Heatmap: Cluster_30 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
HJ48,hypha
HJ48,hypha,anaero/96h
HJ48,hypha,glu,anaero/96h
HJ48,hypha,xyl,anaero/96h
KO,mycelia,cellu
KO,mycelia,glu
KO,mycelia,gly
KO,mycelia,sopho
KO,mycelia,sugarcane
M124,16h
M124,24h
M124,40h
M124,64h
M307,16h
M307,24h
M307,40h
M307,64h
M362,16h
M362,24h
M362,40h
M362,64h
M7,16h
M7,24h
M7,40h
M7,64h
M727,16h
M727,24h
M727,40h
M727,64h
M76,16h
M76,24h
M76,40h
M76,64h
QM6a,WT,glu,0h
QM6a,WT,lac,24h
QM6a,WT,lac,48h
QM6a,WT,mycelia,cellu,dark
QM6a,WT,mycelia,cellu,light
QM6a,WT,mycelia,dark
QM6a,WT,mycelia,light
QM6a,mycelia
QM6a,mycelia,glu
QM6a,mycelia,gly
QM6a,mycelia,sugarcane
QM9414,WT,2h
QM9414,mycelia
QM9414,xyr1/ara1 KO,2h
QM9978,cellulase-,glu,0h
QM9978,cellulase-,lac,48h
Rut-C30
Rut-C30,24h
Rut-C30,SEB
Rut-C30,SEB,24h
Rut-C30,mycelia
Tu-6
Tu-6,glu
Tu-6,kap8 KO,gly,0h
Tu-6,kap8 KO,sopho,3h
Tu-6,mycelia,sugarcane
Tu-6,sugarcane
WT,mycelia,cellu
WT,mycelia,glu
WT,mycelia,sopho
ace3 KO,mycelia
ara1 KO
azf1 KO,glu
azf1 KO,mycelia,sugarcane
azf1 KO,sugarcane
cre1 KO
cre1 KO,mycelia
gpr8 KO,mycelia,cellu,dark
gpr8 KO,mycelia,cellu,light
kap8 KO,gly,0h
kap8 KO,sopho,3h
xki1 KO
xyr1 KO
ypr2 KO,mycelia,dark
ypr2 KO,mycelia,light
-8.36 -1.85 -8.06 -3.09 -1.03 -0.5 0.76 -0.41 0.39 -0.1 -0.26 -0.87 -0.95 0.41 -0.2 -0.44 -0.79 0.13 -0.14 -0.76 -1.09 0.43 0.02 -0.65 -1.06 -0.21 -0.06 -0.22 -1.02 0.4 0.07 -0.49 -0.94 0.07 -0.02 0.33 0.33 0.58 0.6 0.94 0.41 -0.79 1.03 0.6 -0.63 -0.77 -0.63 -0.23 0.22 -0.74 0.52 0.58 0.38 -0.44 0.13 0.96 1.68 0.75 -0.59 -0.63 -0.99 -0.64 -0.76 -1.23 -0.55 0.95 -0.96 -0.99 -0.64 -0.02 0.53 0.53 1.08 0.51 -0.35 -0.21 0.92 0.96
-7.13 -2.22 -7.13 -3.09 -0.66 -0.54 0.5 -0.32 -0.16 0.41 0.42 -0.06 -0.02 0.82 0.28 0.21 0.05 0.75 0.46 -0.0 -0.16 0.9 0.5 0.13 -0.24 0.33 0.43 0.16 0.08 0.92 0.58 0.26 -0.23 -0.39 -0.38 0.21 0.14 0.28 0.34 0.51 0.3 -0.51 0.73 0.03 0.05 -1.43 -0.2 -0.72 0.0 -0.7 -0.28 -0.04 -0.25 -0.5 0.07 0.13 1.34 0.22 -0.96 -1.04 -0.72 -0.21 -0.33 -0.63 -0.73 0.19 -1.12 -1.26 -1.08 -0.5 0.3 0.28 0.6 0.2 -0.52 -0.7 0.55 0.55
-4.46 -2.12 -4.54 -3.04 -1.84 -1.51 -0.32 -1.31 -0.46 0.55 0.55 0.08 0.44 1.21 0.52 0.48 0.56 1.04 0.66 0.03 0.04 1.13 0.58 0.26 0.38 0.5 0.58 0.42 0.46 1.08 0.62 0.28 0.3 -0.67 -0.63 -0.12 -0.06 0.19 0.29 0.62 -0.15 -1.56 -0.09 -0.31 -0.38 -1.19 -0.54 -1.03 -0.45 -0.11 -0.03 0.05 -0.01 -0.51 0.0 0.24 1.2 0.19 -0.8 -0.92 -1.72 -1.38 -1.66 -0.49 -0.77 0.3 -1.08 -1.08 -0.95 -1.32 0.09 0.14 0.96 0.16 -0.72 -0.49 0.53 0.62
-7.99 0.08 -6.89 -2.66 0.32 -0.17 0.13 -0.08 0.49 -0.7 -0.76 -1.6 -1.47 -0.17 -0.68 -0.98 -1.5 -0.19 -0.65 -1.22 -1.65 -0.26 -0.61 -1.6 -2.07 -0.68 -0.65 -0.69 -1.29 -0.34 -0.53 -1.15 -1.66 0.39 0.5 0.03 0.16 0.59 0.36 1.22 0.76 -0.34 0.39 0.83 -0.4 -1.9 -1.27 0.31 0.65 -1.39 1.09 0.97 0.44 -1.13 0.46 0.57 2.02 0.95 -0.55 -0.62 0.45 0.88 0.18 -1.6 -0.91 0.76 -0.44 -0.72 -1.24 0.72 0.13 0.61 0.83 0.17 -0.73 -0.47 1.15 1.28
-4.69 -1.01 -4.69 -2.66 -0.51 -0.29 0.58 0.01 0.29 -0.51 -0.67 -1.16 -1.53 -0.04 -0.36 -0.35 -1.23 -0.24 -0.64 -1.11 -1.71 -0.02 -0.33 -0.84 -1.47 -0.41 -0.2 -0.59 -1.41 -0.01 -0.21 -0.78 -1.32 0.35 0.32 0.9 0.04 0.56 0.23 0.77 0.19 0.02 0.88 0.5 0.03 -0.09 -0.17 0.26 0.8 0.75 0.27 0.28 0.03 -0.07 0.26 0.6 1.27 0.44 -0.38 -0.43 -0.78 -0.41 -0.58 -0.39 0.26 0.66 -0.65 -0.63 0.06 -0.28 0.2 0.57 1.33 0.75 0.45 0.36 0.72 0.72
-2.52 -1.14 -2.46 -0.71 -1.35 0.79 0.08 -0.58 -0.6 -0.93 -1.14 -1.25 -1.6 -0.77 -0.88 -0.82 -1.0 -0.54 -0.25 -0.73 -1.42 -0.79 -0.86 -0.66 -1.32 -0.93 -0.87 -0.69 -1.39 -0.65 -0.6 -0.86 -0.78 -0.04 0.1 -0.02 0.14 1.09 0.08 0.45 1.01 0.67 -0.07 -0.31 1.22 -1.47 1.3 -0.3 0.14 -1.01 0.25 0.37 0.24 -0.89 1.36 1.07 0.9 0.87 0.11 -0.06 -0.1 1.26 -0.32 0.19 -0.88 1.14 0.04 0.05 -1.0 0.56 -0.39 0.99 1.55 0.32 -0.84 -1.15 0.37 0.56
-6.83 -1.48 -6.77 -1.82 -0.96 0.45 0.24 -0.52 0.01 -1.5 -1.52 -1.85 -3.0 -0.48 -1.25 -0.64 -1.76 -0.66 -0.54 -1.25 -2.56 -0.85 -1.32 -1.23 -2.41 -1.95 -1.24 -0.68 -1.76 -0.55 -0.71 -1.36 -2.28 0.63 0.9 0.53 0.15 1.45 -0.11 1.1 1.13 0.34 0.41 0.07 0.43 -1.91 0.18 0.49 0.3 -2.6 0.44 0.07 0.26 -1.07 1.6 1.04 1.02 0.96 -0.76 -0.73 0.27 1.42 -0.45 0.26 -1.23 0.99 -0.8 -0.81 -1.43 0.96 0.03 1.45 1.85 -0.3 -1.24 -1.27 1.05 1.13
-3.57 -0.63 -3.5 -2.16 -1.28 -0.74 0.47 -0.64 0.21 0.55 0.31 -0.52 -0.38 0.81 0.33 0.16 -0.49 0.75 0.28 -0.33 -0.57 1.07 0.49 -0.21 -0.65 0.35 0.61 0.18 -0.56 0.9 0.54 -0.07 -0.56 -0.28 -0.4 0.18 0.23 0.38 0.33 0.58 -0.17 -0.45 0.72 0.39 -1.02 -0.68 -1.15 -0.34 0.1 0.64 -0.08 0.05 -0.29 0.17 -0.93 0.6 0.89 0.04 -0.56 -0.82 -1.29 -0.68 -1.16 -0.64 -0.37 0.7 -0.96 -1.1 -0.44 -0.53 0.54 0.35 0.83 -0.03 -0.02 0.0 0.49 0.53
-7.29 -0.96 -6.2 -2.07 -0.63 -1.74 -0.53 -0.18 -0.91 0.12 -0.08 -0.64 -0.84 0.74 0.16 0.05 -0.63 0.52 0.11 -0.63 -1.32 0.72 0.18 -0.4 -1.14 -0.08 0.21 -0.13 -0.71 0.65 0.25 -0.25 -0.92 -0.19 -0.23 0.33 0.05 1.12 0.25 0.52 0.59 -1.98 -0.28 -0.61 0.31 -1.35 0.32 -0.94 0.27 -0.1 0.5 0.57 0.19 -0.21 0.45 0.72 1.54 0.44 -0.45 -0.52 -0.29 -0.04 -0.16 0.07 -0.62 0.77 -0.67 -0.77 -0.84 -0.08 0.27 1.04 1.26 0.2 -0.5 -0.38 0.54 0.51
-6.07 -1.81 -6.14 -3.01 -1.09 -0.3 0.76 -0.23 -0.07 -0.32 -0.48 -1.13 -1.25 0.44 -0.16 -0.4 -0.95 -0.02 -0.23 -1.15 -1.2 0.18 -0.18 -0.77 -1.45 -0.28 -0.31 -0.34 -1.22 0.2 -0.09 -0.77 -0.98 -0.32 -0.41 -0.04 0.32 0.52 0.61 0.86 0.5 -0.46 1.01 0.16 0.07 -1.19 -0.21 -1.17 -0.33 -0.28 0.51 0.57 0.27 -0.02 0.62 1.02 1.93 1.05 -0.54 -0.59 -0.77 -0.16 -0.51 -0.17 -0.66 0.93 -0.88 -0.97 -0.75 0.01 0.55 0.48 1.48 0.92 -0.35 -0.64 0.93 0.89
- -0.33 - -2.66 -1.04 0.67 1.05 -0.4 0.82 0.01 -0.09 -0.61 -1.28 -0.33 -0.2 -0.3 -0.53 0.28 0.11 -0.28 -0.88 0.07 0.28 -0.74 -0.24 -0.65 -0.16 -0.41 -0.61 0.1 0.4 -0.27 -1.06 -0.23 -0.14 0.19 0.65 0.42 0.72 1.22 0.01 0.63 0.75 0.55 -0.97 -0.85 -1.46 0.25 0.75 -1.9 1.06 1.1 0.5 0.24 -0.99 -0.52 0.73 0.29 -0.58 -0.71 -0.86 -0.3 -0.79 -0.72 -0.69 -0.33 -0.36 -0.17 -0.82 -0.05 1.07 0.53 0.13 0.03 -0.19 -0.6 0.4 1.19
-7.2 -1.52 -7.28 -3.13 -0.85 -0.73 0.5 -0.68 -0.51 0.35 0.37 -0.4 -0.39 0.6 0.09 -0.19 -0.36 0.8 0.42 -0.35 -0.51 0.81 0.22 -0.24 -0.54 0.22 0.38 -0.03 -0.41 0.82 0.27 0.02 -0.56 -1.28 -1.16 -0.12 0.48 0.39 0.38 0.68 0.34 -0.69 0.75 -0.23 0.43 -0.49 0.46 -2.53 -0.99 -1.2 0.41 0.64 0.68 0.54 -0.8 0.56 1.23 0.28 -0.65 -0.77 -1.38 -0.68 -0.98 0.77 0.13 0.63 -1.04 -1.0 -0.26 -0.58 0.75 0.3 -0.3 -0.16 0.44 -0.03 0.56 0.62
-4.49 -0.91 -4.4 -2.39 -0.55 -0.64 0.48 -0.34 -0.19 -0.09 -0.42 -0.66 -0.54 0.29 -0.09 -0.38 -0.18 -0.11 -0.25 -0.7 -0.31 0.32 0.26 -0.56 -0.54 -0.07 -0.29 -0.28 -0.31 0.45 0.36 -0.45 -0.06 -0.2 -0.08 -0.59 0.12 0.59 0.78 1.08 0.47 -0.78 0.66 0.21 -0.34 -1.15 -0.59 -0.63 -0.36 -1.27 0.74 0.74 0.41 -0.83 0.33 0.26 1.59 0.87 0.05 -0.16 -0.56 -0.09 -0.03 -1.41 -0.78 0.45 -0.07 -0.23 -0.93 -0.43 0.32 0.56 1.14 0.43 -0.66 -0.55 0.83 1.04
-5.89 0.74 -5.2 -1.63 0.3 -0.06 0.57 -0.36 0.48 -0.89 -0.88 -1.68 -2.2 -0.25 -0.73 -0.98 -1.59 -0.2 -0.61 -1.57 -1.65 -0.37 -0.56 -1.5 -2.43 -1.05 -1.03 -0.75 -1.67 -0.4 -0.5 -1.25 -1.91 -0.03 -0.12 -0.17 0.16 1.05 -0.17 1.14 1.07 -0.09 0.9 0.9 -0.54 -1.66 -1.65 -0.82 -0.2 -1.43 1.29 1.48 0.81 -1.29 0.27 0.41 2.18 0.91 -0.5 -0.68 0.41 0.84 0.05 -1.0 -0.83 0.64 -0.58 -0.98 -1.14 0.4 0.16 1.0 0.95 0.36 -0.72 -0.38 0.79 1.13
-7.37 -2.1 -7.14 -3.23 -0.95 -0.68 0.31 -0.45 0.05 0.21 0.08 -0.35 0.55 0.72 -0.01 -0.19 0.42 0.36 0.02 -0.39 0.11 0.62 0.28 -0.2 0.37 -0.01 0.08 0.0 0.52 0.68 0.32 -0.13 0.21 -0.03 -0.02 0.26 0.02 0.3 0.44 0.77 0.15 -0.7 0.57 0.29 -0.56 -1.07 -0.61 -0.03 0.35 -0.65 -0.05 0.0 -0.1 -0.67 0.28 0.53 1.34 0.41 -0.54 -0.68 -0.92 -0.43 -0.62 -1.32 -0.94 0.55 -0.89 -0.89 -0.96 -0.5 0.3 0.23 1.04 0.07 -0.77 -0.64 0.76 0.77
-7.33 -1.58 -7.31 -2.06 -0.86 -1.26 -0.25 -0.4 -0.68 0.26 0.08 -0.46 -0.39 0.54 -0.04 -0.13 -0.29 0.72 0.21 -0.56 -0.69 0.78 0.16 -0.39 -0.64 -0.1 -0.1 -0.13 -0.3 0.75 0.23 -0.3 -0.59 -0.48 -0.55 -0.32 0.07 0.8 0.64 0.79 0.71 -1.56 0.03 -0.37 0.04 -1.96 -0.14 -1.4 -0.79 -0.43 0.75 1.01 0.78 -0.81 0.51 0.59 1.71 0.69 -0.38 -0.49 -0.79 -0.38 -0.56 -0.39 -1.16 0.76 -0.67 -0.77 -1.46 -0.31 0.3 0.78 1.38 0.48 -0.97 -0.92 0.85 0.8
-7.94 -1.76 -7.78 -2.82 -1.43 -0.56 0.67 -0.77 0.54 -0.36 -0.41 -1.04 -1.22 -0.05 -0.51 -0.61 -1.23 0.04 -0.44 -0.98 -1.47 0.14 -0.27 -0.79 -1.37 -0.53 -0.28 -0.54 -1.44 0.13 -0.26 -0.8 -1.18 0.11 0.04 0.58 0.58 1.09 0.63 0.89 0.52 -0.64 0.86 0.61 -0.38 -0.55 -0.29 -0.18 0.48 -1.16 0.27 0.44 0.3 -0.2 -0.27 1.14 2.0 0.84 -0.04 -0.16 -1.36 -1.43 -1.35 -0.79 -0.43 1.15 -0.43 -0.39 -0.43 -0.73 0.83 1.01 0.9 0.44 -0.12 0.1 0.88 0.88
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-5.42 -1.78 -5.66 -1.11 -1.01 -0.65 0.01 -0.32 -0.44 -1.07 -0.98 -0.75 -0.66 -0.38 -0.69 -0.51 -0.77 -1.06 -0.66 -0.79 -1.3 -0.6 -0.35 -0.61 -0.67 -1.22 -0.92 -0.64 -0.66 -0.45 -0.54 -0.87 -0.7 1.1 1.07 0.72 -0.11 1.06 0.66 0.76 0.72 -0.5 0.14 -0.31 0.06 -0.62 0.14 0.92 1.09 -1.97 0.81 0.59 0.85 -0.6 0.77 0.61 0.88 0.87 0.25 0.24 -0.35 -0.51 -0.48 -0.46 -0.27 0.53 0.21 0.37 -0.43 -0.39 0.07 0.95 1.04 0.16 -0.36 -0.14 0.68 0.9
-7.54 -1.39 -7.28 -2.45 -0.99 -0.52 0.52 -0.56 0.13 0.33 0.23 -0.32 -0.24 0.95 0.23 0.18 -0.16 0.67 0.26 -0.3 -0.38 0.98 0.58 -0.2 -0.35 0.03 0.37 0.2 -0.27 0.87 0.49 -0.0 -0.32 -0.46 -0.49 -0.04 0.35 0.44 0.3 0.39 0.14 -0.45 0.83 0.33 -0.52 -0.7 -0.57 -0.68 0.41 -0.3 -0.04 0.01 -0.09 -0.17 -0.68 0.33 1.39 0.36 -0.8 -0.95 -1.15 -0.83 -1.06 -0.72 -0.42 0.35 -1.15 -1.21 -0.58 -0.58 0.6 0.35 1.27 0.26 -0.15 -0.03 0.29 0.34
-4.56 0.65 -4.97 -3.02 -0.8 -0.08 0.55 -1.26 0.09 0.33 0.29 -0.41 -0.18 1.06 0.44 0.11 -0.46 0.99 0.54 -0.07 -0.43 1.32 0.99 -0.28 -0.42 -0.01 -0.0 0.31 -0.61 1.29 1.03 0.15 -1.14 -1.22 -1.27 -1.52 0.15 0.42 -0.0 0.92 -0.02 -0.69 0.83 0.06 -0.32 -1.13 -1.5 -1.65 -0.56 -1.36 0.64 0.86 -0.13 -0.68 -0.63 0.07 1.79 0.43 -0.92 -1.03 -0.9 0.14 -1.33 -1.81 -0.95 0.18 -1.07 -1.24 -0.97 -0.16 0.29 0.26 -0.13 -0.59 -0.58 -0.32 0.55 0.73
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-3.69 -1.22 -3.71 -0.77 -0.19 -1.42 -0.34 0.14 -1.09 -0.66 -0.94 -1.55 -2.24 -0.27 -0.88 -1.05 -1.61 -0.52 -0.78 -1.65 -2.41 -0.3 -0.87 -1.36 -2.42 -1.05 -1.26 -0.99 -2.19 -0.22 -0.58 -1.5 -1.64 -0.22 -0.19 -0.06 0.22 1.24 0.77 1.01 1.27 -1.95 0.03 -0.72 0.67 -1.93 0.56 -2.11 -0.84 -0.57 1.4 1.52 1.35 -0.41 0.51 1.42 1.6 0.67 0.05 -0.05 -0.01 0.54 0.18 0.32 -1.35 1.39 -0.2 -0.26 -1.5 0.61 0.47 1.15 0.92 0.27 -1.2 -1.19 1.06 1.08
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-8.21 -1.6 -7.42 -2.73 -1.15 -0.71 0.45 -0.77 -0.1 0.08 0.01 -0.98 -0.94 0.32 -0.23 -0.7 -1.01 0.57 0.03 -0.91 -1.05 0.59 0.06 -0.78 -1.25 -0.12 0.19 -0.22 -1.01 0.52 0.03 -0.53 -1.23 -0.07 0.03 0.82 0.34 0.73 0.6 0.82 0.43 -0.61 0.73 0.23 0.28 -0.67 0.06 -0.47 0.44 -0.8 0.21 0.31 0.24 0.35 -0.46 0.73 1.96 0.81 -0.56 -0.66 -1.33 -0.7 -1.27 -0.06 -0.18 0.76 -0.96 -0.96 -0.45 -0.61 0.64 0.68 0.51 0.38 -0.0 0.06 0.72 0.79
-6.05 -1.64 -6.1 -2.64 -0.88 -0.68 0.45 -0.15 0.13 0.04 -0.05 -0.75 -0.54 0.52 -0.13 -0.36 -0.59 0.35 0.01 -0.72 -0.96 0.54 0.05 -0.54 -1.06 -0.07 -0.02 -0.06 -0.62 0.45 0.03 -0.46 -0.83 0.15 0.13 0.21 0.13 0.67 0.54 0.68 0.73 -0.86 0.68 0.36 -0.35 -1.57 -0.4 -0.23 -0.02 -0.74 0.34 0.36 0.27 -0.62 0.44 0.82 1.91 0.85 -0.78 -0.78 -0.57 -0.27 -0.21 -1.14 -0.95 0.8 -0.99 -1.1 -1.21 0.22 0.34 0.6 1.15 0.49 -0.85 -0.62 0.91 0.78
-5.73 -1.59 -5.72 -1.69 -1.06 -0.29 0.75 -0.45 0.1 0.02 -0.08 -0.79 -0.7 0.42 -0.2 -0.32 -0.71 0.34 -0.16 -0.79 -1.0 0.58 0.1 -0.53 -0.98 -0.12 0.17 -0.22 -0.79 0.44 0.06 -0.41 -1.09 0.12 0.22 0.72 0.26 0.38 0.34 0.62 0.36 -0.1 0.88 0.42 -0.66 -0.75 -0.56 0.19 0.86 -0.2 0.29 0.38 0.25 0.04 0.12 0.69 1.74 0.39 -0.81 -0.86 -0.71 -0.41 -0.62 -0.28 -0.36 0.67 -1.1 -1.13 -0.51 -0.16 0.56 0.28 0.88 0.23 -0.18 -0.21 0.52 0.57
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-7.83 -1.27 -7.65 -2.47 -0.62 -0.76 0.29 0.01 -0.38 -0.15 -0.32 -0.8 -0.7 0.6 -0.07 -0.19 -0.33 0.03 -0.21 -0.81 -0.69 0.36 0.0 -0.54 -0.66 -0.19 0.0 -0.19 -0.56 0.38 0.15 -0.35 -0.57 -0.13 -0.13 0.71 0.11 0.62 0.47 0.71 0.23 -0.75 0.56 -0.04 0.02 -1.16 -0.01 -0.61 0.41 0.49 0.52 0.59 0.56 0.23 -0.2 0.72 1.51 0.4 -0.5 -0.55 -0.78 0.09 -0.29 0.08 -0.6 0.78 -0.8 -0.89 -0.85 -0.44 0.51 0.53 1.12 0.51 -0.31 -0.6 0.6 0.65
-3.75 -0.49 -4.11 -1.65 -0.11 -0.83 0.23 0.29 -0.02 -0.66 -0.82 -1.0 -1.03 -0.15 -0.67 -0.45 -0.72 -0.5 -0.62 -1.18 -1.36 -0.2 -0.46 -0.88 -1.15 -0.79 -0.83 -0.57 -1.18 -0.15 -0.19 -1.05 -0.94 0.31 0.34 0.33 -0.11 0.71 0.59 0.95 0.47 -1.2 0.31 0.37 -0.38 -1.44 -0.63 -0.31 -0.09 -0.8 0.91 0.95 0.61 -0.92 0.53 0.19 1.88 1.19 0.11 -0.09 0.18 0.25 0.23 -1.18 -0.76 0.46 0.02 -0.2 -0.95 0.3 0.23 0.67 1.55 1.06 -0.7 -0.46 0.85 0.98

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.