Heatmap: Cluster_85 (HCCA)

View as: (view zlog-transformed or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Showing raw values)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
9.12 4.47 2.29 0.53 0.58 0.57 13.17 10.42 6.26 14.6 1.89 1.38 1.36 1.59 0.53 0.92 0.87 3.0 1.72 4.79 3.97 2.03 0.62
0.0 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.66 0.0 0.18 5.58 0.0 0.15 0.22 0.09 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.22 0.0 0.0 0.0
9.15 1.77 0.88 0.6 0.08 0.09 3.96 3.29 3.07 48.08 0.2 6.02 1.1 0.43 0.29 0.84 0.61 1.43 1.0 7.16 1.29 1.04 0.47
0.74 0.17 0.6 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.2 0.42 0.0 0.7 1.62 0.1 0.14 0.0 0.21 0.2 0.0 0.0 0.0 0.16 0.06 0.35 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.36 0.0 2.53 0.0 0.0 1.85 1.67 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.9 0.35 1.35 0.1 0.33 0.08 0.37 0.0 0.6 1.48 0.35 0.29 0.25 0.93 0.3 0.16 0.1 0.04 0.0 0.57 1.36 0.0 0.0
0.0 0.87 6.09 0.6 0.0 1.19 2.5 0.0 0.66 10.02 0.0 0.0 0.83 0.71 6.08 0.0 0.66 0.0 0.0 1.11 3.98 0.0 0.0
4.47 2.69 3.6 1.02 1.14 0.82 6.17 0.86 3.9 38.39 2.59 0.97 1.47 7.66 6.24 1.05 1.04 0.37 0.41 2.49 3.6 1.2 0.86
1.15 0.0 3.49 0.1 0.56 0.23 6.15 1.11 1.42 1.23 0.76 0.61 1.57 3.17 4.12 0.28 0.45 0.15 0.0 0.45 3.02 1.97 0.0
0.0 5.89 0.0 0.0 2.05 0.0 0.0 0.0 13.05 38.28 12.42 14.05 16.1 17.78 6.2 0.0 1.24 2.16 1.77 6.17 27.5 0.0 0.0
0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.07 0.0 0.0 0.0 0.04 0.08 0.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0
0.2 0.05 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.06 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.14 0.0
0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.2 0.08 0.42 0.06 0.08 0.06 0.6 0.17 0.02 0.08 0.05 0.06 0.01 0.04 0.22 0.0 0.05 0.0 0.0 0.14 0.03 0.0 0.11
112.07 92.29 6.89 30.25 46.79 54.44 211.42 28.41 103.06 178.89 12.73 71.33 34.78 20.95 11.47 22.65 23.67 46.72 45.0 40.95 34.52 81.76 89.25
0.78 0.88 0.2 0.08 0.05 0.02 1.46 0.32 0.26 1.76 0.22 0.34 0.21 0.13 0.18 0.07 0.17 0.05 0.04 0.5 0.59 0.23 0.32
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.06 0.24 0.0 0.14 0.09 0.06 0.08 0.11 0.18 0.08 0.13 0.05 0.07 0.13 0.24 0.16 0.17 0.01 0.02 0.1 0.17 0.36 0.22
0.96 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.5 0.44 0.18 0.1 0.09 0.0 0.07 0.0 0.12 0.0 0.0 0.0
0.0 0.1 0.0 0.02 0.01 0.02 0.0 0.04 0.02 0.07 0.14 0.03 0.06 0.03 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 0.77 8.92 1.09 0.65 1.38 2.93 0.96 1.18 6.19 0.74 0.49 0.77 1.34 5.23 0.85 0.19 0.0 0.27 1.29 1.75 2.11 1.93
1.29 0.74 2.04 0.57 0.45 0.4 1.0 0.8 0.91 0.83 0.37 0.5 0.75 0.6 1.08 0.28 0.32 0.3 0.28 0.87 0.68 0.32 0.73
0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.49 65.65 4.29 5.99 4.26 8.99 0.0 0.0 13.32 18.32 7.23 12.21 15.31 24.78 6.54 10.7 0.0 4.8 13.48 0.0 0.0 23.63
0.0 0.0 0.0 0.0 4.25 0.0 0.0 0.0 0.0 22.14 0.0 0.0 0.0 5.69 12.17 0.0 0.0 0.0 3.07 4.92 0.0 0.0 0.0
0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.02 0.15 0.0 0.04 0.44 0.15 0.0 0.01 0.02 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.1 0.0 0.0
0.24 0.18 0.36 0.14 0.0 0.07 0.29 0.0 0.0 0.46 0.0 0.1 0.1 0.04 0.43 0.0 0.08 0.0 0.0 0.16 0.12 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.22 0.12 0.1 0.0 0.14 0.13 0.0 0.0 0.0 0.05 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.0 1.18 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.7 0.0 0.0 0.0 0.44 0.0 1.28 0.39 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0
2.72 2.48 1.33 1.71 1.75 2.1 1.96 1.99 0.66 4.92 1.46 2.24 2.8 1.97 0.35 1.87 1.92 1.31 1.16 1.65 1.49 2.2 2.87
0.28 1.15 0.43 0.38 0.16 0.14 0.35 0.15 0.69 3.92 1.38 0.45 1.09 0.14 1.33 0.46 0.34 0.0 0.04 0.43 2.0 0.0 0.15
0.54 0.43 4.6 0.17 0.0 0.14 1.89 0.41 1.35 3.51 0.15 0.73 0.43 1.67 2.15 0.18 0.08 0.0 0.0 0.55 0.5 0.0 0.0
0.0 0.0 2.41 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.71 2.89 0.53 0.15 0.23 0.1 0.96 0.0 0.0 0.0 0.0 0.24 0.26 0.0 0.87
0.24 0.14 0.15 0.06 0.0 0.17 0.0 0.0 0.03 0.5 0.03 0.04 0.16 0.04 0.0 0.04 0.02 0.03 0.0 0.08 0.05 0.0 0.0
1.06 1.46 4.56 0.03 0.08 0.26 2.78 0.55 0.95 8.55 0.38 0.08 0.56 0.45 0.16 0.28 0.35 0.19 0.15 0.64 0.82 0.35 0.0
0.0 0.17 0.19 0.07 0.07 0.11 0.16 0.0 0.47 80.77 0.04 31.69 0.5 0.29 0.18 0.09 0.08 0.05 0.03 0.23 0.49 0.0 0.0
3.28 0.0 5.98 0.0 0.0 0.4 0.0 0.0 0.0 4.99 0.41 1.32 0.3 0.74 0.27 0.48 0.43 0.0 0.3 0.57 0.0 2.36 0.0
0.0 0.11 0.57 0.0 0.04 0.07 0.31 0.3 0.33 0.56 0.0 0.0 0.13 0.41 0.93 0.02 0.0 0.0 0.05 0.05 0.37 0.0 0.0
0.0 0.54 2.94 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 2.45 5.29 0.0 0.57 0.31 0.28 2.25 0.09 0.08 0.26 0.0 0.3 1.2 0.0 0.0
0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.18 0.73 0.0 0.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.9 0.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.16 0.3 0.15 0.03 0.06 0.07 0.29 0.11 0.02 0.64 0.07 0.05 0.05 0.1 0.15 0.1 0.14 0.05 0.07 0.21 0.23 0.0 0.22
0.0 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 3.41 0.0 0.0 0.0 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.95 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.2 0.0 0.0 0.0 0.04 0.18 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.44 0.0 0.0 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.81 0.72 0.89 0.21 0.11 0.19 0.42 0.2 0.4 1.94 0.0 0.29 0.22 0.38 0.83 0.18 0.08 0.06 0.09 0.88 0.5 0.45 0.27
1.45 1.04 4.7 0.57 0.13 0.54 1.93 0.58 2.91 14.03 0.11 0.52 5.61 0.43 0.22 0.26 0.14 0.27 0.27 0.71 2.65 1.5 1.76
3.84 0.0 22.02 4.45 11.96 11.82 0.0 2.95 8.48 28.23 4.37 4.25 4.65 4.97 18.3 0.0 1.19 0.97 0.0 6.6 7.2 6.52 5.94
0.22 0.43 0.51 0.19 0.11 0.15 0.35 0.14 0.3 0.85 0.18 0.06 0.17 0.4 0.07 0.12 0.23 0.04 0.08 0.09 0.06 0.3 0.09
0.0 0.0 0.0 0.0 3.6 0.0 0.0 0.0 0.0 15.38 7.38 11.43 5.79 4.85 5.17 0.0 0.0 3.6 5.89 4.08 0.0 0.0 0.0
3.09 1.71 0.0 0.0 0.25 0.14 2.74 0.36 4.25 6.79 0.39 0.61 1.56 0.08 1.07 0.32 0.14 0.36 0.09 4.17 2.86 1.58 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 2.97 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.34 41.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 3.68 0.0 0.0 0.0
0.21 0.16 0.09 0.02 0.02 0.06 0.08 0.0 0.15 0.08 0.17 0.0 0.05 0.0 0.01 0.05 0.07 0.0 0.01 0.53 0.48 0.0 0.1

Details

Raw expression values (TPM normalized), Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)