1. Home
  2. Tools
  3. Expression Heatmap
  4. Results

Heatmap: Cluster_100 (HCCA)

View as: (view raw or row-normalized)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

 Transpose table  Download table
Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.21 0.56 0.49 0.12 0.12 0.27 0.38 -0.15 -0.36 -0.64 0.02 -0.56 -0.59 0.3 -0.33 0.19 0.18 -0.57 -0.58 -0.24 0.32 0.0 -0.19
0.36 1.07 0.73 0.19 -0.11 0.32 0.23 -0.03 -0.32 -0.9 0.65 -0.42 -0.6 0.51 -1.08 -0.69 -0.52 -0.8 -0.7 -0.16 -0.18 -0.08 0.05
0.28 0.6 -0.71 0.45 0.1 0.02 0.6 0.64 -0.76 -0.16 0.33 0.48 -0.33 0.17 -1.27 -0.35 -0.46 -0.47 -0.54 -0.53 -0.72 0.39 0.15
0.8 0.57 -0.61 -0.09 -0.36 0.02 0.93 0.6 -0.59 -0.13 0.41 -0.17 -0.26 -0.25 -1.06 -0.19 -0.1 -0.13 -0.25 -0.29 0.2 -0.46 -0.36
0.27 0.43 0.03 0.29 0.24 0.21 0.12 0.26 -0.99 -1.04 0.56 -0.41 -0.15 -0.36 -0.74 0.47 0.49 -0.22 -0.31 -0.54 0.16 -0.11 -0.17
0.86 0.47 0.02 -0.37 -0.27 -0.36 0.07 -0.19 -0.77 -0.59 -0.23 -0.14 0.11 0.71 -0.83 0.2 0.62 -0.47 -0.54 -0.06 0.42 -0.24 -0.07
1.17 1.2 0.95 0.55 -0.04 0.11 0.57 -0.76 -0.62 -0.48 -1.27 -0.51 -0.57 0.21 -0.83 0.28 0.2 -1.43 -1.52 -1.03 -0.64 -0.18 -0.05
1.04 0.67 1.04 -0.39 -0.1 -0.11 0.06 -0.55 -0.72 -0.02 -0.34 -0.57 -0.52 0.23 -0.47 -0.19 -0.13 -0.41 -0.5 -0.18 -0.22 0.37 0.01
0.73 0.47 -0.22 -0.2 -0.11 -0.21 1.25 0.23 -1.26 -0.27 0.22 -0.39 -0.41 -0.57 -1.17 0.1 0.01 -0.67 -0.77 -0.18 0.28 0.4 0.19
0.53 0.43 -0.66 0.29 0.18 -0.16 0.37 0.2 -1.25 -0.39 0.43 0.09 -0.32 0.49 -1.41 0.54 0.81 -0.78 -0.75 -0.28 -0.13 -0.38 -0.27
0.44 0.37 -0.63 -0.26 -0.97 -0.38 1.5 0.56 -0.52 -0.03 -0.02 -0.39 -0.77 -0.79 -0.98 -0.01 -0.23 -0.74 -1.0 0.35 0.66 0.37 0.16
1.19 0.48 1.98 -0.64 -0.19 -0.07 0.29 -0.31 0.17 -1.73 -0.32 -0.76 -0.89 0.08 -0.94 -0.85 -0.71 -0.92 -0.95 -0.45 -0.2 -0.04 0.2
0.5 0.91 0.3 -0.06 0.32 0.17 0.02 -0.54 0.19 0.2 0.0 0.14 0.6 -0.61 -0.71 -0.19 -0.16 -0.96 -1.02 -0.24 -0.15 -0.2 -0.19
1.17 1.2 0.95 0.55 -0.04 0.11 0.57 -0.76 -0.62 -0.48 -1.27 -0.51 -0.57 0.21 -0.83 0.28 0.2 -1.43 -1.52 -1.03 -0.64 -0.18 -0.05
0.44 0.85 -0.09 0.24 -0.3 0.22 -0.09 -0.55 -0.59 -0.72 0.62 0.33 -0.05 0.42 -0.81 -0.25 -0.33 -0.62 -0.66 -0.54 0.03 0.34 0.37
0.92 0.51 -1.32 -0.54 -0.55 -0.07 1.53 0.92 -1.35 -0.66 -0.51 -0.78 -0.9 -1.4 -1.0 -0.04 -0.1 -0.57 -0.52 0.27 0.88 0.27 -0.09
0.85 0.51 -0.27 -0.13 -0.16 0.16 0.16 0.52 -1.08 -0.85 -0.33 -0.13 -0.31 0.42 -1.22 0.03 0.11 -0.16 -0.16 0.14 0.04 0.02 0.15
-0.1 1.01 -1.19 0.47 0.68 0.29 0.5 -0.03 0.52 -0.12 -0.16 0.0 0.23 -0.63 -1.14 0.2 -0.04 -0.96 -1.09 -0.77 0.33 -0.46 -0.32
1.17 1.2 0.95 0.55 -0.04 0.11 0.57 -0.76 -0.62 -0.48 -1.27 -0.51 -0.57 0.21 -0.83 0.28 0.2 -1.43 -1.52 -1.03 -0.64 -0.18 -0.05
0.73 0.6 0.35 -0.33 -0.71 0.05 0.71 0.48 -0.77 -0.23 0.33 -0.73 -0.56 0.82 -0.21 -0.2 -0.32 -0.87 -0.8 -0.33 0.38 -0.46 -0.25
0.56 0.62 0.43 0.01 -0.13 0.75 0.2 -0.45 -0.22 -0.33 -0.19 0.29 0.06 -0.27 -0.5 -0.09 -0.43 -1.2 -1.29 -0.47 0.19 0.29 0.28
0.71 0.5 -0.22 0.01 -0.02 -0.45 1.06 0.76 -0.51 0.06 -0.19 -1.08 -1.17 -0.55 -1.58 0.19 -0.12 -0.67 -0.71 0.07 0.57 0.4 -0.16
-0.33 0.64 -0.02 -0.02 0.29 0.17 1.12 0.36 0.32 -0.47 -0.52 -0.4 -0.58 -0.61 -0.54 0.17 0.23 -0.66 -0.78 -0.53 0.12 -0.02 0.21
0.66 0.89 -0.7 -0.03 -0.05 0.29 -0.12 -0.33 -1.01 -0.73 0.34 0.24 -0.24 0.17 -1.79 -0.13 0.33 -0.37 -0.33 -0.25 0.29 0.41 0.17
1.03 0.93 0.39 -0.0 -0.01 0.06 0.11 -0.2 -0.64 -0.83 -0.07 -0.83 -0.74 0.37 -0.83 0.38 0.4 -0.58 -0.62 -0.35 0.36 -0.4 -0.28
0.66 0.84 0.19 -0.11 -0.31 0.17 0.23 0.15 -0.99 -0.7 0.29 -0.18 -0.17 0.43 -1.05 -0.06 -0.12 -0.55 -0.61 -0.3 0.26 0.13 0.1
0.31 0.65 0.01 0.22 0.24 0.32 0.4 -0.23 -0.07 -0.84 0.17 0.02 0.09 -0.15 -0.51 0.18 0.07 -0.65 -0.57 -0.26 -0.02 -0.32 -0.03
0.58 0.33 0.48 -0.42 -0.89 -0.43 0.79 0.39 -0.52 -0.25 0.01 -0.17 -0.07 0.75 -0.0 -0.11 -0.21 -1.27 -1.15 -0.16 0.72 -0.3 -0.55
0.33 0.71 0.12 0.25 -0.08 0.14 0.84 0.69 -1.29 -0.83 -0.62 -0.26 -0.84 -0.43 -0.91 0.23 -0.18 -0.26 -0.38 -0.1 -0.13 0.36 0.38
0.83 0.51 0.45 -0.02 -0.05 0.12 0.44 0.18 -1.11 -0.31 0.3 0.03 -0.35 0.18 -0.99 -0.05 -0.01 -0.76 -0.82 -0.71 0.24 0.06 -0.0
0.44 0.6 0.5 0.14 0.49 -0.05 -0.17 0.1 -1.2 -0.65 0.59 -0.17 -0.47 0.21 -1.66 0.17 0.35 -0.3 -0.3 -0.45 -0.39 0.13 0.01
0.78 1.42 -0.51 -0.12 -0.36 0.18 0.04 0.29 -1.08 -0.19 0.58 -0.46 -0.49 0.55 -1.76 0.03 0.26 -0.67 -0.66 -0.69 -0.06 -0.29 -0.15
0.75 0.66 -0.81 0.3 0.58 0.54 -0.06 -0.33 -0.57 -0.22 0.53 -0.65 -0.56 0.17 -1.19 0.1 0.08 -0.61 -0.5 -0.35 -0.2 0.06 0.24
0.96 0.51 -1.33 -0.36 -0.47 -0.36 1.14 0.52 -0.01 -0.19 0.0 -0.21 -0.31 -0.34 -0.63 -0.38 -0.26 -0.55 -0.56 -0.42 0.58 0.04 0.11
0.68 0.5 0.28 -0.11 0.06 -0.41 0.35 0.13 -0.37 -0.05 -0.06 -0.01 0.24 -0.8 -1.02 0.06 0.25 -0.47 -0.55 -0.31 0.18 0.1 0.15
0.43 0.54 -0.72 0.55 0.44 0.43 -0.39 0.22 -1.58 -0.97 0.23 0.04 -0.42 -0.27 -1.16 0.47 0.08 -0.69 -0.54 -1.05 0.2 0.63 0.58
0.58 0.49 0.71 0.15 -0.34 -0.19 0.81 0.46 -0.57 -1.09 0.15 -0.8 -0.52 -0.26 -0.87 0.25 0.27 -0.64 -0.78 -0.44 0.24 0.07 0.07
1.02 0.1 0.64 -0.59 -0.66 -0.33 -0.21 -0.87 0.15 0.43 0.53 -0.04 -0.26 0.97 -0.09 -1.34 -1.6 -1.36 -1.31 -0.7 0.51 0.34 0.5
0.55 0.41 -1.23 0.31 0.5 0.5 0.25 0.12 -2.16 -1.03 -0.19 -0.09 -0.7 -0.11 -1.06 0.53 0.05 -0.66 -0.53 -0.77 0.21 0.81 0.66
0.41 0.57 0.79 -0.16 -0.37 -0.19 0.62 0.27 -0.76 -0.56 -0.58 -0.76 -0.4 0.43 -0.49 0.28 0.31 -0.57 -0.54 -0.01 0.07 0.06 -0.1
0.55 0.72 0.63 -0.3 -0.15 -0.1 0.31 -0.06 -0.98 -0.53 0.01 -0.23 -0.31 0.9 -0.76 -0.03 -0.14 -0.39 -0.59 -0.44 0.26 -0.06 -0.04
0.44 0.58 0.57 -0.13 -0.21 0.19 0.56 0.08 -0.99 -1.15 0.04 -0.1 -0.42 0.34 -0.02 -0.42 -0.32 -0.52 -0.48 0.15 0.12 0.04 0.16
0.66 0.33 -0.17 0.34 0.34 0.03 0.81 0.29 -0.97 -0.32 -0.01 -0.68 -0.6 0.12 -0.85 0.11 0.19 -0.6 -0.64 -0.56 0.3 -0.0 0.11
0.57 0.54 0.17 0.09 -0.31 0.15 0.52 -0.0 -0.49 -0.54 0.33 -0.53 -0.45 0.37 -0.73 0.06 0.29 -0.68 -0.79 -0.44 0.05 0.29 0.11
0.96 0.48 1.44 0.07 0.08 0.12 0.54 0.27 -0.73 -1.52 -0.57 -0.6 -0.55 0.02 -0.78 -0.26 -0.97 -1.04 -1.22 -0.52 -0.17 0.42 0.44
0.96 0.59 -0.56 -0.44 -0.88 -0.57 0.35 0.52 -1.28 -0.71 0.57 -0.38 -0.64 0.69 -1.38 0.07 0.68 -0.52 -0.6 0.06 0.09 -0.13 0.34
0.31 0.73 0.95 0.01 -0.04 -0.08 0.21 0.17 -1.0 -0.52 -0.04 -0.51 -0.59 0.37 -0.86 0.13 0.23 -0.43 -0.5 -0.19 0.02 -0.02 -0.02
0.77 0.73 -0.13 0.27 0.43 0.2 0.15 -0.06 -1.02 -0.79 0.49 -0.41 -0.46 0.38 -1.53 0.38 0.54 -0.53 -0.51 -0.46 -0.22 -0.42 -0.16
0.46 0.69 -0.63 -0.15 -0.62 -0.12 1.55 1.12 -1.5 -1.02 -0.58 -0.62 -0.63 -0.16 -0.73 -0.03 -0.09 -0.24 -0.37 -0.39 0.16 0.02 0.06
1.18 0.67 0.45 -0.71 -1.23 -0.63 0.29 -0.78 0.77 0.11 0.49 -1.23 -0.64 0.22 0.43 -0.03 -0.06 -1.49 -1.58 0.06 0.82 -0.76 -1.08
1.05 1.09 0.49 0.21 -0.11 -0.46 0.3 0.21 -0.17 0.6 0.29 -6.98 -6.19 0.59 -0.96 -0.32 0.08 -0.75 -0.78 -0.52 -0.31 0.3 -0.37

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.