Heatmap: Cluster_53 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
HJ48,hypha
HJ48,hypha,anaero/96h
HJ48,hypha,glu,anaero/96h
HJ48,hypha,xyl,anaero/96h
KO,mycelia,cellu
KO,mycelia,glu
KO,mycelia,gly
KO,mycelia,sopho
KO,mycelia,sugarcane
M124,16h
M124,24h
M124,40h
M124,64h
M307,16h
M307,24h
M307,40h
M307,64h
M362,16h
M362,24h
M362,40h
M362,64h
M7,16h
M7,24h
M7,40h
M7,64h
M727,16h
M727,24h
M727,40h
M727,64h
M76,16h
M76,24h
M76,40h
M76,64h
QM6a,WT,glu,0h
QM6a,WT,lac,24h
QM6a,WT,lac,48h
QM6a,WT,mycelia,cellu,dark
QM6a,WT,mycelia,cellu,light
QM6a,WT,mycelia,dark
QM6a,WT,mycelia,light
QM6a,mycelia
QM6a,mycelia,glu
QM6a,mycelia,gly
QM6a,mycelia,sugarcane
QM9414,WT,2h
QM9414,mycelia
QM9414,xyr1/ara1 KO,2h
QM9978,cellulase-,glu,0h
QM9978,cellulase-,lac,48h
Rut-C30
Rut-C30,24h
Rut-C30,SEB
Rut-C30,SEB,24h
Rut-C30,mycelia
Tu-6
Tu-6,glu
Tu-6,kap8 KO,gly,0h
Tu-6,kap8 KO,sopho,3h
Tu-6,mycelia,sugarcane
Tu-6,sugarcane
WT,mycelia,cellu
WT,mycelia,glu
WT,mycelia,sopho
ace3 KO,mycelia
ara1 KO
azf1 KO,glu
azf1 KO,mycelia,sugarcane
azf1 KO,sugarcane
cre1 KO
cre1 KO,mycelia
gpr8 KO,mycelia,cellu,dark
gpr8 KO,mycelia,cellu,light
kap8 KO,gly,0h
kap8 KO,sopho,3h
xki1 KO
xyr1 KO
ypr2 KO,mycelia,dark
ypr2 KO,mycelia,light
-9.2 -1.9 -8.51 -3.74 -3.76 -1.28 0.13 -3.06 -0.42 1.44 1.45 1.06 1.19 1.69 1.26 1.13 1.1 1.92 1.37 1.14 1.03 1.92 1.48 1.13 1.16 1.55 1.57 0.99 1.14 1.75 1.41 1.27 0.98 - - - - - - - -1.43 -1.18 0.15 -0.38 -1.57 -0.65 -1.54 - - 0.17 - - - 0.55 - -0.47 - - -1.78 -1.83 -3.68 -2.59 -3.41 -0.46 -0.41 -0.53 -2.14 -2.03 -0.62 -3.28 - - - - -0.09 -0.41 - -
-2.81 -0.31 -2.75 -1.59 -0.31 -0.45 0.13 0.16 -0.33 0.44 0.36 0.76 0.48 0.64 0.53 0.89 0.35 0.27 0.41 0.3 0.62 0.57 0.94 0.6 0.19 0.1 -0.01 0.4 0.5 0.66 0.74 0.88 0.33 -1.36 -1.15 -0.91 -0.04 -1.03 -0.28 -0.76 -0.54 -1.03 -0.07 -0.48 -0.33 0.21 -0.56 -0.13 0.2 -1.06 -0.63 -0.35 -0.49 -0.18 -1.03 -0.04 0.21 0.57 -0.51 -0.66 -0.12 -0.73 -0.32 -0.56 0.42 0.07 -0.19 -0.25 0.27 -0.22 0.12 -1.06 0.36 0.52 0.37 0.07 -0.91 -0.75
-3.96 -1.02 -3.97 -1.99 -1.21 0.66 0.44 -0.75 0.25 0.82 0.62 0.2 0.64 0.75 0.62 0.29 0.32 0.96 0.82 0.6 0.63 0.85 0.75 0.4 0.58 0.69 0.59 0.34 0.41 0.79 0.72 0.57 0.45 -0.83 -0.78 -0.45 -0.26 -0.2 -1.11 -0.55 -0.23 0.73 0.34 0.16 -0.16 0.24 -0.72 -0.67 -0.37 -0.68 -0.66 -0.6 -0.71 -0.14 -1.56 -0.24 -0.29 -0.13 -0.81 -0.93 -1.15 -0.43 -1.34 0.09 0.33 -0.21 -0.86 -0.92 0.21 -0.65 -0.5 -0.26 -0.61 -0.5 0.33 0.23 -1.01 -0.64
-2.03 -1.41 -1.94 -1.7 -2.37 0.65 -0.6 -1.99 -0.34 0.87 0.55 0.36 0.72 0.85 0.48 0.29 0.7 0.84 0.64 0.82 0.36 0.84 0.5 0.59 0.59 0.66 0.55 0.4 0.85 0.77 0.56 0.77 0.47 -0.57 -0.42 -0.68 -0.25 0.54 -0.75 -0.17 -0.33 0.61 -0.51 -0.23 0.09 -0.47 -0.6 -0.16 -0.49 -0.11 -0.74 -0.62 -0.73 -0.89 -0.29 -0.23 0.58 0.37 -0.8 -1.07 -2.05 -0.95 -1.84 -0.17 -0.33 0.0 -1.03 -1.19 -0.46 -1.48 -0.69 0.56 0.57 -0.11 -0.31 -0.39 -0.38 -0.21
-5.41 -2.4 -5.4 -3.98 -1.0 -0.25 -0.32 -0.21 -0.54 0.66 0.56 0.12 -0.19 0.52 0.31 0.23 -0.16 0.88 0.55 0.49 0.08 1.11 0.17 0.24 -0.25 0.63 0.91 0.68 0.2 0.86 0.59 0.75 0.03 -0.13 -0.26 -0.66 0.54 -0.29 0.29 0.7 -0.2 -0.13 -0.7 -1.03 -0.54 -0.59 -1.43 1.33 0.77 -1.42 -0.99 -0.89 -1.62 -0.45 -0.34 -0.11 0.15 0.56 -1.03 -1.11 -1.16 0.28 -0.21 -0.34 -0.63 0.07 -1.21 -1.27 -0.66 0.06 -0.04 -0.34 1.02 0.18 -0.25 -0.62 0.32 0.78
-4.99 -2.3 -4.54 -5.83 -0.64 0.33 -1.4 0.56 -2.13 0.74 0.96 -0.14 -0.15 1.09 0.6 0.46 0.12 1.17 0.56 0.54 -0.22 1.46 0.26 0.22 -0.71 0.86 1.57 1.18 0.35 1.19 0.61 0.85 -0.14 -1.52 -2.06 -1.84 -0.24 -1.59 -0.33 -0.55 -0.84 0.31 -1.86 -2.26 -0.07 -0.39 -0.83 -1.75 -1.1 -2.46 -0.82 -0.83 -0.84 0.24 -0.42 -0.41 1.07 0.48 -0.2 -0.5 -1.29 1.04 0.08 -1.55 0.34 -0.04 -0.16 -0.5 -0.79 0.86 -0.16 -1.78 0.63 -0.29 0.66 -0.44 -1.03 -0.61
-4.05 -0.13 -4.13 -3.49 0.44 -1.98 0.47 -1.06 -1.24 1.44 1.36 1.39 0.74 2.16 1.2 1.2 0.55 -0.44 0.79 0.46 0.81 2.52 2.18 1.62 0.98 -0.23 0.11 0.56 0.24 2.62 1.89 1.52 1.15 -3.14 -2.58 -1.93 -1.05 -3.98 -1.99 -3.95 -3.08 -1.95 -0.9 -2.82 -1.83 -2.67 0.15 -1.71 -1.08 -3.64 -3.24 -2.43 -3.25 -5.28 -3.5 -1.87 -2.35 -1.44 -2.25 -2.33 -0.63 -1.89 -1.27 -2.95 -2.37 -1.7 -0.86 -1.41 -1.84 -0.64 -1.14 -3.57 -2.15 -1.07 -2.26 -2.99 -1.48 -3.51
-7.83 -1.3 -7.39 -3.1 -1.45 -2.73 -1.92 -1.04 -2.66 1.29 1.31 0.72 0.67 1.62 0.96 0.72 0.27 1.98 1.16 0.55 0.7 1.73 0.93 0.67 0.28 1.14 1.06 0.46 0.39 1.76 0.95 0.83 -0.22 -1.5 -1.54 -0.61 -0.89 0.5 -0.49 -0.22 -0.16 -3.53 -1.51 -2.41 0.13 -3.84 0.24 -2.12 -1.42 0.24 0.61 0.75 0.68 0.34 -1.0 -0.07 -2.28 -3.58 -0.97 -0.91 -2.27 -1.05 -1.85 -0.56 -2.95 0.14 -1.08 -1.12 -3.52 -1.62 -0.6 0.41 -2.4 -2.45 -2.52 -3.55 -0.43 -0.27
-6.18 -1.83 -6.1 -2.69 -2.44 -1.55 -0.64 -1.85 -0.88 1.04 1.02 0.51 1.21 1.6 0.79 0.66 0.96 1.48 0.93 0.75 1.15 1.66 1.04 0.6 0.99 0.95 1.01 0.57 1.03 1.58 0.94 0.92 0.66 -0.9 -1.01 -0.48 -0.92 -0.25 -0.79 -0.38 -0.35 -1.36 -0.34 -0.66 -1.34 -1.44 -1.3 -1.34 -0.57 -0.39 -0.5 -0.45 -0.28 -0.99 -0.99 -0.12 0.16 -0.89 -1.55 -1.59 -2.42 -1.45 -2.2 -0.28 -1.11 -0.1 -1.9 -1.99 -1.3 -1.69 -0.68 -0.29 -0.01 -0.87 -1.0 -0.84 -0.57 -0.41
-5.91 -2.13 -7.25 -3.16 -1.28 -0.53 0.55 -1.11 0.08 1.07 0.53 0.11 1.06 0.42 0.54 -0.03 0.48 1.17 0.83 0.17 1.13 0.62 0.92 0.0 0.93 0.89 0.67 0.36 0.83 0.71 0.53 0.28 0.87 -0.53 -0.56 -0.69 -0.43 -0.25 0.07 -0.11 -1.13 -0.74 0.42 0.27 0.09 0.37 -0.1 -0.1 -0.71 -0.26 -0.89 -0.16 -0.54 0.05 -1.08 -0.81 -0.15 -0.46 -0.46 -0.66 -1.85 -2.41 -1.63 -1.37 0.2 -0.69 -0.76 -0.58 0.16 -2.17 -0.03 -0.32 -0.18 -0.2 0.36 0.35 -0.33 -0.15
-3.66 -1.09 -3.75 -1.55 -1.15 -0.88 -0.66 -0.98 -0.35 0.62 0.32 0.01 0.26 0.34 0.26 0.14 0.11 0.5 0.37 0.04 -0.19 0.51 0.57 -0.02 0.33 0.33 0.27 0.07 0.16 0.54 0.45 -0.0 -0.03 -0.05 0.04 -0.0 -0.24 0.45 0.4 0.54 -0.25 -1.09 -0.72 -0.52 0.46 -0.24 -0.04 -0.03 0.3 -1.12 0.51 0.62 0.53 -0.93 -0.33 0.52 0.59 0.63 0.04 -0.12 -1.21 -1.12 -1.45 -0.77 -0.19 0.57 -0.05 -0.07 -0.44 -1.11 -0.2 0.36 0.41 0.39 -0.26 -0.07 0.35 0.57
-3.54 0.84 -3.48 -0.45 -0.41 -0.7 -0.33 -0.81 -0.89 0.16 0.34 0.55 1.23 -0.02 0.6 0.25 0.76 -0.04 0.02 0.75 1.34 0.2 0.32 0.31 1.25 -0.4 -0.39 0.11 0.91 0.36 0.4 0.64 1.12 -0.64 -0.31 -0.58 0.21 -0.67 -0.19 -0.69 -1.01 -0.96 -0.55 -0.98 1.04 0.27 0.3 -0.05 -0.02 -2.37 -0.86 -0.47 -0.87 -2.28 -0.29 0.01 -0.96 -0.17 -0.18 -0.28 -0.11 -0.19 -0.28 -1.9 0.41 0.07 0.14 -0.08 0.11 -0.65 -0.07 -0.8 -0.14 0.1 0.19 -0.04 -0.32 -0.39
-3.89 -0.82 -3.87 -3.45 -2.07 -0.61 0.45 -1.5 0.2 1.16 1.17 0.81 0.61 1.25 1.16 1.07 0.47 1.53 1.12 1.06 0.73 1.52 1.25 0.88 0.63 1.34 1.27 0.89 0.56 1.37 1.18 1.08 0.6 -2.29 -2.14 -1.56 -1.65 -2.42 -1.54 -1.47 -1.24 -0.55 0.54 0.24 -1.41 0.04 -1.02 -1.51 -1.91 0.31 -2.13 -2.13 -2.21 0.93 -2.75 -0.6 -1.3 -1.75 -1.14 -1.29 -2.43 -1.93 -2.19 -0.32 0.07 -0.62 -1.34 -1.34 -0.14 -2.1 -1.42 -2.54 -2.31 -1.9 0.26 0.09 -1.73 -1.58
-6.99 -2.17 -7.15 -3.86 -2.13 -1.02 -0.05 -1.54 -0.68 1.2 1.08 0.32 1.19 1.57 0.59 0.47 1.04 1.5 0.9 0.47 1.07 1.7 1.07 0.47 1.02 0.73 1.07 0.62 1.2 1.53 0.95 0.69 0.67 -1.22 -1.22 -0.32 -0.54 -0.8 -0.28 -0.16 -0.95 -0.92 0.09 -0.54 -1.47 -1.92 -1.39 -1.31 -0.62 -1.48 -1.21 -1.09 -1.36 -0.1 -1.03 -0.14 0.8 -0.3 -1.5 -1.54 -1.94 -1.81 -2.02 -0.84 -1.28 -0.13 -1.79 -1.81 -1.5 -1.22 -0.27 -0.82 -0.14 -0.5 -0.98 -1.1 -0.08 -0.09
-3.44 -0.18 -3.33 -1.21 0.16 0.07 -0.12 -0.43 -0.64 0.61 0.5 0.16 -0.08 0.43 0.5 0.65 0.49 1.17 0.78 0.33 0.17 0.49 0.49 0.05 0.45 0.82 0.62 0.24 0.19 0.66 0.66 0.17 0.2 -1.93 -1.9 -1.56 -0.85 0.41 -0.68 -0.08 -0.19 -0.05 -0.33 -0.72 1.03 -1.07 0.42 -3.48 -1.94 -0.15 -0.06 0.4 0.17 -0.51 -0.51 -0.22 0.25 0.03 0.04 -0.21 -0.52 0.21 -0.47 0.79 -0.88 0.14 -0.04 -0.12 -0.89 -0.61 -0.85 0.37 0.24 0.37 -0.41 -0.79 -0.67 -0.21
-4.75 -1.79 -4.48 -4.23 -2.35 -2.07 -1.3 -2.74 -1.09 1.19 2.08 0.85 0.51 1.3 1.16 1.36 1.08 2.32 1.62 0.73 1.05 1.11 0.98 1.06 0.75 1.08 2.24 1.83 1.26 1.16 0.82 1.19 0.58 -1.91 -1.8 -2.16 -1.43 -0.69 -1.64 -0.15 -1.21 -2.34 -1.18 -1.29 -2.2 -2.98 -1.98 -1.46 -1.33 -0.95 -1.56 -1.53 -1.46 -2.03 -1.71 -1.17 -0.41 -1.27 -2.18 -2.27 -1.66 -0.94 -2.61 -1.79 -2.78 -1.21 -2.1 -2.25 -2.69 -1.5 -1.41 -0.75 -0.38 -1.9 -2.67 -2.38 -0.6 -0.15
-3.47 -0.32 -3.64 -1.75 -1.35 0.03 -0.03 -1.04 -0.4 0.53 0.46 0.2 0.16 0.5 0.51 0.24 0.09 0.41 0.62 0.61 0.24 0.45 0.57 0.19 0.32 0.53 0.18 0.04 0.13 0.41 0.52 0.26 0.22 -0.9 -0.82 -0.33 -0.52 -0.23 -0.33 -0.19 -0.19 0.26 -0.0 -0.11 0.88 0.76 0.35 -0.68 -0.71 0.11 -0.56 -0.64 -0.58 0.74 -0.91 -0.44 0.28 0.31 -0.69 -0.83 -1.61 -0.86 -1.05 0.19 0.67 -0.31 -0.65 -0.71 0.62 -1.35 -0.62 -0.19 0.69 0.68 0.61 0.63 -0.49 -0.18
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-3.94 -0.03 -4.14 -2.13 -1.68 -0.45 0.32 -1.47 -0.05 0.53 0.25 0.38 1.1 0.48 0.55 0.02 0.35 -0.11 0.53 0.82 1.52 0.63 1.15 0.27 0.93 -0.07 -0.29 -0.24 1.04 0.81 0.96 0.8 0.98 -0.28 -0.24 -0.03 -0.51 -0.34 0.07 0.08 -0.87 -0.38 0.23 0.03 -0.05 0.4 -0.2 0.11 -0.3 -2.07 0.1 0.32 0.06 -1.29 -1.25 -0.44 -0.7 0.01 -0.66 -0.75 -2.27 -2.35 -1.83 -1.58 -0.05 -0.4 -0.73 -0.49 0.02 -2.24 -0.2 -0.43 -0.2 0.2 -0.09 0.01 0.04 0.17
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-2.6 -2.25 -2.69 -1.88 -1.12 0.12 0.29 -0.75 0.06 -0.0 -0.2 0.25 0.57 -0.1 -0.37 -0.08 0.2 -0.15 0.2 0.42 0.67 0.14 0.11 0.08 0.57 -0.32 -0.31 -0.16 0.6 0.32 0.18 0.31 0.49 0.29 0.31 0.15 0.12 -0.01 0.48 0.14 -0.08 0.24 0.28 0.23 -0.27 -0.1 -0.05 0.82 0.56 -1.61 -0.2 0.01 -0.3 -0.69 -0.36 0.08 0.2 0.53 -0.17 -0.37 -0.87 -0.74 -0.69 -0.62 0.1 0.25 -0.1 -0.05 -0.04 -0.73 0.3 -0.09 0.43 0.29 0.16 0.23 0.09 0.1
-2.75 -0.41 -2.65 -1.62 -1.98 0.54 -0.56 -1.31 -0.31 1.08 1.07 0.94 1.02 0.94 0.91 0.87 0.53 1.22 1.3 1.52 0.66 1.14 0.95 0.93 0.92 1.15 0.91 0.62 0.43 1.06 0.79 1.05 0.53 -0.69 -0.57 -0.45 -0.54 -0.36 -1.78 -1.29 -0.68 0.8 -0.71 -0.44 -0.38 -0.12 -0.54 0.01 0.1 -1.67 -1.62 -1.81 -1.85 -1.46 -2.3 -0.9 -1.23 -1.3 -1.37 -1.39 -1.78 -0.5 -1.53 -0.47 -0.14 -0.74 -1.37 -1.31 -0.17 -1.37 -1.09 -0.29 -1.49 -1.65 -0.21 -0.19 -1.69 -1.36
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-4.16 0.19 -4.3 -2.2 -0.02 0.06 0.54 0.23 0.01 0.41 0.4 0.29 0.25 0.29 0.24 0.24 0.06 0.57 0.64 0.48 0.28 0.39 0.41 0.15 -0.15 0.09 -0.06 0.16 0.25 0.63 0.63 0.21 0.22 -0.47 -0.4 0.19 -0.18 -0.4 0.17 0.21 -0.8 -0.17 0.33 -0.11 -0.69 -0.07 -0.44 -0.03 -0.21 -0.22 -0.48 -0.14 0.04 0.58 -1.57 -0.57 0.44 0.61 -0.05 -0.37 -0.4 -0.55 -0.35 -0.85 -0.07 -0.31 -0.14 -0.23 -0.16 -0.53 0.1 -0.49 -0.18 0.47 0.21 0.03 -0.1 0.15
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-7.5 0.19 -7.41 -2.88 -0.31 0.01 -0.26 -0.27 -0.18 0.26 0.02 0.12 -0.6 0.35 0.59 0.57 -0.83 -0.01 0.33 0.6 -0.68 0.48 0.81 0.36 -1.28 0.34 0.15 0.33 -1.02 0.57 1.34 0.93 -0.54 -0.26 -0.16 0.22 -0.04 -0.08 0.62 0.4 -0.86 0.07 -0.19 -0.21 -0.58 0.46 -0.93 0.5 0.32 -1.25 0.0 0.03 -0.16 -0.58 -1.6 -0.99 -1.19 0.49 0.67 0.32 -1.06 -0.93 -0.66 -0.5 0.18 -0.51 0.47 0.4 0.2 -1.33 0.57 -0.17 -0.55 0.42 0.43 0.15 0.24 0.43

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.