Heatmap: Cluster_124 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
FB cap+lamellae,YMG,strain #326
FB stipe,YMG,strain #326
Hyphal knots,control,strain #326
Mycelium
Mycelium,Co-culture B.subtilis,28C,8h
Mycelium,Co-culture E.coli,28C,8h
Mycelium,LiCl,strain #326
Mycelium,Predation A.avenae,20h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,2h,matA/matB KO
Mycelium,Predation A.avenae,8h,matA/matB KO
Mycelium,control,20C,matA/matB KO
Mycelium,control,28C,8h
Mycelium,control,strain #326
Stg 1 primordium,YMG,strain #326
Stg 2 primordium,YMG,strain #326
Mycelium,Co-culture B.subtilis,YMG,strain #130
Mycelium,Co-culture E.coli,YMG,strain #130
Mycelium,Dark 37C 96h,YMG,matA43/matB43 KO
Mycelium,Dark 37h 120h,YMG,strain #130
Mycelium,Mechanical damage,YMG,strain #130
Mycelium,Predation A.avenae,YMG,strain #130
Mycelium,Predation C.elegans,YMG,strain #130
Vegetative mycelium,YMG,strain #326
Mycelium,control,YMG,37C,strain #130
YFB cap,YMG,strain #326
YFB lamellae,YMG,strain #326
secondary hyphal knots,YMG,strain #326
strain #130
0.0 0.0 0.0 0.51 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.31 0.0 0.28 0.82 0.53 0.71 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.68
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.54 0.33 0.0 0.19 0.61 0.34 0.82 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.45
0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.51 0.28 0.0 0.36 1.0 0.5 0.8 0.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.43
0.32 0.08 0.15 0.46 0.11 0.04 0.16 0.09 0.06 0.34 0.07 0.14 0.12 0.04 0.05 0.16 0.08 1.0 0.26 0.19 0.15 0.24 0.11 0.27 0.05 0.18 0.03 0.24
0.03 0.09 0.03 1.0 0.27 0.51 0.13 0.27 0.17 0.37 0.28 0.15 0.23 0.04 0.03 0.31 0.37 0.4 0.33 0.44 0.33 0.48 0.05 0.3 0.13 0.08 0.02 0.47
0.0 0.03 0.3 1.0 0.37 0.04 0.19 0.06 0.09 0.17 0.13 0.71 0.07 0.02 0.02 0.18 0.09 0.11 0.48 0.21 0.12 0.2 0.18 0.32 0.0 0.27 0.0 0.23
0.01 0.07 0.38 1.0 0.22 0.17 0.54 0.33 0.34 0.37 0.34 0.18 0.47 0.17 0.2 0.81 0.54 0.37 0.66 0.7 0.49 0.66 0.38 0.67 0.03 0.47 0.23 0.73
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.15
0.02 0.01 0.32 0.71 0.43 0.21 0.37 0.14 0.24 0.25 0.26 0.51 0.37 0.03 0.05 0.71 0.6 0.43 0.99 0.67 0.46 0.75 0.31 0.73 0.06 0.57 0.04 1.0
0.04 0.08 0.54 0.52 0.46 0.15 0.76 0.15 0.4 1.0 0.63 0.8 0.37 0.14 0.13 0.41 0.45 0.45 0.61 0.53 0.43 0.48 0.31 0.52 0.11 0.07 0.15 0.1
0.0 0.0 0.09 0.66 0.02 0.02 0.18 1.0 0.18 0.08 0.1 0.03 0.15 0.11 0.08 0.1 0.04 0.65 0.45 0.14 0.08 0.16 0.03 0.15 0.0 0.0 0.11 0.12
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.31 0.0 0.12 0.1 0.41 0.27 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.96
0.01 0.04 0.47 0.47 0.35 0.26 0.56 0.21 0.33 0.48 0.36 0.35 0.72 0.24 0.19 0.6 0.37 1.0 0.79 0.52 0.69 0.42 0.18 0.4 0.04 0.09 0.22 0.28
0.03 0.03 0.74 1.0 0.18 0.11 0.72 0.28 0.44 0.5 0.51 0.18 0.58 0.23 0.18 0.67 0.58 0.23 0.42 0.8 0.78 0.71 0.22 0.81 0.05 0.04 0.32 0.79
0.53 0.08 0.35 1.0 0.43 0.23 0.53 0.38 0.69 0.42 0.92 0.61 0.38 0.1 0.11 0.89 0.54 0.37 0.74 0.92 0.73 0.72 0.45 0.83 0.04 0.08 0.16 0.85
0.12 0.06 0.36 0.89 0.27 0.25 0.34 0.4 0.93 0.68 0.9 0.25 0.34 0.83 0.63 0.95 0.66 0.3 0.38 1.0 0.7 1.0 0.24 0.94 0.83 0.4 0.76 0.81
0.08 0.3 0.2 0.9 0.26 0.27 0.45 0.52 1.0 0.44 0.36 0.31 0.53 0.31 0.3 0.5 0.45 0.26 0.24 0.37 0.29 0.43 0.42 0.31 0.2 0.46 0.36 0.53
0.02 0.29 0.16 0.84 0.33 0.17 0.27 0.39 0.25 0.4 0.28 0.27 0.4 0.12 0.13 0.89 0.52 0.53 0.92 0.76 0.65 0.71 0.33 0.67 0.12 1.0 0.14 0.72
0.01 0.04 0.29 0.49 0.51 0.26 0.45 0.13 0.31 0.27 0.36 1.0 0.5 0.26 0.18 0.67 0.36 0.19 0.47 0.98 0.51 0.69 0.11 0.77 0.03 0.12 0.39 0.2
0.01 0.07 0.56 0.69 0.94 0.38 0.81 0.49 0.56 1.0 0.55 0.76 0.85 0.51 0.4 0.93 0.38 0.51 0.44 0.79 0.64 0.69 0.16 0.7 0.46 0.04 0.75 0.36
0.02 0.04 0.73 0.75 0.9 0.45 0.42 0.23 0.26 0.15 0.27 0.6 0.49 0.05 0.07 0.43 0.43 1.0 0.52 0.52 0.33 0.54 0.22 0.55 0.06 0.52 0.14 0.47
0.43 0.02 0.82 1.0 0.59 0.22 0.28 0.81 0.36 0.44 0.48 0.64 0.34 0.15 0.17 0.49 0.43 0.38 0.26 0.6 0.47 0.62 0.55 0.68 0.08 0.34 0.17 0.56
0.76 0.16 0.79 1.0 0.05 0.04 0.67 0.35 0.21 0.31 0.22 0.05 0.92 0.25 0.29 0.19 0.18 0.16 0.17 0.4 0.34 0.3 0.77 0.24 0.15 0.62 0.53 0.36
0.11 0.33 0.25 0.51 0.43 0.3 0.28 0.43 0.38 0.33 0.61 1.0 0.23 0.37 0.37 0.36 0.42 0.37 0.52 0.35 0.28 0.36 0.31 0.34 0.41 0.25 0.23 0.2
0.02 0.06 0.42 1.0 0.51 0.37 0.41 0.81 0.73 0.34 0.79 0.66 0.29 0.43 0.61 0.6 0.45 0.2 0.26 0.5 0.61 0.52 0.48 0.56 0.13 0.11 0.48 0.4
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.15 0.17 0.82 0.82 1.0 0.75 0.72 0.51 0.77 0.5 0.52 0.7 0.68 0.16 0.16 0.87 0.76 0.59 0.5 0.79 0.94 0.71 0.59 0.74 0.06 0.53 0.21 0.61
0.01 0.01 0.13 1.0 0.08 0.06 0.07 0.52 0.31 0.24 0.42 0.12 0.04 0.06 0.08 0.05 0.03 0.06 0.02 0.05 0.04 0.04 0.23 0.04 0.01 0.04 0.07 0.22
0.07 0.09 0.32 0.67 0.28 0.08 0.28 0.26 0.61 0.91 1.0 0.28 0.59 0.03 0.05 0.39 0.18 0.16 0.16 0.16 0.35 0.36 0.06 0.21 0.07 0.15 0.05 0.11
0.06 0.03 0.03 1.0 0.12 0.13 0.06 0.08 0.01 0.01 0.01 0.18 0.14 0.12 0.11 0.08 0.07 0.02 0.04 0.04 0.05 0.06 0.02 0.05 0.28 0.03 0.16 0.2
0.0 0.0 0.16 1.0 0.15 0.1 0.12 0.02 0.03 0.03 0.04 0.21 0.12 0.0 0.01 0.48 0.17 0.03 0.2 0.27 0.23 0.35 0.02 0.42 0.0 0.02 0.0 0.52
0.15 0.25 0.27 1.0 0.39 0.13 0.26 0.05 0.08 0.04 0.05 0.28 0.69 0.76 0.53 0.1 0.05 0.15 0.12 0.12 0.16 0.15 0.1 0.18 0.28 0.01 0.57 0.23
0.01 0.05 0.06 1.0 0.42 0.19 0.12 0.09 0.34 0.43 0.35 0.71 0.33 0.01 0.01 0.13 0.13 0.14 0.09 0.13 0.21 0.11 0.04 0.11 0.01 0.06 0.01 0.17
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.16 0.07 0.58 0.6 0.25 0.37 0.5 0.53 0.39 0.24 0.44 0.19 0.2 0.11 0.17 0.41 0.23 1.0 0.6 0.5 0.4 0.38 0.32 0.41 0.23 0.05 0.31 0.27
0.18 0.05 0.89 0.96 1.0 0.51 0.51 0.33 0.55 0.36 0.43 0.8 0.63 0.08 0.1 0.46 0.35 0.42 0.36 0.59 0.53 0.48 0.58 0.5 0.02 0.48 0.13 0.44
0.1 0.01 1.0 0.77 0.39 0.14 0.72 0.17 0.22 0.04 0.17 0.2 0.96 0.03 0.04 0.26 0.23 0.12 0.35 0.39 0.31 0.31 0.15 0.44 0.03 0.01 0.28 0.26
0.21 0.32 0.96 0.94 0.4 0.38 0.55 0.73 0.63 0.54 0.75 0.41 0.25 0.65 0.64 0.64 0.49 0.23 0.49 0.57 1.0 0.53 0.44 0.55 0.61 0.29 0.45 0.4
0.04 0.06 0.23 1.0 0.16 0.15 0.21 0.22 0.13 0.38 0.18 0.27 0.25 0.08 0.08 0.45 0.26 0.2 0.1 0.31 0.19 0.39 0.11 0.2 0.11 0.07 0.09 0.09
0.03 0.07 0.14 1.0 0.04 0.03 0.28 0.64 0.23 0.53 0.18 0.06 0.17 0.05 0.03 0.25 0.08 0.04 0.22 0.17 0.29 0.13 0.05 0.14 0.06 0.01 0.06 0.57
0.02 0.15 0.69 0.67 0.14 0.07 0.46 0.06 0.14 0.12 0.11 0.13 0.25 0.48 0.56 0.15 0.12 1.0 0.13 0.2 0.23 0.22 0.5 0.22 0.51 0.49 0.46 0.48
0.06 0.12 0.49 0.95 0.52 0.35 0.42 0.43 0.78 0.39 1.0 0.71 0.27 0.69 0.54 0.22 0.02 0.34 0.37 0.68 0.11 0.21 0.05 0.28 0.14 0.11 0.99 0.05
0.02 0.15 0.29 0.84 0.41 0.28 0.48 0.28 0.19 0.34 0.2 0.25 0.37 0.11 0.28 1.0 0.61 0.27 0.67 0.81 0.98 0.59 0.67 0.57 0.07 0.35 0.12 0.81
0.16 0.07 0.6 1.0 0.2 0.23 0.62 0.43 0.28 0.76 0.39 0.16 0.68 0.06 0.07 0.5 0.5 0.26 0.53 0.39 0.65 0.39 0.14 0.43 0.26 0.06 0.05 0.93
0.22 0.32 0.69 0.59 0.56 0.85 0.55 0.61 0.49 0.6 0.52 0.5 0.54 0.5 0.45 0.83 0.7 0.29 0.57 0.77 0.83 0.74 0.39 0.74 0.92 1.0 0.45 0.43
0.09 0.26 0.17 0.74 0.25 0.23 0.19 0.68 0.49 0.63 0.33 0.2 0.28 0.32 0.36 0.57 0.33 1.0 0.48 0.39 0.33 0.38 0.28 0.28 0.25 0.45 0.43 0.41
0.14 0.11 0.28 0.56 0.24 0.31 0.3 1.0 0.33 0.38 0.22 0.14 0.34 0.31 0.42 0.39 0.27 0.52 0.49 0.37 0.33 0.34 0.36 0.3 0.78 0.47 0.34 0.54
0.2 0.76 0.82 0.98 0.49 0.15 0.64 0.48 0.34 0.19 0.32 0.19 0.48 0.32 0.27 1.0 0.43 0.34 0.34 0.86 0.7 0.74 0.54 0.66 0.88 0.69 0.49 0.47
0.0 0.0 0.26 0.71 0.1 0.11 0.0 0.21 0.11 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.08 0.13 0.0
0.0 0.01 0.34 0.93 0.48 0.33 0.42 0.54 0.28 0.16 0.32 0.46 1.0 0.21 0.24 0.36 0.41 0.35 0.32 0.37 0.19 0.43 0.66 0.49 0.01 0.02 0.19 0.4
0.0 0.0 0.0 0.8 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.79 0.0 0.4 1.0 0.89 0.88 0.0 0.99 0.0 0.0 0.0 0.65
0.0 0.0 0.27 1.0 0.07 0.07 0.45 0.29 0.21 0.14 0.28 0.13 0.15 0.07 0.07 0.1 0.05 0.01 0.03 0.07 0.06 0.07 0.31 0.06 0.0 0.0 0.13 0.38
0.02 0.14 0.3 0.63 0.29 0.18 0.3 0.39 0.19 0.12 0.13 0.18 0.3 0.34 0.47 1.0 0.61 0.36 0.31 0.5 0.57 0.48 0.3 0.55 0.11 0.03 0.29 0.6
0.2 0.3 0.4 1.0 0.3 0.2 0.51 0.35 0.55 0.23 0.64 0.43 0.7 0.5 0.56 0.58 0.53 0.24 0.33 0.57 0.62 0.53 0.77 0.54 0.19 0.2 0.52 0.8
0.05 0.0 0.64 1.0 0.18 0.08 0.58 0.01 0.02 0.02 0.03 0.22 0.58 0.02 0.02 0.08 0.04 0.16 0.09 0.12 0.05 0.13 0.07 0.1 0.0 0.16 0.03 0.26
0.4 0.64 0.48 1.0 0.36 0.17 0.35 0.24 0.45 0.24 0.6 0.51 0.91 0.1 0.09 0.24 0.14 0.25 0.19 0.33 0.27 0.34 0.2 0.31 0.11 0.1 0.13 0.23
0.14 0.21 0.41 0.84 0.9 0.82 0.57 0.52 0.57 0.47 0.5 0.65 0.57 0.26 0.27 1.0 0.75 0.45 0.38 0.74 0.66 0.7 0.58 0.65 0.09 0.25 0.42 0.85
0.03 0.04 0.39 0.74 0.08 0.05 0.41 0.37 0.3 0.35 0.43 0.14 0.15 0.15 0.21 1.0 0.65 0.12 0.39 0.76 0.88 0.78 0.62 0.68 0.03 0.12 0.15 0.42
0.01 0.15 0.35 1.0 0.48 0.09 0.36 0.28 0.4 0.15 0.32 0.39 0.63 0.66 0.5 0.32 0.19 0.15 0.18 0.32 0.28 0.28 0.11 0.36 0.9 0.14 0.34 0.12
0.17 0.24 0.52 1.0 0.53 0.73 0.92 0.42 0.32 0.4 0.34 0.37 0.9 0.34 0.42 0.87 0.67 0.5 0.74 0.99 0.79 0.9 0.6 0.85 0.35 0.92 0.41 0.61
0.39 0.2 0.08 1.0 0.07 0.06 0.25 0.12 0.32 0.2 0.34 0.08 0.31 0.04 0.04 0.18 0.07 0.27 0.47 0.18 0.17 0.23 0.02 0.25 0.02 0.23 0.04 0.12
0.16 0.14 0.6 0.96 0.54 0.43 0.78 0.6 0.52 0.51 0.47 0.54 0.75 0.34 0.4 0.69 0.63 0.47 0.4 0.71 0.41 0.63 0.54 0.51 0.17 0.57 0.33 1.0
0.08 0.08 0.06 1.0 0.09 0.06 0.07 0.18 0.2 0.2 0.19 0.12 0.06 0.12 0.16 0.23 0.24 0.09 0.08 0.17 0.12 0.16 0.1 0.15 0.07 0.61 0.12 0.44
0.21 0.09 0.64 0.74 0.87 0.29 0.47 0.34 0.29 0.14 0.24 1.0 0.4 0.13 0.12 0.45 0.28 0.34 0.29 0.49 0.35 0.46 0.43 0.59 0.06 0.53 0.1 0.59
0.19 0.33 0.52 0.42 0.59 0.53 0.47 0.27 0.4 0.28 0.53 0.6 0.43 0.33 0.33 0.65 0.69 0.17 0.26 0.51 0.53 0.61 0.37 0.55 0.26 1.0 0.31 0.3
0.5 0.53 0.58 0.82 0.85 1.0 0.73 0.37 0.37 0.38 0.39 0.75 0.6 0.3 0.32 0.72 0.83 0.41 0.77 0.72 0.65 0.75 0.47 0.61 0.48 0.71 0.38 0.94
0.07 0.15 0.44 1.0 0.45 0.74 0.48 0.74 0.96 0.38 0.58 0.35 0.48 0.21 0.28 0.81 0.87 0.28 0.52 0.63 0.65 0.79 0.28 0.66 0.1 0.37 0.32 0.93
0.01 0.07 0.46 0.27 0.21 0.09 0.38 0.11 0.23 0.37 0.28 0.34 0.21 0.09 0.09 0.52 1.0 0.14 0.34 0.43 0.35 0.5 0.22 0.4 0.05 0.09 0.07 0.1
0.1 0.19 0.01 0.54 0.12 0.12 0.09 0.02 0.04 0.03 0.06 0.13 0.08 0.13 0.14 0.47 0.45 0.12 0.42 0.31 0.36 0.34 0.14 0.38 0.19 0.07 0.11 1.0
0.0 0.01 0.02 0.62 0.0 0.01 0.12 0.06 0.01 0.02 0.03 0.0 0.01 0.03 0.05 0.09 0.13 0.03 0.03 0.06 0.07 0.05 0.18 0.06 0.01 0.03 0.02 1.0
0.36 0.02 0.18 1.0 0.27 0.2 0.21 0.11 0.3 0.51 0.43 0.29 0.69 0.03 0.03 0.35 0.26 0.11 0.23 0.31 0.26 0.48 0.03 0.35 0.05 0.43 0.03 0.23
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.63 0.26 0.46 0.81 0.31 0.25 0.37 0.27 0.32 0.25 0.4 0.41 0.26 0.46 0.43 1.0 0.72 0.22 0.45 0.72 0.9 0.74 0.5 0.8 0.25 0.3 0.32 0.74
0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.06 0.33 0.72 0.61 0.53 0.38 0.17 0.35 0.2 0.27 0.76 0.39 0.14 0.13 0.7 0.22 0.24 0.46 0.9 1.0 0.98 0.11 0.76 0.08 0.01 0.19 0.24

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)