Heatmap: Cluster_84 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.32 0.43 0.8 0.13 0.12 0.24 0.47 0.2 1.0 0.86 0.22 0.43 0.26 0.41 0.3 0.12 0.12 0.08 0.06 0.35 0.2 0.2 0.13
0.45 0.64 0.63 0.43 0.14 0.34 0.38 0.11 1.0 0.91 0.65 0.21 0.65 0.92 0.54 0.1 0.11 0.05 0.07 0.3 0.67 0.12 0.21
0.21 0.31 1.0 0.18 0.1 0.16 0.31 0.09 0.21 0.11 0.35 0.11 0.54 0.3 0.25 0.12 0.1 0.06 0.06 0.17 0.17 0.09 0.08
0.08 0.23 0.56 0.09 0.0 0.08 0.27 0.15 0.14 1.0 0.21 0.19 0.21 0.32 0.06 0.04 0.11 0.01 0.09 0.26 0.03 0.06 0.0
0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.88 0.57 0.24 0.33 0.28 0.29 0.16 1.0 0.14 0.13 0.11 0.0 0.81 0.4 0.0 0.0 0.0
0.38 0.67 0.41 0.31 0.35 0.41 0.54 0.2 0.66 1.0 0.49 0.38 0.54 0.47 0.25 0.18 0.18 0.13 0.12 0.27 0.44 0.24 0.24
1.0 0.64 0.53 0.48 0.11 0.29 0.66 0.34 0.33 0.67 0.42 0.39 0.3 0.5 0.57 0.1 0.22 0.06 0.05 0.55 0.89 0.45 0.37
1.0 0.72 0.21 0.27 0.2 0.3 0.59 0.48 0.46 0.46 0.4 0.35 0.28 0.93 0.34 0.26 0.41 0.43 0.43 0.69 0.47 0.44 0.61
0.67 0.83 0.25 0.19 0.18 0.36 0.52 0.41 0.47 0.75 0.34 0.39 0.22 0.26 0.11 0.31 0.39 0.29 0.29 0.49 0.51 1.0 0.65
0.58 0.54 1.0 0.44 0.27 0.14 0.2 0.19 0.73 0.43 0.3 0.57 0.3 0.34 0.76 0.08 0.13 0.1 0.11 0.22 0.4 0.46 0.26
0.57 0.64 1.0 0.49 0.47 0.17 0.56 0.22 0.76 0.22 0.33 0.59 0.33 0.35 0.66 0.1 0.1 0.1 0.11 0.17 0.38 0.22 0.22
0.31 1.0 0.95 0.44 0.33 0.16 0.17 0.08 0.77 0.36 0.37 0.58 0.21 0.3 0.81 0.06 0.09 0.05 0.06 0.18 0.5 0.18 0.25
0.27 0.59 0.0 0.04 0.07 0.04 0.07 0.0 0.04 0.22 0.35 0.41 0.34 0.06 1.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.28 0.77 0.54 0.1
0.16 0.65 0.3 0.43 0.07 0.27 0.06 0.01 1.0 0.08 0.02 0.42 0.06 0.11 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.22 0.07 0.04 0.06
0.93 1.0 0.6 0.84 0.5 0.83 0.55 0.43 0.52 0.45 0.73 0.55 0.53 0.47 0.49 0.48 0.43 0.25 0.24 0.38 0.78 0.68 0.72
1.0 0.84 0.91 0.45 0.56 0.55 0.45 0.41 0.49 0.65 0.72 0.42 0.36 0.56 0.49 0.61 0.57 0.36 0.38 0.48 0.6 0.71 0.75
0.92 0.94 0.37 0.38 0.46 0.51 0.98 0.58 0.39 0.74 0.63 0.62 0.62 0.82 0.28 0.57 0.77 0.6 0.59 0.54 1.0 0.71 0.89
0.29 0.56 0.53 0.25 0.16 0.14 0.08 0.04 0.13 0.18 0.51 0.23 0.18 1.0 0.39 0.09 0.11 0.03 0.02 0.08 0.42 0.21 0.46
0.46 0.5 0.55 0.16 0.05 0.09 0.22 0.0 1.0 0.33 0.08 0.3 0.46 0.35 0.22 0.12 0.09 0.03 0.05 0.25 0.57 0.22 0.1
0.78 1.0 0.53 0.39 0.46 0.51 0.74 0.66 0.25 0.45 0.85 0.59 0.58 0.67 0.34 0.75 0.64 0.43 0.44 0.4 0.6 0.49 0.59
1.0 0.97 0.64 0.29 0.22 0.45 0.51 0.54 0.35 0.23 0.55 0.45 0.32 0.99 0.68 0.42 0.52 0.48 0.48 0.69 0.84 0.65 0.8
0.85 0.79 0.61 0.45 0.61 0.68 1.0 0.6 0.89 0.77 0.83 0.47 0.47 0.35 0.19 0.51 0.5 0.24 0.27 0.52 0.41 0.59 0.54
0.24 1.0 0.74 0.3 0.21 0.27 0.16 0.07 0.16 0.61 0.17 0.91 0.25 0.59 0.73 0.08 0.06 0.04 0.04 0.25 0.6 0.6 0.44
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.41 0.0 0.11 0.0 0.13 0.0 0.41 0.27 0.4 0.06 0.0 0.04 0.14 0.12 0.0 0.0 0.0
0.47 1.0 0.14 0.3 0.08 0.47 0.15 0.06 0.46 0.52 0.14 0.61 0.64 0.12 0.02 0.0 0.01 0.01 0.01 0.19 0.6 0.11 0.09
1.0 0.33 0.4 0.25 0.19 0.3 0.48 0.42 0.56 0.92 0.28 0.39 0.5 1.0 0.54 0.21 0.25 0.29 0.27 0.54 0.37 0.41 0.48
0.0 0.14 0.0 0.21 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.3 0.19 0.15 0.61 0.27 0.06 0.0 0.05 0.16 0.59 0.17 0.0 0.0
0.34 0.5 0.21 0.52 0.66 1.0 0.13 0.12 0.13 0.31 0.36 0.31 0.25 0.28 0.13 0.21 0.21 0.16 0.15 0.16 0.29 0.39 0.42
0.24 1.0 0.2 0.49 0.25 0.64 0.59 0.09 0.36 0.76 0.32 0.77 0.46 0.1 0.13 0.02 0.01 0.02 0.01 0.35 0.86 0.18 0.14
0.61 0.47 0.44 0.52 0.22 0.33 0.32 0.1 0.99 1.0 0.52 0.48 0.38 0.58 0.33 0.19 0.17 0.13 0.13 0.36 0.39 0.42 0.37
0.17 0.48 0.27 0.34 0.26 0.28 0.53 0.19 0.29 1.0 0.47 0.33 0.26 0.24 0.14 0.24 0.15 0.07 0.05 0.3 0.23 0.49 0.63
0.57 0.6 1.0 0.66 0.19 0.49 0.63 0.19 0.47 0.26 0.6 0.49 0.59 0.56 0.53 0.16 0.11 0.08 0.09 0.5 0.6 0.34 0.31
0.37 0.23 0.37 0.47 0.4 0.16 0.25 0.12 1.0 0.89 0.32 0.29 0.15 0.47 0.5 0.1 0.04 0.05 0.05 0.17 0.42 0.49 0.44
0.0 0.09 1.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.08 0.2 0.21 0.26 0.47 0.62 0.31 0.04 0.07 0.0 0.0 0.28 0.0 0.0 0.0
0.82 1.0 0.31 0.19 0.12 0.36 0.52 0.3 0.46 0.93 0.66 0.34 0.35 0.84 0.44 0.28 0.46 0.14 0.17 0.5 0.86 0.29 0.44
0.73 1.0 0.35 0.62 0.52 0.92 0.55 0.36 0.46 0.6 0.56 0.43 0.33 0.41 0.41 0.33 0.4 0.21 0.21 0.42 0.88 0.44 0.55
0.57 1.0 0.07 0.36 0.14 0.47 0.53 0.15 0.48 0.26 0.2 0.32 0.18 0.13 0.1 0.1 0.11 0.06 0.06 0.39 0.33 0.62 0.52
0.74 0.71 0.57 0.56 0.24 0.33 0.31 0.16 0.35 0.34 0.51 0.54 0.33 0.48 0.63 0.16 0.15 0.1 0.11 0.43 1.0 0.38 0.31
0.91 1.0 0.74 0.5 0.54 0.81 0.43 0.46 0.7 0.52 0.62 0.69 0.76 0.48 0.56 0.44 0.44 0.39 0.39 0.49 0.71 0.85 0.92
0.13 0.18 0.83 0.04 0.08 0.08 0.34 0.0 0.78 1.0 0.0 0.29 0.39 0.58 0.22 0.03 0.09 0.09 0.0 0.25 0.2 0.0 0.45
0.68 0.76 0.16 0.37 0.39 0.4 0.5 0.26 0.35 0.48 1.0 0.45 0.66 0.25 0.25 0.66 0.5 0.36 0.39 0.39 0.34 0.48 0.52
1.0 0.5 0.25 0.57 0.24 0.46 0.87 0.59 0.89 0.76 0.38 0.79 0.33 0.46 0.36 0.21 0.15 0.13 0.14 0.37 0.59 0.41 0.56
0.81 0.64 1.0 0.3 0.16 0.28 0.29 0.25 0.56 0.59 0.52 0.55 0.26 0.7 0.37 0.22 0.25 0.2 0.21 0.42 0.6 0.33 0.36
0.69 0.91 0.31 0.73 0.44 1.0 0.5 0.15 0.64 0.66 0.2 0.71 0.3 0.28 0.26 0.03 0.03 0.1 0.09 0.27 0.57 0.54 0.64
0.95 0.99 0.86 0.22 0.29 0.33 0.89 0.27 0.38 0.89 0.66 0.72 0.65 0.77 0.69 0.19 0.2 0.24 0.26 0.86 1.0 0.45 0.49
0.94 0.95 0.58 0.63 0.43 0.68 1.0 0.46 0.35 0.53 0.92 0.43 0.48 0.57 0.33 0.35 0.41 0.21 0.19 0.5 0.68 0.51 0.47
1.0 0.89 0.24 0.27 0.21 0.31 0.45 0.4 0.31 0.55 0.42 0.41 0.26 0.76 0.13 0.29 0.47 0.39 0.39 0.4 0.47 0.31 0.4
0.64 0.75 0.41 0.5 0.58 0.54 0.89 0.42 0.59 1.0 0.68 0.52 0.54 0.39 0.3 0.48 0.51 0.2 0.22 0.41 0.52 0.3 0.5
1.0 0.6 0.63 0.56 0.41 0.5 0.67 0.66 0.53 0.59 0.33 0.58 0.4 0.73 0.44 0.43 0.21 0.28 0.29 0.41 0.69 0.57 0.51
0.62 0.8 0.09 0.4 0.11 0.38 1.0 0.03 0.71 0.52 0.06 0.65 0.1 0.03 0.1 0.02 0.03 0.03 0.02 0.57 0.82 0.48 0.43
0.26 0.61 0.4 0.32 0.34 0.27 0.72 0.07 0.59 1.0 0.89 0.25 0.34 0.43 0.43 0.21 0.21 0.11 0.07 0.24 0.33 0.34 0.35
0.0 0.15 1.0 0.08 0.03 0.06 0.35 0.0 0.25 0.59 0.15 0.16 0.37 0.51 0.08 0.14 0.26 0.05 0.02 0.25 0.09 0.0 0.15
1.0 0.44 0.44 0.32 0.26 0.25 0.63 0.36 0.58 0.56 0.42 0.35 0.34 0.71 0.43 0.22 0.2 0.16 0.19 0.37 0.4 0.37 0.32
0.45 0.66 0.64 1.0 0.3 0.62 0.73 0.25 0.95 0.87 0.45 0.44 0.83 0.17 0.47 0.07 0.06 0.09 0.1 0.37 0.62 0.27 0.27
0.76 0.57 0.76 0.23 0.12 0.19 0.36 0.08 0.23 0.63 0.41 0.25 0.22 1.0 0.44 0.06 0.16 0.1 0.11 0.27 0.61 0.21 0.41
0.22 1.0 0.05 0.56 0.45 0.59 0.51 0.58 0.2 0.17 0.07 0.38 0.1 0.08 0.14 0.17 0.15 0.25 0.22 0.27 0.77 0.74 0.79
0.21 0.42 0.68 0.31 0.06 0.18 0.13 0.05 1.0 0.37 0.25 0.13 0.07 0.26 0.18 0.07 0.08 0.03 0.03 0.18 0.2 0.13 0.15
1.0 0.76 0.58 0.56 0.29 0.47 0.75 0.34 0.56 0.52 0.59 0.49 0.27 0.65 0.47 0.4 0.6 0.29 0.27 0.85 0.82 0.85 0.93
0.13 0.96 0.15 0.92 0.89 0.71 0.38 0.14 0.46 0.26 0.17 1.0 0.14 0.14 0.2 0.13 0.09 0.09 0.07 0.31 0.39 0.33 0.29
0.26 0.39 0.53 0.07 0.03 0.09 0.36 0.0 0.3 1.0 0.09 0.06 0.07 0.34 0.11 0.02 0.04 0.02 0.05 0.12 0.17 0.0 0.1
1.0 0.64 0.49 0.33 0.19 0.33 0.48 0.33 0.99 0.59 0.46 0.34 0.32 0.91 0.65 0.27 0.42 0.37 0.39 0.6 0.56 0.45 0.56
0.41 0.86 0.22 0.5 0.65 1.0 0.42 0.12 0.22 0.46 0.2 0.43 0.23 0.18 0.09 0.17 0.11 0.08 0.08 0.35 0.59 0.53 0.52
1.0 0.74 0.76 0.74 0.59 0.83 0.57 0.43 0.24 0.54 0.79 0.68 0.58 0.53 0.57 0.61 0.63 0.38 0.36 0.52 0.92 0.67 0.63
0.21 0.53 0.83 0.06 0.0 0.02 0.0 0.06 0.65 1.0 0.49 0.06 0.1 0.3 0.38 0.09 0.26 0.01 0.02 0.16 0.17 0.12 0.0
0.85 0.61 0.77 0.52 0.1 0.29 0.7 0.26 1.0 0.59 0.25 0.35 0.24 0.56 0.29 0.1 0.11 0.09 0.05 0.51 0.52 0.32 0.28
0.35 0.37 0.59 0.13 0.13 0.22 0.2 0.12 0.15 0.46 0.2 0.14 0.17 0.61 1.0 0.14 0.17 0.13 0.18 0.22 0.76 0.23 0.14
0.91 0.86 0.66 0.24 0.21 0.3 0.72 0.31 0.28 0.72 0.74 0.78 0.77 0.55 0.82 0.18 0.19 0.22 0.22 0.86 1.0 0.41 0.43
0.0 0.22 0.79 0.0 0.0 0.0 0.32 0.0 0.09 0.34 0.6 0.18 0.84 1.0 0.42 0.0 0.0 0.0 0.0 0.33 0.0 0.0 0.0
0.78 1.0 0.19 0.37 0.17 0.48 0.39 0.09 0.77 0.91 0.12 0.53 0.17 0.25 0.06 0.06 0.06 0.1 0.08 0.62 0.75 0.56 0.52
0.84 1.0 0.13 0.34 0.27 0.53 0.43 0.28 0.46 0.32 0.22 0.8 0.23 0.22 0.19 0.2 0.16 0.33 0.34 0.49 0.74 0.69 0.87
1.0 0.45 0.38 0.68 0.12 0.23 0.28 0.27 0.46 0.47 0.3 0.31 0.16 0.47 0.25 0.23 0.33 0.19 0.18 0.26 0.49 0.21 0.27
0.15 0.44 0.23 0.11 0.04 0.11 0.1 0.12 1.0 0.28 0.31 0.21 0.18 0.24 0.34 0.07 0.02 0.08 0.12 0.28 0.3 0.0 0.13
0.18 0.09 0.0 0.05 0.28 0.2 0.21 0.0 0.0 0.55 0.21 0.49 0.36 0.22 1.0 0.03 0.0 0.05 0.07 0.1 0.34 0.0 0.0
0.55 0.65 1.0 0.48 0.3 0.43 0.7 0.16 0.95 0.93 0.76 0.33 0.65 0.7 0.54 0.13 0.15 0.11 0.1 0.67 0.76 0.36 0.25
1.0 0.75 0.39 0.12 0.09 0.14 0.97 0.45 0.5 0.74 0.28 0.13 0.41 0.95 0.33 0.2 0.27 0.1 0.15 0.6 0.41 0.28 0.16
0.31 0.38 0.41 0.19 0.11 0.22 0.32 0.2 1.0 0.64 0.47 0.29 0.26 0.35 0.35 0.17 0.18 0.13 0.11 0.26 0.36 0.13 0.18
0.25 0.74 0.28 0.34 0.3 0.27 1.0 0.76 0.65 0.83 0.8 0.24 0.37 0.67 0.37 0.39 0.72 0.32 0.22 0.25 0.44 0.39 0.39
0.0 0.12 0.86 0.26 0.16 0.0 0.0 0.0 0.57 0.13 0.28 0.25 1.0 0.63 0.98 0.0 0.19 0.08 0.12 0.32 0.0 0.51 0.0
0.19 0.13 1.0 0.07 0.08 0.05 0.23 0.05 0.48 0.06 0.03 0.07 0.1 0.22 0.27 0.13 0.08 0.04 0.03 0.09 0.22 0.05 0.02
1.0 0.86 0.44 0.72 0.35 0.5 0.44 0.2 0.5 0.84 0.52 0.76 0.4 0.42 0.38 0.37 0.3 0.13 0.13 0.35 0.81 0.55 0.56
0.34 1.0 0.15 0.91 0.79 0.98 0.89 0.53 0.42 0.41 0.27 0.62 0.2 0.17 0.18 0.23 0.18 0.39 0.33 0.23 0.87 0.83 0.92
0.91 1.0 0.67 0.41 0.4 0.44 0.81 0.48 0.96 0.9 0.61 0.55 0.53 0.9 0.47 0.46 0.45 0.35 0.35 0.63 0.78 0.46 0.46
0.76 0.59 0.24 0.31 0.17 0.27 0.72 0.4 1.0 0.46 0.22 0.46 0.21 0.47 0.41 0.19 0.23 0.21 0.19 0.39 0.5 0.44 0.66

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)