Heatmap: Cluster_21 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.55 0.7 1.0 0.0 0.0 0.0 0.21 0.07 0.55 0.38 0.1 0.06 0.4 0.57 0.23 0.05 0.03 0.01 0.0 0.12 0.37 0.0 0.0
0.31 0.54 0.31 0.28 0.22 0.33 0.36 0.17 0.56 1.0 0.51 0.32 0.44 0.35 0.28 0.27 0.22 0.16 0.17 0.39 0.46 0.31 0.39
0.0 0.1 0.36 0.23 0.07 0.07 0.6 0.0 0.56 1.0 0.22 0.0 0.4 0.09 0.24 0.0 0.16 0.03 0.1 0.27 0.0 0.0 0.0
0.0 0.62 0.14 0.41 0.2 0.24 0.67 0.29 0.54 1.0 0.21 0.78 0.67 0.58 0.45 0.21 0.19 0.25 0.12 0.24 0.49 0.0 0.29
0.0 0.51 1.0 0.21 0.18 0.2 0.41 0.0 0.45 0.67 0.0 0.27 0.07 0.74 0.27 0.06 0.11 0.0 0.23 0.2 0.0 0.0 0.0
0.0 0.4 0.0 0.0 0.29 0.0 0.0 0.0 0.34 0.0 0.31 0.0 0.0 0.09 0.0 0.09 0.0 0.0 0.07 0.15 0.0 1.0 0.0
0.88 0.48 1.0 0.81 0.52 0.31 0.36 0.16 0.32 0.83 0.76 0.45 0.64 0.28 0.61 0.32 0.13 0.19 0.17 0.42 0.49 0.87 0.58
0.0 0.65 0.35 0.07 0.07 0.0 0.0 0.09 0.34 1.0 0.14 0.13 0.19 0.19 0.07 0.04 0.02 0.02 0.07 0.07 0.29 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.14 0.89 0.28 1.0 0.77 0.37 0.16 0.0 0.0 0.28 0.0 0.47 0.0 0.0 0.0
0.0 0.7 0.0 0.0 0.57 0.0 0.0 0.0 0.69 0.75 0.0 0.0 0.42 0.0 0.41 0.0 0.0 0.0 0.41 0.1 1.0 0.0 0.0
0.37 0.2 0.53 0.28 0.25 0.18 0.35 0.45 1.0 0.54 0.32 0.37 0.24 0.76 0.25 0.29 0.19 0.1 0.11 0.14 0.03 0.19 0.06
0.0 0.14 1.0 0.38 0.15 0.23 0.14 0.0 0.26 0.32 0.14 0.58 0.41 0.5 0.24 0.54 0.25 0.2 0.29 0.24 0.11 0.0 0.0
0.2 0.41 0.11 0.14 0.16 0.07 0.82 0.12 0.29 1.0 0.3 0.47 0.28 0.4 0.67 0.14 0.08 0.11 0.05 0.31 0.62 0.07 0.06
0.51 0.66 0.11 0.13 0.09 0.2 0.23 0.11 0.58 1.0 0.6 0.37 0.51 0.25 0.22 0.13 0.14 0.16 0.15 0.52 0.41 0.2 0.29
0.4 0.77 0.14 0.27 0.22 0.28 0.69 0.24 0.34 1.0 0.34 0.35 0.48 0.26 0.35 0.22 0.2 0.09 0.1 0.25 0.47 0.26 0.33
0.48 0.73 0.27 0.46 1.0 0.29 0.4 0.23 0.5 0.93 0.33 0.61 0.19 0.34 0.18 0.31 0.24 0.49 0.48 0.4 0.9 0.45 0.39
0.4 0.18 0.21 0.06 0.07 0.1 0.13 0.05 0.25 1.0 0.08 0.2 0.23 0.35 0.52 0.09 0.04 0.02 0.03 0.16 0.16 0.06 0.03
0.49 0.53 0.0 0.14 0.02 0.06 0.0 0.16 0.45 1.0 0.51 0.23 0.2 0.26 0.09 0.04 0.09 0.09 0.01 0.1 0.45 0.07 0.07
1.0 0.82 0.99 0.45 0.57 0.54 0.6 0.21 1.0 0.94 0.87 0.37 0.56 0.6 0.4 0.56 0.73 0.29 0.26 0.77 0.45 0.77 0.9
0.35 1.0 0.25 0.04 0.03 0.03 0.05 0.04 0.58 0.28 0.01 0.02 0.03 0.08 0.03 0.03 0.04 0.01 0.01 0.07 0.12 0.04 0.05
0.16 0.59 0.12 0.27 0.22 0.26 0.59 0.16 0.31 1.0 0.44 0.43 0.35 0.24 0.39 0.16 0.07 0.09 0.08 0.36 0.28 0.35 0.33
0.18 1.0 0.41 0.44 0.45 0.5 0.94 0.52 0.42 0.86 0.62 0.59 0.42 0.46 0.47 0.35 0.32 0.52 0.52 0.45 0.54 0.12 0.12
0.57 0.42 0.51 0.06 0.07 0.06 0.08 0.11 1.0 0.96 0.21 0.21 0.22 0.11 0.31 0.06 0.05 0.01 0.1 0.3 0.24 0.0 0.0
0.3 0.27 0.43 0.06 0.01 0.02 0.31 0.05 1.0 0.69 0.11 0.11 0.12 0.1 0.11 0.02 0.06 0.01 0.02 0.06 0.36 0.0 0.0
1.0 0.79 0.08 0.38 0.23 0.3 0.49 0.43 0.57 0.74 0.32 0.68 0.16 0.16 0.89 0.23 0.24 0.29 0.29 0.3 0.97 0.8 0.89
0.84 1.0 0.26 0.14 0.2 0.14 0.42 0.14 0.17 0.8 0.23 0.19 0.19 0.27 0.15 0.19 0.2 0.0 0.01 0.05 0.56 0.28 0.4
0.0 0.15 0.38 0.04 0.0 0.0 0.0 0.0 0.17 1.0 0.16 0.09 0.13 0.0 0.07 0.0 0.02 0.03 0.0 0.14 0.0 0.0 0.0
0.0 0.83 0.21 0.09 0.04 0.11 0.7 0.4 0.12 1.0 0.21 0.55 0.84 0.13 0.36 0.04 0.06 0.59 0.41 0.54 0.96 0.0 0.0
0.0 0.24 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.18 0.0 0.12 0.0 0.23 0.0 0.0 0.0 0.0 0.06 0.0 0.0 0.0
0.27 0.45 0.83 0.24 0.3 0.32 0.0 0.18 0.22 0.89 0.81 0.58 0.3 0.54 1.0 0.08 0.32 0.03 0.08 0.24 0.27 0.2 0.0
0.37 0.39 0.19 0.3 0.11 0.24 0.22 0.08 1.0 0.84 0.14 0.99 0.11 0.08 0.09 0.08 0.09 0.11 0.14 0.18 0.52 0.53 0.59
0.35 0.75 0.57 0.14 0.06 0.17 0.7 0.25 1.0 0.86 0.23 0.41 0.35 0.11 0.11 0.06 0.08 0.08 0.05 0.56 0.55 0.13 0.14
0.23 1.0 0.99 0.11 0.1 0.09 0.64 0.18 0.32 0.53 0.2 0.2 0.2 0.29 0.25 0.09 0.07 0.01 0.03 0.26 0.62 0.13 0.12
0.77 0.95 0.36 0.04 0.05 0.07 0.07 0.0 0.0 1.0 0.08 0.27 0.47 0.04 0.08 0.04 0.11 0.01 0.04 0.07 0.44 0.35 0.0
0.93 1.0 0.88 0.23 0.25 0.29 0.65 0.53 0.26 0.85 0.28 0.35 0.27 0.47 0.61 0.29 0.29 0.22 0.2 0.31 0.39 0.47 0.42
0.37 0.54 0.24 0.26 0.23 0.2 0.52 0.19 0.6 1.0 0.36 0.35 0.57 0.22 0.24 0.16 0.2 0.14 0.14 0.39 0.29 0.29 0.34
0.24 0.07 0.29 0.32 0.08 0.4 0.12 0.08 0.1 1.0 0.14 0.37 0.41 0.18 0.25 0.23 0.25 0.05 0.02 0.28 0.19 0.17 0.0
0.0 0.51 0.87 0.21 0.16 0.17 1.0 0.09 0.23 0.69 0.12 0.8 0.68 0.17 0.86 0.08 0.15 0.06 0.02 0.21 0.46 0.0 0.0
0.48 0.21 0.33 0.01 0.0 0.0 0.06 0.04 0.15 1.0 0.07 0.14 0.13 0.04 0.06 0.0 0.01 0.01 0.01 0.59 0.15 0.02 0.02
1.0 0.97 0.31 0.06 0.09 0.03 0.3 0.08 0.89 0.64 0.35 0.28 0.5 0.11 0.17 0.05 0.03 0.08 0.08 0.81 0.88 0.03 0.06
0.57 1.0 0.6 0.63 0.43 0.48 0.52 0.27 0.85 0.94 0.53 0.37 0.39 0.3 0.18 0.46 0.59 0.22 0.25 0.54 0.51 0.57 0.64
0.21 0.67 0.47 0.25 0.17 0.25 0.39 0.42 0.28 0.65 0.5 0.59 1.0 0.44 0.88 0.22 0.07 0.07 0.17 0.33 0.94 0.0 0.17
0.34 0.55 0.46 0.34 0.22 0.35 0.31 0.17 0.58 1.0 0.47 0.33 0.28 0.56 0.34 0.28 0.24 0.17 0.18 0.42 0.42 0.62 0.54
0.41 0.49 0.39 0.37 0.25 0.32 1.0 0.52 0.26 0.8 0.68 0.3 0.22 0.31 0.24 0.34 0.28 0.16 0.15 0.37 0.31 0.5 0.42
0.07 0.25 0.29 0.07 0.07 0.11 0.17 0.01 0.26 1.0 0.21 0.12 0.29 0.09 0.09 0.08 0.08 0.0 0.01 0.25 0.14 0.08 0.15
0.32 0.13 0.32 0.01 0.0 0.01 0.97 0.12 0.3 1.0 0.03 0.04 0.06 0.0 0.01 0.0 0.02 0.0 0.0 0.11 0.24 0.0 0.0
0.04 1.0 0.49 0.04 0.05 0.08 0.05 0.0 0.18 0.3 0.11 0.19 0.66 0.17 0.07 0.1 0.08 0.02 0.02 0.6 0.43 0.07 0.0
0.26 0.59 0.72 1.0 0.67 0.57 0.39 0.21 0.55 0.86 0.56 0.76 0.91 0.43 0.71 0.62 0.28 0.21 0.21 0.73 0.32 0.37 0.28
0.69 0.53 0.16 0.27 0.31 0.32 0.99 0.5 0.34 1.0 0.36 0.37 0.55 0.17 0.22 0.22 0.22 0.32 0.31 0.65 0.41 0.43 0.45
0.33 0.46 0.39 0.17 0.17 0.29 0.32 0.06 0.95 1.0 0.71 0.34 0.39 0.27 0.15 0.18 0.17 0.17 0.2 0.3 0.29 0.18 0.34
0.97 1.0 0.36 0.56 0.41 0.44 0.43 0.25 0.36 0.96 0.29 0.79 0.36 0.35 0.58 0.35 0.37 0.36 0.32 0.4 0.73 0.67 0.75
0.0 1.0 0.42 0.0 0.07 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.06 0.11 0.12 0.0 0.0 0.0 0.06 0.07 0.26 0.0 0.0
0.42 0.19 0.09 0.01 0.01 0.06 0.18 0.04 0.14 1.0 0.03 0.15 0.17 0.03 0.06 0.01 0.01 0.01 0.0 0.14 0.19 0.05 0.02
0.66 0.56 0.27 0.19 0.25 0.58 0.9 0.17 0.6 1.0 0.12 0.6 0.6 0.15 0.08 0.18 0.21 0.1 0.12 0.3 0.36 0.26 0.22
0.0 0.28 1.0 0.6 0.09 0.2 0.41 0.0 0.33 0.82 0.46 0.0 0.77 0.18 0.07 0.06 0.16 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0
0.38 0.38 0.6 0.13 0.12 0.17 0.4 0.19 0.47 1.0 0.29 0.26 0.35 0.13 0.21 0.09 0.11 0.08 0.08 0.28 0.37 0.15 0.17
0.18 0.87 0.26 0.06 0.0 0.05 0.21 0.0 0.18 1.0 0.1 0.17 0.32 0.03 0.17 0.03 0.0 0.02 0.0 0.17 0.7 0.0 0.0
0.38 0.33 0.3 0.12 0.12 0.24 0.26 0.14 0.55 1.0 0.03 0.62 0.19 0.09 0.05 0.07 0.08 0.05 0.05 0.25 0.46 0.26 0.31
0.5 0.28 0.28 0.03 0.08 0.05 0.0 0.0 0.28 1.0 0.16 0.22 0.15 0.3 0.46 0.07 0.01 0.0 0.02 0.21 0.13 0.0 0.45
0.19 0.05 0.28 0.02 0.02 0.0 0.05 0.0 1.0 0.42 0.02 0.04 0.06 0.3 0.54 0.03 0.01 0.0 0.0 0.06 0.26 0.0 0.12
0.01 0.29 0.18 1.0 0.38 0.22 0.24 0.01 0.23 0.32 0.02 0.64 0.78 0.05 0.1 0.05 0.01 0.02 0.02 0.25 0.08 0.03 0.02
0.46 0.67 0.82 0.26 0.2 0.19 0.62 0.08 0.51 1.0 0.22 0.19 0.37 0.28 0.2 0.04 0.03 0.09 0.1 0.44 0.32 0.14 0.25
0.25 0.49 0.14 0.07 0.04 0.11 0.59 0.12 0.26 0.64 0.18 0.36 0.54 0.11 0.45 0.09 0.05 0.08 0.16 0.41 1.0 0.34 0.31
0.34 0.64 0.28 0.43 0.22 0.29 0.97 0.17 0.44 1.0 0.34 0.3 0.36 0.32 0.18 0.17 0.2 0.1 0.11 0.29 0.29 0.18 0.23

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)