Heatmap: Cluster_60 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.05 0.22 0.06 0.06 0.18 0.11 0.06 0.14 0.37 0.57 0.37 0.21 0.12 0.25 0.31 0.01 0.05 0.24 0.03 0.04 0.03 0.09 0.01 0.06 0.22 1.0 0.24 0.04
0.03 0.05 0.15 0.11 0.14 0.17 0.24 0.2 0.15 0.24 0.14 0.14 0.29 0.13 0.11 0.24 0.15 1.0 0.2 0.21 0.29 0.19 0.12 0.2 0.1 0.16 0.14 0.17
0.35 0.45 1.0 0.16 0.4 0.43 0.63 0.53 0.36 0.57 0.76 0.53 0.28 0.66 0.81 0.15 0.14 0.05 0.4 0.66 0.08 0.37 0.65 0.33 0.3 0.69 0.99 0.31
0.12 0.41 0.87 0.22 0.2 0.35 0.66 0.54 0.77 0.57 0.99 0.17 0.83 0.97 0.76 0.39 0.44 0.49 0.45 0.67 0.63 0.59 0.37 0.55 0.41 1.0 0.56 0.4
0.41 0.51 0.55 0.37 0.47 0.84 0.62 0.37 0.38 0.48 0.39 0.5 0.48 0.43 0.37 0.55 0.73 0.28 0.3 0.7 0.64 0.73 0.26 0.69 0.31 0.26 0.57 1.0
0.05 0.07 0.11 0.09 0.42 0.37 0.14 0.21 0.31 0.55 0.37 0.58 0.3 0.48 0.45 0.08 0.09 0.2 0.05 0.11 0.06 0.08 0.18 0.07 0.13 1.0 0.31 0.19
0.21 0.18 0.05 0.05 0.06 0.05 0.35 0.17 0.25 0.24 0.44 0.07 0.69 0.05 0.05 0.21 0.49 1.0 0.28 0.07 0.13 0.19 0.03 0.22 0.03 0.09 0.04 0.1
0.0 0.05 0.08 0.02 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.2 0.0 0.06 0.0 0.16 0.18 0.0 0.23 0.0 0.81 0.24 0.51 0.46 0.0 1.0 0.11 0.15 0.0 0.0
0.02 0.07 0.25 0.03 0.12 0.1 0.63 0.38 0.37 0.24 0.42 0.2 1.0 0.16 0.13 0.21 0.51 0.31 0.26 0.11 0.14 0.21 0.03 0.37 0.06 0.02 0.13 0.04
0.77 0.33 0.19 0.21 0.76 0.69 0.24 0.38 0.72 0.8 0.71 1.0 0.37 0.19 0.21 0.08 0.14 0.27 0.1 0.17 0.09 0.16 0.3 0.13 0.16 0.92 0.16 0.53
0.0 0.0 0.64 0.0 0.01 0.01 0.82 0.7 0.37 0.29 0.32 0.01 1.0 0.18 0.1 0.23 0.54 0.08 0.17 0.08 0.26 0.15 0.01 0.17 0.04 0.0 0.08 0.0
0.09 0.41 0.55 0.2 0.32 0.23 0.52 0.32 0.28 0.36 0.3 0.28 0.53 0.4 0.38 0.41 0.25 0.43 0.51 0.39 0.43 0.39 0.27 0.43 1.0 0.37 0.49 0.18
0.07 0.82 0.72 0.27 0.19 0.28 0.68 0.88 0.59 0.57 0.74 0.24 0.58 0.64 0.62 0.45 0.75 0.9 0.72 0.95 0.78 1.0 0.67 0.89 0.44 0.88 0.45 0.62
0.1 0.59 0.56 0.17 0.24 0.51 0.57 0.89 0.7 0.78 0.84 0.36 0.8 0.48 0.62 0.35 0.69 0.22 0.52 0.67 1.0 0.66 0.69 0.67 0.44 0.74 0.38 0.2
0.08 0.51 0.69 0.35 0.23 0.55 0.65 0.93 0.98 1.0 0.78 0.18 0.8 0.34 0.3 0.38 0.51 0.74 0.62 0.7 0.52 0.82 0.52 0.76 0.19 0.3 0.3 0.63
0.1 0.44 0.32 0.28 0.48 0.52 0.52 0.34 0.39 0.39 0.55 0.56 0.51 0.57 0.54 0.38 0.46 0.26 0.27 0.45 0.37 0.42 0.6 0.37 0.27 1.0 0.48 0.43
0.02 0.99 0.06 0.18 0.65 0.33 0.56 0.24 0.58 0.88 0.88 0.91 1.0 0.73 0.69 0.52 0.1 0.59 0.35 0.68 0.29 0.42 0.03 0.4 0.57 0.84 0.3 0.13
0.0 0.01 0.71 0.12 0.1 0.06 0.88 0.28 0.21 0.43 0.46 0.24 1.0 0.28 0.53 0.16 0.11 0.38 0.0 0.16 0.0 0.08 0.37 0.08 0.03 0.15 0.11 0.19
0.08 0.19 0.24 0.2 0.57 0.59 0.19 0.67 0.47 0.48 0.52 0.63 0.21 0.46 0.41 0.24 0.23 0.24 0.19 0.27 0.22 0.26 0.39 0.22 0.13 1.0 0.44 0.18
0.15 0.44 1.0 0.06 0.5 0.35 0.51 0.29 0.35 0.27 0.37 0.35 0.51 0.37 0.37 0.1 0.1 0.56 0.08 0.15 0.16 0.15 0.38 0.17 0.31 0.64 0.38 0.08
0.09 0.14 0.19 0.15 0.2 0.15 0.39 0.36 0.21 0.24 0.34 0.2 1.0 0.47 0.57 0.24 0.37 0.43 0.29 0.15 0.13 0.17 0.16 0.23 0.42 0.4 0.24 0.09
0.02 0.09 0.29 0.14 0.27 0.23 0.41 0.53 0.36 0.53 0.66 0.31 1.0 0.18 0.16 0.32 0.56 0.7 0.29 0.19 0.23 0.26 0.17 0.29 0.07 0.24 0.14 0.16
0.14 0.28 0.28 0.2 0.21 0.13 0.23 0.24 0.38 0.43 0.4 0.23 0.25 0.27 0.29 0.28 0.25 0.25 0.19 0.31 0.3 0.24 0.32 0.23 0.31 1.0 0.3 0.24
0.06 0.38 0.18 0.11 0.25 0.49 0.43 0.3 0.17 0.45 0.31 0.37 0.29 0.61 0.68 0.38 0.55 0.64 0.35 0.48 0.4 0.63 0.29 0.57 0.74 1.0 0.32 0.27
0.13 0.41 0.25 0.24 0.53 0.41 0.43 0.49 0.62 0.58 0.68 0.64 0.39 0.63 0.63 0.32 0.23 0.44 0.32 0.33 0.22 0.3 0.44 0.27 0.26 1.0 0.47 0.27
0.19 0.3 0.27 0.21 0.58 0.52 0.31 0.28 0.33 0.31 0.34 0.47 0.38 0.39 0.41 0.29 0.25 0.29 0.18 0.28 0.29 0.23 0.46 0.23 0.23 1.0 0.34 0.24
0.05 0.1 0.5 0.01 0.01 0.01 0.85 0.09 0.06 0.17 0.11 0.01 1.0 0.09 0.09 0.32 0.86 0.45 0.37 0.14 0.2 0.22 0.02 0.31 0.66 0.03 0.08 0.03
0.43 0.62 1.0 0.25 0.4 0.75 0.89 0.37 0.33 0.46 0.4 0.46 0.64 0.63 0.6 0.7 0.75 0.26 0.35 0.8 0.78 0.76 0.47 0.76 0.37 0.46 0.9 0.49
0.03 0.03 0.9 0.11 0.26 0.12 0.79 0.1 0.71 0.16 1.0 0.27 0.53 0.29 0.21 0.1 0.07 0.59 0.21 0.16 0.11 0.14 0.21 0.14 0.01 0.02 0.53 0.29
0.19 0.29 0.73 0.36 0.52 0.46 0.92 0.26 0.55 0.4 0.6 0.48 0.66 0.51 0.5 0.76 0.79 0.69 0.5 0.78 0.85 0.84 0.63 0.76 0.22 0.35 0.52 1.0
0.37 0.37 0.51 0.35 0.76 0.69 0.55 0.35 0.48 0.47 0.38 0.76 0.72 0.24 0.24 0.54 0.6 0.47 0.41 0.53 0.43 0.48 0.2 0.52 1.0 0.63 0.34 0.54
1.0 0.73 0.72 0.34 0.51 0.54 0.75 0.68 0.6 0.54 0.65 0.46 0.71 0.54 0.54 0.6 0.56 0.34 0.69 0.6 0.59 0.61 0.5 0.57 0.92 0.39 0.53 0.54
0.09 0.27 1.0 0.29 0.5 0.48 0.83 0.33 0.34 0.48 0.29 0.48 0.75 0.81 0.69 0.41 0.42 0.17 0.26 0.36 0.52 0.34 0.45 0.41 0.4 0.25 0.63 0.3
0.1 0.09 0.51 0.16 0.27 0.37 0.6 0.5 0.39 0.21 0.41 0.26 0.21 0.65 0.63 0.29 0.29 0.21 0.23 0.42 0.23 0.29 0.9 0.35 0.06 0.15 1.0 0.42
0.07 0.18 0.13 0.03 0.07 0.06 0.08 0.23 0.28 0.77 0.17 0.25 0.06 0.46 0.42 0.47 0.3 0.06 0.28 0.35 0.65 0.47 0.16 0.53 0.09 1.0 0.37 0.12
0.31 0.28 0.83 0.24 0.22 0.14 0.74 0.32 0.35 0.28 0.34 0.17 0.51 0.31 0.27 0.33 0.22 1.0 0.39 0.37 0.4 0.35 0.38 0.36 0.16 0.09 0.39 0.1
0.01 0.04 0.3 0.15 0.1 0.1 0.19 0.31 0.2 0.26 0.32 0.08 0.22 0.21 0.18 0.29 0.25 1.0 0.39 0.37 0.57 0.39 0.29 0.4 0.08 0.11 0.2 0.18
0.04 0.22 0.18 0.1 0.06 0.04 0.16 0.27 0.17 0.31 0.2 0.09 0.03 0.74 0.73 0.41 0.25 1.0 0.35 0.57 0.65 0.57 0.12 0.46 0.59 0.54 0.47 0.23
0.06 0.34 0.56 0.23 0.33 0.33 0.6 0.22 0.14 0.21 0.15 0.33 0.61 0.49 0.52 0.28 0.37 0.88 0.33 0.47 0.48 0.46 0.41 0.45 1.0 0.79 0.61 0.23
0.02 0.08 0.06 0.09 0.27 0.5 0.08 0.23 0.54 0.49 0.55 0.44 0.19 0.28 0.2 0.11 0.1 0.05 0.21 0.13 0.1 0.12 0.43 0.12 0.06 1.0 0.25 0.13
0.15 0.41 0.6 0.14 0.44 0.36 0.3 0.42 0.34 0.43 0.34 0.55 0.3 0.33 0.33 0.25 0.4 0.23 0.16 0.28 0.37 0.39 0.4 0.33 0.41 1.0 0.29 0.24
0.82 0.3 0.25 0.17 0.23 0.09 0.44 0.13 0.39 0.24 0.37 0.3 0.36 0.38 0.33 0.31 0.24 0.81 1.0 0.9 0.41 0.64 0.18 0.61 0.25 0.49 0.51 0.4
0.07 0.2 0.98 0.35 0.61 0.45 0.98 0.57 0.4 0.87 0.41 0.6 0.6 0.89 0.85 0.59 0.59 0.41 0.27 0.62 0.74 0.61 0.73 0.52 0.55 0.38 1.0 0.34
0.01 0.02 0.15 0.01 0.07 0.04 0.77 0.13 0.12 0.33 0.11 0.1 1.0 0.01 0.01 0.19 0.46 0.78 0.13 0.39 0.44 0.54 0.07 0.33 0.0 0.0 0.02 0.07
0.33 0.14 0.35 0.28 0.24 0.37 0.24 0.32 0.15 0.11 0.17 0.24 0.22 0.63 0.53 0.72 1.0 0.13 0.62 0.56 0.44 0.62 0.12 0.76 0.38 0.07 0.52 0.09
0.04 0.05 0.09 0.07 0.17 0.12 0.29 0.17 0.46 0.25 0.51 0.23 0.39 0.09 0.07 0.31 0.17 1.0 0.49 0.28 0.35 0.23 0.05 0.31 0.04 0.04 0.11 0.05
0.24 0.56 0.81 0.29 0.69 0.47 0.51 0.31 0.33 0.32 0.34 0.48 0.58 0.45 0.41 0.54 0.51 0.35 0.48 0.62 0.57 0.57 0.31 0.58 1.0 0.74 0.74 0.19
0.09 0.45 1.0 0.15 0.43 0.33 1.0 0.45 0.6 0.9 0.56 0.54 0.88 0.72 0.66 0.24 0.29 0.63 0.52 0.29 0.25 0.27 0.59 0.3 0.41 0.92 0.59 0.42
0.06 0.3 0.69 0.19 0.32 0.28 0.84 0.37 0.48 0.44 0.51 0.38 1.0 0.57 0.55 0.21 0.29 0.6 0.72 0.29 0.29 0.29 0.57 0.36 0.25 0.59 0.61 0.27
0.01 0.01 0.26 0.16 0.17 0.08 0.59 0.5 0.32 0.2 0.38 0.12 1.0 0.04 0.04 0.15 0.13 0.94 0.15 0.11 0.13 0.12 0.08 0.16 0.03 0.02 0.04 0.06
0.13 0.48 0.35 0.2 0.19 0.21 0.66 0.43 0.79 0.42 0.73 0.2 0.45 0.67 0.66 0.49 0.42 0.45 0.29 0.62 0.36 0.63 1.0 0.57 0.23 0.36 0.64 0.34
0.0 0.02 0.48 0.05 0.17 0.11 0.53 0.48 0.25 0.24 0.22 0.11 0.76 0.26 0.42 0.0 0.02 1.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.57 0.03 0.09 0.0 0.09 0.09
0.01 0.1 0.67 0.06 0.18 0.15 0.42 0.03 0.04 0.13 0.05 0.22 1.0 0.45 0.45 0.04 0.03 0.42 0.11 0.17 0.17 0.07 0.32 0.12 0.02 0.09 0.22 0.03
0.06 0.14 0.04 0.03 0.03 0.05 0.11 0.04 0.06 0.05 0.07 0.03 0.1 0.06 0.07 0.07 0.07 0.05 0.07 0.07 0.05 0.06 0.05 0.06 1.0 0.48 0.04 0.04
0.05 0.21 0.05 0.0 0.15 0.23 0.07 0.16 0.22 0.42 0.22 0.21 0.11 0.33 0.29 0.0 0.0 0.36 0.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.02 1.0 0.4 0.0
0.03 0.08 0.39 0.02 0.02 0.02 0.51 0.19 0.36 0.04 0.41 0.04 0.6 0.23 0.25 0.42 0.81 0.29 1.0 0.26 0.22 0.37 0.07 0.73 0.02 0.05 0.15 0.04
0.19 0.61 0.9 0.15 0.46 0.37 0.7 0.22 0.38 0.28 0.51 0.42 1.0 0.41 0.43 0.29 0.38 0.73 0.57 0.28 0.21 0.27 0.16 0.27 0.73 1.0 0.51 0.11
0.01 0.38 0.71 0.0 0.11 0.05 0.67 0.12 0.22 0.45 0.16 0.1 0.57 0.32 0.25 0.04 0.01 1.0 0.12 0.12 0.09 0.06 0.76 0.07 0.27 0.05 0.12 0.0
0.07 0.22 0.18 0.12 0.35 0.12 0.3 0.29 0.44 1.0 0.29 0.2 0.26 0.26 0.34 0.08 0.28 0.95 0.59 0.38 0.35 0.22 0.24 0.25 0.24 0.68 0.28 0.19
0.0 0.15 0.53 0.08 0.21 0.2 0.12 0.37 0.68 0.27 0.68 0.33 0.14 0.39 0.44 0.25 0.34 0.07 0.0 0.35 0.0 0.49 0.47 0.41 0.13 1.0 0.48 0.18
0.01 0.01 0.94 0.05 0.2 0.09 0.81 0.07 0.58 0.12 0.78 0.24 0.68 0.17 0.11 0.03 0.02 1.0 0.32 0.08 0.03 0.03 0.09 0.05 0.01 0.01 0.31 0.16
0.1 0.51 0.64 0.29 0.21 0.19 0.88 0.46 0.94 0.57 0.74 0.32 0.76 0.65 0.65 0.32 0.64 0.43 0.53 0.65 0.44 0.72 1.0 0.69 0.26 0.44 0.55 0.55
0.11 0.31 0.29 0.14 0.3 0.34 0.35 0.28 0.29 0.39 0.35 0.35 0.34 0.3 0.38 0.22 0.27 0.28 0.16 0.29 0.19 0.29 0.42 0.28 0.31 1.0 0.22 0.25
0.12 0.54 0.4 0.32 0.43 0.6 0.53 0.64 0.5 0.49 0.5 0.39 0.41 0.64 0.68 0.54 0.51 0.36 0.31 0.47 0.49 0.5 0.51 0.49 0.42 1.0 0.51 0.5
0.08 0.15 0.4 0.3 0.13 0.22 0.61 0.2 0.41 0.45 0.3 0.21 1.0 0.43 0.41 0.24 0.38 0.6 0.39 0.23 0.15 0.21 0.41 0.18 0.08 0.4 0.33 0.59
0.01 0.04 0.82 0.15 0.09 0.09 0.78 0.3 0.34 0.27 0.39 0.06 1.0 0.13 0.11 0.39 0.47 0.2 0.29 0.31 0.39 0.32 0.12 0.37 0.06 0.1 0.14 0.19

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)