.0 0.62 0.91
0.03 0.58 0.65 0.14 0.26 0.16 0.26 0.32 0.51 0.29 0.58 0.3 0.21 0.96 1.0 0.62 0.48 0.96 0.77 0.64 0.69 0.65 0.76 0.73 0.17 0.42 0.82 0.42
0.11 0.45 0.87 0.2 0.32 0.23 0.44 0.16 0.35 0.15 0.39 0.33 0.4 0.88 0.87 0.82 0.79 0.6 0.91 1.0 0.86 0.99 0.82 0.93 0.59 0.24 0.81 0.66
0.04 0.29 0.43 0.31 0.29 0.14 0.25 0.28 0.75 0.72 0.53 0.38 0.19 0.95 1.0 0.33 0.22 0.29 0.18 0.55 0.39 0.33 0.54 0.38 0.38 0.65 0.79 0.43
0.15 0.5 0.27 0.27 0.39 0.42 0.24 0.43 0.52 0.42 0.44 0.43 0.26 1.0 1.0 0.33 0.33 0.49 0.29 0.39 0.37 0.5 0.67 0.45 0.48 0.7 0.68 0.45
0.09 0.3 0.53 0.39 0.46 0.37 0.47 0.37 0.6 0.49 0.58 0.56 0.4 1.0 0.91 0.42 0.39 0.22 0.21 0.5 0.34 0.49 0.56 0.45 0.27 0.81 0.96 0.44
0.3 1.0 0.58 0.52 0.57 0.5 0.6 0.44 0.57 0.49 0.68 0.62 0.49 0.55 0.53 0.61 0.52 0.41 0.41 0.65 0.56 0.6 0.46 0.62 0.44 0.56 0.5 0.51
0.28 0.73 0.49 0.36 0.39 0.38 0.38 0.28 0.55 0.31 0.44 0.52 0.31 1.0 0.97 0.32 0.35 0.29 0.45 0.51 0.36 0.44 0.59 0.4 0.9 0.83 0.71 0.69
0.1 1.0 0.45 0.42 0.4 0.31 0.46 0.24 0.51 0.4 0.51 0.51 0.34 0.68 0.65 0.65 0.41 0.47 0.54 0.65 0.63 0.59 0.52 0.61 0.81 0.45 0.51 0.56
0.02 0.2 0.3 0.11 0.26 0.17 0.24 0.12 0.27 0.17 0.26 0.33 0.25 0.79 0.75 0.19 0.15 0.09 0.09 0.18 0.15 0.17 0.24 0.16 0.2 1.0 0.47 0.13
0.18 0.96 0.62 0.51 0.57 0.74 0.63 0.43 0.52 0.65 0.55 0.51 0.63 0.86 0.74 0.46 0.49 0.45 0.38 0.54 0.5 0.53 0.47 0.45 0.83 1.0 0.94 0.61
0.13 0.53 0.37 0.14 0.5 0.47 0.58 0.54 0.61 0.72 0.66 0.55 0.62 0.78 0.72 0.35 0.41 0.37 0.15 0.42 0.4 0.42 0.54 0.39 0.46 1.0 0.62 0.53
0.05 0.79 0.7 0.52 0.45 0.4 0.38 0.26 0.48 0.5 0.56 0.54 0.4 0.95 0.78 0.62 0.52 0.37 0.8 0.79 0.51 0.69 0.34 0.66 0.69 0.63 0.86 1.0
0.3 0.46 0.32 0.35 0.5 0.6 0.46 0.31 0.36 0.42 0.33 0.55 0.44 0.85 0.75 0.49 0.41 0.41 0.38 0.45 0.51 0.44 0.47 0.38 0.83 1.0 0.64 0.66
0.1 0.05 0.14 0.12 0.43 0.48 0.05 0.11 0.28 0.04 0.17 0.57 0.0 0.2 0.3 0.13 0.07 0.07 0.09 0.0 0.11 0.05 0.08 0.03 0.14 1.0 0.47 0.0
0.14 0.59 0.75 0.24 0.52 0.43 0.82 0.61 0.9 0.96 0.9 0.59 1.0 0.62 0.59 0.41 0.47 0.8 0.6 0.7 0.58 0.7 0.55 0.67 0.33 0.39 0.46 0.4
0.21 0.52 0.77 0.21 0.7 0.85 0.68 0.69 0.83 0.83 0.82 0.75 0.9 0.8 0.94 0.42 0.58 0.72 0.9 0.53 0.36 0.89 0.76 0.67 0.75 1.0 0.72 0.46
0.14 0.43 0.85 0.2 0.69 0.71 0.76 0.42 0.62 0.78 0.67 0.8 0.76 1.0 0.86 0.23 0.21 0.81 0.16 0.32 0.2 0.26 0.41 0.25 0.39 0.32 0.92 0.32
0.07 0.69 0.26 0.37 0.52 0.51 0.36 0.26 0.41 0.46 0.41 0.59 0.41 1.0 0.82 0.15 0.2 0.38 0.08 0.19 0.1 0.19 0.53 0.16 0.35 0.91 0.73 0.55
0.03 0.39 0.19 0.18 0.53 0.41 0.18 0.41 0.62 0.76 0.73 0.7 0.3 0.7 0.63 0.21 0.31 0.4 0.16 0.46 0.21 0.28 0.43 0.27 0.15 1.0 0.5 0.35
0.29 0.56 0.48 0.45 0.53 0.36 0.49 0.54 0.55 0.57 0.57 0.59 0.54 0.99 1.0 0.47 0.4 0.44 0.27 0.49 0.44 0.53 0.65 0.48 0.65 0.72 0.8 0.41

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)