Heatmap: Cluster_54 (HCCA)

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(Values are log2 transformed ratios of a genes expression in a sample divided by the mean expression level)

Gene
HJ48,hypha
HJ48,hypha,anaero/96h
HJ48,hypha,glu,anaero/96h
HJ48,hypha,xyl,anaero/96h
KO,mycelia,cellu
KO,mycelia,glu
KO,mycelia,gly
KO,mycelia,sopho
KO,mycelia,sugarcane
M124,16h
M124,24h
M124,40h
M124,64h
M307,16h
M307,24h
M307,40h
M307,64h
M362,16h
M362,24h
M362,40h
M362,64h
M7,16h
M7,24h
M7,40h
M7,64h
M727,16h
M727,24h
M727,40h
M727,64h
M76,16h
M76,24h
M76,40h
M76,64h
QM6a,WT,glu,0h
QM6a,WT,lac,24h
QM6a,WT,lac,48h
QM6a,WT,mycelia,cellu,dark
QM6a,WT,mycelia,cellu,light
QM6a,WT,mycelia,dark
QM6a,WT,mycelia,light
QM6a,mycelia
QM6a,mycelia,glu
QM6a,mycelia,gly
QM6a,mycelia,sugarcane
QM9414,WT,2h
QM9414,mycelia
QM9414,xyr1/ara1 KO,2h
QM9978,cellulase-,glu,0h
QM9978,cellulase-,lac,48h
Rut-C30
Rut-C30,24h
Rut-C30,SEB
Rut-C30,SEB,24h
Rut-C30,mycelia
Tu-6
Tu-6,glu
Tu-6,kap8 KO,gly,0h
Tu-6,kap8 KO,sopho,3h
Tu-6,mycelia,sugarcane
Tu-6,sugarcane
WT,mycelia,cellu
WT,mycelia,glu
WT,mycelia,sopho
ace3 KO,mycelia
ara1 KO
azf1 KO,glu
azf1 KO,mycelia,sugarcane
azf1 KO,sugarcane
cre1 KO
cre1 KO,mycelia
gpr8 KO,mycelia,cellu,dark
gpr8 KO,mycelia,cellu,light
kap8 KO,gly,0h
kap8 KO,sopho,3h
xki1 KO
xyr1 KO
ypr2 KO,mycelia,dark
ypr2 KO,mycelia,light
-6.05 -2.14 -6.03 -1.87 0.75 -0.6 0.89 1.1 -0.02 -0.6 -0.5 -0.3 -0.23 -1.23 -0.61 -0.12 -0.39 -0.72 -0.53 -0.88 -0.32 -0.55 -0.16 -0.65 -0.33 -1.13 -1.4 -0.37 -0.38 -0.38 -0.2 -0.83 -0.38 -0.54 -0.28 -0.7 0.33 0.46 0.85 0.58 0.11 -0.88 0.56 -0.25 0.44 -0.36 0.32 0.05 -0.77 -1.64 0.14 0.78 0.7 -0.84 0.24 0.2 0.49 1.32 -0.12 -0.19 1.0 0.35 1.32 -1.38 -0.2 0.29 0.02 -0.08 -0.53 0.3 0.72 0.33 0.63 0.89 -0.19 -0.4 0.47 0.6
-5.79 -2.37 -6.16 -2.11 0.31 -0.17 0.49 1.31 0.15 -0.83 -0.95 -1.11 -2.11 -0.9 -0.66 -0.83 -1.89 -0.92 -0.47 -0.5 -1.43 -0.5 -0.22 -0.95 -1.96 -1.16 -1.45 -0.78 -1.84 -0.4 -0.09 -1.04 -0.66 0.4 0.68 0.36 1.17 0.39 1.27 0.92 0.64 -0.2 0.86 0.38 -0.84 -0.31 -0.19 0.3 0.79 -1.76 0.47 0.62 0.27 -0.5 0.77 -0.39 -0.58 0.91 -0.05 -0.25 0.41 0.29 1.49 -1.42 -0.28 0.01 -0.02 -0.01 -0.52 -0.25 0.88 0.43 0.39 0.92 -0.11 -0.2 0.75 0.84
-4.13 -0.89 -4.15 -1.45 0.91 -0.01 0.41 1.06 0.57 -0.97 -1.13 -1.5 -1.96 -1.24 -0.77 -0.6 -0.77 -1.35 -0.51 -1.52 -2.2 -0.82 -0.63 -1.41 -1.89 -1.04 -1.07 -0.75 -1.65 -0.92 -0.49 -1.62 -0.52 0.52 0.76 0.79 0.84 0.6 0.4 0.85 0.58 -0.31 0.41 0.22 -0.52 -0.39 -0.57 0.81 1.39 -1.96 0.1 0.43 0.45 -1.11 0.71 -0.16 0.85 1.12 -0.44 -0.58 1.0 0.85 1.18 -1.53 -0.58 0.06 -0.49 -0.62 -0.5 0.39 0.53 0.56 1.04 0.58 -0.31 -0.26 0.53 0.72
-6.03 -2.21 -5.37 -2.33 0.79 0.24 0.38 1.1 -0.01 -1.21 -1.24 -0.9 -1.6 -1.09 -0.94 -0.7 -0.97 -1.63 -0.82 -0.62 -1.08 -1.21 -0.65 -0.79 -1.16 -1.28 -1.54 -0.84 -1.22 -1.05 -0.61 -0.92 -0.44 1.44 1.5 1.18 0.35 0.72 0.49 0.77 0.39 0.66 0.48 0.04 0.24 -0.62 -0.36 1.93 1.44 -2.67 -0.23 0.1 0.25 -0.78 0.38 -0.43 -0.66 0.2 -0.62 -0.63 1.15 0.91 1.49 -0.86 -0.94 -0.47 -0.48 -0.43 -0.76 0.46 0.3 0.68 -0.29 -0.16 -0.79 -0.77 0.38 0.74
-5.95 -2.04 -6.57 -2.0 0.41 0.27 0.97 1.32 -0.36 -1.42 -1.47 -1.08 -1.54 -1.12 -0.59 -0.81 -0.99 -1.68 -0.7 -1.0 -1.66 -1.51 -0.55 -0.72 -1.41 -0.98 -1.47 -0.89 -1.53 -1.21 -0.39 -1.09 -0.8 0.79 0.88 0.65 0.83 0.33 0.51 0.12 0.72 0.45 0.88 -0.15 0.54 -1.34 -0.45 1.02 1.28 -2.47 0.18 0.53 1.08 -0.93 0.79 -0.03 -0.07 0.86 -0.47 -0.52 1.54 0.7 1.91 -0.49 -1.57 0.12 -0.33 -0.33 -1.34 0.71 0.64 0.32 0.59 0.31 -1.3 -2.05 0.12 0.14
-4.43 -0.41 -4.4 -1.46 0.79 -0.63 0.02 0.99 -0.17 -1.28 -1.07 -0.83 -1.27 -0.67 -0.46 -0.73 -0.79 -1.34 -0.89 -0.61 -1.06 -1.23 -0.83 -0.85 -1.17 -0.59 -1.14 -0.98 -1.08 -0.93 -0.54 -0.95 -0.62 0.58 0.56 0.37 0.01 0.39 0.63 0.58 0.84 -0.96 0.04 -0.14 0.63 -1.37 0.23 0.33 -0.02 -1.72 1.45 1.61 1.62 -1.17 0.55 -0.03 -0.08 0.56 -0.1 -0.14 1.12 0.7 1.58 -0.77 -1.12 0.08 0.12 -0.02 -1.22 0.45 -0.06 0.41 0.49 0.39 -1.2 -1.1 0.71 0.83
-2.66 -0.64 -2.53 -1.28 0.04 0.12 0.42 0.81 0.03 -0.87 -1.57 -1.8 -2.0 -0.92 -0.76 -1.18 -1.66 -1.79 -1.2 -1.72 -1.79 -1.35 -0.97 -1.43 -2.07 -0.65 -1.16 -0.96 -2.12 -1.18 -0.77 -1.64 -1.46 1.03 1.15 1.07 0.18 0.58 0.66 0.57 0.54 0.09 0.31 0.13 0.63 -0.62 0.08 1.1 0.6 -1.23 0.14 0.21 0.65 -0.91 0.72 0.04 0.68 1.08 0.21 0.04 0.7 0.83 1.33 -0.84 -0.45 0.36 0.22 0.03 -0.5 0.38 0.34 0.53 0.69 1.04 -0.39 -0.41 0.5 0.6
-0.22 -1.61 -0.15 -0.92 1.2 -0.13 1.36 1.08 0.14 -1.05 -1.1 -0.92 -1.1 -1.07 -0.78 -0.35 -0.66 -1.64 -0.88 -1.39 -1.1 -1.05 -0.53 -0.79 -1.36 -1.23 -1.65 -0.56 -1.54 -0.79 -0.34 -1.04 -0.74 0.04 0.05 -0.03 0.57 0.15 0.91 0.39 0.42 -0.58 0.88 -0.06 -0.2 -0.92 -0.37 0.68 -0.17 -1.73 0.33 0.65 0.55 -0.6 0.47 -0.31 0.75 1.27 -0.53 -0.68 1.43 0.74 1.53 -1.32 -0.58 -0.0 -0.26 -0.48 -0.83 0.31 0.69 0.13 0.73 0.58 -0.7 -0.86 0.62 0.57
-4.44 -0.93 -4.51 -1.84 1.37 -0.4 -0.08 0.78 0.33 -1.08 -1.15 -0.72 -1.05 -1.16 -0.94 -0.95 -0.63 -1.51 -1.09 -1.04 -1.34 -1.27 -0.88 -0.94 -0.94 -1.19 -1.61 -1.13 -0.65 -0.93 -0.61 -1.07 -0.78 0.75 0.76 0.41 0.03 0.64 0.88 0.78 0.63 -0.59 -0.24 0.38 0.41 -0.75 0.35 0.86 0.39 -1.58 0.93 0.99 0.67 -1.57 0.27 -0.1 -0.04 0.7 0.43 0.32 0.98 0.54 1.15 -0.98 -0.51 -0.0 0.57 0.52 -0.62 0.17 0.15 0.6 0.25 0.34 -0.54 -0.38 0.91 0.94
-5.72 -0.72 -5.73 -1.85 0.15 0.2 0.48 0.88 -0.29 0.17 -0.48 -0.56 -0.66 -0.27 0.0 -0.43 -0.69 -0.75 -0.32 -0.51 -0.69 -0.4 -0.14 -0.51 -0.86 0.4 -0.08 -0.37 -0.88 -0.32 -0.15 -0.63 -0.57 0.4 0.58 0.5 -0.09 0.25 0.35 0.48 0.23 -0.1 0.25 -0.42 0.38 -0.96 -0.07 1.0 0.55 -0.94 0.35 0.45 0.62 -1.23 0.55 -0.26 0.63 0.84 -0.19 -0.28 0.59 0.66 1.27 -1.39 -0.85 -0.08 -0.04 -0.09 -0.71 0.41 0.12 0.25 0.41 0.94 -0.97 -0.79 0.29 0.44
-3.65 0.59 -3.5 -1.6 1.15 0.3 -0.3 0.83 0.11 -1.59 -1.21 -0.78 -1.35 -1.0 -0.31 -0.63 -0.92 -1.63 -1.13 -0.6 -1.52 -1.95 -1.07 -0.43 -1.51 -0.52 -0.84 -0.63 -0.93 -1.54 -0.88 -0.71 -0.92 1.13 1.05 0.5 0.38 0.42 0.77 0.34 0.93 0.47 -0.31 0.51 -0.41 -1.14 -0.43 0.73 1.08 -1.43 0.36 0.14 0.08 -1.39 1.12 -0.41 -0.84 0.1 0.11 0.05 1.41 1.3 1.5 0.08 -0.99 -0.34 0.42 0.15 -0.98 0.77 0.12 0.39 -0.04 -0.1 -1.1 -1.19 0.6 0.56
0.27 0.55 0.18 -0.16 0.31 0.3 0.31 0.67 0.02 -0.71 -1.39 -1.75 -1.25 -1.04 -0.68 -1.21 -1.07 -1.43 -1.07 -1.25 -1.1 -1.3 -1.1 -1.52 -1.41 -0.45 -1.03 -1.04 -1.32 -1.31 -1.07 -1.62 -0.98 0.86 0.86 0.84 0.11 0.7 0.1 0.37 0.47 -0.0 0.18 0.09 -0.11 -1.35 0.09 1.01 1.0 -0.68 0.41 0.59 0.88 -1.46 1.01 -0.06 0.62 0.51 -0.16 -0.19 0.98 0.78 1.36 -0.99 -0.99 0.04 0.0 -0.02 -1.0 0.59 -0.1 0.65 0.29 0.71 -1.0 -0.8 0.25 0.47
-2.89 -1.46 -3.2 -1.42 -0.07 0.06 0.56 0.5 -0.31 0.31 -0.16 -0.48 -0.62 -0.21 0.2 -0.54 -0.61 -0.43 -0.2 -0.39 -0.69 -0.11 0.04 -0.57 -0.99 0.47 -0.38 -0.45 -0.86 -0.11 -0.08 -0.51 -0.69 0.67 0.77 0.55 0.06 0.49 0.48 0.64 0.47 -0.1 0.44 -0.21 0.24 -1.2 -0.38 0.94 0.17 -1.59 -0.01 0.27 0.6 -1.28 0.33 -0.15 0.69 0.87 -0.09 -0.2 0.51 0.4 1.14 -1.26 -1.06 0.08 -0.02 -0.11 -1.05 0.08 0.2 0.46 0.39 0.64 -1.01 -1.03 0.44 0.67
-3.38 -2.38 -3.47 -1.66 0.79 -0.43 0.72 0.89 0.44 -0.91 -0.8 -0.91 -1.2 -1.04 -0.49 -0.72 -0.86 -1.09 -0.96 -1.12 -1.24 -1.02 -0.67 -1.12 -1.44 -0.55 -0.76 -0.89 -1.06 -0.84 -0.47 -1.13 -0.88 0.98 0.93 1.19 0.51 0.44 0.62 0.66 0.58 -0.64 0.34 0.76 0.59 -1.17 -0.14 0.9 1.44 -1.1 0.4 0.68 0.75 -1.49 -0.36 -0.06 0.02 0.61 -0.37 -0.38 1.02 0.58 1.0 -0.56 -0.73 0.15 0.12 -0.07 -1.04 0.35 0.29 0.44 0.09 0.39 -0.68 -1.05 0.81 0.83
-0.75 -0.77 -0.82 -0.18 1.01 0.46 0.99 1.38 -0.85 -1.06 -0.69 -0.62 -1.34 -0.78 -0.5 -0.62 -0.88 -1.14 -0.47 -1.04 -1.39 -1.18 -0.51 -0.72 -1.19 -1.09 -1.54 -0.55 -1.27 -0.94 -0.29 -0.8 -0.54 -0.51 -0.57 -1.03 0.37 0.03 0.67 -0.03 0.47 0.51 1.05 -0.49 -0.04 -0.68 0.12 -0.33 -0.69 -1.67 0.38 0.8 0.2 -0.42 0.83 -0.21 0.99 1.69 -1.0 -1.2 1.31 0.59 1.89 0.17 -0.43 0.02 -0.73 -1.25 -0.79 0.53 0.51 0.08 0.76 1.15 -0.54 -1.31 -0.31 0.07
-4.5 -0.34 -4.59 -1.39 1.14 -0.07 0.12 0.72 0.23 -1.34 -1.35 -1.18 -1.94 -1.05 -1.02 -0.89 -1.44 -1.87 -0.95 -1.32 -2.34 -1.42 -0.9 -1.23 -1.75 -1.35 -2.17 -1.23 -1.77 -1.27 -1.08 -1.24 -1.35 0.55 0.6 0.33 0.44 0.51 0.75 0.23 0.65 -0.33 0.46 0.98 0.06 -0.57 0.26 0.66 0.19 -1.46 -0.03 0.14 0.09 0.24 0.76 -0.04 0.23 0.67 0.38 0.22 1.46 1.7 1.25 0.4 0.01 0.05 0.44 0.33 -0.16 0.71 0.36 0.61 0.34 0.17 -0.18 -0.17 0.38 0.4
-3.5 -1.13 -3.4 -0.5 1.11 0.35 0.96 1.0 -0.22 -1.63 -1.53 -0.97 -1.61 -1.1 -1.17 -1.06 -1.12 -1.99 -0.93 -0.73 -1.21 -1.47 -0.9 -0.95 -1.56 -1.91 -2.21 -1.28 -1.48 -1.26 -0.62 -0.83 -0.37 0.86 0.8 -0.21 0.38 1.27 -0.51 0.22 1.09 0.3 0.91 0.31 0.96 -1.44 0.17 1.1 -0.29 -2.44 0.21 0.72 0.64 -0.44 1.63 -0.06 0.05 0.4 -1.17 -1.25 1.56 1.39 1.99 -1.41 -1.25 -0.04 -1.12 -1.52 -1.21 0.84 -0.07 1.25 0.02 -0.61 -1.36 -1.08 -0.18 0.39
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-6.23 -2.19 -5.37 -1.37 0.45 -0.73 0.06 0.49 -0.15 -0.58 -0.51 -0.61 -0.41 -0.39 -0.2 -0.15 -0.08 -0.93 -0.34 -0.2 -0.3 -0.45 0.0 -0.58 -0.18 -0.52 -1.05 -0.63 -0.28 -0.47 -0.04 -0.49 0.03 0.09 0.26 0.16 0.16 0.68 0.56 0.85 0.47 -0.72 0.09 0.12 0.33 -0.85 -0.89 -0.09 0.55 -2.26 0.84 1.28 1.77 -1.06 0.17 -0.0 0.11 1.03 0.0 -0.15 0.71 -0.06 0.85 -1.51 -0.89 0.08 -0.07 -0.13 -1.01 -0.04 0.21 0.68 0.65 0.21 -0.68 -0.81 0.57 0.87
-4.47 -1.06 -4.54 -1.32 0.52 -0.07 0.59 1.02 0.09 -0.94 -1.35 -1.32 -1.5 -0.99 -0.72 -1.0 -1.2 -1.71 -0.99 -1.35 -1.76 -1.43 -0.98 -1.31 -1.82 -0.64 -1.3 -0.95 -1.6 -1.1 -0.73 -1.51 -0.97 0.9 0.92 0.82 0.03 0.66 0.59 0.7 0.52 -0.27 0.47 0.02 0.46 -1.13 0.27 1.24 0.69 -1.59 0.32 0.56 0.92 -1.32 1.01 -0.12 0.32 0.71 0.07 0.03 1.04 0.8 1.73 -1.37 -0.95 -0.05 0.08 0.06 -0.93 0.48 0.24 0.64 0.44 0.89 -0.97 -0.72 0.59 0.78
-7.9 -2.58 -5.25 -0.8 0.91 -0.61 0.69 0.94 -0.31 -1.6 -1.66 -1.34 -1.83 -1.46 -1.0 -0.65 -1.47 -2.14 -1.1 -1.5 -1.88 -1.09 -0.97 -1.46 -1.76 -1.82 -2.31 -0.93 -1.48 -1.18 -0.8 -1.58 -0.88 0.72 0.85 0.49 0.67 0.77 1.01 0.78 0.45 -1.11 0.32 -0.17 0.48 -0.85 0.4 1.25 0.07 -2.62 0.51 0.78 0.66 -0.0 0.68 0.0 0.67 1.59 -0.23 -0.56 1.1 0.68 1.4 -1.41 -0.37 0.19 -0.08 -0.39 -0.89 0.37 0.73 0.92 0.86 0.75 -0.31 -0.53 0.48 0.73
-1.98 -0.43 -2.35 -0.54 1.32 -0.13 0.31 0.98 0.7 -1.2 -1.17 -0.98 -1.1 -0.76 -1.15 -0.51 -0.71 -1.77 -1.2 -1.24 -0.74 -0.83 -0.55 -1.42 -1.11 -1.76 -1.44 -0.68 -1.43 -1.0 -0.67 -1.11 -0.07 1.23 1.4 0.96 0.19 0.87 0.75 0.71 0.06 -0.45 0.22 0.35 -0.38 -0.78 0.06 1.48 0.31 -0.63 0.19 0.48 0.2 -1.37 0.43 -0.75 0.01 0.48 -0.23 -0.5 0.9 0.86 1.42 -1.4 -0.62 -0.63 -0.12 -0.39 -0.85 -0.12 -0.01 0.91 0.06 0.03 -0.41 -0.28 0.75 0.82
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-2.46 -0.53 -2.42 -0.59 0.85 0.71 0.49 0.81 0.19 -1.58 -1.71 -1.78 -2.23 -1.25 -1.03 -1.26 -1.86 -1.79 -1.16 -2.36 -1.88 -1.3 -1.27 -2.16 -2.15 -1.1 -2.05 -1.26 -2.34 -1.28 -1.02 -2.48 -1.25 0.32 0.28 0.13 0.99 0.76 0.29 0.21 0.62 0.44 0.41 0.21 0.4 -0.72 0.14 0.19 0.25 -1.36 0.96 1.38 1.43 -0.7 0.95 -0.6 0.55 0.62 -0.09 -0.4 1.04 1.12 1.34 -0.37 -0.22 -0.42 -0.15 -0.32 -0.55 0.73 0.58 0.81 1.04 0.72 -0.11 -0.58 0.67 0.35
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Details

Dark gray cells indicate values where the raw expression is zero (cannot be log-transformed). Blue cells indicate samples where the expression of the gene is below average and red cells indicate the gene is expressed above average in the sample. White cells are average.