Heatmap: Cluster_28 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
1.0 0.66 0.3 0.27 0.41 0.39 0.55 0.54 0.78 0.5 1.0 0.33 0.62 0.6 0.52 0.47 0.53 0.33 0.36 0.65 0.59 0.34 0.45
0.14 0.32 0.05 0.01 0.0 0.0 1.0 0.17 0.06 0.01 0.02 0.01 0.01 0.03 0.02 0.0 0.01 0.02 0.03 0.19 0.02 0.13 0.03
0.15 0.17 0.02 0.01 0.01 0.01 1.0 0.13 0.05 0.04 0.06 0.02 0.02 0.06 0.03 0.01 0.01 0.02 0.03 0.33 0.03 0.09 0.04
0.55 0.97 0.12 0.05 0.02 0.04 1.0 0.29 0.48 0.07 0.11 0.05 0.07 0.29 0.08 0.02 0.07 0.06 0.07 0.16 0.1 0.19 0.06
0.46 0.67 0.42 0.1 0.07 0.12 1.0 0.2 0.26 0.23 0.23 0.11 0.22 0.58 0.14 0.06 0.08 0.08 0.08 0.28 0.32 0.14 0.15
0.17 0.13 0.26 0.11 0.08 0.21 1.0 0.19 0.43 0.23 0.13 0.14 0.27 0.09 0.15 0.09 0.06 0.07 0.07 0.13 0.13 0.11 0.1
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.22 0.13 0.05 0.05 0.06 1.0 0.08 0.23 0.14 0.07 0.12 0.1 0.06 0.03 0.03 0.01 0.03 0.02 0.27 0.11 0.57 0.33
0.02 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.08 0.22 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.08 0.0 0.0 0.17 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.01 0.0 0.0
0.07 0.14 0.0 0.02 0.01 0.02 1.0 0.07 0.02 0.02 0.04 0.03 0.05 0.05 0.05 0.03 0.02 0.02 0.03 0.06 0.02 0.03 0.02
0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.14 0.4 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.06 0.01 0.0 0.02 0.0 0.07 0.11 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.21 0.01 0.0 0.0
0.17 0.49 0.1 0.02 0.02 0.05 1.0 0.21 0.19 0.03 0.55 0.02 0.14 0.24 0.07 0.03 0.06 0.03 0.03 0.27 0.07 0.09 0.06
0.24 0.25 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.28 0.05 0.01 0.57 0.0 0.07 0.24 0.0 0.0 0.03 0.03 0.05 0.24 0.02 0.04 0.01
1.0 0.28 0.23 0.54 0.44 0.28 0.56 0.73 0.29 0.59 0.45 0.14 0.34 0.07 0.39 0.46 0.13 0.51 0.45 0.56 0.36 0.67 0.15
0.12 0.12 0.17 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.2 0.06 0.11 0.01 0.15 0.04 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.5 0.2 0.01 0.0
0.19 0.1 0.05 0.01 0.02 0.01 1.0 0.36 0.2 0.06 0.05 0.04 0.03 0.08 0.13 0.01 0.01 0.01 0.01 0.38 0.11 0.25 0.18
0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.13 0.0 0.0 0.0 0.08 0.04 0.04 0.04 0.0 0.0 0.04 0.47 0.0 0.0 0.0
0.07 0.17 0.2 0.03 0.01 0.04 1.0 0.14 0.19 0.03 0.05 0.03 0.04 0.04 0.06 0.02 0.02 0.02 0.01 0.05 0.08 0.04 0.04
0.07 0.02 0.07 0.01 0.0 0.01 1.0 0.01 0.07 0.04 0.01 0.01 0.03 0.02 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.1 0.03 0.01 0.01
0.09 0.05 0.2 0.02 0.02 0.02 1.0 0.02 0.05 0.03 0.03 0.02 0.04 0.08 0.07 0.01 0.02 0.01 0.01 0.13 0.04 0.01 0.01
0.09 0.12 0.01 0.04 0.06 0.03 1.0 0.03 0.11 0.02 0.01 0.11 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.17 0.04 0.31 0.27
0.0 0.0 0.0 0.02 0.05 0.02 1.0 0.05 0.17 0.07 0.0 0.14 0.05 0.02 0.05 0.01 0.01 0.09 0.04 0.08 0.0 0.0 0.1
0.0 0.0 0.0 0.25 0.23 0.25 1.0 0.0 0.0 0.0 0.16 0.33 0.27 0.54 0.4 0.15 0.07 0.0 0.0 0.08 0.0 0.72 0.0
0.04 0.18 0.04 0.01 0.0 0.02 1.0 0.05 0.02 0.02 0.05 0.02 0.04 0.03 0.06 0.01 0.01 0.0 0.0 0.21 0.07 0.07 0.07
0.09 0.27 0.26 0.03 0.01 0.03 1.0 0.04 0.05 0.02 0.03 0.12 0.13 0.1 0.09 0.03 0.04 0.01 0.0 0.35 0.1 0.16 0.14
0.0 0.08 0.0 0.02 0.04 0.0 1.0 0.38 0.11 0.3 0.07 0.02 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.03 0.0 0.0
0.25 0.26 0.32 0.14 0.36 0.21 1.0 0.18 0.11 0.13 0.14 0.14 0.13 0.16 0.2 0.1 0.15 0.15 0.16 0.18 0.16 0.11 0.16
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
1.0 0.47 0.33 0.5 0.41 0.48 0.93 0.53 0.59 0.68 0.49 0.5 0.43 0.6 0.63 0.49 0.41 0.31 0.34 0.77 0.78 0.52 0.64
0.01 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.03 0.03 0.09 0.0 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.15 0.12 0.06 0.01 0.01 0.0 1.0 0.1 0.25 0.01 0.09 0.02 0.04 0.18 0.16 0.0 0.0 0.0 0.01 0.35 0.04 0.16 0.11
0.13 0.13 0.28 0.06 0.04 0.19 1.0 0.15 0.02 0.05 0.04 0.08 0.1 0.16 0.06 0.09 0.1 0.07 0.11 0.34 0.0 0.0 0.0
0.43 0.48 0.29 0.19 0.2 0.2 1.0 0.63 0.42 0.24 0.11 0.26 0.11 0.05 0.15 0.04 0.04 0.1 0.1 0.41 0.21 0.46 0.28
0.0 0.19 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.09 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0
0.24 0.38 0.08 0.07 0.05 0.07 1.0 0.13 0.25 0.13 0.11 0.12 0.18 0.08 0.15 0.05 0.03 0.03 0.03 0.23 0.26 0.09 0.09
0.0 0.02 0.19 0.04 0.07 0.06 1.0 0.05 0.0 0.0 0.02 0.0 0.01 0.09 0.09 0.03 0.03 0.03 0.0 0.23 0.03 0.0 0.0
0.03 0.11 0.09 0.03 0.02 0.02 1.0 0.26 0.12 0.14 0.04 0.19 0.12 0.06 0.2 0.03 0.01 0.04 0.04 0.16 0.0 0.0 0.0
0.14 0.13 0.11 0.05 0.07 0.06 1.0 0.08 0.15 0.14 0.04 0.06 0.07 0.06 0.07 0.05 0.04 0.02 0.03 0.12 0.09 0.11 0.09
0.06 0.23 0.13 0.12 0.17 0.1 1.0 0.49 0.06 0.14 0.18 0.19 0.19 0.18 0.36 0.17 0.2 0.11 0.12 0.33 0.18 0.09 0.1
0.97 0.27 0.25 0.22 0.33 0.04 0.17 0.74 0.41 0.42 1.0 0.28 0.33 0.08 0.48 0.11 0.29 0.38 0.44 0.46 0.13 0.23 0.04
0.32 0.07 0.04 0.08 0.09 0.05 0.81 1.0 0.26 0.02 0.37 0.07 0.02 0.08 0.57 0.04 0.03 0.04 0.03 0.38 0.08 0.07 0.06
0.06 0.55 0.17 0.1 0.06 0.08 0.21 0.27 0.33 1.0 0.15 0.07 0.27 0.27 0.06 0.07 0.15 0.49 0.51 0.62 0.72 0.0 0.09
0.12 0.19 0.39 0.05 0.05 0.05 1.0 0.16 0.3 0.05 0.06 0.05 0.09 0.13 0.16 0.02 0.02 0.04 0.03 0.08 0.18 0.06 0.06
0.03 0.02 0.02 0.0 0.01 0.0 1.0 0.03 0.02 0.0 0.01 0.02 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.01 0.03 0.03
0.0 0.8 0.36 0.02 0.01 0.09 1.0 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.38 0.3 0.56 0.27 0.0 0.0
0.23 0.28 0.13 0.01 0.0 0.01 1.0 0.14 0.02 0.01 0.05 0.02 0.05 0.03 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.2 0.2 0.03 0.04
0.87 0.94 0.42 0.28 0.12 0.22 0.81 0.54 1.0 0.34 0.17 0.4 0.3 0.25 0.19 0.14 0.19 0.13 0.15 0.63 0.53 0.25 0.4
0.01 0.12 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.18 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.01 0.08 0.0 0.0
0.02 0.05 0.01 0.02 0.01 0.02 1.0 0.07 0.05 0.01 0.02 0.02 0.15 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.02 0.05 0.06 0.02 0.02
0.22 0.28 0.07 0.03 0.06 0.03 1.0 0.13 0.19 0.16 0.18 0.06 0.17 0.04 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.13 0.1 0.07 0.06
0.03 0.05 0.08 0.02 0.01 0.01 1.0 0.29 0.12 0.08 0.01 0.0 0.04 0.01 0.01 0.04 0.04 0.01 0.0 0.02 0.07 0.0 0.0
0.18 0.18 1.0 0.16 0.15 0.02 0.72 0.11 0.1 0.3 0.08 0.22 0.09 0.03 0.44 0.07 0.05 0.02 0.01 0.71 0.37 0.04 0.1
0.13 0.04 0.08 0.0 0.0 0.01 1.0 0.12 0.17 0.02 0.01 0.01 0.16 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.01 0.01
0.24 0.18 0.28 0.02 0.03 0.04 1.0 0.03 0.41 0.18 0.05 0.24 0.1 0.15 0.27 0.02 0.03 0.02 0.02 0.66 0.2 0.5 0.33
0.11 0.05 0.05 0.01 0.0 0.01 1.0 0.11 0.12 0.06 0.01 0.01 0.05 0.02 0.06 0.01 0.01 0.01 0.01 0.27 0.15 0.1 0.1
0.18 0.23 0.04 0.03 0.01 0.01 1.0 0.03 0.24 0.2 0.02 0.07 0.03 0.04 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.19 0.13 0.24 0.19
0.04 0.07 0.1 0.01 0.01 0.01 1.0 0.13 0.2 0.04 0.03 0.02 0.05 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.01 0.03 0.04 0.02 0.01
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.75 0.98 1.0 0.18 0.03 0.14 0.56 0.16 0.59 0.3 0.55 0.01 0.01 0.23 0.55 0.21 0.48 0.06 0.05 0.48 0.5 0.14 0.1
0.67 0.69 0.47 0.18 0.19 0.31 1.0 0.31 0.57 0.47 0.62 0.37 0.56 0.31 0.36 0.3 0.32 0.17 0.15 0.45 0.42 0.3 0.3
0.0 0.0 0.0 0.4 0.0 0.71 0.0 0.0 0.0 0.0 0.47 1.0 0.0 0.7 0.97 0.22 0.2 0.16 0.0 0.3 0.0 0.0 0.0
0.09 0.13 0.11 0.05 0.03 0.04 1.0 0.25 0.11 0.05 0.03 0.08 0.06 0.08 0.16 0.02 0.03 0.04 0.03 0.11 0.12 0.02 0.02
0.09 0.14 0.0 0.02 0.01 0.02 1.0 0.26 0.19 0.02 0.02 0.05 0.03 0.01 0.01 0.03 0.03 0.03 0.02 0.07 0.01 0.04 0.02
0.12 0.11 0.07 0.02 0.01 0.02 1.0 0.05 0.13 0.11 0.02 0.03 0.03 0.02 0.07 0.01 0.01 0.01 0.01 0.18 0.09 0.1 0.08
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 1.0 0.0 0.0 0.17 0.28 0.17 0.0 0.28 0.08 0.07 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.07 0.02 0.05 0.02 0.0 0.0 1.0 0.05 0.09 0.17 0.03 0.18 0.1 0.22 0.28 0.01 0.01 0.01 0.07 0.05 0.19 0.06 0.0
0.25 0.14 0.04 0.0 0.0 0.0 1.0 0.26 0.16 0.06 0.17 0.01 0.05 0.04 0.05 0.0 0.02 0.01 0.01 0.46 0.16 0.03 0.01
0.86 0.79 0.34 0.3 0.35 0.37 1.0 0.6 0.26 0.29 0.36 0.31 0.29 0.48 0.46 0.33 0.38 0.34 0.33 0.46 0.49 0.44 0.47
0.0 0.82 0.0 0.08 0.0 0.03 0.15 0.2 0.79 0.86 0.0 0.0 0.03 0.05 0.07 0.02 0.02 0.69 1.0 0.09 0.12 0.22 0.0
0.33 0.22 0.06 0.03 0.03 0.04 1.0 0.16 0.29 0.06 0.22 0.06 0.19 0.03 0.13 0.01 0.02 0.03 0.02 0.25 0.1 0.08 0.09
0.16 0.3 0.06 0.07 0.03 0.07 1.0 0.19 0.19 0.11 0.13 0.09 0.27 0.12 0.08 0.06 0.06 0.04 0.03 0.14 0.23 0.05 0.05
0.1 0.14 0.28 0.09 0.1 0.1 1.0 0.25 0.31 0.16 0.05 0.09 0.12 0.07 0.04 0.06 0.06 0.03 0.02 0.13 0.15 0.05 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.05 0.06 0.0 0.0 0.0 1.0 0.04 0.03 0.02 0.02 0.01 0.02 0.01 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.12 0.04 0.01 0.01
0.13 0.06 0.16 0.01 0.01 0.01 1.0 0.25 0.16 0.02 0.27 0.03 0.05 0.13 0.09 0.01 0.02 0.01 0.01 0.44 0.04 0.14 0.12
0.02 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 1.0 0.12 0.23 0.02 0.01 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.01 0.01 0.0
0.19 0.15 0.04 0.18 0.13 0.14 1.0 0.19 0.07 0.05 0.12 0.13 0.03 0.09 0.11 0.06 0.06 0.16 0.14 0.1 0.11 0.24 0.24
0.4 0.52 0.53 0.43 0.39 0.41 1.0 0.43 0.13 0.14 0.44 0.28 0.2 0.55 0.22 0.34 0.35 0.2 0.17 0.2 0.42 0.46 0.47

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)