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Heatmap: Cluster_34 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

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Gene
HJ48,hypha
HJ48,hypha,anaero/96h
HJ48,hypha,glu,anaero/96h
HJ48,hypha,xyl,anaero/96h
KO,mycelia,cellu
KO,mycelia,glu
KO,mycelia,gly
KO,mycelia,sopho
KO,mycelia,sugarcane
M124,16h
M124,24h
M124,40h
M124,64h
M307,16h
M307,24h
M307,40h
M307,64h
M362,16h
M362,24h
M362,40h
M362,64h
M7,16h
M7,24h
M7,40h
M7,64h
M727,16h
M727,24h
M727,40h
M727,64h
M76,16h
M76,24h
M76,40h
M76,64h
QM6a,WT,glu,0h
QM6a,WT,lac,24h
QM6a,WT,lac,48h
QM6a,WT,mycelia,cellu,dark
QM6a,WT,mycelia,cellu,light
QM6a,WT,mycelia,dark
QM6a,WT,mycelia,light
QM6a,mycelia
QM6a,mycelia,glu
QM6a,mycelia,gly
QM6a,mycelia,sugarcane
QM9414,WT,2h
QM9414,mycelia
QM9414,xyr1/ara1 KO,2h
QM9978,cellulase-,glu,0h
QM9978,cellulase-,lac,48h
Rut-C30
Rut-C30,24h
Rut-C30,SEB
Rut-C30,SEB,24h
Rut-C30,mycelia
Tu-6
Tu-6,glu
Tu-6,kap8 KO,gly,0h
Tu-6,kap8 KO,sopho,3h
Tu-6,mycelia,sugarcane
Tu-6,sugarcane
WT,mycelia,cellu
WT,mycelia,glu
WT,mycelia,sopho
ace3 KO,mycelia
ara1 KO
azf1 KO,glu
azf1 KO,mycelia,sugarcane
azf1 KO,sugarcane
cre1 KO
cre1 KO,mycelia
gpr8 KO,mycelia,cellu,dark
gpr8 KO,mycelia,cellu,light
kap8 KO,gly,0h
kap8 KO,sopho,3h
xki1 KO
xyr1 KO
ypr2 KO,mycelia,dark
ypr2 KO,mycelia,light
-3.26 0.2 -3.46 -2.97 1.6 -0.0 0.56 0.13 1.32 -1.5 -2.02 -2.02 -2.38 -1.33 -1.36 -1.22 -1.41 -2.03 -1.56 -2.32 -1.83 -1.25 -1.25 -1.98 -2.05 -1.12 -1.79 -1.1 -2.19 -1.22 -0.97 -2.06 -0.83 0.85 0.98 0.69 0.29 1.03 0.5 1.39 0.14 -0.49 0.3 1.21 0.01 0.13 -0.51 1.25 0.79 -0.28 1.61 1.69 1.04 -0.57 -0.26 -1.51 -10.72 - -0.27 -0.34 0.9 0.69 0.83 -2.3 -0.08 -1.26 -0.14 -0.44 -0.05 -0.21 0.01 1.06 -0.14 -0.04 0.09 0.32 0.74 1.25
- -4.42 -6.68 -3.45 1.42 -0.53 -0.07 1.62 0.31 -3.83 -3.29 -3.91 -4.92 -3.17 -3.39 -2.68 -4.17 -5.42 -3.26 -4.16 -5.09 -2.25 -1.71 -3.18 -2.34 -3.76 -4.1 -3.44 -4.55 -2.4 -2.15 -3.78 -3.16 0.32 0.1 0.28 0.77 0.97 1.73 1.2 -0.44 0.12 -0.26 0.85 0.03 0.24 1.89 1.14 1.27 -1.63 -3.07 -1.61 -2.05 -2.33 -0.67 -0.19 -1.27 1.83 0.11 0.18 0.34 0.38 2.14 -2.35 0.59 0.23 0.02 -0.03 0.39 0.19 1.01 0.84 -0.61 0.85 1.03 0.95 1.61 1.25
-4.29 -0.29 -3.75 -1.75 1.16 0.79 0.41 0.68 0.74 -1.07 -1.51 -1.51 -1.42 -1.93 -1.31 -0.95 -0.91 -2.02 -1.54 -1.39 -0.66 -1.47 -1.04 -1.81 -1.28 -2.18 -2.38 -1.22 -0.69 -1.35 -0.86 -1.86 -0.64 0.83 0.91 0.36 0.47 0.5 0.72 1.21 -0.14 0.96 0.45 0.47 0.03 0.34 0.36 1.15 -0.42 -1.12 0.7 0.94 0.51 -1.44 -1.14 -0.69 -1.27 0.52 -0.34 -0.49 0.8 0.48 1.66 -0.39 0.17 -0.44 -0.31 -0.34 -0.01 -0.05 0.34 0.46 -0.48 0.53 0.22 0.61 1.12 1.14
-2.98 -1.67 -3.58 0.13 1.38 -1.04 0.54 0.66 0.6 -1.2 -1.71 -1.23 -1.31 -1.06 -0.84 -0.71 -0.41 -2.4 -1.18 -2.55 -1.14 -1.5 -0.41 -0.77 -1.35 -2.28 -1.93 -1.03 -1.34 -1.21 -0.21 -1.04 -0.59 0.3 0.23 0.44 0.29 0.3 1.12 0.84 -0.25 -1.39 0.3 0.41 0.69 0.95 0.61 0.45 0.31 -1.63 -0.62 0.32 0.05 -0.92 -0.69 -0.24 0.01 1.17 0.11 -0.07 0.71 -0.03 1.07 -2.06 0.54 0.02 -0.02 -0.05 0.57 -0.35 0.54 0.21 0.85 1.26 0.75 0.92 0.85 0.7
-1.58 -0.1 -1.47 -1.58 -0.28 -0.62 -0.06 0.02 0.24 -0.4 -0.62 -0.74 -0.23 -0.39 -0.49 -0.06 -0.51 -1.36 -0.46 -0.57 -0.32 -0.32 -0.16 -0.76 -0.18 -0.83 -1.05 -0.7 -0.59 -0.38 -0.32 -0.75 -0.21 0.18 -0.15 0.32 0.32 0.57 0.77 1.05 -0.43 -0.95 -0.05 -0.26 0.5 0.64 0.05 0.87 0.36 -0.81 0.24 0.73 0.72 -1.39 -0.69 -0.27 0.02 0.75 0.75 0.38 -0.41 -0.34 -0.33 -1.52 0.29 -0.07 0.59 0.69 0.35 -0.98 0.64 0.4 0.12 0.74 0.59 0.57 0.62 0.85
-2.05 0.65 -2.19 -0.89 1.24 -2.47 -0.03 0.8 1.17 -1.3 -1.88 -1.47 -1.85 -1.66 -1.05 -1.29 -1.48 -2.03 -1.65 -1.83 -1.64 -1.82 -1.19 -1.48 -1.82 -1.22 -1.82 -1.42 -1.67 -1.69 -1.11 -1.85 -1.21 0.33 0.39 0.37 0.47 0.37 0.74 0.6 0.08 -2.74 -0.21 1.44 0.23 0.77 0.41 0.92 0.34 -1.08 0.27 0.09 0.07 -1.98 -0.23 -0.11 -0.8 0.92 0.45 0.31 1.14 -0.44 1.44 -0.22 0.52 0.19 0.71 0.57 0.28 0.25 0.41 0.33 0.31 0.15 0.33 0.89 1.4 0.65
-1.26 0.74 -1.26 -1.5 1.32 0.13 0.74 0.98 0.89 -2.17 -1.96 -2.12 -3.37 -2.15 -1.69 -1.12 -1.58 -2.17 -1.97 -2.1 -1.56 -1.93 -0.81 -1.97 -1.96 -2.02 -2.27 -1.16 -3.6 -1.86 -1.24 -2.17 -1.4 0.27 0.55 -0.12 0.81 0.25 0.8 1.06 0.06 -0.35 0.64 0.58 -0.36 0.37 -0.38 0.9 0.36 -0.31 0.41 0.75 0.7 -1.15 0.15 -0.28 0.16 1.0 0.23 -0.13 0.81 0.86 1.12 -1.47 -0.09 -0.05 0.1 -0.26 0.02 0.21 0.63 0.32 0.5 1.05 0.16 0.39 1.0 1.11
-2.16 1.39 -2.13 -1.43 1.29 -0.35 -0.16 0.99 -0.17 -0.69 -1.32 -1.69 -2.71 -0.64 -0.37 -0.74 -1.61 -0.68 -0.87 -1.58 -2.97 -0.68 -0.67 -1.79 -2.56 -0.74 -0.73 -0.64 -3.17 -0.79 -0.15 -1.33 -1.38 -0.64 -0.28 0.4 0.35 0.16 0.46 0.68 -0.52 -1.11 -0.28 -0.03 0.16 0.28 0.31 0.02 0.1 -1.26 -0.26 0.45 0.08 -0.6 -0.53 -0.11 1.14 1.43 0.73 0.28 0.78 0.62 0.49 -0.72 0.22 0.31 0.36 0.14 0.15 0.76 0.55 -0.07 0.67 1.48 0.5 0.63 0.42 0.74
-2.31 0.41 -2.19 -1.39 -0.16 -0.42 0.79 -0.2 0.48 -1.42 -1.58 -1.35 -1.12 -0.82 -1.12 -0.88 -0.77 -1.69 -0.87 -1.07 -1.52 -1.24 -0.63 -1.64 -1.49 -1.39 -1.71 -1.05 -2.19 -0.99 -0.38 -1.13 -0.48 -0.06 0.3 0.11 0.57 0.71 1.22 0.85 0.05 -0.87 0.65 0.29 -0.32 0.38 0.27 -0.02 0.01 -0.84 0.53 0.81 0.75 -1.08 -0.33 0.24 0.49 1.17 1.04 0.7 -0.5 -0.17 -0.31 -1.65 0.27 0.56 0.88 0.61 0.21 -0.65 0.81 0.63 0.67 0.86 0.38 0.51 0.91 0.98
-1.26 -0.47 -1.61 -1.46 1.34 0.06 0.59 0.84 1.01 -1.44 -1.77 -1.73 -2.22 -1.6 -1.24 -1.13 -1.84 -2.09 -1.5 -1.67 -1.77 -1.6 -1.15 -2.31 -2.01 -2.15 -1.51 -1.3 -2.54 -1.51 -1.09 -1.59 -1.31 0.42 0.37 0.44 0.98 0.91 1.1 1.7 -0.05 -0.63 0.64 1.02 -1.01 -0.03 -0.29 -0.16 0.11 -0.2 0.66 1.14 0.81 -1.12 0.19 -1.16 -0.37 0.78 0.16 -0.46 0.38 0.47 0.71 -2.21 -0.31 -0.6 -0.38 -0.71 -0.11 -0.4 1.0 0.85 0.17 0.74 0.15 0.4 1.52 1.6
-2.26 0.32 -2.42 -1.79 0.43 0.46 0.53 0.36 0.69 -0.76 -1.29 -0.82 -1.86 -1.34 -0.64 -0.63 -0.7 -1.96 -1.04 -1.04 -1.21 -1.17 -0.52 -0.97 -1.01 -0.9 -1.2 -0.92 -1.29 -1.09 -0.68 -1.18 -0.43 0.3 0.3 0.42 0.37 0.31 0.99 0.84 -0.33 0.32 0.29 0.54 0.19 0.62 0.15 0.98 0.52 -0.32 0.65 0.88 0.85 -1.69 -0.44 -0.08 -0.68 0.4 0.28 0.05 0.21 0.25 0.56 -1.32 0.25 0.06 0.37 0.41 0.41 -0.38 0.63 0.25 -0.12 0.71 0.37 0.49 0.69 0.92
-2.58 0.9 -2.92 -1.05 1.45 -0.47 -0.04 0.75 0.73 -1.25 -1.45 -1.79 -1.98 -1.26 -0.68 -1.04 -1.63 -1.52 -1.27 -2.26 -1.82 -1.66 -0.74 -2.0 -1.41 -0.9 -1.65 -1.35 -2.48 -1.4 -0.75 -1.89 -1.03 0.5 0.57 0.25 0.08 1.38 0.63 1.74 -0.39 -0.89 0.08 0.75 0.38 0.32 -0.07 0.1 -0.7 -1.21 0.54 0.71 0.29 -0.0 -0.81 -0.92 -1.33 0.17 0.47 0.37 0.86 0.53 1.11 -0.95 0.03 -0.63 0.76 0.45 -0.03 -0.0 0.29 1.38 -0.36 0.48 -0.18 0.33 0.96 1.48
- 0.37 -7.34 -1.83 0.99 0.24 0.36 0.4 1.48 -0.85 -4.22 -2.83 -3.8 -1.92 -1.62 -2.19 -3.38 -1.93 -2.36 -2.26 -3.21 -1.97 -0.9 -2.55 -4.25 -1.6 -1.22 -1.17 -2.67 -1.66 -1.43 -1.8 -1.1 0.15 0.6 0.77 0.26 0.93 1.31 1.86 -0.63 -0.16 0.55 1.27 -0.85 0.61 -0.33 1.24 0.68 -0.84 -0.05 1.24 0.76 -1.63 -2.22 -1.07 -1.45 0.7 0.76 0.09 0.38 0.24 -0.26 -2.17 0.34 -0.73 0.12 -0.24 0.17 -0.59 0.76 0.59 -0.03 0.03 0.52 0.71 1.85 1.76
-2.6 0.03 -2.75 -1.61 1.27 0.27 0.42 0.71 0.27 -1.11 -1.29 -1.41 -1.45 -1.57 -1.19 -0.54 -1.22 -1.86 -0.81 -1.12 -1.19 -1.09 -0.6 -1.67 -1.42 -1.86 -2.0 -0.88 -1.03 -0.94 -0.54 -1.18 -0.81 0.41 0.63 0.49 0.27 0.2 0.76 0.82 -0.23 0.19 0.49 0.15 0.34 0.52 1.02 0.32 0.25 -1.92 0.27 0.71 0.48 -1.62 -0.37 -0.15 -0.15 0.67 0.19 -0.04 0.68 0.78 0.95 -1.14 0.58 0.13 0.15 0.06 0.27 0.28 0.36 0.25 0.06 0.93 0.57 0.59 0.78 0.86
-0.61 -0.47 -0.59 0.59 1.14 -0.68 0.88 1.86 0.3 -3.7 -3.75 -3.25 -3.61 -2.78 -2.88 -2.47 -2.63 -3.38 -2.63 -3.24 -2.58 -3.0 -2.2 -3.0 -2.48 -3.62 -3.62 -3.0 -3.99 -2.45 -1.91 -4.22 -2.7 0.65 0.78 0.93 0.27 1.08 0.09 0.61 0.7 -1.23 1.04 -0.02 0.04 0.32 0.32 1.14 1.62 -2.14 0.53 0.27 -0.78 -1.24 0.41 -0.27 -0.43 1.02 0.26 0.04 1.67 -0.45 1.89 -0.67 0.33 -0.16 0.68 0.52 -0.08 0.32 -0.35 1.09 -0.05 0.65 0.24 0.34 -0.3 0.47
-2.79 -0.2 -2.96 -1.3 0.27 -0.51 -0.08 0.23 0.03 -0.6 -1.37 -0.94 -0.47 -0.41 -0.71 -0.39 -0.4 -1.47 -1.09 -0.48 -0.11 -0.53 -0.69 -1.61 0.06 -1.2 -1.39 -0.96 -0.65 -0.65 -0.61 -1.15 0.3 0.31 0.24 -0.39 -0.15 0.1 0.82 1.18 -0.67 -1.42 -0.06 -0.21 0.22 0.54 0.54 0.13 -0.79 -0.74 0.39 0.62 0.2 -2.12 -0.66 0.06 -0.21 0.99 0.97 0.64 -0.21 0.3 0.28 -2.0 0.56 0.58 0.85 0.76 0.44 -0.43 0.26 -0.03 0.77 1.04 0.5 0.87 1.01 1.12
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-0.48 -1.0 -0.71 1.52 1.31 0.36 0.15 1.01 0.44 -2.3 -2.29 -1.7 -2.44 -1.55 -1.37 -1.49 -1.76 -2.76 -1.67 -1.53 -2.57 -2.33 -1.1 -1.66 -2.21 -2.22 -2.24 -1.4 -2.25 -1.9 -1.08 -1.97 -1.17 1.24 1.21 1.55 0.3 1.17 0.54 0.87 -0.2 0.69 0.11 0.46 -0.44 -0.4 -0.14 1.26 0.55 -0.73 -0.48 0.1 0.12 -1.3 0.09 -0.76 -1.02 -0.15 0.3 0.2 1.26 1.14 1.17 -2.09 -0.5 -0.55 0.37 0.19 -0.58 0.08 0.35 1.19 -0.37 0.03 -0.34 -0.18 0.84 0.85
-3.38 0.2 -3.35 -2.49 0.61 0.14 0.43 0.41 0.89 -1.01 -2.47 -2.58 -3.29 -1.36 -1.56 -1.38 -2.03 -1.77 -1.29 -1.91 -1.59 -1.94 -1.02 -1.97 -1.17 -1.91 -2.63 -1.08 -2.58 -1.11 -0.66 -2.1 -0.58 0.03 0.27 -0.18 0.45 0.7 0.95 1.76 -0.44 -0.58 0.32 0.75 -0.31 0.67 -0.16 0.59 0.41 0.17 0.32 0.82 0.45 -1.19 0.47 -0.83 0.68 1.0 0.58 0.29 -0.0 -0.1 0.08 -2.73 0.3 -0.35 0.24 0.12 0.42 -0.85 0.71 0.8 0.31 1.05 0.74 0.92 1.3 1.62
-1.25 0.37 -1.38 -0.38 0.69 0.17 -0.14 0.25 0.2 -0.95 -1.29 -1.25 -1.12 -1.15 -1.03 -1.12 -0.99 -1.65 -1.14 -1.06 -0.57 -1.17 -0.77 -1.31 -0.81 -0.73 -1.91 -1.19 -1.06 -1.04 -0.77 -1.4 -0.53 0.7 0.79 0.69 0.02 0.88 0.34 0.9 0.06 -0.05 -0.15 -0.12 0.94 0.34 0.99 0.74 -0.12 -2.36 0.62 0.92 0.87 -1.78 -0.54 -0.42 -0.81 0.27 0.39 0.25 0.45 0.78 0.65 -0.67 0.36 -0.19 0.53 0.42 0.18 -0.04 0.09 0.86 -0.21 0.33 0.33 0.62 0.77 0.83
-4.44 0.33 -4.62 -1.13 0.33 0.29 0.56 -0.33 0.76 -0.74 -1.31 -1.35 -1.43 -0.83 -0.92 -0.86 -0.91 -1.15 -0.99 -1.24 -0.54 -0.41 -0.31 -1.4 -1.54 -1.88 -1.57 -0.69 -0.97 -0.17 -0.12 -1.23 -0.5 0.41 0.47 0.66 -0.09 0.77 0.64 1.1 -0.14 0.01 0.7 0.44 0.19 0.2 0.2 0.93 0.65 -1.35 0.3 0.73 0.01 -1.26 -0.22 -0.21 0.66 0.91 0.28 -0.16 -0.16 -0.12 -0.06 -2.01 0.21 0.01 -0.05 -0.04 0.01 -0.9 0.23 0.71 0.72 0.64 0.53 0.82 1.05 1.27
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-4.01 0.88 -3.77 -1.36 1.52 -0.53 -0.0 0.68 0.99 -2.19 -1.89 -1.27 -1.73 -1.21 -1.02 -0.86 -1.37 -2.43 -1.79 -0.88 -1.47 -1.89 -1.13 -1.52 -1.86 -1.75 -2.37 -1.46 -1.8 -1.92 -1.23 -1.41 -1.16 0.21 0.29 0.1 0.6 1.14 0.32 1.28 -0.35 -0.81 0.16 0.91 -0.02 0.04 1.05 0.56 -0.91 -0.78 0.91 1.75 1.47 -2.03 0.46 -1.02 -1.31 0.17 0.19 -0.16 0.93 0.47 1.33 -2.93 0.03 -0.73 -0.12 -0.49 0.1 -0.19 -0.01 1.15 -0.17 0.47 0.06 0.44 1.03 1.27
- 0.5 -6.25 -1.7 1.39 -0.57 0.93 0.77 0.51 -1.6 -0.98 -3.46 - -1.85 -2.14 -1.37 -1.53 -1.99 -1.71 -2.81 -1.03 -2.69 -0.99 -3.06 - -1.83 -1.2 -1.0 - -1.45 -1.69 -2.43 -2.34 0.64 0.28 0.69 -0.75 0.52 -0.15 1.28 -0.65 -1.06 0.52 0.06 0.92 1.01 0.02 1.41 0.22 -3.32 -0.41 0.66 -0.35 -1.39 -1.05 0.38 -0.51 1.54 -0.35 0.3 0.63 -0.53 0.57 -2.7 0.89 0.42 -0.03 0.23 0.98 -0.4 -0.31 0.62 1.62 1.56 1.0 1.27 0.48 1.19

Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.