Heatmap: Cluster_2 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.11 0.13 1.0 0.03 0.04 0.04 0.13 0.04 0.22 0.14 0.12 0.06 0.1 0.14 0.07 0.07 0.07 0.01 0.01 0.05 0.09 0.03 0.04
0.04 0.06 1.0 0.04 0.02 0.02 0.04 0.03 0.07 0.04 0.03 0.06 0.06 0.01 0.01 0.02 0.01 0.02 0.01 0.04 0.01 0.01 0.01
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0
0.07 0.1 1.0 0.08 0.06 0.06 0.04 0.03 0.06 0.1 0.2 0.05 0.05 0.18 0.02 0.08 0.09 0.03 0.03 0.04 0.08 0.04 0.05
0.07 0.03 1.0 0.01 0.0 0.01 0.08 0.02 0.13 0.03 0.02 0.01 0.03 0.15 0.08 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.06 0.0 0.01
0.01 0.02 1.0 0.0 0.0 0.01 0.09 0.02 0.0 0.02 0.02 0.0 0.01 0.12 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.01 0.0
0.02 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.07 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0
0.01 0.02 1.0 0.08 0.06 0.08 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.02 0.02 0.02 0.02 0.07 0.03 0.0 0.0 0.03 0.01 0.05 0.05
0.03 0.03 1.0 0.04 0.12 0.08 0.06 0.03 0.08 0.1 0.02 0.04 0.01 0.14 0.02 0.02 0.02 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.05 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.07 0.08 1.0 0.05 0.05 0.07 0.12 0.04 0.04 0.02 0.04 0.01 0.06 0.04 0.01 0.1 0.05 0.02 0.02 0.11 0.04 0.06 0.07
0.0 0.0 1.0 0.02 0.02 0.04 0.0 0.05 0.0 0.03 0.0 0.0 0.01 0.06 0.03 0.0 0.0 0.01 0.01 0.03 0.03 0.0 0.0
0.0 0.02 1.0 0.11 0.07 0.02 0.22 0.1 0.18 0.14 0.05 0.07 0.08 0.16 0.11 0.1 0.12 0.07 0.01 0.11 0.0 0.0 0.1
0.13 0.02 1.0 0.06 0.07 0.03 0.02 0.04 0.1 0.04 0.12 0.03 0.01 0.18 0.13 0.05 0.03 0.03 0.03 0.04 0.03 0.07 0.05
0.0 0.01 1.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.03 0.04 0.06 0.0 0.04 0.01 0.04 0.01 0.02 0.01 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0
0.02 0.02 1.0 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.03 0.01 0.01 0.01 0.03 0.02 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.01 0.0 0.0
0.09 0.07 1.0 0.01 0.01 0.01 0.08 0.02 0.05 0.05 0.12 0.02 0.1 0.07 0.15 0.01 0.01 0.01 0.01 0.03 0.08 0.01 0.01
0.18 0.18 1.0 0.11 0.14 0.09 0.22 0.16 0.06 0.05 0.09 0.06 0.07 0.13 0.06 0.13 0.12 0.07 0.07 0.11 0.14 0.09 0.1
0.06 0.06 1.0 0.01 0.01 0.01 0.06 0.13 0.06 0.16 0.03 0.02 0.05 0.16 0.11 0.03 0.05 0.01 0.01 0.06 0.03 0.0 0.01
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.05 1.0 0.0 0.0 0.02 0.06 0.0 0.05 0.04 0.02 0.05 0.09 0.08 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.05 0.0 0.0
0.07 0.1 1.0 0.04 0.01 0.01 0.07 0.02 0.09 0.09 0.01 0.01 0.05 0.08 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.02 0.05 0.03 0.0
0.07 0.07 1.0 0.08 0.12 0.08 0.11 0.06 0.03 0.02 0.04 0.05 0.06 0.03 0.03 0.08 0.06 0.03 0.03 0.06 0.11 0.1 0.11
0.06 0.04 1.0 0.03 0.01 0.01 0.04 0.02 0.03 0.17 0.07 0.02 0.05 0.06 0.02 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.03 0.01
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.04 0.0 0.0 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 1.0 0.01 0.0 0.0 0.01 0.01 0.06 0.08 0.01 0.01 0.01 0.06 0.05 0.01 0.01 0.0 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.02 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.03 0.02 0.01 0.0 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.01 0.02 0.03 0.02 0.0 0.02 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.01 0.0 0.0
0.0 0.02 1.0 0.0 0.01 0.01 0.0 0.0 0.17 0.07 0.05 0.02 0.02 0.13 0.06 0.01 0.0 0.01 0.01 0.02 0.09 0.0 0.05
0.0 0.01 1.0 0.01 0.01 0.03 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.01 0.0 0.02 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.06 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.0 0.0
0.06 0.06 1.0 0.04 0.04 0.04 0.06 0.05 0.03 0.02 0.03 0.04 0.04 0.14 0.06 0.08 0.06 0.03 0.03 0.06 0.06 0.04 0.05
0.13 0.09 1.0 0.08 0.07 0.06 0.1 0.08 0.06 0.09 0.06 0.05 0.05 0.22 0.1 0.16 0.13 0.05 0.05 0.1 0.06 0.1 0.1
0.12 0.13 1.0 0.06 0.06 0.03 0.09 0.1 0.05 0.09 0.15 0.04 0.06 0.15 0.11 0.13 0.16 0.02 0.04 0.12 0.09 0.04 0.04
0.05 0.04 1.0 0.06 0.06 0.04 0.03 0.02 0.03 0.05 0.04 0.02 0.03 0.08 0.03 0.05 0.07 0.04 0.04 0.02 0.03 0.03 0.03
0.04 0.08 1.0 0.02 0.01 0.02 0.07 0.05 0.02 0.06 0.03 0.02 0.01 0.11 0.35 0.03 0.02 0.0 0.0 0.02 0.11 0.0 0.0
0.18 0.15 1.0 0.13 0.1 0.08 0.15 0.1 0.22 0.16 0.09 0.07 0.12 0.06 0.06 0.1 0.08 0.04 0.04 0.06 0.13 0.11 0.09
0.0 0.0 1.0 0.05 0.0 0.0 0.21 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.04 0.07 0.13 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.06 1.0 0.01 0.0 0.01 0.06 0.05 0.01 0.01 0.01 0.02 0.03 0.03 0.19 0.01 0.01 0.01 0.01 0.01 0.05 0.01 0.01
0.12 0.03 1.0 0.01 0.01 0.01 0.3 0.05 0.14 0.26 0.01 0.03 0.07 0.07 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.17 0.0 0.01
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0 0.0
0.03 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.05 0.02 0.13 0.03 0.01 0.0 0.02 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.01 0.0 0.01 0.01
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.01 0.01 1.0 0.04 0.02 0.02 0.01 0.01 0.0 0.01 0.01 0.01 0.0 0.04 0.02 0.04 0.03 0.01 0.01 0.02 0.01 0.01 0.01
0.01 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.02 0.01 0.0 0.01 0.08 0.01 0.0 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.0 0.0 0.01
0.02 0.03 1.0 0.01 0.01 0.0 0.12 0.01 0.17 0.02 0.03 0.01 0.1 0.08 0.01 0.01 0.01 0.02 0.01 0.05 0.06 0.0 0.02
0.19 0.06 1.0 0.08 0.07 0.07 0.07 0.09 0.17 0.06 0.1 0.05 0.09 0.13 0.31 0.14 0.15 0.05 0.05 0.08 0.12 0.05 0.05
0.05 0.02 1.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.03 0.01 0.01 0.01 0.02 0.07 0.23 0.01 0.02 0.0 0.0 0.04 0.05 0.0 0.0
0.1 0.01 1.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.01 0.02 0.01 0.0 0.01 0.01 0.04 0.09 0.0 0.01 0.0 0.0 0.04 0.02 0.0 0.0
0.0 0.09 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.08 0.0 0.0 0.0 0.0 0.13 0.0 0.04 0.04 0.0 0.05 0.0 0.0 0.0 0.36
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.0 0.16 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.03 0.0 0.0 0.01 0.18 0.03 0.01 0.01 0.01 0.01 0.0 0.0 0.0 0.0

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)