Heatmap: Cluster_120 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.28 0.33 0.57 0.46 0.32 0.17 0.57 0.17 0.72 0.25 0.4 0.6 0.46 0.87 0.81 0.3 0.28 0.51 0.24 0.49 0.18 0.41 0.87 0.23 0.18 0.56 0.58 1.0
0.22 0.07 0.24 0.52 0.38 0.65 0.38 0.31 0.32 0.28 0.35 0.4 0.24 0.28 0.35 0.73 0.58 0.27 0.68 0.68 0.71 0.59 0.49 0.62 0.34 0.25 0.27 1.0
0.11 0.15 0.17 0.34 0.65 1.0 0.44 0.19 0.25 0.21 0.25 0.47 0.24 0.32 0.26 0.15 0.15 0.13 0.13 0.19 0.09 0.16 0.09 0.13 0.15 0.29 0.56 0.26
0.15 0.29 0.3 0.47 0.61 1.0 0.16 0.12 0.26 0.16 0.22 0.67 0.12 0.42 0.39 0.39 0.31 0.23 0.31 0.35 0.31 0.34 0.33 0.28 0.34 0.23 0.4 0.87
0.09 0.16 0.57 0.76 0.24 0.24 0.6 0.14 0.42 0.41 0.37 0.42 0.57 0.65 0.65 0.48 0.34 0.35 0.22 0.71 0.49 0.41 0.59 0.47 0.05 1.0 0.61 0.32
0.19 0.15 0.75 0.69 0.32 0.24 0.76 0.28 0.58 0.2 0.43 0.29 0.58 0.43 0.45 0.89 1.0 0.37 0.84 0.88 0.82 0.89 0.6 0.85 0.31 0.4 0.42 0.81
0.34 0.75 0.77 0.97 0.37 0.2 0.36 0.51 0.91 0.62 1.0 0.47 0.16 0.81 0.79 0.63 0.45 0.45 0.56 0.66 0.67 0.56 0.51 0.6 0.55 0.86 0.69 0.95
0.54 0.27 0.31 0.58 0.94 1.0 0.59 0.58 0.83 0.75 0.82 0.93 0.5 0.64 0.74 0.54 0.44 0.37 0.92 0.56 0.44 0.49 0.75 0.45 0.63 0.27 0.62 0.65
0.13 0.46 0.48 0.49 0.82 0.87 1.0 0.35 0.65 0.74 0.63 0.79 0.72 0.4 0.47 0.6 0.57 0.78 0.69 0.66 0.56 0.57 0.74 0.61 0.21 0.09 0.36 0.73
0.03 0.02 0.56 0.56 0.44 0.52 0.55 0.11 0.3 0.12 0.24 0.25 0.31 0.15 0.18 0.86 0.7 1.0 1.0 0.76 0.59 0.83 0.3 0.61 0.02 0.11 0.16 0.68
0.03 0.07 0.29 0.3 0.61 0.59 0.23 0.18 0.39 0.17 0.46 0.76 0.16 0.13 0.18 0.49 0.43 0.99 1.0 0.5 0.35 0.46 0.32 0.48 0.03 0.12 0.15 0.31
0.21 0.25 0.67 0.39 0.54 0.78 0.81 0.5 0.56 0.52 0.47 0.66 0.8 0.26 0.3 0.67 0.53 0.74 1.0 0.66 0.54 0.61 0.51 0.65 0.15 0.5 0.35 0.6
0.66 0.21 0.64 0.79 0.55 0.93 0.83 0.44 0.71 0.36 0.62 0.56 0.46 0.54 0.64 0.63 0.61 0.44 0.64 0.68 0.5 0.68 0.91 0.65 0.29 0.36 0.48 1.0
0.05 0.04 0.53 0.36 0.49 0.62 0.69 0.31 0.42 0.52 0.36 0.35 0.59 0.32 0.31 0.7 0.48 0.45 1.0 0.65 0.86 0.68 0.38 0.75 0.06 0.48 0.3 0.51
0.07 0.24 0.68 0.66 0.4 0.38 1.0 0.44 0.45 0.56 0.48 0.28 0.69 0.49 0.43 0.82 0.59 0.41 0.89 0.97 0.79 0.88 0.56 0.84 0.19 0.51 0.52 0.62
0.06 0.04 0.37 0.39 0.89 1.0 0.27 0.17 0.44 0.19 0.36 0.72 0.17 0.25 0.22 0.45 0.32 0.22 0.32 0.39 0.24 0.41 0.52 0.33 0.05 0.11 0.21 0.54
0.3 0.3 0.55 0.56 0.46 0.45 0.56 0.66 0.97 0.55 0.88 0.6 0.33 0.52 0.55 0.83 0.84 0.39 0.41 0.89 0.71 1.0 0.57 0.86 0.27 0.44 0.46 0.67
0.07 0.07 0.51 0.39 0.74 1.0 0.69 0.24 0.71 0.26 0.77 0.93 0.35 0.27 0.28 0.77 0.77 0.31 0.66 0.75 0.6 0.81 0.38 0.8 0.04 0.25 0.27 0.5
0.13 0.11 0.43 0.46 0.74 0.95 0.54 0.23 0.59 0.33 0.57 0.89 0.33 0.25 0.28 0.7 0.68 0.44 1.0 0.68 0.48 0.68 0.37 0.65 0.06 0.24 0.24 0.58
0.04 0.04 0.3 0.27 0.6 0.45 0.42 0.08 0.28 0.09 0.28 0.99 0.23 0.13 0.18 0.35 0.33 0.5 1.0 0.39 0.31 0.39 0.57 0.4 0.04 0.53 0.16 0.61
0.19 0.06 0.4 0.43 0.61 1.0 0.57 0.13 0.34 0.13 0.29 0.52 0.16 0.17 0.18 0.37 0.42 0.12 0.23 0.4 0.23 0.46 0.24 0.4 0.07 0.05 0.19 0.61
0.19 0.31 0.47 0.64 0.59 0.56 0.53 0.23 0.39 0.2 0.38 0.78 0.54 0.44 0.55 0.63 0.51 0.62 1.0 0.74 0.53 0.78 0.59 0.73 0.13 0.27 0.38 0.71
0.54 0.06 0.44 0.61 0.83 0.75 0.4 0.21 0.67 0.24 0.55 1.0 0.36 0.25 0.3 0.84 0.72 0.43 0.95 0.73 0.55 0.7 0.64 0.74 0.57 0.69 0.19 0.77
0.13 0.17 0.49 0.46 0.52 0.78 0.6 0.17 0.45 0.21 0.41 0.53 0.35 0.36 0.34 0.59 0.6 0.37 1.0 0.62 0.44 0.57 0.42 0.62 0.29 0.37 0.36 0.66
0.03 0.01 0.42 0.33 0.65 1.0 0.29 0.15 0.3 0.12 0.18 0.69 0.14 0.16 0.16 0.33 0.31 0.12 0.17 0.28 0.27 0.3 0.6 0.31 0.01 0.13 0.17 0.71
0.3 0.19 0.19 0.43 0.49 0.52 0.25 0.29 0.42 0.32 0.45 0.59 0.16 0.33 0.42 0.31 0.36 0.36 1.0 0.39 0.25 0.39 0.74 0.4 0.18 0.33 0.35 0.53
0.27 0.35 0.52 0.74 0.45 0.82 0.68 0.44 0.55 0.6 0.46 0.42 0.83 0.76 0.76 0.84 0.58 0.41 0.43 0.93 0.77 0.6 0.82 0.6 0.2 0.74 0.86 1.0
0.14 0.04 0.3 0.41 0.23 0.32 0.41 0.17 0.29 0.13 0.22 0.31 0.28 0.12 0.15 0.45 0.39 0.26 0.41 0.31 0.33 0.35 0.38 0.34 0.1 0.29 0.15 1.0
0.04 0.02 0.14 0.6 0.17 0.23 0.39 0.07 0.08 0.15 0.08 0.15 0.18 0.1 0.11 0.75 0.56 0.35 1.0 0.75 0.69 0.63 0.23 0.59 0.05 0.03 0.16 0.95
0.18 0.15 0.45 0.53 0.71 1.0 0.59 0.19 0.45 0.22 0.4 0.69 0.43 0.21 0.22 0.57 0.73 0.19 0.24 0.52 0.35 0.6 0.5 0.45 0.11 0.1 0.26 0.88
0.11 0.74 0.29 0.45 0.38 0.64 1.0 0.29 0.3 0.32 0.27 0.44 0.35 0.41 0.44 0.48 0.39 0.27 0.26 0.52 0.35 0.45 0.53 0.42 0.28 0.82 0.44 0.72
0.24 0.13 0.52 0.44 0.8 1.0 0.4 0.16 0.53 0.22 0.48 0.9 0.21 0.33 0.37 0.47 0.58 0.23 0.46 0.53 0.25 0.59 0.4 0.49 0.15 0.52 0.34 0.84
0.02 0.01 0.4 0.61 0.41 1.0 0.42 0.13 0.25 0.12 0.24 0.27 0.22 0.08 0.1 0.4 0.41 0.1 0.29 0.41 0.27 0.46 0.15 0.38 0.01 0.03 0.1 0.59
0.03 0.05 0.64 0.42 0.75 1.0 0.65 0.28 0.68 0.26 0.7 0.84 0.34 0.19 0.22 0.81 0.89 0.34 0.75 0.92 0.55 0.99 0.35 0.92 0.02 0.2 0.26 0.48
0.17 0.19 0.37 0.44 0.34 0.35 0.52 0.15 0.5 0.22 0.51 0.48 0.28 0.27 0.32 0.8 0.53 1.0 0.69 0.7 0.7 0.68 0.47 0.66 0.13 0.35 0.28 0.65
0.09 0.06 0.3 0.38 0.3 0.4 0.63 0.17 0.33 0.16 0.31 0.35 0.24 0.17 0.2 0.48 0.43 1.0 0.43 0.48 0.36 0.49 0.31 0.44 0.05 0.11 0.18 0.74
0.12 0.1 0.53 0.51 0.17 0.07 1.0 0.23 0.74 0.36 0.71 0.39 0.23 0.31 0.34 0.5 0.45 0.19 0.3 0.62 0.39 0.64 0.36 0.59 0.14 0.27 0.35 0.76
0.07 0.14 0.55 0.39 0.75 1.0 0.79 0.15 0.34 0.2 0.34 0.6 0.48 0.22 0.24 0.55 0.49 0.78 0.27 0.56 0.3 0.59 0.43 0.58 0.08 0.11 0.3 0.53
0.36 0.11 0.11 0.2 0.28 0.3 0.14 0.05 0.3 0.07 0.23 0.38 0.16 0.16 0.26 0.23 0.17 1.0 0.82 0.28 0.21 0.25 0.47 0.28 0.04 0.22 0.14 0.22
0.16 0.25 0.25 0.69 0.43 0.32 0.38 0.31 0.63 0.28 0.56 0.63 0.29 0.41 0.59 0.6 0.51 0.77 0.98 0.6 0.58 0.51 1.0 0.58 0.21 0.41 0.38 0.75
0.22 0.27 0.51 0.61 0.62 0.64 0.64 0.31 0.87 0.38 0.82 0.81 0.45 0.47 0.56 0.77 0.75 0.45 0.38 0.81 0.54 0.82 0.54 0.8 0.35 0.53 0.47 1.0
0.34 0.32 0.71 0.51 0.76 1.0 0.72 0.25 0.53 0.31 0.53 0.78 0.4 0.41 0.39 0.63 0.55 0.39 0.59 0.64 0.48 0.66 0.44 0.58 0.23 0.36 0.42 0.64
0.16 0.09 0.28 0.33 0.61 1.0 0.39 0.12 0.23 0.19 0.22 0.46 0.23 0.21 0.19 0.27 0.33 0.16 0.17 0.3 0.19 0.37 0.17 0.25 0.09 0.11 0.2 0.51
0.04 0.05 0.49 0.31 0.64 1.0 0.35 0.11 0.29 0.2 0.23 0.56 0.23 0.27 0.25 0.19 0.18 0.13 0.1 0.23 0.15 0.23 0.16 0.18 0.09 0.09 0.27 0.46
0.06 0.04 0.09 0.34 0.57 1.0 0.28 0.17 0.17 0.27 0.13 0.52 0.26 0.39 0.33 0.79 0.66 0.2 0.68 0.55 0.18 0.71 0.59 0.43 0.94 0.22 0.31 0.83
0.1 0.13 0.66 0.46 0.5 0.66 1.0 0.42 0.38 0.42 0.49 0.32 0.69 0.27 0.29 0.84 0.64 0.49 0.82 0.75 0.77 0.76 0.41 0.71 0.15 0.3 0.29 0.5
0.08 0.07 0.58 0.53 0.71 0.95 0.79 0.27 0.64 0.33 0.67 0.63 0.43 0.24 0.29 1.0 0.88 0.48 0.87 0.88 0.65 0.89 0.41 0.91 0.04 0.19 0.31 0.8
0.14 0.17 0.43 0.3 0.74 1.0 0.94 0.69 0.36 0.55 0.44 0.59 0.53 0.4 0.38 0.47 0.62 0.29 0.5 0.43 0.53 0.52 0.43 0.5 0.24 0.41 0.34 0.41
0.18 0.13 0.38 0.34 0.41 0.52 1.0 0.19 0.15 0.26 0.13 0.19 0.5 0.34 0.31 0.73 0.55 0.24 0.58 0.7 0.42 0.67 0.28 0.59 0.45 0.25 0.33 0.72
0.05 0.1 0.53 0.44 0.64 1.0 0.64 0.28 0.4 0.33 0.42 0.63 0.34 0.26 0.24 0.6 0.58 0.47 0.62 0.47 0.38 0.55 0.43 0.54 0.23 0.11 0.25 0.55
0.12 0.08 0.55 0.52 0.68 0.83 0.58 0.39 0.52 0.35 0.49 0.55 0.5 0.21 0.26 0.77 0.77 0.66 1.0 0.77 0.61 0.84 0.6 0.72 0.02 0.28 0.25 0.79
0.16 0.26 0.55 0.84 0.6 0.43 0.49 0.31 0.62 0.37 0.69 0.66 0.44 0.6 0.7 0.78 0.63 0.57 0.79 0.86 0.76 0.75 0.72 0.82 0.11 0.77 0.58 1.0
0.2 0.65 0.72 0.84 0.65 0.74 0.67 0.52 0.48 0.54 0.49 0.45 0.69 0.72 0.75 0.76 0.62 0.83 0.97 0.85 0.87 0.74 0.79 0.68 0.44 1.0 0.91 0.95
0.11 0.08 0.44 0.33 0.67 1.0 0.49 0.16 0.4 0.16 0.44 0.71 0.25 0.14 0.15 0.59 0.6 0.56 0.49 0.48 0.35 0.55 0.3 0.5 0.12 0.18 0.16 0.53
0.25 0.15 0.33 0.31 0.79 0.87 0.29 0.27 0.59 0.29 0.63 1.0 0.18 0.26 0.28 0.43 0.55 0.29 0.65 0.41 0.25 0.45 0.44 0.43 0.25 0.42 0.25 0.4
0.03 0.33 0.53 0.6 0.52 0.54 1.0 0.32 0.59 0.53 0.65 0.62 0.39 0.39 0.46 0.83 0.48 0.39 0.49 0.87 0.72 0.78 0.66 0.72 0.2 0.69 0.5 0.86
0.11 0.04 0.24 0.46 0.72 1.0 0.3 0.08 0.25 0.14 0.22 0.6 0.19 0.13 0.17 0.44 0.36 0.18 0.26 0.38 0.23 0.43 0.23 0.33 0.06 0.16 0.15 0.94
0.15 0.09 0.53 0.79 0.38 0.28 0.79 0.29 0.63 0.53 0.65 0.56 0.63 0.34 0.37 0.78 0.61 0.35 0.74 0.87 0.47 0.89 0.44 0.7 0.16 0.2 0.32 1.0
0.19 0.23 0.5 0.47 0.37 0.6 1.0 0.5 0.41 0.48 0.46 0.23 0.58 0.36 0.33 0.92 0.61 0.31 0.54 0.9 0.76 0.8 0.38 0.74 0.28 0.5 0.37 0.69
0.4 0.16 0.48 0.41 0.19 0.29 1.0 0.14 0.17 0.18 0.18 0.16 0.45 0.16 0.15 0.56 0.5 0.18 0.75 0.56 0.59 0.54 0.2 0.58 0.14 0.18 0.18 0.57
0.05 0.13 0.51 0.44 0.68 1.0 0.83 0.38 0.49 0.49 0.53 0.52 0.65 0.21 0.25 0.66 0.73 0.54 0.38 0.67 0.69 0.71 0.65 0.73 0.16 0.41 0.35 0.62
0.09 0.05 0.79 0.88 0.65 0.79 0.9 0.31 0.42 0.23 0.43 0.58 0.57 0.34 0.38 0.89 0.76 0.38 0.81 0.89 0.82 0.85 0.66 0.86 0.05 0.15 0.48 1.0
0.04 0.01 0.57 0.43 0.73 1.0 0.59 0.35 0.39 0.29 0.43 0.61 0.47 0.1 0.11 0.38 0.35 0.25 0.47 0.54 0.32 0.48 0.26 0.38 0.02 0.27 0.2 0.47
0.28 0.36 0.38 0.54 0.46 0.65 0.59 0.38 0.76 0.48 0.82 0.49 0.4 0.71 0.85 0.45 0.31 0.34 0.35 0.39 0.45 0.45 0.69 0.35 0.29 1.0 0.41 0.78

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)