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Heatmap: Cluster_55 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
YPD,37C,RB1 KO
YPD,37C,WT
YPD,WT
YPG,WT
WT
37C,PUS7 KO
2n,Pre-SPO
2n,YPD
Butyric acid
Acetic acid
Lactic acid
Propionic acid
HCl
Ctrl
ZFS1 KO
cyr1 KO
cyr1/CYR1 KO
+Tomatidine
TRY4 KO
ZFU2 KO
ZCF8 KO
YPD
Spider
FBS
Lees
RPMI
CUP9 KO
RIM101 KO
RIM101 OE
YPD,30C,AOX2 KO
+SHAM,WT
+Pyocyanin,WT
CPH2 KO
HMS1 KO
MTLa/a,YPD-K,WT
MTLa/a,YP-K,WT
YPD,+Caffeine,WT
YPD,+Myriocin,WT
YPD,RTG3 KO
YPD,+Caffeine,RTG3 KO
YPD,+Myriocin,RTG3 KO
Log,YPD,RCA1 KO
Log,YPD,RCA1 REV
HSF1-TAP/HSF1 -Dox
HSF1-TAP/HSF1 +Dox
tetO-HSF1/tetO-HSF1 -Dox
tetO-HSF1/tetO-HSF1 +Dox
MBF1 KO
YNB-CSM,WT
YNB-CMS,MBF1 KO
YNB-CSM,GCN4 KO
YNB-His,WT
YNB-His,MBF1 KO
YNB-His,GCN4 KO
Infection;Mouse Kidney,WT
Infection;Mouse Kidney,MBF1 KO
OPC Infection:Mouse Tongue Epi Sheet,WT
KAR3 KO
KIP1 KO
YPD,MIG2 KO
YPD,MIG1/MIG2 KO
YPG,MIG1/MIG2 KO
EFG1 KO
+Miconazole
RPMI1640,6h,WT
RPMI1640,6h,CYS4 KO
RPMI1640,+EAOA,6h,CAF2
EBSS+2%H.Serum,EPT1 KO
EBSS+2%H.Serum,EPT1 OE
EBSS+2%H.Serum,PSD1/PSD2 KO
EBSS+2%H.Serum,WT
TET-TEM1 On
TET-TEM1 Off
Serum
SET1 KO
SIR2 KO
-Dox,WT
+Oxi.Stress,+Cat.Stress
+Cat.Stress
+Oxi.Stress
+Nitro.Stress
+Oxi.Stress,+Cat.Stress,+Nitro.Stress
+Oxi.Stress,+Nitro.Stress
+Cat.Stress,+Nitro.Stress
+H2O2
+H2O2,+NaCl
+NaCl
HSP90/HSP90,Ctrl
HSP90/HSP90,+Dox,Ctrl
HSP90/HSP90,+Dox,Heat Shock
tetO-HSP90/hsp90,Ctrl
tetO-HSP90/hsp90,+Dox,Ctrl
tetO-HSP90/hsp90,+Dox,Heat Shock
+Dox,WT
+Dox,STE11 KO
-Dox,STE11 KO
4n,Pre-SPO
4n,YPD
-0.61 -1.13 1.12 0.45 -0.04 -1.45 -0.22 -1.3 -0.45 -0.5 -0.66 -0.67 -0.08 0.17 0.61 -1.55 -0.25 -0.03 -0.5 -0.46 -0.64 -0.61 0.19 0.15 0.28 0.11 -0.86 0.07 0.18 1.25 1.47 1.11 1.05 0.17 -0.21 0.41 1.51 -2.09 -0.55 0.86 -2.07 0.79 0.22 -0.89 -0.79 -0.79 -0.28 0.0 -1.27 -1.11 -0.43 -0.57 -0.47 0.14 1.3 1.38 1.65 -0.38 -0.29 0.39 0.31 0.14 0.99 -0.59 -0.63 -0.79 -0.7 0.24 0.04 -0.31 -0.03 -1.54 -0.84 0.03 0.65 0.64 -0.57 0.05 -1.68 -0.08 -2.12 0.1 0.05 -0.95 -0.47 -0.56 -0.27 -0.56 -1.12 0.92 -0.77 -1.4 0.73 -2.85 -1.92 -2.4 0.56 -1.13
-0.43 -0.51 0.45 -0.78 -0.41 -0.57 -0.0 -0.54 -1.33 -1.36 -2.0 -1.53 -0.82 -0.32 -0.08 -0.88 -1.66 0.07 -0.54 -0.6 -0.75 -0.38 -0.33 -0.2 -0.03 -0.14 -1.3 -0.01 -0.2 0.72 0.7 0.61 0.91 0.48 -0.68 -0.36 0.78 0.01 0.17 0.59 0.09 -0.19 -0.3 -0.19 -0.26 -0.4 0.08 0.07 -0.29 -0.08 0.26 -0.32 -0.11 0.27 1.41 1.29 1.08 0.12 -0.28 -0.96 -1.19 -0.87 -0.78 -0.19 -0.53 -2.38 -1.47 0.59 0.52 1.38 0.58 -0.18 0.34 -0.55 0.81 0.02 0.47 -0.74 -0.5 -0.63 -0.29 -0.7 -0.62 -0.74 -0.27 -0.43 -0.19 -0.32 0.01 1.07 -0.28 -0.1 1.2 0.3 0.85 0.98 0.25 -0.54
-0.59 -0.95 0.68 0.03 -0.23 -0.5 0.49 -0.72 -0.63 -0.75 -0.78 -0.88 -0.27 0.16 0.45 -0.69 -0.67 0.04 -0.76 -0.54 -0.67 -0.29 -0.04 -0.09 0.23 0.09 -0.76 -0.18 -0.37 0.91 1.45 1.0 0.89 0.55 -0.06 -0.71 0.97 -0.74 -0.37 0.26 -0.31 0.29 -0.11 -1.09 -1.21 -1.14 -0.18 0.77 -0.56 -0.47 0.15 -0.25 -0.1 0.04 0.88 1.35 1.16 0.15 0.13 0.08 -0.02 0.07 0.2 -1.2 -0.47 -1.68 -1.19 -0.59 -0.51 0.33 -0.56 -0.37 0.45 0.08 -0.19 0.59 -0.01 0.29 -0.38 0.06 -1.14 0.16 0.3 -0.19 -0.0 0.09 0.06 -0.28 -0.71 1.12 -0.51 -0.72 0.58 -1.05 -0.33 -0.15 0.49 -0.55
-0.31 -0.98 0.89 -0.31 -0.36 -0.57 0.13 -0.6 -0.81 -0.71 -1.0 -0.93 -0.32 0.05 0.03 -1.41 -0.89 -0.44 -0.17 0.0 -0.1 -0.23 0.12 0.14 0.47 0.1 -0.49 0.27 0.16 0.95 1.51 1.22 0.95 0.7 0.68 -0.37 1.45 -0.06 -0.02 1.14 -0.07 -0.27 -0.37 -1.67 -1.97 -1.73 -0.24 0.4 -0.88 -0.71 -0.21 -0.44 -0.32 0.15 0.02 0.83 0.82 -0.1 -0.01 -0.45 -0.6 -0.35 0.07 0.42 -1.3 -1.99 -1.0 -0.73 -0.35 -0.78 -0.7 -0.39 0.48 0.11 -0.04 0.63 0.27 0.01 -0.12 -0.16 -1.31 0.0 -0.08 -0.02 0.18 -0.03 0.09 -0.51 -1.11 1.14 -0.43 -1.01 0.44 -0.23 0.29 0.18 0.61 -0.44
-0.79 -0.92 0.48 -0.52 -0.06 -0.64 0.14 -0.56 -0.76 -0.76 -1.01 -0.86 -0.51 -0.2 -0.12 -0.28 -0.8 -0.08 0.24 0.29 0.06 -0.55 -0.08 -0.43 -0.15 -0.43 0.08 -0.33 -0.49 0.56 1.08 0.66 0.83 0.27 0.94 0.53 0.51 0.04 0.09 0.25 -0.03 0.86 1.6 -0.9 -1.26 -0.81 -0.05 -0.26 -0.76 -0.57 -0.49 -0.65 -0.44 -0.04 0.81 1.12 0.73 -0.45 -0.43 -0.67 -0.87 -0.79 -0.63 0.11 0.09 -0.95 -0.82 0.1 0.2 0.06 -0.16 -1.29 -0.24 -0.32 0.72 0.65 0.63 -0.43 0.42 -0.67 0.27 -0.52 -0.47 -0.89 0.19 -0.66 -0.42 -0.73 -0.29 0.91 -0.67 -0.25 0.55 0.11 0.68 0.74 0.43 -0.62
-0.93 -1.1 0.36 -0.71 -0.22 0.03 -0.37 -0.37 -0.88 -1.03 -1.19 -0.99 -0.67 -0.4 0.92 -0.0 -0.88 -0.19 -0.45 -0.3 -0.36 -0.12 0.11 -0.37 0.0 -0.22 -1.78 0.34 0.04 0.68 0.68 0.45 0.42 -0.26 -0.52 -0.59 0.21 -0.35 0.09 0.05 -0.01 0.37 0.95 -1.29 -1.29 -1.56 -0.44 0.69 -0.07 0.07 0.73 -0.02 0.17 0.62 0.94 1.01 0.19 0.19 0.25 -0.96 -0.47 -0.47 -0.32 -0.06 -0.14 -1.25 -1.11 -0.93 -0.57 -0.52 -0.62 0.07 0.79 0.08 -1.13 -0.68 1.18 -0.72 -0.23 -0.42 0.01 -0.55 -0.75 -0.56 0.38 -0.14 0.14 -0.46 0.05 0.84 -0.27 0.24 0.32 1.08 1.47 1.46 -0.09 -0.35
-0.67 -0.73 -0.03 -1.18 -0.01 -0.29 0.4 -0.46 -0.97 -0.99 -0.84 -1.36 -0.01 0.21 0.93 -0.49 -0.54 -0.67 0.54 0.63 0.44 0.04 0.65 0.0 -0.1 -0.16 0.22 -0.16 0.06 0.08 -0.46 -0.24 0.75 0.45 -0.1 -0.23 1.92 -0.23 0.6 1.25 0.18 1.76 1.72 -0.24 -0.49 -0.19 0.59 0.85 -0.37 -0.41 0.14 -0.13 -0.13 0.1 0.46 0.69 0.81 -0.02 0.15 -1.35 -1.2 -1.25 -1.17 0.1 -1.59 -3.87 -1.86 -1.38 -1.44 -1.52 -1.56 0.26 0.36 1.3 0.55 0.37 -0.08 0.03 -0.85 0.07 -0.36 -0.16 0.04 -0.29 -0.73 -0.91 -0.59 -0.68 -0.91 0.18 -1.02 -1.19 -0.08 -2.61 -2.43 -2.73 0.71 -0.2
-1.88 -1.9 0.14 -0.22 -0.0 -0.57 -0.41 -0.17 -0.6 -0.73 -0.56 -0.62 -0.63 -0.16 0.97 -0.15 -0.14 -0.58 -0.3 -0.1 -0.2 -0.19 0.36 -0.53 0.01 -0.39 -0.93 0.25 0.16 0.48 0.37 0.43 0.32 0.16 0.72 0.51 0.31 -0.21 0.13 0.13 0.36 -0.32 -0.11 -0.76 -0.95 -0.68 0.07 1.02 -0.25 -0.17 0.04 -0.4 -0.21 0.16 2.18 1.57 1.0 -0.32 -0.57 -0.65 -0.15 0.56 -1.04 0.36 0.25 -1.63 -1.1 0.08 0.16 0.47 0.16 0.27 0.62 0.46 -0.2 -0.26 0.62 -0.32 -0.39 -0.28 0.18 -0.22 -0.36 0.01 -0.69 -1.35 -1.07 -1.16 -1.05 -0.64 -1.31 -1.11 -0.58 0.34 0.54 0.57 -0.24 -0.17
-0.67 -1.02 0.51 -0.45 -0.14 -0.76 0.31 -0.71 -0.48 -0.59 -0.45 -0.83 0.11 0.46 0.6 -1.25 -0.82 -0.24 -0.2 -0.02 -0.23 -0.27 0.56 0.14 0.14 0.04 -0.46 0.12 -0.16 1.11 1.88 0.73 1.0 0.5 -0.06 -0.32 1.47 -1.59 -0.33 0.47 -1.16 0.13 0.14 -1.25 -1.52 -1.44 0.22 0.66 -0.62 -0.71 -0.26 -0.02 -0.14 0.05 -0.12 0.61 0.95 0.18 0.56 -0.44 -0.42 -0.54 -0.08 -0.33 -1.63 -2.4 -1.48 -0.92 -0.93 -1.28 -1.32 -0.51 0.53 0.73 -0.01 -0.8 0.24 0.31 -1.05 -0.03 -1.69 0.14 0.3 -0.08 0.04 -0.39 -0.0 -0.33 -1.08 1.98 -0.52 -0.58 1.57 -1.68 -1.15 -1.2 0.75 -0.37
-0.13 -0.27 0.49 -1.12 -0.47 -1.3 -0.01 -0.82 -1.07 -1.2 -1.67 -1.42 -0.25 -0.08 0.84 -1.54 -2.04 -0.01 0.19 0.2 0.14 -0.13 0.13 0.47 0.31 0.47 -1.22 0.69 0.59 0.13 0.94 0.69 0.32 -0.35 0.71 0.05 0.66 0.19 0.43 1.01 0.16 1.64 1.91 -1.02 -1.55 -1.27 -0.45 -0.77 -0.26 -0.12 0.17 0.15 0.25 0.68 1.17 1.03 0.7 -0.2 0.13 -1.24 -1.23 -0.82 -0.92 -0.16 -0.74 -1.74 -0.65 0.16 0.48 0.51 0.07 -0.74 0.17 -0.2 -0.71 1.44 0.22 -0.58 -0.53 -0.55 -1.75 -0.61 -0.65 -1.02 0.06 -0.42 -0.12 -0.51 -1.2 -0.04 -0.83 -1.29 -0.74 -0.97 -0.11 0.11 0.32 -0.75
-2.38 -2.66 0.84 -1.67 -1.47 -1.79 1.34 -0.07 0.4 -0.98 -0.89 0.37 -1.82 -0.93 -0.91 0.07 0.67 -1.7 -0.2 -0.44 -1.01 -1.09 -1.02 -0.71 -0.54 -1.51 -1.49 -0.64 -2.23 1.22 1.79 1.5 2.4 1.81 0.98 0.13 -0.07 -0.17 0.19 0.62 -0.24 -2.63 -0.36 -1.96 -3.03 -4.19 -0.66 -3.13 -1.87 -1.81 -1.72 -2.13 -2.21 -0.39 1.01 1.49 -1.25 -1.0 -1.26 -2.42 -2.82 -2.55 -1.79 2.07 -1.04 -1.07 -2.58 -0.47 -2.44 -0.9 -0.27 -1.63 0.67 -1.69 1.83 0.4 1.38 -2.85 -1.34 -2.71 -2.38 -2.67 -2.71 -2.98 -2.0 -2.46 -1.78 -2.21 -1.91 1.09 -2.33 -1.19 0.74 1.86 1.84 2.08 2.02 -0.31
-0.94 -1.14 -0.35 -0.67 -0.09 -0.59 0.35 -0.57 -0.4 -0.62 -0.62 -0.45 -0.34 -0.12 0.0 0.23 0.68 -0.64 0.31 0.39 0.26 -0.42 0.55 -0.14 0.06 -0.28 1.05 0.24 0.54 -0.66 -0.34 -0.43 1.54 1.32 0.71 0.19 0.58 -0.16 0.58 0.29 0.25 0.85 0.65 -1.51 -1.76 -0.86 -0.8 0.94 -0.85 -0.71 -0.45 -0.65 -0.51 -0.3 2.08 2.09 1.71 -0.53 -0.68 -0.93 -1.48 -1.04 -1.53 -0.3 -0.08 -1.76 -0.71 0.45 0.61 0.32 0.56 -0.87 -0.58 0.53 -1.31 -0.72 -0.44 -0.35 0.11 -0.73 -0.32 -0.32 -0.51 -0.51 -0.54 -1.67 -1.27 -1.3 -1.42 0.55 -1.38 -1.51 0.32 -1.22 -0.78 -0.94 0.18 -0.44
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-0.38 -0.63 0.18 0.17 0.46 0.22 -0.3 -0.43 -0.17 -0.32 -0.17 -0.37 0.22 0.36 0.47 -0.61 -2.54 0.45 0.29 0.41 0.25 -0.14 0.1 -0.36 -0.21 -0.03 -0.01 0.32 0.59 -0.28 0.25 0.21 -0.08 -0.07 -0.27 0.28 0.32 0.13 0.48 0.41 0.71 -0.12 0.12 0.13 -0.12 0.39 0.65 0.72 -0.07 -0.09 -0.09 -0.04 0.07 0.1 0.26 0.51 1.3 -0.27 -0.02 0.42 0.45 0.0 0.18 -0.37 -0.32 -1.96 -1.02 -1.1 -1.23 0.19 -1.16 -0.16 0.14 0.65 -0.86 0.04 0.43 0.19 -0.54 0.1 0.17 0.23 0.12 0.27 -0.7 -0.94 -0.51 -0.23 -0.4 0.68 -0.67 -0.94 0.04 -1.9 -1.72 -1.63 -0.06 -0.23
-1.02 -1.62 0.58 0.3 -0.09 -0.77 -0.54 -1.23 0.56 0.0 0.32 0.58 0.23 -0.08 0.73 -1.36 -1.65 -0.85 -0.43 -0.49 -0.65 -0.11 0.34 0.08 0.08 0.18 -1.81 1.08 0.94 0.11 -0.12 0.39 0.68 0.61 -0.32 -0.12 0.89 0.03 0.33 0.83 0.44 0.02 0.12 -1.1 -1.3 -1.2 -0.43 1.46 -0.57 -0.67 -0.92 -0.49 -0.33 -0.49 2.34 1.79 2.26 -0.35 -0.23 0.16 0.22 0.06 0.1 -0.23 0.35 -1.64 -0.96 -0.72 -0.96 0.3 -0.8 -0.01 0.11 0.53 -1.38 -1.18 -0.52 -0.35 -0.82 -0.17 -1.43 -0.23 -0.46 -0.29 -0.65 -0.79 -0.46 -0.9 -1.09 0.25 -1.25 -1.49 0.27 -2.8 -2.76 -2.56 -0.04 -1.04
-0.02 -0.13 -0.12 0.51 0.13 -0.57 0.33 -0.34 -0.4 -0.3 -0.32 -0.69 0.59 0.4 0.63 -1.14 0.23 0.12 0.66 0.93 0.7 0.19 0.03 0.14 -0.11 0.03 0.44 0.25 0.29 -0.44 0.47 -0.19 0.04 0.04 1.08 0.17 0.44 0.05 -0.29 0.66 0.11 0.64 0.3 0.19 -0.3 0.03 0.91 0.89 -0.37 -0.2 -0.29 -0.01 0.05 -0.35 0.02 0.43 1.57 -0.05 0.25 0.37 0.46 0.37 0.2 -0.07 -1.26 -1.8 -1.06 -2.09 -1.96 -0.63 -2.37 -1.27 0.19 -0.2 -1.74 1.11 0.04 -0.27 -0.9 -0.73 -0.81 -0.32 -0.5 -1.28 0.28 -0.86 -0.56 -0.0 -0.4 0.49 -0.29 -0.94 -0.73 -3.1 -2.79 -2.6 0.6 -0.18
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.