Heatmap: Cluster_31 (HCCA)

View as: (view raw or zlog-transformed)

View using InCHLib : here ( Experimental feature, still under development)

(Values are normalized against highest expression of the row)

Gene
infectn,Str1980
Str02-05,ctrl
2n,asex,PDagar,soybean
Str1980,tomato
Str1980,sunflower
Str1980,thalecress
sporeRelease,StrEp
StrEpT1
StrDK3,soybean
virus,soybean
invitro,ctrl
2n,infectn,asex,rapeseed
2n,asex,invitro,PDbroth,rapeseed
PDbroth,Str1980,ctrl
MM,Str1980,ctrl
PDagar,Str1980,border
PDagar,Str1980,center
infectn,virus,StrEp
infectn,noVirus,StrEp
infectn,Str1980,rapeseed
invitro,rapeseed
48hpi,suscept,rapeseed
48hpi,resist,rapeseed
0.16 0.24 0.61 0.17 0.12 0.13 0.2 0.1 0.13 0.15 0.25 0.19 0.31 1.0 0.19 0.23 0.45 0.09 0.08 0.31 0.24 0.13 0.24
0.97 0.72 0.52 0.39 0.61 0.53 0.4 0.73 0.17 0.35 0.96 0.58 0.37 1.0 0.26 0.71 0.79 0.69 0.71 0.52 0.52 0.58 0.66
0.43 0.97 0.48 0.26 0.27 0.34 1.0 0.22 0.45 0.18 0.52 0.34 0.88 0.75 0.25 0.24 0.41 0.22 0.18 0.51 0.35 0.21 0.39
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.9 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.21 0.2 0.43 0.21 0.12 0.35 0.14 0.11 0.19 0.29 0.29 0.32 0.2 1.0 0.53 0.26 0.18 0.21 0.23 0.15 0.18 0.14 0.11
0.76 0.48 0.74 0.32 0.23 0.23 0.56 0.4 0.39 0.6 0.29 0.48 0.23 1.0 0.15 0.67 0.56 0.12 0.11 0.77 0.21 0.33 0.32
0.45 0.18 0.41 0.08 0.05 0.13 0.0 0.0 0.15 0.04 0.28 0.0 0.02 1.0 0.38 0.15 0.09 0.04 0.02 0.04 0.0 0.0 0.0
0.43 0.83 0.47 0.2 0.06 0.25 0.54 0.12 0.52 0.57 0.31 0.13 0.68 1.0 0.98 0.07 0.04 0.04 0.05 0.45 0.6 0.03 0.01
0.15 0.13 0.4 0.09 0.02 0.15 1.0 0.05 0.1 0.2 0.1 0.17 0.13 0.94 0.11 0.01 0.02 0.01 0.01 0.18 0.08 0.03 0.02
0.73 0.79 0.56 0.51 0.49 0.48 0.96 0.51 1.0 0.65 0.74 0.63 0.67 0.75 0.67 0.52 0.57 0.32 0.33 0.65 0.59 0.39 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.22 0.14 0.19 0.12 0.01 0.03 0.39 0.03 0.53 0.03 0.1 0.0 0.11 1.0 0.21 0.01 0.01 0.01 0.01 0.07 0.09 0.01 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.6 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.88 0.56 0.28 0.54 0.33 0.48 1.0 0.66 0.27 0.43 0.32 0.32 0.21 0.99 0.42 0.58 0.33 0.31 0.32 0.76 0.81 0.79 0.67
0.23 0.25 1.0 0.07 0.0 0.0 0.55 0.0 0.81 0.61 0.35 0.18 0.0 0.67 0.04 0.0 0.04 0.03 0.0 0.44 0.11 0.0 0.0
0.77 0.42 0.98 0.21 0.33 0.3 0.38 0.64 0.18 0.31 1.0 0.24 0.19 0.98 0.11 0.51 0.79 0.43 0.47 0.42 0.2 0.24 0.32
0.51 0.73 0.89 0.26 0.1 0.16 0.21 0.06 0.54 0.34 0.29 0.08 0.33 1.0 0.22 0.08 0.07 0.05 0.09 0.22 0.43 0.11 0.02
0.35 0.22 0.31 0.34 0.03 0.19 0.15 0.12 0.36 0.03 0.33 0.0 0.21 1.0 0.12 0.14 0.13 0.08 0.09 0.06 0.2 0.0 0.0
0.26 0.14 1.0 0.13 0.09 0.24 0.24 0.17 0.18 0.22 0.16 0.18 0.15 0.73 0.06 0.06 0.05 0.11 0.1 0.09 0.08 0.13 0.14
0.79 1.0 0.74 0.45 0.42 0.58 0.61 0.52 0.33 0.46 0.6 0.84 0.69 0.91 0.44 0.48 0.6 0.59 0.55 0.61 0.69 0.46 0.6
0.32 0.52 0.23 0.23 0.23 0.43 0.18 0.21 0.34 0.59 0.15 0.24 0.53 1.0 0.08 0.29 0.34 0.23 0.28 0.18 0.22 0.31 0.35
0.3 0.56 0.36 0.19 0.26 0.21 0.5 0.1 0.58 0.35 0.05 0.25 0.09 1.0 0.14 0.41 0.43 0.03 0.03 0.12 0.17 0.38 0.51
0.33 0.41 1.0 0.24 0.02 0.15 0.32 0.2 0.25 0.25 0.1 0.19 0.08 0.72 0.28 0.34 0.3 0.02 0.02 0.38 0.13 0.15 0.15
0.05 0.0 0.0 0.01 0.01 0.01 0.03 0.07 0.01 0.08 0.18 0.05 0.02 1.0 0.03 0.02 0.02 0.04 0.03 0.09 0.0 0.0 0.0
1.0 0.71 0.63 0.69 0.46 0.76 0.4 0.28 0.8 0.99 0.59 0.59 0.59 0.74 0.74 0.53 0.43 0.33 0.36 0.72 0.89 0.82 0.78
0.42 0.29 0.63 0.17 0.11 0.1 0.31 0.07 0.56 0.95 0.14 0.27 0.12 1.0 0.37 0.13 0.18 0.05 0.0 0.22 0.08 0.3 0.14
0.56 0.91 0.34 0.23 0.27 0.21 0.45 0.15 0.26 0.3 0.04 0.28 0.06 1.0 0.26 0.22 0.26 0.04 0.04 0.23 0.33 0.39 0.79
0.21 0.17 0.38 0.15 0.21 0.16 1.0 0.11 0.32 0.09 0.63 0.15 0.3 0.76 0.39 0.09 0.09 0.08 0.09 0.37 0.25 0.3 0.36
0.41 0.34 0.21 0.35 0.21 0.16 0.15 0.29 0.66 0.18 0.34 0.21 0.14 1.0 0.18 0.15 0.17 0.16 0.14 0.08 0.16 0.41 0.38
0.69 0.77 0.42 0.85 0.42 0.5 0.41 0.67 0.66 0.23 0.45 0.87 0.49 1.0 0.26 0.3 0.32 0.47 0.44 0.51 0.32 0.73 0.65
0.44 0.48 0.3 0.11 0.06 0.19 1.0 0.14 0.67 0.56 0.71 0.39 0.22 0.54 0.28 0.03 0.03 0.04 0.06 0.35 0.39 0.24 0.25
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.11 0.0 0.0 0.0
0.59 0.35 0.18 0.27 0.33 0.25 0.34 0.68 0.19 0.16 0.54 0.19 0.2 1.0 0.09 0.61 0.73 0.39 0.41 0.4 0.28 0.38 0.47
0.78 0.67 0.56 0.61 0.49 0.66 0.53 0.32 1.0 0.78 0.6 0.41 0.38 0.65 0.28 0.48 0.35 0.32 0.31 0.43 0.41 0.56 0.49
0.52 0.61 0.74 0.22 0.27 0.27 0.52 0.23 0.61 0.6 0.75 0.41 0.35 1.0 0.31 0.34 0.32 0.14 0.12 0.32 0.21 0.5 0.91
0.54 0.48 1.0 0.28 0.27 0.28 0.31 0.69 0.33 0.19 0.62 0.36 0.46 0.68 0.11 0.41 0.52 0.41 0.43 0.36 0.29 0.45 0.42
0.72 0.47 0.67 0.09 0.09 0.12 1.0 0.34 0.21 0.28 0.27 0.13 0.2 0.55 0.15 0.03 0.03 0.08 0.07 0.39 0.39 0.15 0.14
0.18 0.04 1.0 0.0 0.0 0.01 0.32 0.05 0.11 0.02 0.07 0.01 0.09 0.47 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.04 0.01 0.0 0.0
0.2 0.04 1.0 0.01 0.0 0.03 0.28 0.04 0.05 0.02 0.08 0.0 0.08 0.45 0.03 0.0 0.0 0.0 0.0 0.03 0.02 0.0 0.0
0.14 0.09 1.0 0.02 0.02 0.04 0.16 0.03 0.04 0.04 0.07 0.06 0.08 0.46 0.04 0.01 0.01 0.01 0.01 0.04 0.04 0.03 0.02
0.48 0.55 0.23 0.28 0.21 0.31 0.55 0.53 0.46 1.0 0.38 0.48 0.54 0.56 0.3 0.41 0.37 0.42 0.37 0.5 0.63 0.67 0.73
0.56 0.47 0.31 0.49 0.45 0.35 0.35 0.42 0.29 0.22 0.44 0.26 0.44 0.97 0.22 1.0 0.96 0.26 0.27 0.38 0.38 0.29 0.33
0.84 0.4 0.44 0.19 0.28 0.27 0.25 0.73 0.19 0.23 0.47 0.31 0.22 1.0 0.1 0.39 0.59 0.61 0.65 0.48 0.32 0.27 0.43
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.88 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.77 0.78 0.34 0.33 0.24 0.36 0.6 0.37 0.35 1.0 0.41 0.35 0.29 0.87 0.27 0.41 0.58 0.32 0.34 0.68 0.72 0.45 0.58
0.43 1.0 0.28 0.32 0.27 0.45 0.68 0.41 0.27 0.32 0.23 0.3 0.23 0.63 0.24 0.35 0.43 0.19 0.19 0.31 0.45 0.69 0.72
0.38 0.23 0.86 0.08 0.04 0.07 0.23 0.07 0.45 1.0 0.09 0.09 0.08 0.55 0.32 0.06 0.06 0.02 0.02 0.19 0.21 0.07 0.06
0.28 0.24 1.0 0.01 0.01 0.02 0.11 0.02 0.53 0.43 0.06 0.04 0.16 0.86 0.88 0.01 0.02 0.01 0.01 0.14 0.31 0.01 0.02
1.0 0.61 0.97 0.29 0.38 0.36 0.39 0.88 0.18 0.28 0.78 0.49 0.35 0.91 0.19 0.49 0.52 0.54 0.58 0.48 0.34 0.49 0.57
0.97 1.0 0.64 0.49 0.48 0.49 0.8 0.69 0.32 0.78 0.96 0.56 0.4 1.0 0.35 0.7 0.92 0.4 0.38 0.57 0.78 0.58 0.58
0.0 0.0 0.0 0.46 0.39 0.18 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.25 0.22 0.0 0.0 0.15 0.0 0.0 0.0
0.34 0.35 0.3 0.39 0.11 0.82 0.72 1.0 0.22 0.51 0.56 0.31 0.33 0.61 0.17 0.93 0.36 0.12 0.14 0.21 0.41 0.64 0.55
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.37 0.0 0.0 0.0 0.0 0.1 0.0 0.0 0.0
0.17 0.09 1.0 0.01 0.01 0.01 0.13 0.04 0.04 0.06 0.02 0.03 0.04 0.56 0.11 0.03 0.01 0.0 0.0 0.06 0.11 0.03 0.02
0.05 0.03 0.03 0.02 0.0 0.02 0.17 0.02 0.06 0.04 0.34 0.01 0.03 1.0 0.02 0.02 0.03 0.0 0.0 0.05 0.0 0.0 0.03
0.05 0.02 0.0 0.13 0.05 0.07 0.0 0.0 0.03 0.06 0.47 0.02 0.02 1.0 0.02 0.02 0.04 0.01 0.01 0.03 0.0 0.0 0.0
0.33 0.45 0.24 0.1 0.03 0.18 1.0 0.25 0.88 0.27 0.1 0.05 0.23 0.65 0.04 0.04 0.07 0.08 0.07 0.19 0.07 0.12 0.0
1.0 0.53 0.33 0.34 0.36 0.31 0.33 0.4 0.27 0.37 0.66 0.32 0.29 0.9 0.4 0.55 0.65 0.44 0.45 0.43 0.55 0.37 0.44
0.88 0.59 0.48 0.31 0.42 0.43 0.3 0.8 0.11 0.2 0.84 0.38 0.16 1.0 0.1 0.56 0.72 0.66 0.65 0.37 0.27 0.57 0.72
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.93 0.0 0.0 0.27 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.17 0.13 0.23 0.03 0.01 0.06 0.33 0.08 0.34 0.12 0.12 0.01 0.11 1.0 0.16 0.15 0.12 0.04 0.07 0.1 0.19 0.01 0.0
0.68 0.31 0.59 0.16 0.08 0.15 0.4 0.26 0.15 0.29 0.64 0.17 0.21 1.0 0.19 0.42 0.58 0.12 0.13 0.28 0.24 0.19 0.22
0.43 0.34 0.59 0.14 0.01 0.16 0.18 0.07 0.23 0.56 0.26 0.01 0.01 1.0 0.12 0.0 0.01 0.02 0.02 0.03 0.06 0.05 0.02
0.48 0.21 0.2 0.24 0.39 0.34 0.06 0.38 0.13 0.14 0.77 0.16 0.1 1.0 0.12 0.44 0.43 0.52 0.55 0.21 0.12 0.39 0.46
1.0 0.48 1.0 0.46 0.41 0.51 0.76 0.5 0.53 0.99 0.53 0.67 0.47 0.88 0.7 0.42 0.39 0.33 0.3 0.77 0.68 0.57 0.57
1.0 0.4 0.28 0.41 0.51 0.42 0.37 0.89 0.23 0.19 0.52 0.19 0.18 0.88 0.23 0.66 0.62 0.59 0.62 0.44 0.27 0.55 0.53
0.0 0.0 0.0 0.0 0.48 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.68 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.43 0.4 0.89 0.39 0.14 0.28 0.38 0.34 0.18 0.32 0.94 0.35 0.47 1.0 0.16 0.66 0.83 0.09 0.11 0.65 0.22 0.3 0.31
0.52 0.37 0.17 0.08 0.03 0.09 0.26 0.08 0.14 0.27 0.08 0.1 0.15 1.0 0.72 0.08 0.11 0.12 0.12 0.12 0.41 0.06 0.11
0.0 0.0 1.0 0.41 0.0 0.2 0.0 0.0 0.44 0.55 0.22 0.0 0.07 0.91 0.53 0.12 0.05 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.73 0.68 0.43 0.37 0.36 0.31 1.0 0.37 0.53 0.34 0.47 0.34 0.25 0.8 0.41 0.35 0.49 0.12 0.14 0.77 0.59 0.45 0.44
0.88 0.17 0.62 0.43 0.33 0.39 0.51 0.32 0.3 0.76 0.3 0.2 0.17 1.0 0.37 0.42 0.3 0.18 0.18 0.49 0.5 0.53 0.54
0.52 0.45 0.33 0.44 0.4 0.59 0.31 0.3 0.33 0.29 0.31 0.43 0.28 1.0 0.45 0.33 0.41 0.25 0.26 0.46 0.41 0.47 0.54
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.04 0.11 0.17 0.05 0.01 0.08 0.01 0.06 0.38 0.06 0.2 0.03 0.1 1.0 0.24 0.18 0.13 0.03 0.02 0.01 0.02 0.06 0.05
1.0 0.66 0.65 0.24 0.23 0.46 0.91 0.5 0.58 0.72 0.3 0.36 0.19 0.8 0.81 0.23 0.31 0.26 0.29 0.68 0.81 0.57 0.76
0.36 0.17 0.21 0.13 0.14 0.18 0.35 0.31 0.16 0.18 0.24 0.14 0.18 1.0 0.18 0.23 0.23 0.38 0.39 0.21 0.18 0.16 0.24
0.07 0.09 0.39 0.04 0.03 0.05 0.13 0.02 0.2 0.11 0.12 0.08 0.12 1.0 0.11 0.04 0.05 0.03 0.03 0.09 0.06 0.05 0.06
0.4 0.56 0.76 0.16 0.21 0.25 0.22 0.2 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.18 0.76 0.84 0.13 0.16 0.34 0.23 0.36 0.39
0.3 0.38 0.03 0.1 0.02 0.06 0.08 0.07 0.52 0.05 0.24 0.15 0.18 1.0 0.09 0.04 0.04 0.08 0.07 0.08 0.27 0.06 0.07
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 1.0 0.26 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.0
0.0 0.0 0.0 0.0 0.0 0.02 0.0 0.06 0.0 0.03 0.04 0.0 0.01 1.0 0.03 0.01 0.02 0.0 0.0 0.0 0.03 0.0 0.0
0.39 0.36 0.44 0.06 0.03 0.07 0.8 0.19 0.59 1.0 0.23 0.12 0.5 0.66 0.4 0.04 0.05 0.02 0.03 0.26 0.3 0.09 0.05
0.46 0.6 0.6 0.51 0.58 0.48 0.5 0.4 0.37 0.39 0.47 0.39 0.33 1.0 0.44 0.5 0.49 0.31 0.35 0.63 0.54 0.45 0.45
0.17 0.18 0.23 0.04 0.05 0.07 0.37 0.09 0.32 1.0 0.16 0.24 0.17 0.77 0.6 0.03 0.06 0.04 0.04 0.34 0.27 0.17 0.17
0.84 0.61 0.75 0.26 0.2 0.29 0.45 0.85 0.21 0.25 0.43 0.27 0.21 1.0 0.14 0.64 0.81 0.5 0.49 0.8 0.29 0.42 0.48
0.92 0.95 0.44 0.51 0.54 0.71 0.38 0.37 0.4 0.82 0.8 0.79 0.66 0.86 0.51 0.58 0.72 0.46 0.45 0.75 1.0 0.87 0.85
0.96 0.36 0.28 0.12 0.18 0.22 0.27 0.98 0.14 0.1 0.69 0.39 0.12 1.0 0.09 0.24 0.25 0.62 0.62 0.3 0.15 0.26 0.38
0.24 0.03 0.18 0.2 0.22 0.29 0.16 0.04 0.37 0.31 0.04 0.09 0.14 1.0 0.64 0.3 0.17 0.1 0.09 0.17 0.15 0.07 0.06

Details

Expression values normalized per gene (using the maximum value, Green cells indicate low expression and red high. (Dark gray cells indicate missing values)